脓毒症诊断模型构建方法、化合物筛选方法及电子设备技术

技术编号:39303049 阅读:10 留言:0更新日期:2023-11-12 15:53
本申请提供一种脓毒症诊断模型构建方法、化合物筛选方法及电子设备,所述脓毒症诊断模型构建方法包括:获取脓毒症基因表达数据集及衰老基因数据集;根据基因本体富集分析和京都基因与基因组百科全书富集分析对所述脓毒症基因表达数据集和所述衰老基因数据集进行分析,以获取脓毒症相关基因;应用套索回归分析以及支持向量机对所述脓毒症相关基因进行分析,以获取脓毒症相关枢纽基因;根据多因素逻辑回归及所述脓毒症相关枢纽基因构建脓毒症诊断模型。该脓毒症诊断模型构建方法能够从大量基因中筛选出与脓毒症发展密切相关的核心基因,并根据这些基因构建脓毒症诊断模型,该脓毒症诊断模型在脓毒症的发病机制和临床表现中发挥着重要作用。现中发挥着重要作用。现中发挥着重要作用。

【技术实现步骤摘要】
脓毒症诊断模型构建方法、化合物筛选方法及电子设备


[0001]本申请涉及健康监测
,尤其涉及一种脓毒症诊断模型构建方法、化合物筛选方法及电子设备。

技术介绍

[0002]脓毒症是一种严重的感染导致的综合征,其影响深远而致命。脓毒症引发的全身性炎症反应可以导致血压下降、组织器官损害以及多器官功能障碍综合征(MODS)。由于脓毒症早期症状常常模糊,很难及时准确地诊断,因此患者往往在病情严重时才寻求治疗,导致治疗时机的延误。
[0003]目前广泛使用的诊断标准脓毒症

3虽然有一定的准确性,但其涉及多个系统的检查,所需时间较长,可能导致治疗延误,影响患者的预后。

技术实现思路

[0004]有鉴于此,有必要提供一种脓毒症诊断模型构建方法、化合物筛选方法及电子设备,能够至少克服以上缺陷之一。
[0005]第一方面,本申请实施例提供一种脓毒症诊断模型构建方法,所述脓毒症诊断模型构建方法包括:获取脓毒症基因表达数据集及衰老基因数据集;根据基因本体富集分析和京都基因与基因组百科全书富集分析对所述脓毒症基因表达数据集和所述衰老基因数据集进行分析,以获取脓毒症相关基因;应用套索回归分析以及支持向量机对所述脓毒症相关基因进行分析,以获取脓毒症相关枢纽基因;根据多因素逻辑回归及所述脓毒症相关枢纽基因构建脓毒症诊断模型。
[0006]根据本申请的一个实施例,在所述获取脓毒症基因表达数据集及衰老基因数据集之后,还包括:应用微阵列数据线性模型对所述脓毒症基因表达数据集进行处理,以使所述脓毒症基因表达数据集的表达矩阵实现标准化以及归一化。
[0007]根据本申请的一个实施例,所述对所述脓毒症基因表达数据集进行分析,以获取脓毒症相关基因,包括:根据加权基因共表达网络分析处理所述脓毒症基因表达数据集,以获取所述脓毒症相关基因,所述脓毒症相关基因包括与脓毒症正相关的基因以及与脓毒症负相关的基因。
[0008]根据本申请的一个实施例,所述脓毒症诊断模型构建方法,还包括:获取脓毒症基因表达验证集;根据所述脓毒症基因表达验证集验证所述脓毒症诊断模型。
[0009]根据本申请的一个实施例,所述脓毒症相关枢纽基因,包括:BCL6,ETS1,ETS2,FOS,MAPK14及MYC。
[0010]第二方面,本申请实施例提供一种化合物筛选方法,包括:获取丹参中的主要化合物;根据所述主要化合物获取靶向蛋白;获取所述靶向蛋白对应的基因;获取根据第一方面所述的脓毒症诊断模型构建方法构建的脓毒症诊断模型;根据所述脓毒症诊断模型获取脓毒症相关枢纽基因;根据所述靶向蛋白对应的基因及所述脓毒症相关枢纽基因获取丹参中
与脓毒症相关的共同基因;根据所述共同基因获取丹参中与脓毒症相关的脓毒症相关化合物。
[0011]根据本申请的一个实施例,所述共同基因包括:MYC、FOS及MAPK14。
[0012]根据本申请的一个实施例,所述脓毒症相关化合物包括:异丹参酮I、乌尔梅酸、二氢乌尔梅酮、丹参新醌B、丹参新醌A、2

(4

羟基
‑3‑
甲氧基苯基)
‑5‑
(3

羟丙基)
‑7‑
甲氧基
‑3‑
苯并呋喃甲醛、丹参酮IIA及甲基迷迭香酸。
[0013]根据本申请的一个实施例,所述化合物筛选方法还包括:应用所述脓毒症相关化合物中的至少一种制备用于治疗脓毒症的化合物。
[0014]第三方面,本申请实施例提供一种电子设备,包括:处理器;用于存储处理器可执行指令的存储器;其中,所述处理器被配置为执行所述指令时实现如第一方面所述的脓毒症诊断模型构建方法或者如第二方面所述的化合物筛选方法。
[0015]本申请实施方式提供的脓毒症诊断模型构建方法、化合物筛选方法及电子设备,能够从大量基因中筛选出与脓毒症发展密切相关的核心基因,并根据这些基因构建脓毒症诊断模型,该脓毒症诊断模型在脓毒症的发病机制和临床表现中发挥着重要作用,对于早期诊断和预后评估具有重要意义。
附图说明
[0016]图1为本申请一实施例提供的脓毒症诊断模型构建方法流程图。
[0017]图2为本申请一实施例提供的聚类模块参数示意图。
[0018]图3a为本申请一实施例提供的京都基因与基因组百科全书富集分析基因本体富集分析示意图。
[0019]图3b为本申请另一实施例提供的京都基因与基因组百科全书富集分析基因本体富集分析示意图。
[0020]图4为本申请一实施例提供的蛋白质

蛋白质网络示意图。
[0021]图5为本申请一实施例提供的核心网络示意图。
[0022]图6为本申请一实施例提供的套索分析示意图。
[0023]图7为本申请一实施例提供的韦恩图示意图。
[0024]图8为本申请一实施例提供的脓毒症诊断模型示意图。
[0025]图9为本申请一实施例提供的化合物筛选方法流程示意图。
[0026]图10为本申请另一实施例提供的韦恩图示意图。
[0027]图11为本申请一实施例提供的化合物网络示意图。
[0028]图12为本申请一实施例提供的电子设备示意图。
[0029]主要元件符号说明:20

电子设备;21

处理器;22

存储器。
具体实施方式
[0030]下面将结合本申请实施方式中的附图,对本申请实施方式中的技术方案进行清楚、完整地描述,显然,所描述的实施方式是本申请一部分实施方式,而不是全部的实施方式。
[0031]需要说明的是,本申请实施例中“至少一个”是指一个或者多个,多个是指两个或
两个以上。除非另有定义,本文所使用的所有的技术和科学术语与属于本申请中的
的技术人员通常理解的含义相同。本申请的说明书中所使用的术语只是为了描述具体的实施例的目的,不是旨在于限制本申请。
[0032]需要说明的是,本申请实施例中,“第一”、“第二”等词汇,仅用于区分描述的目的,而不能理解为指示或暗示相对重要性,也不能理解为指示或暗示顺序。限定有“第一”、“第二”的特征可以明示或者隐含地包括一个或者更多个所述特征。在本申请实施例的描述中,“示例性的”或者“例如”等词用于表示作例子、例证或说明。本申请实施例中被描述为“示例性的”或者“例如”的任何实施例或设计方案不应被解释为比其它实施例或设计方案更优选或更具优势。确切而言,使用“示例性的”或者“例如”等词旨在以具体方式呈现相关概念。
[0033]基于本申请中的实施方式,本领域普通技术人员在没有付出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施方式,都是属于本申请保护的范围。
[0034]脓毒症是一种严重的感染导致的综合征,其影响深远而致命。脓毒症引发的全身性炎症反应可以导致血压下降、组织器官损害以及多器官功能障碍综合征(MODS)。由于脓本文档来自技高网
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种脓毒症诊断模型构建方法,其特征在于,所述脓毒症诊断模型构建方法包括:获取脓毒症基因表达数据集及衰老基因数据集;根据基因本体富集分析和京都基因与基因组百科全书富集分析对所述脓毒症基因表达数据集和所述衰老基因数据集进行分析,以获取脓毒症相关基因;应用套索回归分析以及支持向量机对所述脓毒症相关基因进行分析,以获取脓毒症相关枢纽基因;根据多因素逻辑回归及所述脓毒症相关枢纽基因构建脓毒症诊断模型。2.如权利要求1所述的脓毒症诊断模型构建方法,其特征在于,在所述获取脓毒症基因表达数据集及衰老基因数据集之后,还包括:应用微阵列数据线性模型对所述脓毒症基因表达数据集进行处理,以使所述脓毒症基因表达数据集的表达矩阵实现标准化以及归一化。3.如权利要求2所述的脓毒症诊断模型构建方法,其特征在于,所述根据基因本体富集分析和京都基因与基因组百科全书富集分析对所述脓毒症基因表达数据集和所述衰老基因数据集进行分析,以获取脓毒症相关基因,包括:根据加权基因共表达网络分析处理所述脓毒症基因表达数据集,以获取所述脓毒症相关基因,所述脓毒症相关基因包括与脓毒症正相关的基因以及与脓毒症负相关的基因。4.如权利要求3所述的脓毒症诊断模型构建方法,其特征在于,所述脓毒症诊断模型构建方法,还包括:获取脓毒症基因表达验证集;根据所述脓毒症基因表达验证集验证所述脓毒症诊断模型。5.如权利要求1所述的脓毒症诊断模型构建方法,其特征在于,所述脓毒症相关枢纽基因,包括:BCL6,ETS1,ETS2,FOS,MAPK14及MYC。6.一种化...

【专利技术属性】
技术研发人员:胡亚惠郑泽茂葛静
申请(专利权)人:南方医科大学南方医院
类型:发明
国别省市:

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