一种蜱源荆门蜱病毒基因组扩增引物组、扩增方法和应用技术

本发明专利技术公开一种蜱源荆门蜱病毒基因组扩增引物组、扩增方法和应用，属于生物技术领域。本发明专利技术分别以12对引物作为扩增引物的上下游引物，以蜱样本提取的荆门蜱病毒RNA模板进行RT

【技术实现步骤摘要】
一种蜱源荆门蜱病毒基因组扩增引物组、扩增方法和应用


[0001]本专利技术涉及一种蜱源荆门蜱病毒基因组扩增引物组、扩增方法和应用，属于生物


技术介绍

[0002]蜱虫是一种吸血性寄生虫，属于寄螨目、蜱总科。蜱虫是重要的人类和动物病原体媒介，其可通过叮咬宿主的方式传播病原体，严重威胁人类健康和畜牧业的生产；有多种病毒可通过蜱叮咬传播，主要有发热伴血小板减少综合征病毒、克里米亚刚果出血热病毒、森林脑炎病毒等人畜共患疾病。如蜱传脑炎病毒可引起严重的神经系统疾病，即蜱传脑炎，造成动物和人中枢神经系统受损。这些蜱传病毒对公共卫生安全造成了极大的威胁。
[0003]荆门蜱病毒是一类单股正链的带包膜RNA病毒，基因组由四个节段组成，其中节段1和节段3分别编码非结构蛋白NSP1和NSP2，节段2编码结构蛋白VP1，节段4分别编码结构蛋白VP2和VP3；该病毒可由多种蜱类传播，在蜱虫叮咬后发现发热症状的人体内检测到了荆门蜱病毒，说明该病毒可能是这些症状的原因；荆门蜱病毒可能是新的蜱传人类病原体，对人类存在潜在致病性。
[0004]蜱虫是许多病毒的载体，通常对人类和动物的健康造成极大的危害；我国植被类型丰富多样，许多地方以农牧业为主，蜱类种群丰富；因此，对蜱携带的荆门蜱病毒设计引物，建立基因组扩增方法，并对扩增序列进行基因分析是了解荆门蜱病毒的重要基础，有利于掌握病毒的流行趋势和变异情况，对荆门蜱病毒的相关研究具有重要意义。

技术实现思路

[0005]针对现有技术存在的问题，本专利技术的目的在于提供了一种具有高特异性和灵敏度的蜱源荆门蜱病毒基因组扩增方法。
[0006]本专利技术所述的蜱源荆门蜱病毒基因组扩增引物组，包括12对扩增引物，12对通用引物的名称及序列如下：
[0007]第1对引物：
[0008]正向引物1JMTV
‑1‑
F如SEQ ID NO:1所示：5
’‑
TTACTGCAAGTGCAAAGGTTAAGG
‑3’
；
[0009]反向引物1JMTV
‑1‑
R如SEQ ID NO:2所示：5
’‑
GTGTTGTTGAGGTGAGTTGCCAT
‑3’
；
[0010]第2对引物：
[0011]正向引物2JMTV
‑2‑
F如SEQ ID NO:3所示：5
’‑
TCTATAGCAGAGATGCATATGGAA
‑3’
；
[0012]反向引物2JMTV
‑2‑
R如SEQ ID NO:4所示：5
’‑
CATTTCTTCGTCCTCCGCTA
‑3’
；
[0013]第3对引物：
[0014]正向引物3JMTV
‑3‑
F如SEQ ID NO:5所示：5
’‑
ACCAGGCAGGTGAACAAAGGAAG
‑3’
；
[0015]反向引物3JMTV
‑3‑
R如SEQ ID NO:6所示：5
’‑
TTGTGTTCATGTACGGTGGCGCTAA
‑3’
；
[0016]第4对引物：
[0017]正向引物4JMTV
‑4‑
F如SEQ ID NO:7所示：5
’‑
TACCGCTGACTCCCCAAGGAAG
‑3’
；
[0018]反向引物4JMTV
‑4‑
R如SEQ ID NO:8所示：5
’‑
CACCGGTCTGGTGTAGATGGAGTAC
‑3’
；
[0019]第5对引物：
[0020]正向引物5JMTV
‑5‑
F如SEQ ID NO:9所示：5
’‑
ATATGCTCTACACATGAACACGAC
‑3’
；
[0021]反向引物5JMTV
‑5‑
R如SEQ ID NO:10所示：5
’‑
GCGACCACTGTTGACCATGTG
‑3’
；
[0022]第6对引物：
[0023]正向引物6JMTV
‑6‑
F如SEQ ID NO:11所示：5
’‑
CAACAACTTACCAACAGTGCTTGTG
‑3’
；
[0024]反向引物6JMTV
‑6‑
R如SEQ ID NO:12所示：5
’‑
ACGCATGCGGCCATAACC
‑3’
；
[0025]第7对引物：
[0026]正向引物7JMTV
‑7‑
F如SEQ ID NO:13所示：5
’‑
CCTCGCGCTAGACTCACTTTACAGA
‑3’
；
[0027]反向引物7JMTV
‑7‑
R如SEQ ID NO:14所示：5
’‑
GCTAGTGCGAAGGTGCGATCTC
‑3’
；
[0028]第8对引物：
[0029]正向引物8JMTV
‑8‑
F如SEQ ID NO:15所示：5
’‑
GATCGAGAACAGCCAGAGTGCAG
‑3’
；
[0030]反向引物8JMTV
‑8‑
R如SEQ ID NO:16所示：5
’‑
GACAAGGTAGTGGTACTGTTGGC
‑3’
；
[0031]第9对引物：
[0032]正向引物9JMTV
‑9‑
F：如SEQ ID NO:17所示：5
’‑
TTCAGGGACTACCCTAGAGGGCTG
‑3’
；
[0033]反向引物9JMTV
‑9‑
R如SEQ ID NO:18所示：5
’‑
GCTAGCCGCAACCTAGTCATTGC
‑3’
；
[0034]第10对引物：
[0035]正向引物10JMTV
‑
10
‑
F如SEQ ID NO:19所示：5
’‑
GAGTTGCAAGTGCMATAGCTCG
‑3’
；
[0036]反向引物10JMTV
‑
10
‑
R如SEQ ID NO:20所示：5
’‑
TTGAARGCCAGSGACACCAC
‑3’
；
[0037]第11对引物：
[0038]正向引物11JMTV...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种蜱源荆门蜱病毒基因组扩增引物组，其特征在于：所述扩增引物组包括以下12对扩增引物：第1对引物：正向引物1JMTV
‑1‑
F如SEQ ID NO:1所示：5
’‑
TTACTGCAAGTGCAA AGGTTAAGG
‑3’
；反向引物1JMTV
‑1‑
R如SEQ ID NO:2所示：5
’‑
GTGTTGTTGAGGTGA GTTGCCAT
‑3’
；第2对引物：正向引物2JMTV
‑2‑
F如SEQ ID NO:3所示：5
’‑
TCTATAGCAGAGATGC ATATGGAA
‑3’
；反向引物2JMTV
‑2‑
R如SEQ ID NO:4所示：5
’‑
CATTTCTTCGTCCTCC GCTA
‑3’
；第3对引物：正向引物3JMTV
‑3‑
F如SEQ ID NO:5所示：5
’‑
ACCAGGCAGGTGAAC AAAGGAAG
‑3’
；反向引物3JMTV
‑3‑
R如SEQ ID NO:6所示：5
’‑
TTGTGTTCATGTACGG TGGCGCTAA
‑3’
；第4对引物：正向引物4JMTV
‑4‑
F如SEQ ID NO:7所示：5
’‑
TACCGCTGACTCCCC AAGGAAG
‑3’
；反向引物4JMTV
‑4‑
R如SEQ ID NO:8所示：5
’‑
CACCGGTCTGGTGTA GATGGAGTAC
‑3’
；第5对引物：正向引物5JMTV
‑5‑
F如SEQ ID NO:9所示：5
’‑
ATATGCTCTACACATG AACACGAC
‑3’
；反向引物5JMTV
‑5‑
R如SEQ ID NO:10所示：5
’‑
GCGACCACTGTTGAC CATGTG
‑3’
；第6对引物：正向引物6JMTV
‑6‑
F如SEQ ID NO:11所示：5
’‑
CAACAACTTACCAA CAGTGCTTGTG
‑3’
；反向引物6JMTV
‑6‑
R如SEQ ID NO:12所示：5
’‑
ACGCATGCGGCCAT AACC
‑3’
；第7对引物：正向引物7JMTV
‑7‑
F如SEQ ID NO:13所示：5
’‑
CCTCGCGCTAGACTC ACTTTACAGA
‑3’
；反向引物7JMTV
‑7‑
R如SEQ ID NO:14所示：5
’‑
GCTAGTGCGAAGGT GCGATCTC
‑3’
；第8对引物：正...

【专利技术属性】
技术研发人员：王炳辉，宁玉婷，夏雪山，侯宇彤，刘丽，
申请(专利权)人：昆明理工大学，
类型：发明
国别省市：