肿瘤共享新抗原表位肽或其编码核酸在制备药物中的应用制造技术

本发明专利技术属于生物医药技术领域，具体公开了一种肿瘤共享新抗原表位肽或其编码核酸在制备预防和/或治疗肿瘤的药物中的应用。本发明专利技术通过分析TIMER和COSMIC数据库，表位预测和体内外免疫活性实验，鉴定获得了3个肿瘤共享新抗原CTNNB1、SMAD4、SMARCA4来源的5条HLA

【技术实现步骤摘要】
肿瘤共享新抗原表位肽或其编码核酸在制备药物中的应用


[0001]本专利技术属于生物医药
，具体涉及一种肿瘤共享新抗原表位肽或其编码核酸在制备预防和/或治疗肿瘤的药物中的应用。

技术介绍

[0002]肿瘤免疫治疗近年来发展迅速，被认为是最有前景的治疗方法。研究表明，肿瘤免疫治疗的临床疗效很大程度上取决于肿瘤患者中存在的肿瘤抗原特异性的CD8
+
T淋巴细胞，而肿瘤抗原在其中扮演着重要的角色。理想的肿瘤抗原是仅在肿瘤细胞中表达而在正常细胞中不表达的肿瘤特异性抗原。新抗原是肿瘤特异性突变产生的一类肿瘤特异性抗原，因其在正常细胞中不表达而具有较高的免疫原性，可以通过激活CD4
+
T淋巴细胞和CD8
+
T淋巴细胞产生强烈的免疫反应，被认为是最理想的肿瘤免疫治疗靶点之一。
[0003]目前，基于新抗原的新表位疫苗以及新表位特异性的T淋巴细胞在实体瘤的治疗中展现出独特优势。然而，当下鉴定的绝大多数新抗原多为患者所特有，人群覆盖率较低，严重制约了基于新表位的肿瘤免疫疗法的临床应用。因此，具有广泛人群覆盖率的共享新抗原将是未来临床应用的关键。
[0004]随着二代测序技术和生物信息学技术的发展，大量肿瘤患者的突变信息被COSMIC、TIMER等在线数据库收录，并且结合不同算法的预测软件将为共享新抗原的筛选及其突变特异性的表位肽的预测提供便利。然而，表位肽预测的准确率较低，需要活性试验验证有效才具有实践意义。此外，HLA
‑
A2亚型在中国人群中占比50％左右。因此，鉴定HLA
‑
A2限制性共享新表位肽将具有广泛的人群覆盖率，并可为基于共享新抗原的肿瘤免疫治疗提供新的靶点和策略。

技术实现思路

[0005]为了克服新抗原人群覆盖率低的问题，本专利技术旨在鉴定在两种以上肿瘤类型中均具有高突变频率的共享新抗原，并以此鉴定新抗原表位肽。这些新抗原表位肽能够有效刺激并诱导产生新抗原特异性的细胞毒性T淋巴细胞，用于共享新抗原阳性表达的肿瘤细胞的杀伤，具有良好的临床应用价值。因此，本专利技术主要解决的技术问题是提供一种肿瘤共享新抗原表位肽或其编码核酸在制备预防和/或治疗肿瘤的药物中的应用。
[0006]同时，本专利技术还提供一种预防和/或治疗肿瘤的药物。
[0007]为解决上述技术问题，本专利技术提供了以下技术方案：
[0008]一种肿瘤共享新抗原表位肽或其编码核酸在制备预防和/或治疗肿瘤的药物中的应用，所述肿瘤共享新抗原表位肽的氨基酸如SEQ ID NO：1
‑
5中任一项所示。
[0009]具体的，所述肿瘤共享新抗原表位肽为3个肿瘤共享新抗原CTNNB1、SMAD4、SMARCA4来源的5条HLA
‑
A2限制性CTL表位肽，其氨基酸序列如下所示：
[0010]CTNNB1
‑
S37F：YLDSGIHFGA(SEQ ID NO：1)；
[0011]CTNNB1
‑
S37F：Tyr
‑
Leu
‑
Asp
‑
Ser
‑
Gly
‑
Ile
‑
His
‑
Phe
‑
Gly
‑
Ala。
[0012]CTNNB1
‑
T41A：YLDSGIHSGATATA(SEQ ID NO：2)；
[0013]CTNNB1
‑
T41A：Tyr
‑
Leu
‑
Asp
‑
Ser
‑
Gly
‑
Ile
‑
His
‑
Ser
‑
Gly
‑
Ala
‑
Thr
‑
Ala
‑
Thr
‑
Ala。
[0014]CTNNB1
‑
T41A：YLDSGIHSGATA(SEQ ID NO：3)；
[0015]CTNNB1
‑
T41A：Tyr
‑
Leu
‑
Asp
‑
Ser
‑
Gly
‑
Ile
‑
His
‑
Ser
‑
Gly
‑
Ala
‑
Thr
‑
Ala。
[0016]SMAD4
‑
R361C：YVDPSGGDCFCL(SEQ ID NO：4)；
[0017]SMAD4
‑
R361C：Tyr
‑
Val
‑
Asp
‑
Pro
‑
Ser
‑
Gly
‑
Gly
‑
Asp
‑
Cys
‑
Phe
‑
Cys
‑
Leu。
[0018]SMARCA4
‑
T910M：LLMGTPLQNKLPEL(SEQ ID NO：5)；
[0019]SMARCA4
‑
T910M：Leu
‑
Leu
‑
Met
‑
Gly
‑
Thr
‑
Pro
‑
Leu
‑
Gln
‑
Asn
‑
Lys
‑
Leu
‑
Pro
‑
Glu
‑
Leu。
[0020]具体的，所述编码肿瘤共享新抗原表位肽的核酸包括DNA或RNA。在不改变编码的氨基酸序列的前提下，可以根据密码子的偏好性进行修饰改造。
[0021]作为本专利技术一种优选的实施方案，所述药物包括疫苗、细胞制剂等。
[0022]具体的，所述药物为可诱导机体产生肿瘤共享新抗原特异性T细胞克隆的疫苗或细胞制剂。所述疫苗可以为核酸疫苗，所述核酸疫苗包含编码肿瘤共享新抗原表位肽的核酸序列，如DNA疫苗、RNA疫苗；或者，所述疫苗为重组蛋白疫苗、合成长肽疫苗、混合肽池(peptide pool)疫苗等，所述重组蛋白疫苗、合成长肽疫苗或混合肽池疫苗均包含肿瘤共享新抗原表位肽的氨基酸序列。所述细胞制剂包含抗原提呈细胞(如树突细胞)，所述抗原提呈细胞包含肿瘤共享新抗原表位肽的氨基酸序列。
[0023]或者，所述药物为可预防和/或治疗共享新抗原阳性表达的肿瘤的细胞制剂。所述细胞制剂包含经修饰的细胞，例如，编码T细胞受体(TCR)或嵌合抗原受体(CAR)的核酸转染的T细胞、NK细胞、NK
‑
T细胞、CD4
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种肿瘤共享新抗原表位肽或其编码核酸在制备预防和/或治疗肿瘤的药物中的应用，其特征在于：所述肿瘤共享新抗原表位肽的氨基酸如SEQ ID NO：1
‑
5中任一项所示。2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于：所述药物为可诱导机体产生肿瘤共享新抗原特异性T细胞克隆的疫苗或细胞制剂；优选地，所述疫苗为核酸疫苗，所述核酸疫苗包含编码肿瘤共享新抗原表位肽的核酸序列；或者，所述疫苗为重组蛋白疫苗、合成长肽疫苗或混合肽池疫苗，所述重组蛋白疫苗、合成长肽疫苗或混合肽池疫苗均包含肿瘤共享新抗原表位肽的氨基酸序列；优选地，所述细胞制剂包含抗原提呈细胞，所述抗原提呈细胞包含肿瘤共享新抗原表位肽的氨基酸序列。3.根据权利要求1所述的应用，其特征在于：所述药物为可预防和/或治疗共享新抗原阳性表达的肿瘤的细胞制剂；优选地，所述细胞制剂包含经修饰的细胞，所述经修饰的细胞为编码T细胞受体或嵌合抗原受体的核酸转染的T细胞、NK细胞、NK
‑
T细胞、CD4
+
T细胞、CD8
+
T细胞或肿瘤浸润淋巴细胞，或者，所述经修饰的细胞为修饰有T细胞受体或嵌合抗原受体的T细胞、NK细胞、NK
‑
T细胞、CD4
+
T细胞、CD8
+
T细胞或肿瘤浸润淋巴细胞；所述T细胞受体或嵌合抗原受体特异性识别肿瘤共享新抗原表位肽。4.根据权利要求1
‑
3中任一项所述的应用，其特征在于：所述肿瘤共享新抗原表位肽采用化学合成法制备，合成策略包括C
‑
端合成、N
‑
端合成、分段合成；优选地，采用化学合成法制备的肿瘤共享新抗原表位肽在C
‑
端或N
‑
端包含修饰基团。5.根据权利要求1
‑
3中任一项所述的应用，其特征在于：所述肿瘤为共享新抗原阳性表达的肿瘤，包括子宫内膜癌、肝细胞癌、结肠腺癌、直肠腺癌、胰腺癌、肺腺癌、食管癌、乳腺癌、低级别脑胶质瘤、肾乳头状细胞癌、结内帕利沙肌成纤维母细胞瘤、神经肌肉迷行瘤、硬纤维瘤、青少年血管纤维瘤、牙釉质型颅咽管癌、肝母细胞瘤、胰腺导管癌、胆道癌、脑血管瘤、皮肤默克尔细胞癌、皮肤鳞状细胞癌、原位黑色素瘤、皮肤基底细胞癌肉瘤。6.一种预防和/或治疗肿瘤的药物，其特征在于：所述药物包含肿瘤共享新抗原表位肽或其...

【专利技术属性】
技术研发人员：吴亚红，王明霜，孔亚南，李朵，李玉冰，
申请(专利权)人：郑州大学，
类型：发明
国别省市：