用于体内检测的STARR-seq系统及其质粒骨架、文库和构建方法技术方案

本申请实施例的提供了一种用于体内检测的STARR

【技术实现步骤摘要】
用于体内检测的STARR
‑
seq系统及其质粒骨架、文库和构建方法


[0001]本专利技术涉及基因工程领域，具体涉及用于体内检测的STARR
‑
seq系统及其质粒骨架、文库和构建方法。

技术介绍

[0002]近年来，根据全基因组关联分析(英文Genome
‑
wide association study，简称GWAS)和选择进化分析的结果都发现，大量影响复杂性状的脱氧核糖核酸(英文DeoxyriboNucleic Acid，缩写为DNA)变异位点位于非编码调控区，因此遗传信息不仅在编码区，在非编码区也有值得深入挖掘研究。由此，解析非编区调控元件的功能，鉴定影响复杂性状的因果变异成为目前遗传研究的热点之一。在这个背景下，可以理解，增强子作为非编区调控元件中最重要的顺式调控原件之一，使得对增强子进行定位和定量研究以及位于增强子区的因果变异进行鉴定也就具有重要的研究意义。
[0003]STARR
‑
Seq(self
‑
transcribing active本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.用于生物体内检测的STARR
‑
seq系统的病毒质粒骨架，其特征在于，包括：5
’
ITR元件、3
’
ITR元件和具有ORI元件的基因表达框；其中，ORI元件位于所述5
’
ITR元件和所述3
’
ITR元件的外侧。2.根据权利要求1所述的用于生物体内检测的STARR
‑
seq系统的病毒质粒骨架，其特征在于，所述基因表达框还具有chemic intron元件、tGFP元件、ccbd元件和sv40 polyA signal元件，所述chemic intron元件、所述tGFP元件、所述ccbd元件和所述sv40 polyA signal元件插入所述5
’
ITR元件和所述3
’
ITR元件之间。3.根据权利要求1所述的用于生物体内检测的STARR
‑
seq系统的病毒质粒骨架，其特征在于，病毒质粒骨架为腺腺相关病毒质粒骨架。4.用于生物体内检测的STARR
‑
seq系统的STARR
‑
seq系统的病毒质粒文库，其特征在于，包括：权利要求1
‑
3任一所述的用于生物体内检测的STARR
‑
seq系统的病毒质粒骨架；和目的基因；其中，目的基因同源重组在所述病毒质粒骨架中。5.用于生物体内检测的STARR
‑
seq系统的质粒文库的构建方法，其特征在于，包括：获取权利要求1
‑
3任一所述的用于生物体内检测的STARR
‑
seq系统的病毒质粒骨架；将目的基因同源重组在病毒质粒骨架中，生成病毒质粒文库。6.根据权利要求5所述的病毒质粒文库的构建方法，其特征在于，将目的基因同源重组在病毒质粒骨架中，生成病毒质粒文库，包括：将用于生物体内检测的STARR
‑
seq系统的病毒质粒骨架切割成线性化质粒骨架；将待测的目的基因同源重组至线性化质粒骨架中，...

【专利技术属性】
技术研发人员：刘毓文，许令娜，郑伟刚，秦胜华，孙涛，张圆圆，陈畴霖，陈云，鲍泳舟，王震，
申请(专利权)人：中国农业科学院农业基因组研究所，
类型：发明
国别省市：