新抗原ESR1来源的CTL表位肽或其编码核酸在制备药物中的应用制造技术

本发明专利技术属于生物医药技术领域，具体公开了一种新抗原ESR1来源的CTL表位肽或其编码核酸在制备治疗肿瘤的药物中的应用。本发明专利技术通过分析COSMIC数据库、表位预测和体内外免疫活性实验，鉴定获得了新抗原ESR1来源的HLA

【技术实现步骤摘要】
新抗原ESR1来源的CTL表位肽或其编码核酸在制备药物中的应用


[0001]本专利技术属于生物医药
，具体涉及一种新抗原ESR1共享/热点突变来源的CTL表位肽或其编码核酸在制备治疗肿瘤的药物中的应用。

技术介绍

[0002]乳腺癌是全球女性癌症死亡的主要原因之一，其发病率和死亡率仍在逐年上升。其中，雌激素受体(Estrogen receptor，ER)阳性乳腺癌患者约占乳腺癌总病例的70％。对于ER+乳腺癌患者，内分泌疗法(抗雌激素疗法)是临床上的主要治疗手段。然而，内分泌疗法耐药是ER+乳腺癌患者所面临的主要问题，最终导致复发和转移。
[0003]研究表明，ESR1的获得性体细胞突变是ER+转移性乳腺癌患者内分泌治疗耐受的一个关键驱动因素，导致持续的转录活性和降低的内分泌治疗敏感性。这些突变对转移性乳腺癌(metastatic breast cancer，MBC)是非常不利的，且在高达36％的转移性乳腺癌患者中存在。
[0004]ESR1是编码ER的基因，ESR1基因异常通常包括基因的扩增、重排及突变等几种形式。研究显示，ESR1的错义突变通常与乳腺癌耐药和转移性乳腺癌的疾病进展相关，且大多数的突变集中在ESR1的配体结合区域(ligand
‑
binding domain，LBD)。
[0005]近年来，肿瘤免疫治疗因其能够诱导和激活患者自身肿瘤特异性的免疫细胞来识别和杀伤肿瘤，建立免疫记忆，被认为是最有前景的治疗方法。肿瘤免疫治疗的临床疗效依赖于患者中的肿瘤抗原特异性T淋巴细胞，而肿瘤抗原在其中扮演着重要角色。理想的肿瘤抗原是仅在肿瘤细胞中表达而在正常细胞中不表达的肿瘤特异性抗原。新抗原(neoantigen)是肿瘤细胞特异性突变产生的一类肿瘤特异性抗原，由于这些突变产生的抗原是后天产生的，在正常组织中不表达，因而具有很强的免疫原性和肿瘤特异性，被认为是目前最理想的肿瘤抗原之一。新抗原中能够特异性激活T淋巴细胞的表位又称新表位(neoepitopes)，已在肿瘤免疫治疗中显现出独特的优势。
[0006]然而，目前鉴定的绝大多数新抗原多为患者所特有，人群覆盖率较低，严重制约了基于新表位的肿瘤免疫疗法的临床应用。因此，具有广泛人群覆盖率的共享新抗原将是未来临床应用的关键。
[0007]随着二代测序技术和生物信息学技术的发展，大量肿瘤患者的突变信息被COSMIC、TIMER等在线数据库收录，并且结合不同算法的预测软件将为ESR1来源的共享/热点突变位点特异性的新抗原的筛选及其突变特异性的表位肽的预测提供便利。但与此同时，表位肽预测的准确率较低，需要活性试验验证有效才具有实践意义。此外，HLA
‑
A2亚型在中国人群中占比50％左右。因此，鉴定HLA
‑
A2限制性共享新表位肽具有广泛的人群覆盖率，可为基于新抗原的肿瘤免疫治疗提供新的候选和策略。

技术实现思路

[0008]为了克服新抗原人群覆盖率低的问题，本专利技术通过COSMIC在线数据库分析，发现内分泌治疗耐药的样本中ESR1的突变率为76.06％，通过对ESR1点突变分析发现，ESR1突变主要集中在303、380、537和538四个位点，且一些肿瘤样本中同时存在两个或者两个以上的突变位点。ESR1四个突变位点能够覆盖80％以上的耐药突变样本，具有广泛的人群覆盖率，是免疫治疗的理想靶点。
[0009]本专利技术提供的新抗原表位肽来源于ESR1的高频突变，能够有效刺激、诱导产生新表位特异性的细胞毒性T淋巴细胞克隆，特异性区分野生型和突变型序列，杀伤表达突变表位的肿瘤细胞，具有良好的抗肿瘤效果，并且该新抗原表位肽患者覆盖率高，具有良好的治疗潜力和应用前景。因此，本专利技术主要解决的技术问题是提供一种新抗原ESR1来源的CTL表位肽或其编码核酸在制备治疗肿瘤的药物中的应用。
[0010]同时，本专利技术还提供一种治疗肿瘤的药物。
[0011]为解决上述技术问题，本专利技术提供了以下技术方案：
[0012]一种新抗原ESR1来源的CTL表位肽或其编码核酸在制备治疗肿瘤的药物中的应用，所述新抗原ESR1来源的CTL表位肽的氨基酸序列如SEQ ID NO：1、3、6、8、11、12、13、14中任一项或多项所示。
[0013]本专利技术通过分析COSMIC数据库和表位预测，获得了与新抗原ESR1及热点突变相关的14条抗原肽，其氨基酸序列如下所示：
[0014]ESR1
‑
K303R：RNSLALSLTADQMV(SEQ ID NO：1)；
[0015]ESR1
‑
K303R：Arg
‑
Asn
‑
Ser
‑
Leu
‑
Ala
‑
Leu
‑
Ser
‑
Leu
‑
Thr
‑
Ala
‑
Asp
‑
Gln
‑
Met
‑
Val。
[0016]ESR1
‑
E380Q：LLQCAWLEI(SEQ ID NO：2)；
[0017]ESR1
‑
E380Q：Leu
‑
Leu
‑
Gln
‑
Cys
‑
Ala
‑
Trp
‑
Leu
‑
Glu
‑
Ile。
[0018]ESR1
‑
E380Q(10aa)：HLLQCAWLEI(SEQ ID NO：3)；
[0019]ESR1
‑
E380Q(10aa)：His
‑
Leu
‑
Leu
‑
Gln
‑
Cys
‑
Ala
‑
Trp
‑
Leu
‑
Glu
‑
Ile。
[0020]ESR1
‑
Y537S：VPLSDLLLEM(SEQ ID NO：4)；
[0021]ESR1
‑
Y537S：Val
‑
Pro
‑
Leu
‑
Ser
‑
Asp
‑
Leu
‑
Leu
‑
Leu
‑
Glu
‑
Met。
[0022]ESR1
‑
Y537S
‑
D538G(1)：VPLSGLLLEM(SEQ ID NO：5)；
[0023]ESR1
‑
Y537S
‑
D538G(1)：Val
‑
Pro
‑
Leu
本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种新抗原ESR1来源的CTL表位肽或其编码核酸在制备治疗肿瘤的药物中的应用，其特征在于：所述新抗原ESR1来源的CTL表位肽的氨基酸序列如SEQ ID NO：1、3、6、8、11、12、13、14中任一项或多项所示。2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于：所述药物为可诱导机体产生新抗原特异性T细胞克隆的治疗性肿瘤疫苗或细胞制剂；优选地，所述治疗性肿瘤疫苗为核酸疫苗，所述核酸疫苗包含编码新抗原ESR1来源的CTL表位肽的核酸序列；或者，所述治疗性肿瘤疫苗为多肽疫苗、重组蛋白疫苗、合成长肽疫苗、混合肽池疫苗或包含抗原偶联物的疫苗，所述疫苗均包含新抗原ESR1来源的CTL表位肽的氨基酸序列；优选地，所述细胞制剂包含抗原提呈细胞，所述抗原提呈细胞包含新抗原ESR1来源的CTL表位肽的氨基酸序列。3.根据权利要求1所述的应用，其特征在于：所述药物为可治疗新抗原ESR1阳性表达的肿瘤的细胞制剂；优选地，所述细胞制剂包含经修饰的细胞，所述经修饰的细胞为编码T细胞受体或嵌合抗原受体的核酸转染的T细胞、NK细胞、NK
‑
T细胞、CD4
+
T细胞、CD8
+
T细胞或肿瘤浸润淋巴细胞，或者，所述经修饰的细胞为修饰有T细胞受体或嵌合抗原受体的T细胞、NK细胞、NK
‑
T细胞、CD4
+
T细胞、CD8
+
T细胞或肿瘤浸润淋巴细胞；所述T细胞受体或嵌合抗原受体特异性识别新抗原ESR1来源的CTL表位肽。4.一种治疗肿瘤的药物，其特征在于：所述药物包含新抗原ESR1来源的CTL表位肽或其编码核酸，或者包含特异性识别新抗原ESR1来源的CTL表位肽的T细胞受体、嵌合抗原受体或其编码核酸，所述新抗原ESR1来源的CTL表位肽的氨基酸序列如SEQ ID NO：1、3、6、8、11、12、13、14中任一项或多项所示。5.根据权利要求4所述的药物，其特征在于：所述药物为可诱导机体产生新抗原特异性T细胞克隆的治疗性肿瘤疫苗或细胞制剂；优选地，所述治疗性肿瘤疫苗为核酸疫苗，所述核酸疫苗包含编码新抗原ESR1来源的CTL表位肽的核酸序列；或者，所述治疗性肿瘤疫苗为多肽疫苗、重组蛋白疫苗、...

【专利技术属性】
技术研发人员：吴亚红，王明霜，李朵，孔亚南，
申请(专利权)人：郑州大学，
类型：发明
国别省市：