评价观测值的准确性的方法及程序技术

在本公开中，提供一种方法，关于具有二项分类的分类属性，该方法评价对象属于某个组的似然度，其中，所述方法包括如下步骤：接收与对象的观测值相关的对象得分；使用以与所述观测值相关的得分为中介变量的在灵敏度与特异度之间成立的关系式，取得以所述对象得分为所述中介变量的情况下的所述对象得分的所述灵敏度和所述特异度；取得所述对象的属性的先验概率；及基于所述对象的所述灵敏度、所述特异度及所述先验概率来取得属于所述对象特有的分类属性的似然度。类属性的似然度。类属性的似然度。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】评价观测值的准确性的方法及程序


[0001]本公开涉及评价观测值的准确性的方法、程序及系统。

技术介绍

[0002]迄今为止，检查结果是对照ROC曲线来判断对象是阳性或阴性。这是将ROC曲线上固有的点(距左角最近的点，由约登指数(Youden Index)决定的点)作为截止点。通常，如果观测值比截止点高，则返回阳性的结果，如果观测值比截止点低，则返回阴性的结果。根据该截止点，计算阳性预测值(PPV)。但是，该阳性预测值是ROC曲线固有的值，只不过是对评价系统进行评价的值。

技术实现思路

[0003]专利技术所要解决的课题
[0004]对象者期望根据检查结果更适当地评价自身是阳性还是阴性、即更适当地评价对象者的结果的方法。
[0005]用于解决课题的技术方案
[0006]根据本公开的一个实施方式，提供一种评价对象属于某个组的似然度(准确性)的新的方法。在一些实施方式中，方法可以包括：取得与对象的观测值相关的对象得分。在一些实施方式中，方法也可以包括：使用以与观测值相关的得分为中介变量的、在灵敏度与特异度之间成立的关系式，取得以对象得分为中介变量的情况下的对象得分的灵敏度和记特异度。在一些实施方式中，方法也可以包括：取得对象的属性的先验概率。在一些实施方式中，方法也可以包括：基于对象的灵敏度、特异度及先验概率来取得属于对象特有的分类属性的似然度。
[0007]本领域的技术人员将容易地从下面的详细描述中了解本公开的进一步的方式和优点，在下面的详细描述中，仅仅示出和描述了本公开的示例性实施例。应当理解，本公开可以具有其他不同的实施例，并且其一些细节可以在不脱离本公开的情况下以各种清楚的方式进行修改。因此，附图和说明本质上应该视为示例，而不应该视为限定。
附图说明
[0008]图1表示示出本公开的一个实施方式所涉及的评价方法的流程图。
[0009]图2表示示出本公开的一个实施方式所涉及的计算机控制系统的框图。
具体实施方式
[0010]图1中示出本公开的一个实施方式所涉及的评价对象属于某个组的似然度(准确性)的新的方法的流程图。在步骤S101中，接收与对象的观测值相关的对象得分。在步骤S102中，使用以与观测值相关的得分得分为中介变量的、在灵敏度与特异度之间成立的关系式，取得以对象得分为中介变量的情况下的对象得分的灵敏度和记特异度。在步骤S103
中，取得对象的属性的先验概率。在步骤S104中，基于对象的所述灵敏度、特异度及先验概率来取得属于对象特有的分类属性的似然度。
[0011]＜观测＞
[0012]本公开中使用的“观测”不限于狭义的“进行观测”，通常是指生物、医学、药学、生化、物理、化学、电、光学上的观测、测定、分析等。
[0013]＜检查＞
[0014]在一些实施方式中，观测也可以是临床检查。
[0015]临床检查包括样本检查、活体检查、图像诊断、病理诊断、身体检查、心理检查、其他以有无疾病或诊断为目的或即使不是目的也用于得到关联的信息的检查。
[0016]样本检查包括生化检查、血液学检查、尿/粪便检查、免疫学检查、微生物学检查等。
[0017]在本公开中，用于检查的体液是指从对象得到的体液或来源于该体液的试样。非限定性地，体液可以是血液、血清、血浆、淋巴液，也可以是组织间液、细胞间液、间质液等组织液，也可以是体腔液、浆膜腔液、胸水、腹水、心囊液、脑脊髓液(髓液)、关节液(滑液)、眼房水(房水)。体液可以是唾液、胃液、胆汁、胰液、肠液等消化液，也可以是汗、泪、鼻涕、尿、精液、阴道液、羊水、乳汁。体液可以是动物的体液，也可以是人的体液。
[0018]活体检查包括呼吸循环功能检查、超声波检查、由监视装置进行的各个检查、脑电波检查、神经/肌肉检查、耳鼻喉科学性检查、眼科学性检查、皮肤科学性检查、临床心理/神经心理检查、负荷试验等使用放射性同位素的检查、内窥镜检查等。在一些实施方式中，活体检查也可以是液体活检。
[0019]在一些实施方式中，观测值可以是与基因检查中的基因表达相关的量、频度及其他检查值。
[0020]基因可以是核酸(DNA及RNA中的至少一方)。
[0021]RNA可以是信使RNA(mRNA)、转运RNA(tRNA)、核糖体RNA(rRNA)、微小RNA(miRNA)等。
[0022]在基因检查中，也可以取得对象者的体液(血液、唾液、尿等)，测定规定或任意的核酸的量(相对量、绝对量)。核酸可以扩增。核酸可以使用DNA芯片(也称为微阵列)、定序器等遗传解析设备来测定。
[0023]基因检查可以包括基因变异的检查。作为基因变异，可以测定复制数变化。也可以测定单核苷酸多态性(SNP)的数量、表达量变化。也可以测定融合基因。例如，也可以判定在规定的基因或碱基部位是否发生融合。也可以测定融合基因的数量。也可以测定染色体异常。也可以测定有无染色体异常、其规定区域内的量或频度等。染色体异常可以是结构的变化或染色体数的变化或者这双方。也可以测定肿瘤基因变异量(TMB)。也可以测定肿瘤基因的数量或TMG得分。也可以测定甲基化(位点的数量、在规定的位点的频度)、乙酰化等表观遗传变化的量。也可以测定这些变异产生的部位的数量或在规定的部位的变化量。也可以进行微卫星不安定性(MSI)的解析或检查。也可以测定微卫星区域中的产生变化的碱基的数量或其频度。也可以测定拼接异常。可以测定该异常的有无，也可以测定该部位的数量(个数或碱基数)、绝对数、频度等。
[0024]在通过数值来评价观测的情况下，得分可以是该观测值，也可以是根据该观测值
换算出的值。在观测不提供数值的情况下，得分也可以通过评价方法将观测结果数值化来求出。
[0025]得分可以是检查结果的值本身，也可以是加工后的值。得分可以是归一化的值。得分也可以根据检查结果的值或评价来计算。得分也可以基于多个检查的结果来计算。在几个方式中，也可以将它们复合而使用机器学习等软件来计算得分。得分可以是连续或非连续(离散数、例如二值0/1)。在一些实施方式中，可以将遗传检查中的体液中的规定的基因(例如RNA)的量作为得分，或者也可以利用根据基因表达量谱求出的得分。
[0026]在一些实施方式中，本公开的方法可以包括提供基于与观测值相关的得分的二项分类。在一些实施方式中，本公开的方法可以包括提供基于与观测值相关的得分的多值分类。
[0027]二项(或多值)分类可以事先或与对象的观测独立地准备或提供。也可以相对于观测值的得分，得到规定的分类。
[0028]＜关系式＞
[0029]在一些实施方式中，也可以使用以得分为中介变量的关系式。
[0030]中介变量可以被称为阈值或截止点。
[0031]在一些实施方式中，也可以使用与二项分类的一方相关的值和与另一方相关的值之间的关系式。在几个方式中，也可以使用二项分类的TPR(真阳性率)和FNR(假阳性率)中的任一方与FPR(假阳性率本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种方法，关于具有二项分类的分类属性，该方法评价对象属于某个组的似然度，其中，所述方法包括如下步骤：接收与对象的观测值相关的对象得分；使用以与所述观测值相关的得分为中介变量的、在灵敏度与特异度之间成立的关系式，取得以所述对象得分为所述中介变量的情况下的所述对象得分的所述灵敏度和所述特异度；取得所述对象的属性的先验概率；及基于所述对象的所述灵敏度、所述特异度及所述先验概率来取得属于所述对象特有的分类属性的似然度。2.根据权利要求1所述的方法，其中，取得所述对象为阳性的似然度或为阴性的似然度的步骤包括分别取得与所述对象得分相关的修正阳性预测值或修正阴性预测值。3.一种方法，关于具有二项分类的临床检查，该方法评价对象是阳性或阴性的似然度，其中，所述方法包括如下步骤：接收与对象的临床检查相关的对象得分；根据在以与所述临床检查相关的得分得分为中介变量的灵敏度和特异度之间成立的关系式，取得以所述对象得分为所述中介变量的情况下的所述对象得分的所述灵敏度和所述特异度；取得所述对象的属性的患病率；及基于所述对象的所述灵敏度、所述特异度及所述患病率，取得所述对象为阳性的似然度或为阴性的似然度。4.根据权利要求3所述的方法，其中，取得所述对象为阳性的似然度或为阴性的似然度的步骤包括分别取得与所述对象得分相关的修正阳性预测值或修正阴性预测值。5.根据权利要求3或4所述的方法，其中，所述临床检查是活体检查。6.根据权利要求3至5中任一项所述的方法，其中，所述临床检查是液体活检。7.根据权利要求6所述的方法，其中，所述液体活检是尿检查或血液检查。8.根据权利要求3...

【专利技术属性】
技术研发人员：市川裕树，山口裕树，水沼未雅，
申请(专利权)人：科莱鹤株式会社，
类型：发明
国别省市：