生物标志物组合及其在预测免疫治疗联合化疗治疗食管癌效果中的应用制造技术

本发明专利技术公开了一种生物标志物组合及其在预测免疫治疗联合化疗治疗食管癌效果中的应用

【技术实现步骤摘要】
生物标志物组合及其在预测免疫治疗联合化疗治疗食管癌效果中的应用


[0001]本专利技术属于生物信息学领域，具体涉及一种生物标志物组合及其在预测免疫治疗联合化疗治疗食管癌效果中的应用
。

技术介绍

[0002]食管癌
(Esophageal cancer
，
EC)
是常见的恶性消化道肿瘤之一，也是世界上第六大致死率较高的癌症
。
食管癌根据病理组织分型主要分为两类：食管鳞状细胞癌和食管腺癌
。90
％的食管癌患者是食管鳞状细胞癌
。
到目前为止，仍缺乏针对食管癌的有效靶向治疗方式
。
晚期食管癌病人的首选治疗方法是外科手术
。
对于一些没有手术治疗机会的患者，只能靠药物提高生活质量甚至维持生存
。
近年来，随着免疫抑制剂的研究，免疫治疗在多种肿瘤中取得很好的治疗效果
。
其中卡瑞利珠单抗
(Camrelizumab
；艾瑞卡
)
，一种
PD1
抑制剂，它是我国原研且唯一进入医保的
PD1
抑制剂
。
艾瑞卡联合紫杉醇和卡铂
(TC)
方案也是不可切除局部晚期
/
复发或转移性食管鳞癌患者的一线治疗方案
。
但是药物耐受问题仍未得到解决，食管癌治疗的总体预后仍处于较差水平
。
在临床上，肿瘤的治疗效果存在较大的个体差异，但是药物个性化的选择依据过少，临床急需指导个体化精准医疗的标志物，从而缓解药物耐受问题
。
[0003]因此，为了实现食管癌的个体化治疗，有必要根据分子遗传学和病理学特征来识别亚类，发现并应用相应的靶基因
。
此外，在食管癌研究中，已经报道了可以根据食管癌的亚型对食管癌的预后进行分类的结果
。
目前已涌现的多项研究性专利均是基于基因组和转录组的基因表达水平实现对食管癌的早期筛查，如食管癌预后标志物及其应用
(
专利号
CN106701992A)
，食管癌的诊治标志物
(
专利号
CN105886627B)。
然而在临床中，针对食管癌患者的一线治疗方案艾瑞卡抗
PD1
免疫治疗或联合其他化疗方案
(
例如联合紫杉醇，或卡铂
/
铂类
)
仍未实现有效的治疗方案抉择
。
[0004]蛋白质组学在揭示肿瘤发生的复杂分子事件，如肿瘤发生
、
侵袭
、
转移和对治疗耐受上起了重大作用
。
蛋白质组学肿瘤诊断具有灵敏度高
、
特异性强
、
背景机理明确的优点，近年来被越来越多地运用于肿瘤检测
。
而且，这些肿瘤标志物的研究往往是基于一定量的实验数据，所涉及的癌症种类和样本量都相对有限
。
因此，通过收集蛋白质组数据，利用大数据分析方法，建立预测治疗有效的模型，有助于实现个性化化疗，对患者推荐合适的治疗方案具有重要的临床意义
。

技术实现思路

[0005]针对现有技术中缺少预测艾瑞卡联合化疗
(
紫杉醇
+
铂类
)
治疗食管癌效果的技术方案的缺陷，本专利技术提供了一种生物标志物组合及其在预测免疫治疗联合化疗治疗
(
艾瑞卡联合化疗治疗
)
食管癌效果中的应用
。
所述生物标志物组合至少包括
SPTB、FGA、FGG、ZC3H7B、LSR、WIPF2、RNF214
和
NDUFB7
，此时可达到验证集中预测准确率
、
诊断灵敏度和特异
性均为
90
％
、92
％和
88
％，所述生物标志物组合至多可扩展至包括如本专利技术所述的
298
种蛋白质分子生物标志物，其预测准确率
、
诊断灵敏度和特异性均较高
。
[0006]为解决上述技术问题，本专利技术提供的一个技术方案为：一种生物标志物组合，所述生物标志物组合包括以下一种或多种蛋白质：
SPTB、FGG、FGB、ZC3H7B、LSR、WIPF2、RNF214
和
NDUFB7。
[0007]优选地，所述生物标志物组合还包括
ADD2。
更优选地，所述生物标志物组合进一步还包括
ARF1。
[0008]进一步更优选地，所述生物标志物组合还包括以下一个或多个生物标志物：
ARF1、KRTAP3
‑
3、BOLA1、TMEM50B、TSEN54、FNTB、NWD1、MBIP、MAPKBP1、MMACHC、PIGN、RAPGEF2、FANCD2、INSR、ILDR1、CUTC、BAG4、PTGR2、HPR、CACTIN、MGAT5、OCA2、PGK2、BSDC1、NLRP10、TACO1、KATNA1、NHSL2、MCC、LAMC3、ACTG2、AKR1C2、REEP3、FETUB、CEP290、ZC3H7B、KRT85、FHL2、ADD2、FADS2、FGFR1OP、HBG1、GP5、FGG、CHI3L1、GALNS、NEFM、EMC10、FGB、FGA、GP1BA、ANK1、SPTB、CCNK、F2、MAP4K4、SPTA1、SLC4A1、PLEK、CALML5、PSME1、NDUFS4、RAP1A、FAM129A、PPP1R9B、CLASP2、GIMAP4、LMF2、EML2、ELL、PRPF38A、DFFA、ASAH1、ERAP1、CYFIP2、PPP1R21、TMED10、CEPT1、LSP1、CIRBP、STAT1、GNG12、POLR1C、FYB、ANP32E、SUGT1、APOA2、HIST1H1D、CD97、MOV10、GBP2、GGT5、SCFD1、SUMF1、SUCLG1、FBP1、SLC25A22、SLC1A5、LTA4H、PAK1、HIST1H1C、EXOC7、SKP1、DNAJC7、EIF3M、NANS、FKBP11、ATP1B3、C1orf52、PTPRC、ELP3、RPS26、STX4、TMX2、SMC6、PIK3C2A、TMED1、LYN、NDUFB7、CD74、WDFY1、HLA
‑
DPB1、ATP6V1G1、COASY、TMED5、SPCS2、TAP2、PPOX、EPB41L1、MUC1、SPTLC1、SLC7A1、HLA
‑
DRA、CRAT、AP1M1、HLA
‑
E、HLA
‑
B、MTMR6、CTBP1、LYNX1、CD14、TBC1D10C、CDK9、SGPL1、AB本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.
一种生物标志物组合，其特征在于，所述生物标志物组合包括以下一种或多种蛋白质：
SPTB、FGG、FGB、ZC3H7B、LSR、WIPF2、RNF214
和
NDUFB7。2.
如权利要求1所述的生物标志物组合，其特征在于，所述生物标志物组合还包括
ADD2
；优选地，所述生物标志物组合进一步还包括
ARF1。3.
如权利要求1或2所述的生物标志物组合，其特征在于，所述生物标志物组合还包括以下一个或多个生物标志物：
ARF1、KRTAP3
‑
3、BOLA1、TMEM50B、TSEN54、FNTB、NWD1、MBIP、MAPKBP1、MMACHC、PIGN、RAPGEF2、FANCD2、INSR、ILDR1、CUTC、BAG4、PTGR2、HPR、CACTIN、MGAT5、OCA2、PGK2、BSDC1、NLRP10、TACO1、KATNA1、NHSL2、MCC、LAMC3、ACTG2、AKR1C2、REEP3、FETUB、CEP290、ZC3H7B、KRT85、FHL2、ADD2、FADS2、FGFR1OP、HBG1、GP5、FGG、CHI3L1、GALNS、NEFM、EMC10、FGB、FGA、GP1BA、ANK1、SPTB、CCNK、F2、MAP4K4、SPTA1、SLC4A1、PLEK、CALML5、PSME1、NDUFS4、RAP1A、FAM129A、PPP1R9B、CLASP2、GIMAP4、LMF2、EML2、ELL、PRPF38A、DFFA、ASAH1、ERAP1、CYFIP2、PPP1R21、TMED10、CEPT1、LSP1、CIRBP、STAT1、GNG12、POLR1C、FYB、ANP32E、SUGT1、APOA2、HIST1H1D、CD97、MOV10、GBP2、GGT5、SCFD1、SUMF1、SUCLG1、FBP1、SLC25A22、SLC1A5、LTA4H、PAK1、HIST1H1C、EXOC7、SKP1、DNAJC7、EIF3M、NANS、FKBP11、ATP1B3、C1orf52、PTPRC、ELP3、RPS26、STX4、TMX2、SMC6、PIK3C2A、TMED1、LYN、NDUFB7、CD74、WDFY1、HLA
‑
DPB1、ATP6V1G1、COASY、TMED5、SPCS2、TAP2、PPOX、EPB41L1、MUC1、SPTLC1、SLC7A1、HLA
‑
DRA、CRAT、AP1M1、HLA
‑
E、HLA
‑
B、MTMR6、CTBP1、LYNX1、CD14、TBC1D10C、CDK9、SGPL1、ABCD1、PSME2、C5orf51、IKBKG、TBC1D4、COTL1、AMFR、TRIM22、FMNL1、RGS19、CSTA、HECTD1、CECR1、DPYD、ITGAX、NR3C1、WDR45B、NIPSNAP3A、LZTFL1、SLFN11、EPB41L3、LRCH1、SHKBP1、NGLY1、ACSL4、WIPF2、LGALS9、ARRB1、TAPBP、CDC16、KPNA7、C16orf80、CPSF3L、FUCA1、CASP1、CUL3、ZBP1、SPCS3、OSTC、SORT1、NFYC、USMG5、EMILIN2、CROCC、CDKN2AIPNL、RNF214、LSR、ITM2B、UBA7、ACE、C8orf33、ATG9A、AKAP8L、HTT、CCDC9、ASB15、MPHOSPH8、CROT、ITGB7、DNLZ、SEMA4B、VPS13C、PANK4、BPIFB1、ALPL、MAP3K4、BACH1、ATP13A1、ARMC5、SLC35B2、INTS2、LSM5、CASP10、NCF4、DCAF11、FLG2、CD8A、CC2D1B、COX15、SEL1L、KLK13、GIMAP8、NHEJ1、CLCC1、EXOSC9、VAV1、SORL1、MAN1A1、PRKAG1、RASAL3、DNAJC17、ANGPTL2、CHCHD4、GBP5、FCGR1A、SYNJ2、SASH3、HMCN1、TMEM161A、APOL3、ZBTB7A、MOB2、TFAM、WAC、NUDT18、SCLY、LCN1、NCS1、MICU2、APOL2、CXorf38、STK17B、CD99L2、ACADS、FNBP1L、ATG16L1、NAV2、CRYBG3、NFATC2、C3orf17、LARS2、CLK2、C12orf44、SLC30A5、GPCPD1、PTPMT1、TRAPPC2L、PPP1R13B、DAPP1、CEP350、LILRB5、CHL1、RECQL5、FAM46C、SLC27A2、RENBP、C10orf137、PUS3、ARAP3、CEP128、ZEB2、VAMP5、ZBTB21、CEP44、MAD2L1BP、STAT4、MYO19、GAS7、C5orf22、LMBRD2、PDCL、THEMIS、ARGLU1
和
PADI3。4.
一种生物标志物组合在预测免疫治疗联合化疗治疗食管癌效果中的应用，其特征在于，所述生物标志物组合为如权利要求1‑3中任一项所述的生物标志物组合；所述免疫治疗联合化疗治疗为艾瑞卡联合紫杉醇
+
铂类的化疗；优选地，所述铂类为卡铂
。5.
一种用于检测如权利要求1‑3中任一项所述的生物标志物组合的试剂；其特征在于，优选地，所述试剂用于检测所述生物标志物的表达水平；和
/
或，所述表达水平为蛋白表达水平和
/
或
mRNA
转录水平；更优选地，所述试剂为与所述生物标志物特异性结合，或者与编码所述生物标志物的核酸特异性杂交的生物分子试剂；
进一步优选地，所述生物分子试剂选自引物
、
探针和抗体；进一步更优选地，所述试剂为用于转录组和
/
或蛋白质组测序的试剂
。6.
一种用于检测如权利要求1‑3中任一项所述的生物标志物组合的试剂在制备预测免疫治疗联合化疗治疗食管癌效果的制剂中的应用；其特征在于，所述免疫治疗联合化疗治疗为艾瑞卡联合紫杉醇
+
铂类的化疗；优选地，所述铂类为卡铂
。7.
一种试剂盒，所述试剂盒包含如权利要求5所述的试剂和
/
或如权利要求1‑3中任一项所述的生物标志物组合
。8.
一种预测免疫治疗联合化疗治疗食管癌效果的方法，其特征在于，所述方法包括检...

【专利技术属性】
技术研发人员：李明珠，
申请(专利权)人：上海爱谱蒂康生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：