一种检测鸡INHA基因单核苷酸多态性的方法及其应用技术

发明专利技术名称利用PCR

【技术实现步骤摘要】
一种检测鸡INHA基因单核苷酸多态性的方法及其应用


[0001]本专利技术涉及分子遗传学和动物育种领域。涉及INHA基因的单核苷酸多态性(SNP)分子标记的检测方法及应用。

技术介绍

[0002]单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)指在基因组水平上由于单个碱基的转换、颠换、插入、缺失而引起的变异，进而形成DNA序列多态性，并且一种等位基因在群体中的频率不少于1％。SNP广泛存在于基因组中，是第三代分子标记，在遗传图谱构建、基因精确定位、遗传育种等方面应用广泛。SNP在基因组中的位置可分为基因编码区的突变SNP(coding SNP,cSNP)和非编码区的SNP。位于编码区内的cSNP比较少，但却在遗传育种研究中具有重要意义，因此，编码区内的cSNP的研究更受关注。cSNP分为同义cSNP和非同义cSNP。同义cSNP指碱基突变后没有引起其所翻译的蛋白质的氨基酸序列发生改变。非同义cSNP指碱基突变后引起其所翻译的蛋白质的氨基酸序列发生改变，可能最终影响到蛋白质的功能。
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种利用PCR
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RFLP检测鸡INHA基因单核苷酸多态性的方法及其在蛋鸡分子辅助选择育种中的应用，其特征在于：以待测鸡全基因组DNA为模板，以引物对P1和P2为引物，PCR扩增鸡INHA基因片段；分别用限制性内切酶XhoI和BsaWI酶切PCR扩增产物，对酶切产物分别进行琼脂糖凝胶电泳；根据电泳结果鉴定绵羊INHA基因c.187C＞T和c.680A＞G位点的基因型。所述的引物对P1序列为：上游引物F1：5
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ACATTTGCGTCAGTGTCAGATAC
‑3’
；下游引物R1：5
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CATCGTAACCCATCACTTAGCAT
‑3’
；所述的c.187C＞T位点表现为C或T的单核苷酸多态性，具有CC、TT以及CT三种基因型，电泳结果分别为：CC型表现为532bp和105bp两个条带；TT型表现为637bp；TC型表现为532bp，105bp和637bp三个条带。c.187C＞T位点对300日龄产蛋量，TC与TT基因型均显著高于CC基因型，对500日龄产蛋量，TC显著高于CC基因型，TT极显著高于CC基因型。所述的引物对P2序列为：上游引物F2：5
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ATGGGTTACGATGCTGAAGGAT
‑3’
；下游引物R2：5
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AAAGAGATGTTGAGGGACGCC
‑3’
；所述的c.680A＞G位点表现为A或G的单核苷酸多态性，具...

【专利技术属性】
技术研发人员：王红娜，马腾壑，潘晨曦，李璐，潘辰冲，陈俞任，
申请(专利权)人：河北工程大学，
类型：发明
国别省市：