【技术实现步骤摘要】
一种高效浮游生物eDNA宏条形码监测引物组
[0001]本专利技术属于微生物检测领域,具体涉及一种高效浮游生物eDNA宏条形码监测引物组。
技术介绍
[0002]Hebert等研究者2003年提出了DNA条形码技术(DNAbarcoding),即基于一段短的DNA序列进行物种鉴定。一段比较理想的DNA条形码应该满足一定的条件:(1)片段内存在能够产生变异的区域,以此来实现不同物种的区别;(2)片段内存在相对保守的区域,以实现通用引物的设计;(3)片段长度合适,不宜过长或过短,以实现目标片段的扩增。DNA条形码技术在动植物和微生物界均得到了广泛的应用。近年来,基于高通量测序可以对土壤、水体等不同环境中DNA(EnvironmentDNA,eDNA)进行更加高效的物种多样性监测,即宏条形码技术(metabarcoding)。环境DNA是指从自然环境中所采集样品,如土壤、水体等,然后提取得到DNA,DNA主要来自于环境样本中的生物残体、组织或者分泌物等。随后进行环境DNA分析,主要包括样品的采集,DNA提取以及PCR扩增目标片段。 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.引物组,所述引物组选自如下引物对A1
‑
A4中的一种或多种,其中,引物对A1由18S
‑
v4
‑5‑
189F和18S
‑
v4
‑5‑
885R组成,18S
‑
v4
‑5‑
189F:GCAGTTARAAMGCTCGTAGT,如SEQ ID NO:1所示;18S
‑
v4
‑5‑
885R:TYAAGTTTCAGMCTTGCGAC,如SEQ ID NO:2所示;引物对A2由1FC1RF272FN和1FC1RF597R组成,1FC1RF272FN:AGACCGATAGCRMACAAGTA,如SEQ ID NO:3所示;1FC1RF597R:ACTYCTYGGTCCGTGTTTCA,如SEQ ID NO:4所示;引物对A3由rbcL
‑
Chlo21F和rbcL
‑
Chlo429R组成,rbcL
‑
Chlo21F:TTYCGTATGACTCCWCAACC,如SEQ ID NO:5所示;rbcL
‑
Chlo429R:GCWGAAAGACCTAAT...
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