一种SNP分子标记A08-12271831在鉴定大白菜根肿病抗性中的应用制造技术

本发明专利技术属于分子标记辅助育种技术领域，涉及一种SNP分子标记A08

【技术实现步骤摘要】
一种SNP分子标记A08
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12271831在鉴定大白菜根肿病抗性中的应用


[0001]本专利技术属于分子标记辅助育种
，具体涉及一种SNP分子标记A08
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12271831在鉴定大白菜根肿病抗性和/或抗根肿病大白菜育种中的应用。

技术介绍

[0002]根肿病也称“根癌”，是由芸薹根肿菌(PlasmodiophorabrassicaeWoron.)侵染引起的世界性土传病害，主要侵染大白菜、小白菜、甘蓝、萝卜、花椰菜、芥菜、油菜等十字花科植物。根肿菌侵染后会导致根部细胞异常增殖，形成肿瘤，从而影响水分和营养物质的运输，造成植株地上部分缺乏养分枯萎，直至全株死亡。利用抗根肿病基因培育抗病品种具有安全、高效、经济的特点，是从根本上解决根肿病困扰的重要途径之一，而通过寻找与抗根肿病基因紧密连锁的分子标记，利用分子标记辅助选择育种(marker
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assistedselection)能够大大提高抗病育种效率。因此，筛选出更多与白菜根肿病抗性基因相关的SNP，应用于白菜抗病材料的选择和抗病品种的育种，对提高白菜产量和品质等方面均有重要的意义。

技术实现思路

[0003]本专利技术的目的在于提供一种SNP分子标记A08
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12271831在鉴定大白菜根肿病抗性和/或抗根肿病大白菜育种中的应用。本专利技术所述SNP分子标记A08
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12271831能够实现抗根肿病大白菜的鉴定，用于筛选抗根肿病大白菜的选育。
[0004]本专利技术提供了一种SNP分子标记A08
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12271831在鉴定大白菜根肿病抗性和/或抗根肿病大白菜育种中的应用，所述SNP分子标记A08
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12271831的序列如SEQ ID NO.1所示，SEQ ID NO.1所示序列自5
’
端起第70位碱基是SNP位点，其碱基为T或C。
[0005]本专利技术还提供了一种检测上述技术方案所述应用中SNP分子标记A08
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12271831的试剂。
[0006]优选的是，所述试剂包括引物组Crr5
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funK4，所述引物组Crr5
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funK4包括Crr5
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funK4Ra、Crr5
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funK4Rb和Crr5
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funK4F；所述Crr5
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funK4Ra的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示；所述Crr5
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funK4Rb的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示；所述Crr5
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funK4F的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示。
[0007]优选的是，所述Crr5
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funK4Ra和Crr5
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funK4Rb分别标记不同颜色的荧光基团。
[0008]优选的是，所述荧光基团包括FAM和HEX。
[0009]本专利技术还提供了一种检测上述技术方案所述应用中SNP分子标记A08
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12271831的试剂盒，所述试剂盒包括上述技术方案所述试剂和反应液。
[0010]本专利技术还提供了上述技术方案所述试剂或上述技术方案所述试剂盒在鉴定大白菜根肿病抗性和/或抗根肿病大白菜育种中的应用。
[0011]本专利技术还提供了一种鉴定大白菜根肿病抗性的方法，包括以下步骤：
[0012]使用上述技术方案所述试剂或上述技术方案所述试剂盒对大白菜基因组DNA进行
竞争性等位基因特异性PCR扩增，最后对KASP扩增产物进行终点法荧光信号读取，得到基因分型结果：当基因型为TT或TC时，鉴定所述大白菜为抗根肿病大白菜，当基因型为CC时，鉴定所述大白菜为感根肿病大白菜。
[0013]优选的是，所述PCR扩增的反应体系以8μL计，包括1.5μL基因组DNA，4μL2
×
KASPMastermix，0.14μL引物组和余量的水。
[0014]优选的是，所述PCR扩增的反应程序包括：94℃15min；94℃20s，61℃60s，共10个循环，从第二个循环开始，每个循环降低0.6℃；94℃20s，55℃60s，共26个循环；37℃1min。
[0015]本专利技术提供了一种SNP分子标记A08
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12271831在鉴定大白菜根肿病抗性和/或抗根肿病大白菜育种中的应用。本专利技术所述SNP分子标记A08
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12271831能够实现抗根肿病大白菜的鉴定，用于筛选抗根肿病大白菜的选育。具体的，使用检测所述SNP分子标记A08
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12271831的试剂进行检测，可以实现大白菜抗根肿病和感根肿病材料的区分鉴定，在分子水平上快速筛选大白菜后代群体中含有抗根肿病基因的个体，准确性高，能够大大提高抗病育种效率。
附图说明
[0016]为了更清楚地说明本专利技术实施例或现有技术中的技术方案，下面将对实施例中所需要使用的附图作简单地介绍，显而易见地，下面描述中的附图仅仅是本专利技术的一些实施例，对于本领域普通技术人员来讲，在不付出创造性劳动性的前提下，还可以根据这些附图获得其他的附图。
[0017]图1为本专利技术提供的利用标记Crr5
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funK4对F2群体进行KASP基因分型结果图；
[0018]图2为本专利技术提供的利用标记Crr5
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funK4对自然群体进行KASP基因分型结果图。
具体实施方式
[0019]本专利技术提供了一种SNP分子标记A08
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12271831在鉴定大白菜根肿病抗性和/或抗根肿病大白菜育种中的应用，所述SNP分子标记A08
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12271831的序列如SEQ ID NO.1所示(AGCTTTAAATCTCAAGGATGTAGGAAAACGTGTATCGAATCCATTCAGTTTCATTGACACTGAACTCCCYGTGGCTCTGTAACTGAAATATGCAGGCACCGTTTCTCCGGGAAAGATCGCCCATATTTTTGTCGATGTC，Y＝T/C)，SEQ ID NO.1所示序列自5
’
端起第70位碱基是SNP位点，其碱基为T或C。本专利技术所述SNP分子标记A08
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12271831为大白菜根肿病抗性相关基因Crr5的SNP分子标记。本专利技术首次公开了与大白菜抗根肿病性状相关的SNP分子标记A08
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12271831。使用检测所述SNP分子标记A08
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12271831的试剂进行检测，可以实现大白菜抗根肿病和感根肿病材料的区分鉴定，在分子水平上快速筛选大白菜后代群体中含有抗根肿病基因的个体，准确性高，能够大大提高抗病育种效率。
[0020]本专利技术还提供了一种检测上述技术方案所述应用中SNP分子标记A08
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种SNP分子标记A08
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12271831在鉴定大白菜根肿病抗性和/或抗根肿病大白菜育种中的应用，所述SNP分子标记A08
‑
12271831的序列如SEQ ID NO.1所示，SEQ ID NO.1所示序列自5
’
端起第70位碱基是SNP位点，其碱基为T或C。2.一种检测权利要求1所述应用中SNP分子标记A08
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12271831的试剂。3.根据权利要求2所述的试剂，其特征在于，所述试剂包括引物组Crr5
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funK4，所述引物组Crr5
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funK4包括Crr5
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funK4Ra、Crr5
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funK4Rb和Crr5
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funK4F；所述Crr5
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funK4Ra的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示；所述Crr5
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funK4Rb的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示；所述Crr5
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funK4F的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示。4.根据权利要求3所述的试剂，其特征在于，所述Crr5
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funK4Ra和Crr5
‑
funK4...

【专利技术属性】
技术研发人员：原玉香，杨双娟，张文静，张晓伟，王坐京，苏贺楠，王志勇，魏小春，赵艳艳，李林，
申请(专利权)人：河南省农业科学院园艺研究所，
类型：发明
国别省市：