一种缘管浒苔的微卫星标记制造技术

缘管浒苔的爆发，影响重大，需判断目标区域缘管浒苔的生长状况，为此本发明专利技术提出一种缘管浒苔的微卫星标记

【技术实现步骤摘要】
一种缘管浒苔的微卫星标记、引物组及鉴定缘管浒苔家系的方法
[0001]

:
本专利技术涉及一种缘管浒苔的微卫星标记
、
引物组及鉴定缘管浒苔家系的方法，属于分子标记

。
[0002]
技术介绍

:
缘管浒苔又名长石莼，海白菜，海波菜，海青菜等
。
藻体黄绿色至深绿色
。
不分枝，披针形
、
线形或倒卵形，形状变化很大，并常呈螺旋状扭曲，边缘具波皱，基部逐渐变细，形成明显的柄部
。
生长在海湾内潮间带的岩石上或石沼中，生长在潮间带或在大干潮线附近岩石或石砾上，有时也附生在其他大型藻体上，晚春到夏季生长最旺盛
。
[0003]缘管浒苔虽然无毒，但是和赤潮一样，大量繁殖能遮蔽阳光，影响海底藻类的生长
。
缘管浒苔爆发还会严重影响景观，干扰旅游观光和水上运动的进行，这正是人们想要竭力消除的最大不利影响
。
缘管浒苔的生长需在人类可控的范围内，否则该物种的爆发将导致巨大的损害，因此需建立一种缘管浒苔的家系判定方法，来判断待测区域缘管浒苔的生长状况，根据判断结果可提前确定是否需控制该区域的缘管浒苔的生长
。
[0004]
技术实现思路

:
缘管浒苔的爆发，影响到海底藻类生长
、
景观，且干扰旅游观光和水上运动，需要判断待监测区域的缘管浒苔的生长状况，为缘管浒苔灾害的评判提供基础，对本专利技术为解决这个问题，提供了一种缘管浒苔的微卫星标记
、
引物组及鉴定缘管浒苔家系的方法，有助于快速准确的鉴别不同家系的缘管浒苔，进而判断缘管浒苔的生长状况，在评判缘管浒苔灾害中提供理论基础
。
[0005]本专利技术实现第一专利技术目的采用的技术方案为：一种缘管浒苔的微卫星标记，包括：
YGHT1、YGHT2、YGHT3、 YGHT4、 YGHT5、 YGHT6、 YGHT7、 YGHT8、YGHT9
和
YGHT10。
[0006]其中，所述的
YGHT1~ YGHT10
的核苷酸序列依次如
SEQ ID NO.1~10
所示
。
[0007]本专利技术实现第二专利技术目的采用的技术方案为：一种缘管浒苔的微卫星标记引物组，用于扩增以上技术方案所述的缘管浒苔的微卫星标记，所述的引物组包括：扩增
YGHT1
的引物对，包括：核苷酸序列如
SEQ ID NO.11
和
SEQ ID NO.12
所示的上
、
下游引物；扩增
YGHT2
的引物对，包括：核苷酸序列如
SEQ ID NO.13
和
SEQ ID NO.14
所示的上
、
下游引物；扩增
YGHT3
的引物对，包括：核苷酸序列如
SEQ ID NO.15
和
SEQ ID NO.16
所示的上
、
下游引物；扩增
YGHT4
的引物对，包括：核苷酸序列如
SEQ ID NO.17
和
SEQ ID NO.18
所示的上
、
下游引物；扩增
YGHT5
的引物对，包括：核苷酸序列如
SEQ ID NO.19
和
SEQ ID NO.20
所示的上
、
下游引物；扩增
YGHT6
的引物对，包括：核苷酸序列如
SEQ ID NO.21
和
SEQ ID NO.22
所示的
上
、
下游引物；扩增
YGHT7
的引物对，包括：核苷酸序列如
SEQ ID NO.23
和
SEQ ID NO.24
所示的上
、
下游引物；扩增
YGHT8
的引物对，包括：核苷酸序列如
SEQ ID NO.25
和
SEQ ID NO.26
所示的上
、
下游引物；扩增
YGHT9
的引物对，包括：核苷酸序列如
SEQ ID NO.27
和
SEQ ID NO.28
所示的上
、
下游引物；扩增
YGHT10
的引物对，包括：核苷酸序列如
SEQ ID NO.29
和
SEQ ID NO.30
所示的上
、
下游引物
。
[0008]本专利技术实现第三专利技术目的采用的技术方案为：一种鉴定缘管浒苔家系的方法，包括以下步骤：
S1、
采集待监测区域的缘管浒苔叶片样品并提取
DNA
；
S2、
应用以上技术方案中的引物组对步骤
S1
提取的缘管浒苔样品
DNA
进行双重
PCR
扩增，得到
PCR
扩增产物；
S3、
将步骤
S2
得到的
PCR
扩增产物进行电泳和银染，得到银染结果；
S4、
通过遗传分析软件分析步骤
S3
得到的银染结果，得到待测样品之间的遗传距离；
S5、
以步骤
S4
得到的遗传距离绘制
UPGMA
聚类分析图，根据聚类分析图得到：待鉴定家系区域的缘管浒苔的家系结果
。
[0009]本专利技术的有益效果是：（1）应用本专利技术的鉴定缘管浒苔家系的微卫星标记
、
引物组和方法，得到待监测区域缘管浒苔样品之间的亲缘关系，可判定待鉴定区域的缘管浒苔的遗传多样性；（2）并且通过亲缘关系结果可确定出繁殖能力较好的缘管浒苔家系，进而可以推测该区域缘管浒苔的繁殖力，为评判缘管浒苔灾害提供理论基础，并且可进一步根据推测结果确定是否需控制该区域缘管浒苔的繁殖；（3）本专利技术的鉴定缘管浒苔家系的方法可快速鉴定待监测区域的缘管浒苔样品的家系，与采样记录相比，家系结果一致，准确率高
。
附图说明
[0010]图
1 为本专利技术实施例中缘管浒苔样品遗传距离的
UPGMA
聚类分析图
。
[0011]具体实施方式：缘管浒苔微卫星标记开发：（1）利用本实验的缘管浒苔简化基因组数据进行分析，大规模筛查微卫星片段
。
利用软件
RIMER PREMIER 5.0 设计引物，设计条件为：引物长度为
17
‑
24bp
，
GC
含量在
40
‑
60%
之间，扩增目的片段长度在
100
‑
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.
一种缘管浒苔的微卫星标记，其特征在于，所述缘管浒苔的微卫星标记包括：
YGHT1、YGHT2、YGHT3、 YGHT4、 YGHT5、 YGHT6、 YGHT7、 YGHT8、YGHT9
和
YGHT10 ；所述的
YGHT1~ YGHT10
的核苷酸序列依次如
SEQ ID NO.1~10
所示
。2.
一种缘管浒苔的微卫星标记引物组，用于扩增权利要求1所述的缘管浒苔的微卫星标记，其特征在于，所述的引物组包括：扩增
YGHT1
的引物对，包括：核苷酸序列如
SEQ ID NO.11
和
SEQ ID NO.12
所示的上
、
下游引物；扩增
YGHT2
的引物对，包括：核苷酸序列如
SEQ ID NO.13
和
SEQ ID NO.14
所示的上
、
下游引物；扩增
YGHT3
的引物对，包括：核苷酸序列如
SEQ ID NO.15
和
SEQ ID NO.16
所示的上
、
下游引物；扩增
YGHT4
的引物对，包括：核苷酸序列如
SEQ ID NO.17
和
SEQ ID NO.18
所示的上
、
下游引物；扩增
YGHT5
的引物对，包括：核苷酸序列如
SEQ ID NO.19
和
SEQ ID NO.20
所示的上
、
下游引物；扩增
YGHT6
的引物对，包括：核苷酸序列如
SEQ ID NO.21
和
SEQ ID NO.22
所示的上
、
下游引物；扩增
YGHT7
的引物对，包括：核苷酸序列如
SEQ ID NO.23
和
SEQ ID NO.24
所示的上
、
下游引物；扩增
YGHT8
的引物对，包括：核苷酸序列如
SEQ ID NO.25
和
SEQ ID NO.26
所示的上
、
下游引物；扩增
YGHT9
的引物对，包括：核苷酸序列如
SEQ ID NO.27
和
SEQ ID NO.28
所示的上
、
下游引物；扩增
YGHT10
的引物对，包括：核苷酸序列如
SEQ ID NO.29
和
SEQ ID NO.30
所示的上
、
下游引物
。3.
一种鉴定缘管浒苔家系的方法，其特征在于，所述的鉴定缘管浒苔家系的方法包括以下步骤：
S1、
采集待监测区域的缘管浒...

【专利技术属性】
技术研发人员：孙滔滔，宋江腾，高薇，庞伟程，廖国威，李婷婷，王利平，赵尚飞，张华怡乐，冯杰，田勇，张晓鑫，林健，唐天均，李梦婷，
申请(专利权)人：深圳市芦苇生态环境科技服务有限公司，
类型：发明
国别省市：