一种肺淋巴上皮瘤样癌诊断和/或发病风险评估产品制造技术

技术编号:38037400 阅读:13 留言:0更新日期:2023-06-30 11:04
本发明专利技术公开了一种肺淋巴上皮瘤样癌诊断和/或发病风险评估产品,其含有检测EB病毒loc7209、loc132048和/或loc156013中的一个或几个的基因型的试剂。本发明专利技术提供了一组与肺淋巴上皮瘤样癌发病风险相关的EB病毒基因组变异位点,并根据这组变异位点制备了一种可用于EB病毒变异位点检测及分型的试剂盒,该变异位点组合联合患者性别、年龄信息,可以精确评估EB病毒感染者罹患肺淋巴上皮瘤样癌的患病风险,对EB病毒相关肿瘤的预防、筛查、预后提升以及对EB病毒疫苗研制均具有重要指导意义与实际应用价值。际应用价值。际应用价值。

【技术实现步骤摘要】
一种肺淋巴上皮瘤样癌诊断和/或发病风险评估产品


[0001]本专利技术涉及肺淋巴上皮瘤样癌分子诊断
,具体地,涉及一种肺淋巴上皮瘤样癌诊断和/或发病风险评估产品。

技术介绍

[0002]肺淋巴上皮瘤样癌是一种特殊类型的非小细胞肺癌,与其他类型非小细胞肺癌不同的是,肺淋巴上皮瘤样癌好发于亚洲的年轻女性,且多为非吸烟者。此外由于疾病早期症状不典型,易被忽视或误诊为其他疾病而延误治疗。并且一些经典的肺癌驱动变异如表皮生长因子受体变异、间变性淋巴瘤激酶重排等在肺淋巴上皮瘤样癌患者中相当罕见,使得现有靶向治疗药物难以奏效。目前对肺淋巴上皮瘤样癌的研究认为,EB病毒感染是其发病的重要原因,因此EB病毒可能是提升其筛查和治疗手段的重要突破口。
[0003]EB病毒是一种广泛分布的人类疱疹病毒,并且是人类最早鉴定出的致瘤病毒,与全球1.8%的恶性肿瘤死亡事件相关。除肺淋巴上皮瘤样癌外,EB病毒还与多种恶性肿瘤相关,如鼻咽癌、EB病毒相关胃癌及多种淋巴瘤。全球有95%的人有EB病毒感染史并终身携带病毒,但仅有极少部分个体会发展为EB病毒相关的恶性肿瘤。EB病毒基因组为172kb的双链DNA,编码超过90种蛋白及多种RNA。已有研究表明EB病毒基因组的遗传变异在多种EB病毒相关的肿瘤中发挥重要作用,它们可以通过改变EB病毒编码基因的表达水平及功能,从而影响EB病毒的致病能力,因此推测EB病毒的特定单倍型可能与包含肺淋巴上皮瘤样癌在内的恶性肿瘤的发病风险相关。

技术实现思路

[0004]本专利技术的目的是提供一种肺淋巴上皮瘤样癌诊断和/或发病风险评估产品。鉴定肺淋巴上皮瘤样癌相关的EB病毒基因组变异位点,构建肺淋巴上皮瘤样癌的高危EB病毒单倍型,对肺淋巴上皮瘤样癌的病因学研究、肿瘤预防、早期筛查、治疗手段改进具有重要意义,并且对EB病毒疫苗的设计与研发提供重要参考。鉴定出肺淋巴上皮瘤样癌风险相关的EB病毒变异位点及病毒单倍型,可用于肺淋巴上皮瘤样癌的预防、早期筛查,并有助于EB病毒疫苗的研发和肿瘤治疗靶点的研究,减轻个人及社会的肿瘤负担。
[0005]本专利技术的第一个目的是提供检测受检者EB病毒loc7209、loc132048和/或loc156013中的一个或几个的基因型的试剂在制备肺淋巴上皮瘤样癌诊断和/或发病风险评估产品中的应用。
[0006]本专利技术的另一个目的是提供一种肺淋巴上皮瘤样癌诊断和/或发病风险评估产品。
[0007]为了实现上述目的,本专利技术是通过以下方案予以实现的:
[0008]专利技术人基于肺淋巴上皮瘤样癌患者和健康对照人群进行EB病毒全基因组关联研究,发现了3个肺淋巴上皮瘤样癌发病风险相关的EB病毒基因组变异位点(loc7209、loc132048以及loc156013),并研制出本专利技术所述的EB病毒变异位点检方法及分型试剂盒,
用于评估受检者罹患肺淋巴上皮瘤样癌的风险程度。
[0009]因此本专利技术要求保护以下内容:
[0010]检测受检者EB病毒loc7209、loc132048和/或loc156013中的一个或几个的基因型的试剂在制备肺淋巴上皮瘤样癌诊断和/或发病风险评估产品中的应用。
[0011]其中,loc7209位于NC_007605.1的7209个碱基,loc132048位于NC_007605.1的132048个碱基,loc156013位于NC_007605.1的156013个碱基。
[0012]优选地,所述loc7209基因型为T该受检者为肺淋巴上皮瘤样癌的高危人群,患有肺淋巴上皮瘤样癌概率高;所述loc7209基因型为C该受检者为肺淋巴上皮瘤样癌的低危人群,患有肺淋巴上皮瘤样癌概率低。
[0013]优选地,所述loc132048基因型为A该受检者为肺淋巴上皮瘤样癌的高危人群,患有肺淋巴上皮瘤样癌概率高;所述loc132048基因型为G该受检者为肺淋巴上皮瘤样癌的低危人群,患有肺淋巴上皮瘤样癌概率低。
[0014]优选地,所述loc156013基因型为T该受检者为肺淋巴上皮瘤样癌的高危人群,患有肺淋巴上皮瘤样癌概率高;所述loc156013基因型为C该受检者为肺淋巴上皮瘤样癌的低危人群,患有肺淋巴上皮瘤样癌概率低。
[0015]更优选地,检测loc7209、loc132048和loc156013的基因型,loc7209、loc132048和loc156013的基因单倍型为TAT或TGT该受检者为肺淋巴上皮瘤样癌的高危人群,患有肺淋巴上皮瘤样癌概率高;loc7209、loc132048和loc156013的基因单倍型为CGC该受检者为肺淋巴上皮瘤样癌的低危人群,患有肺淋巴上皮瘤样癌概率低。
[0016]进一步优选地,根据loc7209、loc132048和loc156013的基因型得到风险评分,风险评分=(0.08
×
年龄的评分)

(1.65
×
性别的评分)+(17.3
×
loc7209分型的评分)+(1.35
×
loc132048分型的评分)+(16.9
×
SNP156013分型的评分);
[0017]其中,年龄的评分:以实际的年龄代入;性别的评分:男性=“1”,女性=“0”;分型的评分:对于EB病毒基因组变异位点分型,危险型=“1”,非危险型=“0”;
[0018]其中,loc7209的非危险型为“C”,危险型为“T”;loc132048的非危险型为“G”,危险型为“A”;loc156013的非危险型为“C”,危险型为“T”;
[0019]受检者的风险评分小于40时,认定该受检者为肺淋巴上皮瘤样癌的低危人群;当受检者的风险评分高于40时,认定该受检者为肺淋巴上皮瘤样癌的高危人群。
[0020]优选地,所述试剂为引物。
[0021]本专利技术还要求保护一种肺淋巴上皮瘤样癌诊断和/或发病风险评估产品,含有检测EB病毒loc7209、loc132048和/或loc156013中的一个或几个的基因型的试剂。
[0022]优选地,含有检测EB病毒loc7209、loc132048和loc156013的基因型的试剂。
[0023]更优选地,检测EB病毒loc7209基因型的试剂为SEQ ID NO.1~2所示的引物;
[0024]检测EB病毒oc132048基因型的试剂为SEQ ID NO.3~4所示的引物;
[0025]检测EB病毒loc156013基因型的试剂为SEQ ID NO.5~6所示的引物。
[0026]与现有技术相比,本专利技术具有以下有益效果:
[0027](1)病毒基因组变异位点是一种新型遗传性生物标志物,且EB病毒以唾液方式传播,且基因组稳定、变异率低,唾液EB病毒的基因组和肿瘤组织中的基因组高度相似,使唾液样本具有无创、易获取、易于检测的优点。
[0028](2)本专利技术提供了一种系统的EB病毒变异位点检测及分型本文档来自技高网
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.检测受检者EB病毒loc7209、loc132048和/或loc156013中的一个或几个的基因型的试剂在制备肺淋巴上皮瘤样癌诊断和/或发病风险评估产品中的应用。2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述loc7209基因型为T该受检者为肺淋巴上皮瘤样癌的高危人群,患有肺淋巴上皮瘤样癌概率高;所述loc7209基因型为C该受检者为肺淋巴上皮瘤样癌的低危人群,患有肺淋巴上皮瘤样癌概率低。3.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述loc132048基因型为A该受检者为肺淋巴上皮瘤样癌的高危人群,患有肺淋巴上皮瘤样癌概率高;所述loc132048基因型为G该受检者为肺淋巴上皮瘤样癌的低危人群,患有肺淋巴上皮瘤样癌概率低。4.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述loc156013基因型为T该受检者为肺淋巴上皮瘤样癌的高危人群,患有肺淋巴上皮瘤样癌概率高;所述loc156013基因型为C该受检者为肺淋巴上皮瘤样癌的低危人群,患有肺淋巴上皮瘤样癌概率低。5.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,检测loc7209、loc132048和loc156013的基因型。6.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,根据loc7209、loc132048和loc156013的基因型得到风险评分,风险评分=(0.08
×
年龄的评分)

(1.65
×
性别的评分)+(1...

【专利技术属性】
技术研发人员:贾卫华吴艳霞王瞳旻
申请(专利权)人:中山大学肿瘤防治中心中山大学附属肿瘤医院中山大学肿瘤研究所
类型:发明
国别省市:

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