新型生物标志物制造技术

本发明专利技术涉及一种用于预测诊断患有癌症的受试者对免疫疗法的反应或者预后诊断患有癌症的受试者的存活时间的体外方法，该方法包括在受所述癌症影响的组织中测量由对

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】新型生物标志物


[0001]本专利技术涉及出于预后疾病发展的目的并且具体地出于预测癌症患者对免疫疗法的反应和评价癌症患者的存活时间的目的的细胞群体的检测和分析的领域
。

技术介绍

[0002]癌症是全世界主要的死亡原因，并且据估计
2017
年有约
960
万人死于癌症
。
随着由于对其它死因治疗的发展所带来的预期寿命的提高，癌症病例数缓慢增长
。
因此，持续需要用于评价癌症的新方法以告知患者和护理人员两者患者个体疾病的状态和未来存活前景
。
[0003]恶性肿瘤的
TNM
分类系统
(Brierly
等人，
2017)
提供了描述癌症和对癌症分期的国际统一标准，其隶属于国际抗癌联盟
(UICC)
发表
。
[0004]已提议了以商品名
(
在本公开中，有时缩写为“IS”)
可商购的免疫打分系统，其评价常规切除的肿瘤中肿瘤中心区中和侵袭边缘处的
CD3
+
和
CD8
+
T
细胞的丰度
(Galon
等人，
2006)。
它最近还被验证作为除其它临床参数，包括
T
和
N
期外的结肠癌
I
‑
III
期中的独立预后因子
(Pag
è
s
等人，
2018)。
尽管在结直肠癌中的有效性得到证实，但是仍缺少它在其它肿瘤类型中的预后显著性的强力证据
。
[0005]已表明
CD163
+
肿瘤浸润巨噬细胞和
CD8
+
细胞是骨肉瘤中的关键性预后生物标志物
(Gomez
‑
Brouchet
等人，
2017)。
已发现
CD68
和
CD163
染色的存在是高度相关的，据发现这表明可能存在常见的巨噬细胞亚组
。
解释结果表明
CD163
和
CD68
的高水平与更好的整体存活期和无转移发展存活期关联
。
作者还发现患者样品间的
CD8
+
染色水平较低，其中值染色为1％
。
尽管在超过一半的患者样品中检测到
CD8
+
细胞，但是在诊断时它们的存在与较低的转移率显著关联
。
尚未研究
CD8
+
、CD163
+
和
CD68
+
细胞的定量测量之间的关系
。
[0006]WO2016/134416
公开了提供患有弥漫性大
B
‑
细胞淋巴瘤的受试者对治疗方案起反应的预后的方法，该方法包括：基于受试者中
CD137、CD4、CD8、CD56、TNF
α
(
α
)
和
LMO2
中的任何一种或多种的水平与受试者中的
PD
‑
1、PD
‑
L1、CD163、CD68、PD
‑
L2、LAG3、TIM3
和
SCYA3(CCL3)
中的任何一种或多种的水平之比，确定受试者的免疫得分，将免疫得分与参考得分相比较；其中与参考得分相比的免疫得分指示了受试者对治疗方案起反应的预后
。WO2016/134416
中公开的特异性免疫得分全部定义了比例，该比例在分子中包括了多种标志物水平，并且所有所指明的免疫得分引入了
PD
‑1或
PD
‑
L1。

技术实现思路

[0007]本专利技术的目的是提供用于评价多种癌症形式的替代和改善的生物标志物，并且具体地提供用于预后诊断患有癌症的受试者的存活时间的方法
。
[0008]因此，在第一方面，本专利技术涉及用于预测诊断患有癌症的受试者对免疫疗法的反应或者预后诊断患有癌症的受试者的存活时间的体外方法，包括：
[0009]‑
在受所述癌症影响的组织中，测量由对
CD8
呈阳性的细胞组成的第一细胞类别的第一密度
D1
和由对以下中的至少一种呈阳性的细胞组成的第二细胞类别的第二密度
D2
：
C1q
；
CD68
和
CD163
的组合；以及
CD68
和
C1q
的组合，
[0010]‑
确定
D1
和
D2
之间的关系；和
[0011]‑
将所确定的关系与预测所述受试者对免疫疗法的反应或指示所述受试者的存活时间的至少一个预定参考值相比较
。
[0012]在一个实施方式中，该方法包括
[0013]‑
从该受试者获得癌组织样品；
[0014]‑
在该组织样品中，测量由对
CD8
呈阳性的细胞组成的第一细胞类别的第一密度
D1
和由对以下中的至少一种呈阳性的细胞组成的第二细胞类别的第二密度
D2
：
C1q
；
CD68
和
CD163
的组合；以及
CD68
和
C1q
的组合，
[0015]‑
确定
D1
和
D2
之间的关系；
[0016]‑
将所确定的关系与指示所述受试者的存活时间的至少一个预定参考值相比较；和
[0017]‑
基于该比较确定受试者对免疫疗法的反应的预测以及受试者的存活时间的预后
。
[0018]在一个实施方式中，通过以下确定用于预测受试者对免疫疗法的反应的预定参考值：
[0019]‑
在来自诊断患有所述癌症并且对免疫疗法具有已知反应的受试者群组中每位受试者的癌组织样品中，测量由对
CD8
呈阳性的细胞组成的第一细胞类别的第一密度
D1
和由对以下中的至少一种呈阳性的细胞组成的第二细胞类别的第二密度
D2
：
C1q
；
CD68
和
CD163
的组合；以及
CD68
和
C1q
的组合，
[0020]‑
确定
D1
和
D2
之间的关系；
[0021]‑
将所确定的关系与受试者的已知存活时间相比较以获得该关系与存活时间之间的关联；和...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.
一种用于预测诊断患有癌症的受试者对免疫疗法的反应或者预后诊断患有癌症的受试者的存活时间的体外方法，包括：
‑
在受所述癌症影响的组织中，测量由对
CD8
呈阳性的细胞组成的第一细胞类别的第一密度
D1
和由对以下中的至少一种呈阳性的细胞组成的第二细胞类别的第二密度
D2
：
C1q
；
CD68
和
CD163
的组合；以及
CD68
和
C1q
的组合，
‑
确定
D1
和
D2
之间的关系；和
‑
将所确定的关系与预测所述受试者对免疫疗法的反应或指示所述受试者的存活时间的至少一个预定参考值相比较
。2.
根据权利要求1所述的方法，其中所述方法包括
‑
从所述受试者获得癌组织样品；
‑
在所述组织样品中，测量由对
CD8
呈阳性的细胞组成的第一细胞类别的第一密度
D1
和由对以下中的至少一种呈阳性的细胞组成的第二细胞类别的第二密度
D2
：
C1q
；
CD68
和
CD163
的组合；以及
CD68
和
C1q
的组合，
‑
确定
D1
和
D2
之间的关系；
‑
将所确定的关系与指示所述受试者的存活时间的至少一个预定参考值相比较；和
‑
基于所述比较确定所述受试者对免疫疗法的反应的预测以及所述受试者的存活时间的预后
。3.
根据前述权利要求中任一项所述的用于预测受试者对免疫疗法的反应的方法，其中通过以下确定所述预定参考值：
‑
在来自诊断患有所述癌症并且对免疫疗法具有已知反应的受试者群组中每位受试者的癌组织样品中，测量由对
CD8
呈阳性的细胞组成的第一细胞类别的第一密度
D1
和由对以下中的至少一种呈阳性的细胞组成的第二细胞类别的第二密度
D2
：
C1q
；
CD68
和
CD163
的组合；以及
CD68
和
C1q
的组合，
‑
确定
D1
和
D2
之间的关系；
‑
将所确定的关系与所述受试者的已知存活时间相比较以获得所述关系与所述存活时间之间的关联；和
‑
确定所述参考值以预测诊断患有所述癌症的受试者对免疫疗法的反应
。4.
根据权利要求1‑3所述的用于预后受试者的存活时间的方法，其中通过以下确定所述预定参考值：
‑
在来自诊断患有所述癌症并且具有已知存活时间的受试者群组中每位受试者的癌组织样品中，测量由对
CD8
呈阳性的细胞组成的第一细胞类别的第一密度
D1
和由对以下中的至少一种呈阳性的细胞组成的第二细胞类别的第二密度
D2
：
C1q
；
CD68
和
CD163
的组合；以及
CD68
和
C1q
的组合，
‑
确定
D1
和
D2
之间的关系；
‑
将所确定的关系与受试者的所述已知存活时间相比较以获得所述关系与所述存活时间之间的关联；和
‑
确定所述参考值以指示诊断患有所述癌症的受试者的存活时间
。5.
一种测量受癌症影响的组织样品中相对细胞密度的方法，包括以下步骤：测量所述组织样品中由对
CD8
呈阳性的细胞组成的第一细胞类别的第一密度
D1
和所述组织样品中由
对以下中的至少一种呈阳性的细胞组成的第二细胞类别的第二密度
D2
：
C1q
；
CD68
和
CD163
的组合；以及
CD68
和
C1q
的组合，以及计算
D1
和
D2
之间的关系
。6.
根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述第二细胞类别由对
CD68
和
CD163
两者呈阳性的细胞组成
。7.
根据权利要求1‑4中任一项所述的方法，其中所述第二细胞类别由对
C1qA、C1qB
和
C1qC
中的至少一种以及任选地
CD68
呈阳性的细胞组成
。8.
根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中
D1
和
D2
之间的关系的确定包括计算比率
D1/(D1+D2)
或
D1/D2、
或者它们的倒数
。9.
根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述癌症选自结直肠癌
、
乳腺癌
、
胰十二指肠癌
、
膀胱癌
、
肺癌
、
黑色素瘤和胃食管腺癌
。10.
根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中将所确定的关系与确定所述受试者的存活时间的预后的至少一种临床风险因子组合
。11.
根据权利要求
10
所述的方法，其中所述至少一种临床风险因子选自由以下组成的组：受试者的性别
、
微卫星不稳定性状态
、
肿瘤偏侧性
、T
期
、N
期
、
肿瘤分化
。12.
根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中通过分析基因表达进行细胞密度的测量
。13.
根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中通过以下进行细胞密度的测量：对分析的...

【专利技术属性】
技术研发人员：阿图尔，
申请(专利权)人：托比亚斯，
类型：发明
国别省市：