一组用于鉴别茶枝柑品种的SSR引物组合及其应用制造技术

本发明专利技术提供了一组用于鉴别茶枝柑品种的SSR引物组合及其应用，涉及分子生物学和植物品种鉴别技术领域。本发明专利技术提供了一组用于鉴别茶枝柑品种的SSR分子标记组合，利用筛选获得的30组SSR分子标记，并依据保守序列设计并验证SSR序列扩增引物，利用PCR和电泳检测技术可对茶枝柑品种快速鉴定，可高效、准确对茶枝柑品系进行鉴定，还提供了一种茶枝柑品种指纹图谱的构建方法，本发明专利技术的鉴定方法可以为茶枝柑真伪进行有效监控，减少育种的盲目性，提高了育种的效率，有利于新品种培育，为茶枝柑品种的保护和鉴定提供了依据。的保护和鉴定提供了依据。

【技术实现步骤摘要】
一组用于鉴别茶枝柑品种的SSR引物组合及其应用


[0001]本专利技术涉及分子生物学和植物品种鉴别
，具体涉及一组用于鉴别茶枝柑品种的SSR引物组合及其应用。

技术介绍

[0002]茶枝柑的果皮制干即为中药陈皮，是陈皮正品。王好古《汤液本草》(公元1248年)载：“或云与陈皮一种，“日久者佳，故称陈皮”。历来所称陈皮，原出广州，故又称广陈皮，就是茶枝柑的果皮。茶枝柑作为国家地理标志产品有700多年的种植栽培历史，是十大广药之首。依靠传统经验的品种鉴定多从形态性状为判别点，易受植物形态及环境的影响，并且需要从事中药材种植经验丰富的专业人员才能准确区别。随着分子生物学鉴定的发展，分子生物学鉴定技术为物种鉴定特别是中药混淆品、代用品鉴定提供了一种新技术思路。
[0003]现有技术中基于K2P距离构建的NJ发育树不能较好地区分鉴定各陈皮栽培品种，原因在于陈皮来源植物宽皮柑橘的栽培品种之间普遍存在自然杂交和芽变现象,特别是经杂交育种的杂柑(天草、不知火等),其DNA片段上仅存在少数位点的单核苷酸变异，ITS2序列存在高度相似性，因此，仅从具有特征片段的DNA条形码序列难以进行区分。通过判断trnH
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psbA序列DNA条形码可用于初步鉴别广陈皮，但是不能区分新会茶枝柑。通过比较五种DNA条形码候选片段ITS2、ITS、psbA
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trnH、rbcL、matK用于不同产地和栽培品种的的鉴定，发现ITS2序列鉴别效果最佳，但是ITS序列测序成功率低，且基于ITS序列构建的NJ进化树无法区分广陈皮与陈皮。
[0004]SSR位点分析是对SSR序列进行基因型分析的过程。SSR(简单重复序列，又称微卫星)是长度为1至6个碱基的串联重复序列，并广泛分布在动植物基因组中，通过PCR扩增，电泳分离和测序等技术，可以将样品中的SSR位点扩增出来，并进行分型分析。SSR位点分析可以用于遗传多样性研究、种质资源评估、品种鉴定、遗传图谱构建、基因功能研究等领域。
[0005]SSR在种间的通用性和特异性表现良好，利用少数的SSR标记组合便可以提供较高的检测效率。此外，SSR标记可从物种的基因组和转录组测序中开发获得，具有共显性、稳定性和可重复性，已成为一种用于动植物种质资源识别、鉴定的理想分子标记。其鉴定结果可靠性高且可重复,不受实验条件和设备的影响，便于不同实验室相互交流合作开发引物，这对茶枝柑种质资源的收集、保存、评价和利用具有十分重要的意义。
[0006]在中药材品种改良和育种中，SSR位点分析可以帮助选择优良基因型，实现快速育种和良种选育。有鉴于此，本专利技术致力于提供一种通过分析茶枝柑基因组序列获得了基因组SSR分子标记，并根据序列合成核心基因组SSR引物，构建了茶枝柑鉴定的SSR指纹图谱，可高效、准确、低成本对茶枝柑品系或其近缘种进行鉴定。目前，在国内还未见基于SSR分子标记对茶枝柑品种进行鉴定的相关报道。

技术实现思路

[0007]为解决上述技术问题，本专利技术提供以下技术方案。
[0008]本专利技术的目的在于提供一组用于鉴别茶枝柑品种的SSR分子标记组合，所述分子标记具有如下编号为:Cluster
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1013.0、Cluster
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10239.0、Cluster
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10345.0、Cluster
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10191.0、Cluster
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10077.0、Cluster
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10228.0、Cluster
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10273.0、Cluster
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10192.0、Cluster
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10023.0、Cluster
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10024.0、Cluster
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10025.0、Cluster
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1038.0、Cluster
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10343.0、Cluster
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10337.0、Cluster
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10019.0、Cluster
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10157.0、Cluster
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10233.0、Cluster
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10313.0、Cluster
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10022.0、Cluster
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10357.0、Cluster
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10014.0、Cluster
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10247.0、Cluster
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10351.0、Cluster
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10272.1、Cluster
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10204.0、Cluster
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10211.0、Cluster
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10141.0、Cluster
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10044.0、Cluster
‑
10260.0、Cluster
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10027.0所示的序列；所述分子标记物组合包括所述分子标记中的至少3个；用于扩增所述SSR分子标记的引物对核苷酸序列依次为:SEQ ID NO：1和SEQ ID NO：2、SEQ ID NO：3和SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：5和SEQ ID NO：6、SEQ ID NO：7和SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：9和SEQ ID NO：10、SEQ ID NO：11和SEQ ID NO：12、SEQ ID NO：13和SEQ ID NO：14、SEQ ID NO：15和SEQ ID NO：16、SEQ ID NO：17和SEQ ID NO：18、SEQ ID NO：19和SEQ ID NO：20、SEQ ID NO：21和SEQ ID NO：22、SEQ ID NO：23和SEQ ID NO：24、SEQ ID NO：25和SEQ ID NO：26、SEQ ID NO：27和SEQ ID NO：28、SEQ ID NO：29和SEQ ID NO：30、SEQ ID NO：31和SEQ ID NO：32、SEQ ID NO：33和SEQ ID NO：34、SEQ ID NO：35和SEQ ID NO：36、SEQ ID NO：37和SEQ ID NO：38、SEQ ID NO：39和SEQ ID NO：40、SEQ ID NO：41和SEQ ID NO：42、SEQ ID NO：43和SEQ ID NO：44、SEQ ID NO：45和SEQ ID NO：46、SEQ ID NO：47和SEQ ID NO：48、SEQ ID NO：49和SEQ ID NO：50、SEQ ID NO：51和SEQ ID NO：52、SEQ ID NO：53和SEQ ID NO：54、SEQ ID NO：55和SEQ ID NO：56、SEQ ID NO：57和SEQ ID NO：58或SEQ ID NO：59
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SEQ ID NO：60。
[0009]本专利技术提供的茶本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一组用于鉴别茶枝柑品种的SSR分子标记组合，其特征在于，所述分子标记具有如下编号为:Cluster
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1013.0、Cluster
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10239.0、Cluster
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10345.0、Cluster
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10191.0、Cluster
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10077.0、Cluster
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10228.0、Cluster
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10273.0、Cluster
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10192.0、Cluster
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10023.0、Cluster
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10024.0、Cluster
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10025.0、Cluster
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1038.0、Cluster
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10343.0、Cluster
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10337.0、Cluster
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10019.0、Cluster
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10157.0、Cluster
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10233.0、Cluster
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10313.0、Cluster
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10022.0、Cluster
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10357.0、Cluster
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10014.0、Cluster
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10247.0、Cluster
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10351.0、Cluster
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10272.1、Cluster
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10204.0、Cluster
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10211.0、Cluster
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10141.0、Cluster
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10044.0、Cluster
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10260.0、Cluster
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10027.0所示的序列；所述分子标记物组合包括所述分子标记中的至少3个；用于扩增所述SSR分子标记的引物对核苷酸序列依次为:SEQ ID NO：1和SEQ ID NO：2、SEQ ID NO：3和SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：5和SEQ ID NO：6、SEQ ID NO：7和SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：9和SEQ ID NO：10、SEQ ID NO：11和SEQ ID NO：12、SEQ ID NO：13和SEQ ID NO：14、SEQ ID NO：15和SEQ ID NO：16、SEQ ID NO：17和SEQ ID NO：18、SEQ ID NO：19和SEQ ID NO：20、SEQ ID NO：21和SEQ ID NO：22、SEQ ID NO：23和SEQ ID NO：24、SEQ ID NO：25和SEQ ID NO：26、SEQ ID NO：27和SEQ ID NO：28、SEQ ID NO：29和SEQ ID NO：30、SEQ ID NO：31和SEQ ID NO：32、SEQ ID NO：33和SEQ ID ...

【专利技术属性】
技术研发人员：李卫岗，张文生，吴洁珊，陈超，翁福良，
申请(专利权)人：北京师范大学珠海校区，
类型：发明
国别省市：