诱导型细胞死亡系统技术方案

本文提供了用于以受调控的方式，例如在安全开关系统中诱导细胞死亡的组合物和方法。诱导型细胞死亡可由配体与一个或多个配体结合结构域结合而触发。细胞死亡可包括诱导细胞凋亡。亡。亡。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】诱导型细胞死亡系统
[0001]相关申请的交叉引用
[0002]本申请要求2020年11月20日提交的美国临时申请第63/116,433号的权益，该临时申请特此通过引用整体并入用于所有目的。
[0003]序列表
[0004]本申请含有序列表，该序列表已经由EFS
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Web提交并特此通过引用整体并入。所述ASCII副本创建于20XX年XX月XX日，命名为XXXXXUS_sequencelisting.txt，大小为X,XXX,XXX字节。

技术介绍

[0005]当前可用的细胞和基因疗法产品可能缺乏控制，这可能导致安全性问题，诸如在接受这些疗法的受试者中产生毒性。因此，需要控制和调节这些疗法的其他方法。

技术实现思路

[0006]本文公开了可用于以受调控的方式，例如在安全开关系统中诱导细胞死亡的诱导型细胞死亡系统。
[0007]在一些方面，本公开提供了一种诱导型细胞死亡系统，所述诱导型细胞死亡系统包含两个或更多个多肽单体，其中每个多肽单体包含一个或多个配体结合结构域和细胞死亡诱导结构域，其中所述多肽单本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种诱导型细胞死亡系统，所述诱导型细胞死亡系统包含两个或更多个多肽单体，其中每个多肽单体包含一个或多个配体结合结构域和细胞死亡诱导结构域，其中所述多肽单体构造为在使所述多肽单体与所述一个或多个配体结合结构域的同源配体接触时寡聚化并在表达所述多肽单体的细胞中产生细胞死亡诱导信号，并且其中：所述两个或更多个多肽单体中的每一个多肽单体的所述一个或多个配体结合结构域包括选自由以下组成的组的结构域或其功能片段：任选地包含SEQ ID NO:31的氨基序列的ABI结构域；任选地包含SEQ ID NO:53的氨基酸序列的PYL结构域；任选地包含SEQ ID NO:33的氨基酸序列的咖啡因结合单结构域抗体；任选地包含选自由SEQ ID NO:34、35、36、37和38组成的组的氨基酸序列的大麻二酚结合结构域；任选地包含SEQ ID NO:42的氨基酸序列的雌激素受体(ER)结构域的激素结合结构域；任选地包含SEQ ID NO:50的氨基酸序列的抗尼古丁抗体的重链可变区(VH)，和/或任选地包含氨基SEQ ID NO:51的氨基酸序列的抗尼古丁抗体的轻链可变区(VL)；任选地包含SEQ ID NO:43的氨基酸序列的FKBP结构域；和任选地包含SEQ ID NO:52的氨基酸序列的孕酮受体结构域；或者所述两个或更多个多肽单体中的第一多肽单体的所述一个或多个配体结合结构域包含任选地包含SEQ ID NO:43的氨基酸序列的FKBP结构域，并且所述两个或更多个多肽单体中的第二多肽单体的所述一个或多个配体结合结构域包含任选地包含SEQ ID NO:44的氨基酸序列的FRB结构域；或者所述两个或更多个多肽单体中的第一多肽单体的所述一个或多个配体结合结构域包含任选地包含SEQ ID NO:127和129之一列出的氨基酸序列的小脑蛋白结构域，并且所述两个或更多个多肽单体中的第二多肽单体的所述一个或多个配体结合结构域包含任选地包含SEQ ID NO:131和133之一列出的氨基酸序列的降解决定子，并且任选地其中所述细胞死亡诱导结构域源自于选自由以下组成的组的蛋白质：半胱天冬酶3、半胱天冬酶6、半胱天冬酶7、半胱天冬酶8、半胱天冬酶9、白喉毒素片段A(DTA)、Bax、Bak、Bok、Bad、Bcl
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xS，Bak、Bik、Bcl
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2相互作用蛋白3(BNIP3)、Fas、Fas相关死亡结构域蛋白(FADD)、肿瘤坏死因子受体1型相关死亡结构域蛋白(TRADD)、TNF受体(TNF
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R)、APAF
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1、颗粒酶B、第二线粒体来源的半胱天冬酶激活因子(SMAC)、Omi、Bmf、Bid、Bim、p53上调凋亡调节因子(PUMA)、Noxa、Blk、Hrk、细胞色素c、Arts、TNF相关细胞死亡诱导配体(TRAIL)、单纯疱疹病毒胸苷激酶(HSV
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TK)、水痘
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带状疱疹病毒胸苷激酶(VZV
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TK)、病毒刺突蛋白、羧基酯酶、胞嘧啶脱氨酶、硝基还原酶Fksb、羧肽酶G2、羧肽酶A、辣根过氧化物酶、亚麻苦苷酶、肝细胞色素P450
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2B1和嘌呤核苷磷酸化酶，任选地其中所述半胱天冬酶9或其功能性截短包含SEQ ID NO:39的氨基酸序列：任选地其中所述DTA包含SEQ ID NO:41的氨基酸序列，任选地其中所述颗粒酶B包含SEQ ID NO:47的氨基酸序列，任选地其中所述Bax包含SEQ ID NO:32的氨基酸序列。2.如权利要求1所述的诱导型细胞死亡系统，其中每个多肽单体包含相同的配体结合结构域，任选地其中每个多肽单体包含：FKBP结构域，任选地其中所述同源配体是FK1012、其衍生物或其类似物；或者ABI结构域和PYL结构域，任选地其中所述同源配体是脱落酸；或者包含SEQ ID NO:34的氨基酸序列的第一大麻二酚结合结构域，和包含选自由SEQ ID NO:35、36、37和38组成的组的氨基酸序列的第二大麻二酚结合结构域，任选地其中所述同
源配体是植物大麻素，任选地所述植物大麻素是大麻二酚；或者雌激素受体(ER)结构域的激素结合结构域和FKBP结构域，任选地其中所述同源配体是雷帕霉素或其衍生物或其类似物和/或他莫昔芬或其代谢物，任选地其中所述他莫昔芬代谢物选自由以下组成的组：4
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羟基他莫昔芬、N
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去甲基他莫昔芬、他莫昔芬
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N
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氧化物和因多昔芬；两个咖啡因结合单结构域抗体，任选地其中每个咖啡因结合单结构域抗体包含SEQ ID NO:33的氨基酸序列，任选地其中所述同源配体是咖啡因或其衍生物；或者包含SEQ ID NO:52的氨基酸序列的第一孕酮受体结构域，和包含SEQ ID NO:52的氨基酸序列的第二孕酮受体结构域，任选地其中所述同源配体是米非司酮或其衍生物，任选地其中所述多肽单体构造为在与所述同源配体接触时形成同源寡聚体，并且任选地其中所述同源寡聚体包括同源二聚体。3.如权利要求1所述的诱导型细胞死亡系统，其中第一多肽单体包含第一配体结合结构域并且第二多肽单体包含第二配体结合结构域，任选地其中：所述第一单体包含FKBP结构域并且所述第二单体包含FRB结构域，任选地其中所述同源配体是雷帕霉素或其衍生物；或者所述第一多肽单体包含雌激素受体(ER)结构域的激素结合结构域并且所述第二多肽单体包含FKBP结构域，任选地其中所述同源配体是雷帕霉素或其衍生物和/或他莫昔芬或其代谢物；或者所述第一多肽单体包含FRB结构域并且所述第二多肽单体包含雌激素受体(ER)结构域的激素结合结构域，任选地其中所述同源配体是雷帕霉素或其衍生物和/或他莫昔芬或其代谢物；或者其中所述第一多肽单体包含雌激素受体(ER)结构域的激素结合结构域和FKBP结构域，并且所述第二多肽单体包含FRB结构域和雌激素受体(ER)结构域的激素结合结构域，任选地其中所述同源配体是雷帕霉素或其衍生物和/或他莫昔芬或其代谢物；或者所述第一多肽单体包含ABI结构域并且所述第二多肽单体包含PYL结构域，任选地其中所述同源配体包含脱落酸；或者所述第一多肽单体包含抗尼古丁抗体的重链可变区(VH)并且所述第二多肽单体包含抗尼古丁抗体的轻链可变区(VL)，任选地其中所述抗尼古丁抗体是Nic12抗体，任选地其中所述VH包含SEQ ID NO:50的氨基酸序列，并且任选地其中所述VL包含SEQ ID NO:51的氨基酸序列，并且任选地其中所述同源配体是尼古丁或其衍生物；或者所述第一多肽单体包含含有选自由SEQ ID NO:35、36、37和38组成的组的氨基酸序列的大麻二酚结合结构域，并且所述第二多肽单体包含含有SEQ ID NO:34的氨基酸序列的大麻二酚结合结构域，任选地其中所述同源配体是植物大麻素，任选地其中所述植物大麻素是大麻二酚；或者所述第一多肽单体包含含有SEQ ID NO:127和129之一列出的氨基酸序列的小脑蛋白结构域并且所述第二多肽单体包含含有SEQ ID NO:131和133之一列出的氨基酸序列的降解决定子结构域，任选地其中所述同源配体是IMiD，任选地其中所述IMiD是FDA批准的药物，并且任选地其中所述IMiD选自由以下组成的组：沙利度胺、来那度胺和泊马度胺，任选地其中所述多肽单体构造为在与所述同源配体接触时形成异源寡聚体，并且任选
地其中所述异源寡聚体包括异源二聚体。4.如权利要求1
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3中任一项所述的诱导型细胞死亡系统，其中所述两个或更多个多肽单体中的至少一个多肽单体还包含位于每个配体结合结构域和细胞死亡诱导结构域之间的接头，任选地其中所述接头包含选自由以下组成的组的氨基酸序列：GGGGSGGGGSGGGGSVDGF(SEQ ID NO:101)和ASGGGGSAS(SEQ ID NO:102)，任选地其中每个多肽单体还包含位于每个配体结合结构域和细胞死亡诱导结构域之间的接头。5.一种诱导型细胞死亡系统，所述诱导型细胞死亡系统包含条件激活控制多肽(ACP)，其中所述ACP包含配体结合结构域和转录效应子结构域，并且其中在所述配体结合结构域与同源配体结合时，所述ACP能够调节可操作地连接至ACP反应性启动子的目标基因的转录表达，其中所述目标基因包含细胞死亡诱导多肽，并且任选地其中所述配体结合结构域包含降解决定子，任选地其中所述降解决定子能够诱导所述ACP的降解，并且任选地其中所述降解决定子选自由以下组成的组：HCV NS4降解决定子、PEST(人IκBα的残基277
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307的两个拷贝)、GRR(人类p105的残基352
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408)、DRR(酵母Cdc34的残基210
‑
295)、SNS(SP2和NB的串联重复序列(甲型流感或乙型流感的SP2
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NB
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SP2)、RPB(酵母RPB残基1688
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1702的四个拷贝)、SPmix(SP1和SP2的串联重复序列(甲型流感病毒M2蛋白的SP2
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SP1
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SP2
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SP1
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SP2)、NS2(甲型流感病毒NS蛋白的残基79
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93的三个拷贝)、ODC(鸟氨酸脱羧酶的残基106
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142)、Nek2A、小鼠ODC(残基422
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461)、小鼠ODC_DA(mODC的残基422
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461，包括D433A和D434A点突变)、APC/C降解决定子、COP1 E3连接酶结合降解决定子基序、CRL4
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Cdt2结合PIP降解决定子、actinfilin结合降解决定子、KEAP1结合降解决定子、KLHL2和KLHL3结合降解决定子、MDM2结合基序、N
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降解决定子、缺氧信号传导中的羟脯氨酸修饰、植物激素依赖性SCF
‑
LRR结合降解决定子、SCF泛素连接酶结合磷酸降解决定子、植物激素依赖性SCF
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LRR结合降解决定子、DSGxxS磷酸依赖性降解决定子、Siah结合基序、SPOP SBC对接基序和PCNA结合PIP盒，或所述降解决定子包含小脑蛋白(CRBN)多肽底物结构域，所述结构域能够响应于免疫调节药物(IMiD)结合CRBN，从而促进泛素途径介导的所述可调控多肽的降解，任选地其中所述CRBN多肽底物结构域选自由以下组成的组：IKZF1、IKZF3、CKla、ZFP91、GSPT1、MEIS2、GSS E4F1、ZN276、ZN517、ZN582、ZN653、ZN654、ZN692、ZN787和ZN827，或其能够进行药物诱导CRBN结合的片段，任选地其中所述CRBN多肽底物结构域是天然CRBN多肽序列的嵌合融合产物，任选地其中所述CRBN多肽底物结构域是IKZF3/ZFP91/IKZF3嵌合融合产物，具有氨基酸序列FNVLMVHKRSHTGERPLQCEICGFTCRQKGNLLRHIKLHTGEKPFKCHLC NYACQRRDAL(SEQ ID NO:103)。6.一种诱导型细胞死亡系统，所述诱导型细胞死亡系统包含条件激活控制多肽(ACP)，其中所述ACP包含一个或多个配体结合结构域及包含核酸结合结构域和转录效应子结构域的转录因子，其中所述ACP在所述配体结合结构域与同源配体结合时经历核定位，并且其中当定位于细胞核时，所述ACP能够诱导可操作地连接至ACP反应性启动子的目标基因的转录表达，其中所述目标基因包含细胞死亡诱导结构域，
任选地其中所述转录效应子结构域选自由以下组成的组：单纯疱疹病毒蛋白16(VP16)激活结构域；包含VP16的四个串联拷贝的激活结构域、VP64激活结构域；NFκB的p65激活结构域；爱泼斯坦
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巴尔病毒R反式激活因子(Rta)激活结构域；包含VP64、p65和Rta激活结构域(VPR激活结构域)的三元激活因子；包含VP64、p65和HSF1激活结构域(VPH激活结构域)的三元激活因子；人E1A相关蛋白p300的组蛋白乙酰转移酶(HAT)核心结构域(p300 HAT核心激活结构域)；Kr
ü
ppel相关盒(KRAB)阻遏结构域；阻遏因子元件沉默转录因子(REST)阻遏结构域；毛发相关的基本螺旋
‑
环
‑
螺旋阻遏蛋白的WRPW基序，所述基序称为WRPW阻遏结构域；DNA(胞嘧啶
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5)
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甲基转移酶3B(DNMT3B)阻遏结构域；和HP1α染色体阴影阻遏结构域，并且任选地其中所述配体结合结构域包含：雌激素受体(ER)结构域的激素结合结构域，任选地包含SEQ ID NO:42的氨基酸序列，任选地其中所述同源配体是他莫昔芬或其代谢物，并且任选地其中所述他莫昔芬代谢物选自由以下组成的组：4
‑
羟基他莫昔芬、N
‑
去甲基他莫昔芬、他莫昔芬
‑
N
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氧化物和因多昔芬；或孕酮受体结构域，任选地包含SEQ ID NO:52的氨基酸序列，并且任选地其中所述同源配体是米非司酮或其衍生物，任选地其中：所述两个或更多个多肽单体中的每一个多肽单体的所述一个或多个配体结合结构域包含选自由以下组成的组的结构域或其功能片段：ABI结构域，任选地包含SEQ ID NO:31的氨基酸序列，并且任选地其中所述同源配体是脱落酸；PYL结构域，任选地包含SEQ ID NO:53的氨基酸序列，并且任选地其中所述同源配体是脱落酸；咖啡因结合单结构域抗体，任选地包含SEQ ID NO:33的氨基酸序列，并且任选地其中所述同源配体是咖啡因或其衍生物；大麻二酚结合结构域，任选地包含选自由SEQ ID NO:34、35、36、37和38组成的组的氨基酸序列，任选地其中所述同源配体是植物大麻素，任选地其中所述植物大麻素是大麻二酚；雌激素受体(ER)结构域的激素结合结构域，任选地包含SEQ ID NO:42的氨基酸序列，任选地其中所述同源配体是他莫昔芬或其代谢物，并且任选地其中所述他莫昔芬代谢物选自由以下组成的组：4
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羟基他莫昔芬、N
‑
去甲基他莫昔芬、他莫昔芬
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N
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氧化物和因多昔芬；抗尼古丁抗体的重链可变区(VH)，任选地包含SEQ ID NO:50的氨基酸序列，并且任选地其中所述同源配体是尼古丁或其衍生物；抗尼古丁抗体的轻链可变区(VL)，任选地包含SEQ ID NO:51的氨基酸序列，并且任选地其中所述同源配体是尼古丁或其衍生物；孕酮受体结构域，任选地包含SEQ ID NO:52的氨基酸序列，并且任选地其中所述同源配体是米非司酮或其衍生物；FRB结构域，任选地包含SEQ ID NO:44的氨基酸序列，并且任选地其中所述同源配体是雷帕霉素、AP1903、AP20187、FK1012、其衍生物或其类似物；或者所述两个或更多个多肽单体中的第一多肽单体的所述一个或多个配体结合结构域包含任选地包含SEQ ID NO:43的氨基酸序列的FKBP结构域，并且所述两个或更多个多肽单体中的第二多肽单体的所述一个或多个配体结合结构域包含任选地包含SEQ ID NO:44的氨基酸序列的FRB结构域；任选地其中所述同源配体是雷帕霉素、AP1903、AP20187、FK1012、其衍生物或其类似物；或者所述两个或更多个多肽单体中的第一多肽单体的所述一个或多个配体结合结构域包含任选地包含SEQ ID NO:127和129之一列出的氨基酸序列的小脑蛋白结构域，并且所述两个或更多个多肽单体中的第二多肽单体的所述一个或多个配体结合结构域包含任选地包
含SEQ ID NO:131和133之一列出的氨基酸序列的降解决定子，任选地其中所述同源配体是IMiD，任选地其中所述IMiD是FDA批准的药物，并且任选地其中所述IMiD选自由以下组成的组：沙利度胺、来那度胺和泊马度胺，任选地其中所述核酸结合结构域包含DNA结合锌指蛋白结构域(ZF蛋白结构域)，任选地其中所述ZF蛋白结构域在设计上是模块化的并且由一系列锌指基序组成，任选地其中所述ZF蛋白结构域包含一至十个锌指基序，任选地其中所述目标基因是细胞死亡诱导多肽，任选地其中所述细胞死亡诱导结构域源自于选自由以下组成的组的蛋白质：半胱天冬酶3、半胱天冬酶6、半胱天冬酶7、半胱天冬酶8、半胱天冬酶9、白喉毒素片段A(DTA)、Bax、Bak、Bok、Bad、Bcl
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xS，Bak、Bik、Bcl
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2相互作用蛋白3(BNIP3)、Fas、Fas相关死亡结构域蛋白(FADD)、肿瘤坏死因子受体1型相关死亡结构域蛋白(TRADD)、TNF受体(TNF
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R)、APAF
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1、颗粒酶B、第二线粒体来源的半胱天冬酶激活因子(SMAC)、Omi、Bmf、Bid、Bim、p53上调凋亡调节因子(PUMA)、Noxa、Blk、Hrk、细胞色素c、Arts、TNF相关细胞死亡诱导配体(TRAIL)、单纯疱疹病毒胸苷激酶(HSV
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TK)、水痘
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带状疱疹病毒胸苷激酶(VZV
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TK)、病毒刺突蛋白、羧基酯酶、胞嘧啶脱氨酶、硝基还原酶Fksb、羧肽酶G2、羧肽酶A、辣根过氧化物酶、亚麻苦苷酶、肝细胞色素P450
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2B1和嘌呤核苷磷酸化酶，任选地其中所述半胱天冬酶9或其功能性截短包含SEQ ID NO:39的氨基酸序列：任选地其中所述DTA包含SEQ ID NO:41的氨基酸序列，任选地其中所述颗粒酶B包含SEQ ID NO:47的氨基酸序列，任选地其中所述Bax包含SEQ ID NO:32的氨基酸序列。7.一种诱导型细胞死亡系统，所述诱导型细胞死亡系统包含工程化的可调控细胞存活多肽，所述细胞存活多肽包含促存活多肽和异源配体结合结构域，其中在所述配体结合结构域与同源配体结合时，所述同源配体抑制所述促存活多肽，任选地其中所述促存活多肽选自由以下组成的组：XIAP、经修饰的XIAP、Bcl
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2、Bcl
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xL、Bcl
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w、Bcl
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2相关蛋白A1(BCL2A1)、Mcl
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1、FLICE样抑制蛋白(c
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【专利技术属性】
技术研发人员：张睿泽，R，
申请(专利权)人：森迪生物科学公司，
类型：发明
国别省市：