一种利福平耐药结核的代谢标志物的筛选及应用制造技术

本发明专利技术属于生物技术领域，具体涉及一种利福平耐药结核病的尿液代谢标志物的筛选及应用，所述尿液代谢标志物共20种，经验证后所述20种代谢物的水平变化确实与利福平耐药结核相关，本发明专利技术还提供一种利福平耐药结核代谢标志物的筛选方法、诊断利福平耐药结核疾病的检测试剂盒和利福平耐药结核疾病诊断的模型。本发明专利技术采用筛选得到的20种尿液代谢标志物进行利福平耐药结核检测具有较高的准确性，对于利福平耐药结核的诊断具有重要意义。福平耐药结核的诊断具有重要意义。

【技术实现步骤摘要】
一种利福平耐药结核的代谢标志物的筛选及应用


[0001]本专利技术属于生物
，具体涉及一种利福平耐药结核病的代谢标志物的筛选及应用。

技术介绍

[0002]结核病(tuberculosis，TB)是由结核分枝杆菌引起的慢性消耗性人畜共患病，也是全球致死性疾病之一。近年来，快速分子检测技术的应用显著提高了结核病的诊断效能。提前筛选和鉴别耐药或敏感型结核病并及时诊治，是当前有效控制结核病传播的重要手段。
[0003]现阶段，耐药结核的诊断基于表型培养的检测方法敏感度不高、耗时较长，尚需严格的微生物安全防御措施；分子生物学检测技术如核酸扩增检测技术(GeneXpert MTB/RIF、GeneXpert MTB/RIF Ultra、Xpert MTB/XDR)、线性探针技术、基因测序技术、Truenat技术、MTB游离DNA(MTB cell
‑
free DNA，MTB
‑
cfDNA)检测技术、基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix
‑
assisted laser desorption ionization
‑
time offlight mass spectrometry，MALDI
‑
TOF MS)检测技术等虽具有高效，快速，特异，敏感等特点，但也存在不足之处。核酸扩增检测结果临床医师需进行综合评估，警惕假阳性；基因测序检测结果存在具有诊断价值的序列数，检测标本的类型可靠性及检测病原体类型的临床意义均不明确；Truenat技术、MTB
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cfDNA及MALDI
‑
TOF MS检测等新型结核病检测技术，尚需大样本前瞻性研究明确其临床意义。同时，部分分子生物学检测技术成本高昂，使其在基层医院应用及推广受限。因此，迫切需要寻找敏感、特异、方便、有效的早期便捷检测方法，无创取样的检测程序，对于控制利福平耐药结核感染、阻断传播、抑制流行等至关重要。
[0004]代谢组学可提供细胞和代谢过程中的下游产物及特定组织或器官健康/疾病状况等关键信息。目前该技术已在药物研发、疾病诊断、药物代谢、药物不良反应以及治疗效果的监测等方面开展研究及应用。许多生物体液样本如：尿液、血液和组织匀浆等可用于代谢组学分析。代谢组学运用现代检测技术结合生物信息学分析方法对生物体内组织、细胞或体液中内源性小分子代谢物种类、数量变化的动态规律进行定性或定量检测，获得机体在病理生理刺激或环境因素变化等不同影响下的差异代谢标志物。
[0005]与血液相比，尿液不受平衡机制影响能够真实反映身体状况，而且具有收集简便和无创取样等优点，在婴儿和无法取得痰标本的病人中广泛应用。尿液检测相关代谢标志物以确定疾病的发生、发展和预后越来越引起研究人员的关注。尿液易于大批量连续无创采集，有助于代谢物鉴定、定量和后续数据分析；同时，尿液中蛋白质含量较低，处理过程相对不复杂，尿液代谢物相对较小，热力学稳定，尿液样本中代谢物的分子间相互作用较少。因此，通过研究结核病患者的尿液，筛选出具体有效的尿液代谢标志物，对于利福平耐药结核病的诊断与鉴别诊断至关重要。
[0006]综上，如何提供更多潜在尿液代谢标志物作为一种快速、高效、敏感、特异、经济的诊断方法，提高检测效率是本领域技术人员亟需解决的问题。

技术实现思路

[0007]第一方面，本专利技术提供一种鉴别诊断和/或筛查利福平耐药结核病的代谢标志物，所述代谢标志物为二氢小檗碱(Dihydroberberine)、二甲基亚砜(Dimethyl Sulfoxide)、1
‑
棕榈酰
‑2‑
油酰基
‑3‑
亚油酰
‑
外消旋
‑
甘油(1
‑
Palmitoyl
‑2‑
Oleoyl
‑3‑
Linoleoyl
‑
Rac
‑
Glycerol)、胆碱(Choline)、N,N
‑
二甲基精氨酸(N,N
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Dimethylarginine)、吡哆醇(Pyridoxine)、D
‑
丙氨酰
‑
D
‑
丙氨酸(D
‑
Alanyl
‑
D
‑
alanine)、脯氨酸羟脯氨酸(Proline
‑
Hydroxyproline)、2
‑
乙酰氧基
‑4‑
十五烷基苯甲酸(2
‑
Acetoxy
‑4‑
Pentadecylbenzoic Acid)、1
‑
肉桂酰基吡咯烷(1
‑
Cinnamoylpyrrolidine)、4
‑
(胞苷
‑
12
‑
酰胺基)苯甲酸(4
‑
(Cytisin
‑
12
‑
Amido)
‑
BenzoicAcid)、磷脂酰乙醇胺Lyso 20(Phosphatidylethanolamine Lyso 20)、C18鞘氨醇(C18
‑
Sphingosine)、芥酸酰胺(Erucamide)、β
‑
羟基肉豆蔻酸(Beta
‑
HydroxymyristicAcid)、2
‑
(2
‑
氧吲哚
‑3‑
基)乙酸((2
‑
Oxo
‑
2,3
‑
Dihydro
‑
1H
‑
Indol
‑3‑
Yl)Acetic Acid)、环丝氨酸(Cycloserine)、4
‑
吡哆酸(4
‑
Pyridoxic Acid)、二氟全氟甲氧基甲酸(Difluoro(Perfluoromethoxy)Acetic Acid)、β
‑
丙氨酸(Beta
‑
Alanine)中的一种或多种的丰度下调或上调。
[0008]进一步的，当所述代谢标志物二氢小檗碱(Dihydroberberine)、二甲基亚砜(Dimethyl Sulfoxide)、胆碱(Choline)、N,N
‑
二甲基精氨酸(N,N
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Dimethylarginine)、吡哆醇(Pyridoxine)、D
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丙氨酰
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D
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丙氨酸(D
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Alanyl
‑
D
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alanine)、脯氨酸羟脯氨酸(Proline
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Hydroxyproline)、4
‑
(胞苷
‑
12...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种鉴别诊断和/或筛查利福平耐药结核病的代谢标志物，所述代谢标志物为二氢小檗碱(Dihydroberberine)、二甲基亚砜(DimethylSulfoxide)、1
‑
棕榈酰
‑2‑
油酰基
‑3‑
亚油酰
‑
外消旋
‑
甘油(1
‑
Palmitoyl
‑2‑
Oleoyl
‑3‑
Linoleoyl
‑
Rac
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Glycerol)、胆碱(Choline)、N,N
‑
二甲基精氨酸(N,N
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Dimethylarginine)、吡哆醇(Pyridoxine)、D
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丙氨酰
‑
D
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丙氨酸(D
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Alanyl
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D
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alanine)、脯氨酸羟脯氨酸(Proline
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Hydroxyproline)、2
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乙酰氧基
‑4‑
十五烷基苯甲酸(2
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Acetoxy
‑4‑
PentadecylbenzoicAcid)、1
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肉桂酰基吡咯烷(1
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Cinnamoylpyrrolidine)、4
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(胞苷
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12
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酰胺基)苯甲酸(4
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(Cytisin
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12
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Amido)
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Benzoic Acid)、磷脂酰乙醇胺Lyso20(PhosphatidylethanolamineLyso20)、C18鞘氨醇(C18
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Sphingosine)、芥酸酰胺(Erucamide)、β
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羟基肉豆蔻酸(Beta
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HydroxymyristicAcid)、2
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(2
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氧吲哚
‑3‑
基)乙酸((2
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Oxo
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2,3
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Dihydro
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1H
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Indol
‑3‑
Yl)AceticAcid)、环丝氨酸(Cycloserine)、4
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吡哆酸(4
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PyridoxicAcid)、二氟全氟甲氧基甲酸(Difluoro(Perfluoromethoxy)AceticAcid)、β
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丙氨酸(Beta
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Alanine)中的一种或多种的丰度下调或上调；当所述代谢标志物二氢小檗碱(Dihydroberberine)、二甲基亚砜(Dimethyl Sulfoxide)、胆碱(Choline)、N,N
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二甲基精氨酸(N,N
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Dimethylarginine)、吡哆醇(Pyridoxine)、D
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丙氨酰
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D
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丙氨酸(D
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Alanyl
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D
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alanine)、脯氨酸羟脯氨酸(Proline
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Hydroxyproline)、4
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(胞苷
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12
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酰胺基)苯甲酸(4
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(Cytisin
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Amido)
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Benzoic Acid)、磷脂酰乙醇胺Lyso20(PhosphatidylethanolamineLyso20)、2
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(2
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氧吲哚
‑3‑
基)乙酸((2
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Oxo
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2,3
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Dihydro
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1H
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Indol
‑3‑
Yl)AceticAcid)、环丝氨酸(Cycloserine)、4
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吡哆酸(4
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PyridoxicAcid)、二氟全氟甲氧基甲酸(Difluoro(Perfluoromethoxy)AceticAcid)、β
‑
丙氨酸(Beta
‑
Alanine)中的一种或多种的丰度的log2FoldChange值＜
‑
0.26，即丰度下调，说明该患者患利福平耐药结核风险高；当所述代谢标志物1
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棕榈酰
‑2‑
油酰基
‑3‑
亚油酰
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外消旋
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甘油(1
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Palmitoyl
‑2‑
Oleoyl
‑3‑
Linoleoyl
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Rac
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Glycerol)、2
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乙酰氧基
‑4‑
十五烷基苯甲酸(2
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Acetoxy
‑4‑
PentadecylbenzoicAcid)、1
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肉桂酰基吡咯烷(1
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Cinnamoylpyrrolidine)、C18鞘氨醇(C18
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Sphingosine)、芥酸酰胺(Erucamide)、β
‑
羟基肉豆蔻酸(Beta
‑
HydroxymyristicAcid)中的一种或多种的log2FoldChange值＞0.26，即丰度上调，说明该患者患利福...

【专利技术属性】
技术研发人员：于佳佳，逄宇，唐神结，袁金锋，刘荣梅，马丽萍，丁卫民，梁晨，刘盛盛，
申请(专利权)人：北京市结核病胸部肿瘤研究所，
类型：发明
国别省市：