一种与大豆耐贮藏性相关的QTL、分子标记、扩增引物及应用制造技术

本发明专利技术公开了一种与大豆耐贮藏性相关的QTL、分子标记、扩增引物及应用。所述QTL位于大豆第6号染色体的11459396bp

【技术实现步骤摘要】
一种与大豆耐贮藏性相关的QTL、分子标记、扩增引物及应用


[0001]本专利技术属于农作物领域，具体涉及一种与大豆耐贮藏性相关的QTL、分子标记、扩增引物及应用。

技术介绍

[0002]种子的贮藏性在很大程度上决定了种子在贮藏过程中的活力，在农业和生态学中具有重要意义。大豆种子因其含有丰富的蛋白质和油脂而成为世界上重要的粮食作物，然而，正是由于大豆种子中存在的高水平的蛋白质和脂肪酸使其比其他的粮食作物更难储存。此外，种子的贮藏性属于复杂的数量性状，受多基因控制，受环境影响大。这一度加大了对种子的贮藏性这样性状的研究。选育和利用耐贮藏的大豆品种是最为经济有效的措施之一。分子标记辅助选择育种的发展，为人们加快育种进程提供了新的途径。近年来，提供大豆种子耐贮藏性的遗传基础研，已有一些与种子耐贮藏性相关的QTL(quantitative trait locus)被报道，但仍存在大量大豆种子耐贮藏性相关的QTL有待挖掘。为了进一步提高大豆种子耐贮藏性，发掘和利用新的大豆种子耐贮藏性的QTL主效位点至关重要。

技术实现思路

[0003]本专利技术的目的在于提供一种与大豆耐贮藏性相关的QTL、分子标记、扩增引物及应用，以解决上述技术问题。
[0004]本专利技术的第一个方面，提供一种与大豆耐贮藏性相关的QTL，所述QTL位于大豆第6号染色体的11459396bp
‑
12310027bp区间。
[0005]本专利技术的第二个方面，提供所述与大豆耐贮藏性的QTL的SSR分子标记，所述分子标记位于大豆第6号染色体的11716582bp
‑
11717006bp区间。
[0006]本专利技术的第三个方面，所述SSR分子标记的扩增引物，所述扩增引物如下：
[0007]正向引物序列5
’‑
GAACACGGACCAAATAGCTTCTG
‑3’
[0008]反向引物序列5
’‑
TACACCAACGGTATTTATTTTCC
‑3’
[0009]本专利技术的第四个方面，提供所述的与大豆耐贮藏性相关的QTL、与大豆耐贮藏性的QTL的SSR分子标记或所述的扩增引物在大豆耐贮藏性性状鉴定中的应用。
[0010]本专利技术的第五个方面，利用所述的扩增引物鉴定大豆耐贮藏性的方法，包括以下步骤：
[0011]S1、提取AG292,K3大豆以及待鉴定大豆材料基因组DNA；
[0012]S2、利用扩增引物对AG292,K3大豆以及待鉴定大豆材料基因组DNA进行PCR扩增；
[0013]S3、对扩增产物进行电泳分析，如果待鉴定大豆材料扩增产物的电泳带型与AG292扩增产物的电泳带型一致，则鉴定为大豆低耐贮藏性性状，如果待鉴定大豆材料扩增产物的电泳带型与K3扩增产物的电泳带型一致，则鉴定为高耐贮藏性性状。
[0014]本专利技术挖掘了一种与大豆耐贮藏性相关的QTL、分子标记、扩增引物及应用，利用他们可以有效的鉴别大豆品种的耐贮藏性，为大豆育种提供技术支持。
附图说明
[0015]图1为数量性状位点(QTL)定位图。
[0016]图2为K3和Ag292以及其杂交后代F2的聚丙烯酰胺凝胶电泳图。
具体实施方式
[0017]下面结合具体实施例，对本专利技术做详细描述，但不是对本专利技术的限制。
[0018]实施例1
[0019]一、实验方法：
[0020]1、群体构建
[0021]以不耐储的大豆品种AG292为母本，大豆耐储种质K3为父本进行杂交，通过单粒传法连续自交9代，获得包含91个株系的重组自交系(RIL)群体。
[0022]2、表型鉴定
[0023]对自然老化和新鲜种子的萌发实验。自然老化种子是通过将新鲜种子存放在自然环境条件(经度：113.367196，纬度:23.181797)下保存4年获得的。从每个大豆群体中随机选择了30颗种子进行萌发处理，并在第七天记录了萌发率，进行3次平行实验。通过t检验分析了单倍型之间的表型差异。
[0024]3、QTL的定位
[0025]利用之前由Lu等人(Lu et al.,2015)构建的遗传连锁图谱，鉴定与大豆种子贮藏性状相关的数量性状位点(QTLs)。将连续两年的萌发数据与现有的连锁图谱结合，在C2染色体上鉴定到一个主效QTL位点：qSS
‑
C2，LOD值分别为2.51和2.73，分别能解释13.6％和17.5％的表型变异，见图1。AG292,K3大豆品种的新鲜种子的萌发率接近100％，分别为95.56％，97.78％。经过自然老化后AG292,K3的萌发率出现明显差异，分别为4.4％和97.78％
[0026]本研究利用1,131个简单序列重复(simple sequence repeat,SSR)标记，利用QTL Network软件进行QTL分析(Yang et al.,2008)。应用复合区间映射(composite interval mapping,CIM)方法，通过排列检验1000次，在P<0.05的显著性水平建立LOD阈值(Churchill&Doerge,1994)。利用同一软件，采用多区间映射(MQM)方法对CIM确定的QTL进行验证。我们将2.5的LOD评分设定为确认特定基因组区域内QTL显著性的最低要求。
[0027]二、实验结果
[0028]1、本专利技术的大豆耐贮藏性相关的主效QTL位点：qSS
‑
C2，位于大豆C2染色体的11459396bp
‑
12310027bp区间
[0029]2、针对上述主效QTL位点，筛选获得与大豆耐贮藏性的QTL的SSR分子标记，所述分子标记位于大豆第6号染色体的11716582bp
‑
11717006bp区间，具体为：GAACACGGACCAAATAGCTTCTGTGTCATTCCACTATAAGCTTGCAATGGATTCAGAGGGTAGAGATTAAACAAAGTTAGAGAGAAAAGGTTCACCTGAGGTCTCTTGGTGTTTTGGTGGTTGGGTCTAGACCTATAAAGTGAGTGTAGTGGCTGAAGAGCCAGATCATAAAAGCATAAAATGGAAGACATAAAGACAGAGTGAATCAATAGTTCAGAGAGATGAAGCAGAGAAAAACTAATTAGCTATGTGGCAGGTGGCAGGTGGCAGGTGGCAACAGGTCCTCCTGTGGTTAGACTTGATGTAAAAAAAGATGAGAACTTGAGAGATTGCTCTGTCTTAGCAATTAGATTGAGAGAAAATGAACATAAAGAAGAGACCCCAAAAAACAAAATGGTGGCAGGAAAATAAATACCGTTGGTGTA(SEQ ID NO.1)。
[0030]针对此SSR标记设计了扩本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种与大豆耐贮藏性相关的QTL，其特征在于，所述QTL位于大豆第6号染色体的11459396bp
‑
12310027bp区间。2.一种与大豆耐贮藏性的QTL的SSR分子标记，其特征在于，所述分子标记位于大豆第6号染色体的11716582bp
‑
11717006bp区间。3.一种鉴定大豆耐贮藏性QTL的SSR分子标记的扩增引物，其特征在于，所述扩增引物如下：正向引物序列5
’‑
GAACACGGACCAAATAGCTTCTG
‑3’
反向引物序列5
’‑
TACACCAACGGTATTTATTTTCC
...

【专利技术属性】
技术研发人员：李晓明，侯兴亮，刘虹洁，吕天晓，张春雨，
申请(专利权)人：中国科学院华南植物园，
类型：发明
国别省市：