一种胃癌患者预后生物标志物及其应用制造技术

本发明专利技术涉及一种胃癌患者预后生物标志物在制备胃癌患者预后和免疫检查点抑制剂治疗反应的检测工具中的应用，所述生物标志物包括cg06804210、cg19410791或cg12606911中的至少一种，通过分析所述生物标志物的甲基化水平，可对胃癌患者预后和免疫检查点抑制剂治疗反应的进行评估。本发明专利技术首次发现CD8A基因的甲基化位点cg06804210、cg19410791、cg12606911的甲基化水平与胃癌患者预后以及胃癌肿瘤环境中的免疫微环境之间的相关性，并基于该发现将所述甲基化位点作为评估胃癌患者预后和免疫检查点抑制剂治疗反应的生物标志物，其对胃癌患者的治疗具有重要价值。患者的治疗具有重要价值。患者的治疗具有重要价值。

【技术实现步骤摘要】
一种胃癌患者预后生物标志物及其应用


[0001]本专利技术涉及生物医药
，特别是涉及一种胃癌预后生物标志物及其应用。

技术介绍

[0002]胃癌是世界范围内最常见的癌症之一，每年新增患者超过100万，占所有癌症诊断的5.7％。近年来，针对胃癌的临床治疗取得了很大进展，尤其是免疫治疗，例如免疫检查点抑制剂的应用等。但是，实践中只有少数患者可以从免疫检查点抑制剂治疗中受益。因此，确定可靠的分子生物标记物对胃癌的预后以及免疫治疗的反应进行预测显得极其重要。
[0003]DNA甲基化是基因表观遗传调控的重要组成部分，经常被描述为“沉默”表观遗传标记。随着甲基化技术基因组规模绘图的快速发展，DNA甲基化已成为诊断、治疗反应和预测各种疾病(包括癌症)生存率的一种有前景的生物标记物。最近，无细胞DNA甲基化生物标记物的液体活检也已成为肿瘤学中一种有前途的无创诊断方法。此外，许多研究发现了使用DNA甲基化预测癌症免疫治疗反应的应用。因此，其有望成为寻找可对胃癌患者预后和免疫治疗反应进行预测的生物标志物的着眼点。

技术实现思路

[0004]基于此，本专利技术的目的在于，提供一种胃癌预后生物标志物组合，其可对胃癌的预后和免疫治疗反应进行预测。
[0005]一种胃癌患者预后生物标志物在制备胃癌患者预后和免疫检查点抑制剂治疗反应的检测工具中的应用，其中所述生物标志物包括cg06804210、cg19410791或cg12606911中的至少一种。
[0006]具体地，所述cg06804210、cg19410791、cg12606911均为CD8A基因(genebank登录号：925)的甲基化位点，其位于所述CD8A基因的启动子上。本专利技术首次发现所述三个甲基化位点的甲基化水平与胃癌患者预后以及胃癌肿瘤环境中的免疫微环境之间的相关性，并基于该发现将所述甲基化位点作为评估胃癌患者预后和免疫检查点抑制剂治疗反应的生物标志物并应用于制备胃癌患者预后和免疫检查点抑制剂治疗反应的检测工具中。
[0007]进一步地，所述检测工具检测所述生物标志物的甲基化水平，并基于所述生物标志物的甲基化水平对胃癌患者预后和免疫检查点抑制剂治疗反应进行评估。
[0008]进一步地，所述检测工具包括检测所述生物标志物甲基化水平的试剂。
[0009]本专利技术还提供一种评估胃癌患者预后和免疫检查点抑制剂治疗反应的检测工具，其包括检测生物标志物甲基化水平的试剂，其中所述生物标志物包括cg06804210、cg19410791或cg12606911中的至少一种。
[0010]进一步地，所述检测工具基于所述生物标志物的甲基化水平对胃癌患者预后和免疫检查点抑制剂治疗反应进行评估。
[0011]为了更好地理解和实施，下面结合附图详细说明本专利技术。
附图说明
[0012]图1为实施例1所述的14个保护位点的Kaplan
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Meier生存分析的曲线图，图1A：甲基化位点cg13803976的Kaplan
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Meier生存分析曲线图，图1B：甲基化位点cg07152196的Kaplan
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Meier生存分析曲线图，图1C：甲基化位点cg26057751的Kaplan
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Meier生存分析曲线图，图1D：甲基化位点cg06804210的Kaplan
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Meier生存分析曲线图，图1E：甲基化位点cg12653796的Kaplan
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Meier生存分析曲线图，图1F：甲基化位点cg19410791的Kaplan
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Meier生存分析曲线图，图1G：甲基化位点cg09046939的Kaplan
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Meier生存分析曲线图，图1H：甲基化位点cg00916536的Kaplan
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Meier生存分析曲线图，图1I：甲基化位点cg12606911的Kaplan
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Meier生存分析曲线图，图1J：甲基化位点cg13946520的Kaplan
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Meier生存分析曲线图，图1K：甲基化位点cg05163496的Kaplan
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Meier生存分析曲线图，图1L：甲基化位点cg27247697的Kaplan
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Meier生存分析曲线图，图1M：甲基化位点cg27502457的Kaplan
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Meier生存分析曲线图，图1N：甲基化位点cg17108819的Kaplan
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Meier生存分析曲线图；
[0013]图2为实施例2所述的14个保护位点的甲基化水平与CD8A基因表达的相关性示意图，图2A：甲基化位点cg13803976的甲基化水平与CD8A基因表达水平的相关性示意图，图2B：甲基化位点cg07152196的甲基化水平与CD8A基因表达水平的相关性示意图，图2C：甲基化位点cg26057751的甲基化水平与CD8A基因表达水平的相关性示意图，图2D：甲基化位点cg06804210的甲基化水平与CD8A基因表达水平的相关性示意图，图2E：甲基化位点cg12653796的甲基化水平与CD8A基因表达水平的相关性示意图，图2F：甲基化位点cg19410791的甲基化水平与CD8A基因表达水平的相关性示意图，图2G：甲基化位点cg09046939的甲基化水平与CD8A基因表达水平的相关性示意图，图2H：甲基化位点cg00916536的甲基化水平与CD8A基因表达水平的相关性示意图，图2I：甲基化位点cg12606911的甲基化水平与CD8A基因表达水平的相关性示意图，图2J：甲基化位点cg13946520的甲基化水平与CD8A基因表达水平的相关性示意图，图2K：甲基化位点cg05163496的甲基化水平与CD8A基因表达水平的相关性示意图，图2L：甲基化位点cg27247697的甲基化水平与CD8A基因表达水平的相关性示意图，图2M：甲基化位点cg27502457的甲基化水平与CD8A基因表达水平的相关性示意图，图2N：甲基化位点cg17108819的甲基化水平与CD8A基因表达水平的相关性示意图；
[0014]图3为实施例3所述的肿瘤微环境浸润免疫细胞的富集分数与所述34个CD8A甲基化位点的甲基化水平的相关性热图；
[0015]图4为实施例4所述的14个保护位点的低甲基化和高甲基化组对应的三种主要抑制性免疫特征的富集分数示意图，图4A：甲基化位点cg13803976的富集分数示意图，图4B：甲基化位点cg07152196的富集分数示意图，图4C：甲基化位点cg26057751的富集分数示意图，图4D：甲基化位点cg06804210的富集分数示意图，图4E：甲基化位点cg12653796的富集分数示意图，图4F：甲基化位点cg19410791的富集分数示意图，图4G：甲基化位点cg09046939的富集分数示意图，图4H：甲基化位点cg00916536的富集分数示意图本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种胃癌患者预后生物标志物在制备胃癌患者预后和免疫检查点抑制剂治疗反应的检测工具中的应用，其特征在于，所述生物标志物包括cg06804210、cg19410791或cg12606911中的至少一种。2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述检测工具检测所述生物标志物的甲基化水平，并基于所述生物标志物的甲基化水平对胃癌患者预后和免疫检查点抑制剂治疗反应进行评估。3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，...

【专利技术属性】
技术研发人员：邓务国，龙谦，贾轲，
申请(专利权)人：广州希灵生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：