显微成像扫描方法及扫描系统技术方案

技术编号:38058023 阅读:8 留言:0更新日期:2023-06-30 11:24
本发明专利技术提供了显微成像扫描方法及扫描系统,通过采集切片的预览图像,可以对预览图像进行目标检测,框出切片所属的区域,在切片所属的区域,通过边缘检测算法,获得切片的轮廓,根据切片的轮廓规划扫描相机的扫描路径。本发明专利技术仅对切片进行扫描,对切片的轮廓外的空白区域不做扫描,本发明专利技术减少了不必要的扫描操作,提高了显微成像设备的扫描速度。提高了显微成像设备的扫描速度。提高了显微成像设备的扫描速度。

【技术实现步骤摘要】
显微成像扫描方法及扫描系统


[0001]本专利技术涉及显微成像
,尤其涉及一种显微成像扫描方法及扫描系统。

技术介绍

[0002]随着数字显微镜技术的发展,可以对整个病理切片进行自动的全面扫描以获得全切片数字显微图像,即在数字显微镜的放大下依次拍摄玻片各个视场的显微图像,并利用图像拼接技术获得完整的全切片数字显微图像。
[0003]在进行显微成像及扫描时,显微成像设备的扫描速度是一个非常关键的技术参数。为了提高设备的扫描速度,可以考虑使用更高速的相机,精度更高、移动速度更快的移动导向部件,更稳定的设备结构,以达到更高的扫描速度。因此,如何在使用这些手段的基础上,进一步提高扫描速度,是需要解决的技术问题。

技术实现思路

[0004]本专利技术的目的在于提供一种显微成像扫描方法及扫描系统,以提高显微成像设备的扫描速度。
[0005]为实现上述目的,本专利技术采用以下技术方案:
[0006]本专利技术第一个方面提供一种显微成像扫描方法,包括:
[0007]采集切片的预览图像,所述预览图像为第一全切片图像;
[0008]对所述预览图像进行目标检测,获取所述切片所属的区域;
[0009]在所述切片所属的区域,通过边缘检测算法,获取所述切片的轮廓;
[0010]根据所述切片的轮廓规划扫描路径;
[0011]按照所述扫描路径对所述切片进行扫描,获得当前扫描区域各个视野的图像;
[0012]将扫描获得的各图像进行拼接,获得第二全切片图像。<br/>[0013]在一种优选实施例中,所述采集切片的预览图像,是通过预览相机对玻片样本进行拍照得到的预览图像,所述预览相机是显微扫描仪上的相机;
[0014]在采集切片的预览图像之前,将显微扫描仪的物镜位置调整至允许的最高位置,物镜切换为放大倍数为最小倍数的物镜。
[0015]在一种优选实施例中,对所述切片进行扫描,是通过扫描相机对所述切片进行连续数字成像扫描,所述扫描相机是显微扫描仪上的相机。
[0016]在一种优选实施例中,所述预览图像为RGB格式的图像。
[0017]在一种优选实施例中,对所述预览图像进行目标检测,获取切片所属的区域,包括:
[0018]使用目标检测算法进行目标检测,采用矩形框框出目标物体,所述矩形框框出的区域即为所述切片所属的区域。
[0019]在一种优选实施例中,所述根据所述切片的轮廓规划扫描相机的扫描路径,包括:
[0020]根据横向扫描方向和纵向扫描方向,获取所述切片的轮廓的最小外接矩形,所述
最小外接矩形相邻的两条边中,一条边沿着横向扫描方向延伸,另一条边沿着纵向扫描方向延伸;
[0021]将所述最小外接矩形的尺寸调整至原来的Y/X倍,其中,X为获取所述预览图像所使用的物镜的放大倍数,Y为扫描所使用的物镜的放大倍数;
[0022]根据横向扫描步长、纵向扫描步长,对调整尺寸后的所述最小外接矩形进行网格化,划分为至少两个矩形区域;
[0023]检测矩形区域中位于所述切片的轮廓外的空白区域,剔除所述空白区域;
[0024]根据剩余的矩形区域,规划扫描路径,其中,每个矩形区域对应一个扫描相机的物方视场。
[0025]在一种更优选实施例中,所述根据剩余的矩形区域,规划扫描路径,包括:
[0026]在剩余的矩形区域中,规划行程最短的扫描路径。
[0027]进一步地,所述扫描路径的起点,选择为与剔除的空白区域相邻的矩形区域。
[0028]在一种更优选实施例中,所述扫描路径为蛇形路径。
[0029]本专利技术第二个方面还提供一种显微成像扫描系统,包括:
[0030]预览图像获取模块,用于采集切片的预览图像,所述预览图像为第一全切片图像;
[0031]切片区域获取模块,用于对所述预览图像进行目标检测,获取所述切片所属的区域;
[0032]切片轮廓确定模块,用于在所述切片所属的区域,通过边缘检测算法,获取所述切片的轮廓;
[0033]扫描路径规划模块,用于根据所述切片的轮廓规划扫描路径;
[0034]扫描图像获取模块,用于按照所述扫描路径对所述切片进行扫描,获得当前扫描区域各个视野的图像;
[0035]图像拼接模块,用于将扫描获得的各图像进行拼接,获得第二全切片图像。
[0036]在一种优选实施例中,所述扫描路径规划模块,包括:
[0037]最小外接矩形获取模块,用于根据横向扫描方向和纵向扫描方向,获取所述切片的轮廓的最小外接矩形,所述最小外接矩形相邻的两条边中,一条边沿着横向扫描方向延伸,另一条边沿着纵向扫描方向延伸;
[0038]尺寸调整模块,用于将所述最小外接矩形的尺寸调整至原来的Y/X倍,其中,X为获取所述预览图像所使用的物镜的放大倍数,Y为扫描所使用的物镜的放大倍数;
[0039]矩形区域生成模块,用于根据横向扫描步长、纵向扫描步长,对调整尺寸后的所述最小外接矩形进行网格化,划分为至少两个矩形区域;
[0040]空白区域检测模块,用于检测矩形区域中位于所述切片的轮廓外的空白区域,剔除所述空白区域;
[0041]扫描路径规划模块,用于根据剩余的矩形区域,规划扫描路径,其中,每个矩形区域对应一个扫描相机的物方视场。
[0042]本专利技术第三个方面还提供一种计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序,所述计算机程序被处理器执行时实现上述所述方法的步骤。
[0043]与现有技术相比,本专利技术的技术方案具有以下有益效果:
[0044]本专利技术提供一种显微成像扫描方法及扫描系统,通过采集切片的预览图像,可以
对预览图像进行目标检测,框出切片所属的区域,在切片所属的区域,通过边缘检测算法,获得切片的轮廓,根据切片的轮廓规划扫描相机的扫描路径,这样,可以仅对切片进行扫描,其余空白区域不作扫描,减少了不必要的扫描操作,可以提高显微成像设备的扫描速度。
附图说明
[0045]为了更清楚地说明本专利技术具体实施方式或现有技术中的技术方案,下面将对具体实施方式或现有技术描述中所需要使用的附图作简单地介绍,显而易见地,下面描述中的附图是本专利技术的一些实施方式,对于本领域普通技术人员来讲,在不付出创造性劳动的前提下,还可以根据这些附图获得其他的附图。
[0046]图1是本专利技术实施例的一种显微成像扫描方法的流程示意图之一;
[0047]图2是本专利技术实施例的一种显微成像扫描方法的流程示意图之二;
[0048]图3是本专利技术实施例示出的一切片轮廓的最小外接矩形的示意图;
[0049]图4是本专利技术实施例示出的将最小外接矩形进行网格化的示意图;
[0050]图5是本专利技术实施例示出检测切片的轮廓外的空白区域的示意图;
[0051]图6是本专利技术实施例示出的一种根据切片的轮廓规划扫描路径的示意图;
[0052]图7是本专利技术实施例示出的另一种根据切片的轮廓规划扫描本文档来自技高网
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.显微成像扫描方法,其特征在于,包括:采集切片的预览图像,所述预览图像为第一全切片图像;对所述预览图像进行目标检测,获取所述切片所属的区域;在所述切片所属的区域,通过边缘检测算法,获取所述切片的轮廓;根据所述切片的轮廓规划扫描路径;按照所述扫描路径对所述切片进行扫描,获得当前扫描区域各个视野的图像;将扫描获得的各图像进行拼接,获得第二全切片图像。2.根据权利要求1所述的显微成像扫描方法,其特征在于,所述采集切片的预览图像,是通过预览相机对玻片样本进行拍照得到的预览图像,所述预览相机是显微扫描仪上的相机;在采集切片的预览图像之前,将显微扫描仪的物镜位置调整至允许的最高位置,物镜切换为放大倍数为最小倍数的物镜。3.根据权利要求1所述的显微成像扫描方法,其特征在于,对所述切片进行扫描,是通过扫描相机对所述切片进行连续数字成像扫描,所述扫描相机是显微扫描仪上的相机。4.根据权利要求1所述的显微成像扫描方法,其特征在于,对所述预览图像进行目标检测,获取切片所属的区域,包括:使用目标检测算法进行目标检测,采用矩形框框出目标物体,所述矩形框框出的区域即为所述切片所属的区域。5.根据权利要求1所述的显微成像扫描方法,其特征在于,所述根据所述切片的轮廓规划扫描相机的扫描路径,包括:根据横向扫描方向和纵向扫描方向,获取所述切片的轮廓的最小外接矩形,所述最小外接矩形相邻的两条边中,一条边沿着横向扫描方向延伸,另一条边沿着纵向扫描方向延伸;将所述最小外接矩形的尺寸调整至原来的Y/X倍,其中,X为获取所述预览图像所使用的物镜的放大倍数,Y为扫描所使用的物镜的放大倍数;根据横向扫描步长、纵向扫描步长,对调整尺寸后的所述最小外接矩形进行网格化,划分为至少两个矩形区域;检测矩形区域中位于所述切片的轮廓外的空白区域,剔除所述空白区域;根据剩余的矩形区域,规划扫描路径,其中,每个矩形区域对...

【专利技术属性】
技术研发人员:梅园
申请(专利权)人:上海申挚医疗科技有限公司
类型:发明
国别省市:

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