海岛棉高光效渐渗片段的分子标记及应用制造技术

本发明专利技术公开海岛棉高光效渐渗片段的分子标记及应用，涉及植物遗传育种及核酸鉴定技术领域；利用本发明专利技术所提供分子标记及其引物鉴定所构建的近等基因系是否存在海岛棉高光效渐渗片段，并进一步为研究渐渗系的高光效特性提供了理想材料，进一步应用于棉花分子育种，能极大地提高棉花光合效率，优化冠层结构，提高生物量和产量，并且本发明专利技术所提供的海岛棉高光效渐渗片段的

【技术实现步骤摘要】
海岛棉高光效渐渗片段的分子标记及应用


[0001]本专利技术公开分子标记和应用，涉及植物遗传育种及核酸鉴定
，具体地说是海岛棉高光效渐渗片段的分子标记及应用
。

技术介绍

[0002]光合作用是决定棉花产量的最关键因素，同时冠层结构的优化对提高棉花的群体光合速率具有重要意义
。
目前缺乏鉴定能提高棉花光合速率，又能同时优化棉花冠层结构的种质资源的方法，不利于对棉花进行优良育种，进而限制棉花产量提高
。

技术实现思路

[0003]本专利技术针对现有技术的问题，提供海岛棉高光效渐渗片段的分子标记及应用，通过本专利技术获得的分子标记可筛选高光效渐渗片段，用于获得优秀的种质资源，同时可对种质资源的高光效基因进行鉴定
。
[0004]本专利技术提出的具体方案是：
[0005]本专利技术提供海岛棉高光效渐渗片段，所述海岛棉高光效渐渗片段来自于海岛棉
pima10
‑
53
，通过
20
个
InDel
分子标记进行鉴定：
[0006]使用所述
20
个
InDel
分子标记引物扩增棉花基因组
DNA
，同时含有
20
个
InDel
分子标记位点的染色体片段为海岛棉高光效渐渗片段，所述
InDel
分子标记为
InD_U13_3、InD_U13_4、InD_U13_5、InD_U13_6、InD_U13_7、InD_U12_10、InD_U12_11、InD_U10_1、InD_U7_1、InD_U6_1、InD_U5_1、InD_U4_1、InD_U3_1、InD_U2_1、InD_U1_2、InD_D1_2、InD_D2_1、InD_D2_3、InD_D2_4
和
InD_D2_5
，所述
InDel
分子标记引物序列如下表：
[0007][0008]本专利技术还提供海岛棉高光效渐渗片段的分子标记引物，所述分子标记引物序列分别如下表：
[0009][0010]本专利技术还提供海岛棉高光效渐渗片段的分子标记，由所述的分子标记引物扩增形成
。
[0011]本专利技术还提供海岛棉高光效渐渗片段的分子标记数据库，包括所述的分子标记的数据
。
[0012]本专利技术还提供所述的分子标记引物
、
所述的分子标记和所述的分子标记数据库在制备鉴定具有高光效渐渗片段的棉花种质资源的试剂中的用途
。
[0013]本专利技术还提供一种试剂盒，包含所述海岛棉高光效渐渗片段的分子标记和
/
或所述海岛棉高光效渐渗片段的分子标记引物
。
[0014]进一步，所述的一种试剂盒，还包括所述海岛棉高光效渐渗片段的分子标记引物的
PCR
扩增体系所需试剂
。
[0015]本专利技术还提供所述的海岛棉高光效渐渗片段片段在增加棉花光合速率及优化棉花冠层结构育种中的应用
。
[0016]本专利技术还提供一种鉴定棉花种质资源具有海岛棉高光效渐渗片段的方法：
[0017]S1
：获取待鉴定棉花种质资源的
DNA
；
[0018]S2
：通过所述分子标记引物进行
PCR
扩增；
[0019]S3
：对
S2
获得的
PCR
扩增产物进行测序并与所述海岛棉高光效渐渗片段的分子标记数据库比对，匹配成功则待鉴定棉花种质资源具有海岛棉高光效渐渗片段
。
[0020]本专利技术的有益之处是：
[0021]可利用本专利技术所提供分子标记及其引物鉴定所构建的近等基因系是否存在海岛棉
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高光效渐渗片段，并进一步为研究渐渗系的高光效特性提供了理想材料，进一步应用于分子标记辅助选择棉花育种，可针对性选择含有海岛棉
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高光效渐渗片段的品系，缩短育种周期，加快优质新品种的培育进程，提高棉花光合效率，优化冠层结构，提高生物量和产量
。
附图说明
[0022]图1是本专利技术鉴定棉花种质资源具有海岛棉高光效渐渗片段的方法的流程示意图
。
[0023]图2是亚鸡脚叶品系
(LMY28S)
和常态叶品系
(LMY28N)
参数比较柱状示意图，图2中
A
显示净光合速率
Pn
比较结果
、B
显示群体光合速率
CAP
比较结果
、C
显示打顶前冠层叶面积系数
LAI
比较结果
、D
显示打顶后冠层叶面积系数
LAI
比较结果
、E
显示打顶前冠层透光率
PAR
比较结果
、F
显示打顶后冠层透光率
PAR
比较结果
、G
显示干物质积累量
Biomass
比较结果
、H
显示第一次收获籽棉产量
FHY
和总产量
TY
的比较结果
。
[0024]图3是高光效渐渗片段测序分析示意图，图中
A
显示
LMY28S
和
LMY28N
差异序列比对，
B
显示
LMY28S
中渐渗片段与
TM
‑1序列比对结果，
C
显示
LMY28S
中渐渗片段与
Hai7124
序列比对结果，
D
显示
LMY28S
中渐渗片段分别与
TM
‑1和
Hai7124
比对后差异位点的分布密度分析
。
基于测序结果证实
LMY28S
中高光效渐渗片段来自于海岛棉
。
[0025]图4是渐渗片段的
InDel
分子标记对
TM
‑
1(T)、LMY28N(N)、Hai7124(H)、LMY28S(S)
的扩增片段对照
。
基于分子标记的基因型，可明确渐渗片段所在基因组区间及高光效材料的基因型
。
具体实施方式
[0026]结合附图和具体实施例对本专利技术作进一步说明，以使本领域的技术人员可以更好地理解本专利技术并能予以实施，但所举实施例不作为对本专利技术的限定
。
[0027]结合具体实例对本专利技术作进一步说明时，以下实施例仅是为了解释本专利技术，在以下实施例中所用到的试验样本及试验过程如果未注明的实验具体条件，通常按照常规条件，或按照试剂公司所推本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.
海岛棉高光效渐渗片段，其特征是所述海岛棉高光效渐渗片段来自于海岛棉品系
pima10
‑
53
，通过
20
个
InDel
分子标记进行鉴定：使用所述
20
个
InDel
分子标记引物扩增棉花基因组
DNA
，同时含有
20
个
InDel
分子标记位点的染色体片段为海岛棉高光效渐渗片段，所述
InDel
分子标记为
InD_U13_3、InD_U13_4、InD_U13_5、InD_U13_6、InD_U13_7、InD_U12_10、InD_U12_11、InD_U10_1、InD_U7_1、InD_U6_1、InD_U5_1、InD_U4_1、InD_U3_1、InD_U2_1、InD_U1_2、InD_D1_2、InD_D2_1、InD_D2_3、InD_D2_4
和
InD_D2_5
，所述
InDel
分子标记引物序列如下表：
2.
海岛棉高光效渐渗片段的分子标记引物，其特征是所述分子标记引物序列分别如下表：
3.
海岛棉高光效渐...

【专利技术属性】
技术研发人员：姜辉，赵军胜，房健，高明伟，王秀丽，张超，柴启超，王永翠，王家宝，李艳丽，陈莹，刘晓艳，张晓明，
申请(专利权)人：新疆金博种业有限责任公司，
类型：发明
国别省市：