用于检测肥厚型心肌病致病基因突变的基因标志物及其应用制造技术

本发明专利技术公开了用于检测肥厚型心肌病致病基因突变的基因标志物及其应用，该基因标志物选自以下基因形成的组：MYBPC3、MYH7、TNNI3、TNNT2、ALPK3、TPM1、OBSCN和TTN，特别是该基因标志物为MYBPC3和/或MYH7，其作为生物标志物用于制备早期诊断肥厚型心肌病的药物以及检测该基因标志物的试剂用于制备检测肥厚型心肌病致病基因突变的药物。本发明专利技术通过对所有已知的肥厚型心肌病致病基因进行全外显子组测序，对肥厚型心肌病表型和基因型之间的关系进行精确评估确定敏感的预测参数，提高临床基因测试的效率，增加基因检测的阳性率，具有较高的临床应用价值。的临床应用价值。的临床应用价值。

【技术实现步骤摘要】
用于检测肥厚型心肌病致病基因突变的基因标志物及其应用


[0001]本专利技术属于生物医药
，具体涉及用于检测肥厚型心肌病致病基因突变的基因标志物及其应用。

技术介绍

[0002]肥厚型心肌病(HCM)的特点是左心室肥大，不能用异常压力或全身性疾病来解释，临床症状从无症状到心脏猝死不等，即使没有明显症状的人也可能会增加心血管并发症的风险。早期识别和干预至关重要，因为肥厚型心肌病影响0.2％至0.5％的普通人群，其中30％至60％的患者有致病或可能致病的基因变体。目前有相当一部分肥厚型心肌病患者缺乏证据证明其疾病的遗传病因，这主要是由于基因型和表型之间的关系不确定，因此很难准确定义新的变体或意义不确定的变体的致病性。
[0003]众多研究人员致力于通过建立基因型和表型之间的相关性来提高肥厚型心肌病遗传诊断的准确性和有效性。然而，这些研究的结果并不一致，部分原因是基因筛查主要针对数量有限的基因，不包括最近与肥厚型心肌病相关的几个基因。此外，肥厚型心肌病的表型异质性使其在影像学上准确量化相关的表型成为挑战。以往的研究主要集中在描述疾病的形态，而这是一个非常主观和复杂的测量特征。研究者之间的差异，加上年龄和高血压的影响，导致表型定义的显著变化，使得基因型和表型之间难以建立一种强有力的关系。

技术实现思路

[0004]针对现有技术存在的不足，本专利技术的主要目的在于提供一种用于检测肥厚型心肌病致病基因突变的基因标志物，通过对家族性肥厚型心肌病患者的致病基因进行全外显子组测序，涵盖所有已知的肥厚型心肌病致病基因，对肥厚型心肌病表型和基因型之间的关系进行精确评估得到。
[0005]本专利技术的另一目的在于提供前述用于检测肥厚型心肌病致病基因突变的基因标志物的应用。
[0006]为实现上述目的，本专利技术采用如下技术方案：
[0007]本专利技术的第一方面提供一种用于检测肥厚型心肌病致病基因突变的基因标志物，其选自以下基因形成的组：MYBPC3、MYH7、TNNI3、TNNT2、ALPK3、TPM1、OBSCN和TTN。
[0008]本专利技术的第二方面提供检测所述基因标志物的试剂在制备检测肥厚型心肌病致病基因突变的药物中的应用。
[0009]作为优选，所述基因标志物为MYBPC3和/或MYH7。
[0010]作为优选，所述药物包含检测所述基因标志物表达量的试剂，且以其作为唯一活性成分。
[0011]本专利技术的第三方面提供一种检测肥厚型心肌病致病基因突变的试剂盒，其包括检测所述基因标志物表达量的试剂，且以所述试剂作为唯一活性成分。
[0012]本专利技术的第四方面提供所述基因标志物作为生物标志物在制备早期诊断肥厚型
心肌病的药物中的应用。
[0013]作为优选，所述生物标志物为MYBPC3和/或MYH7。
[0014]作为优选，所述药物包含检测所述生物标志物表达量的试剂。
[0015]本专利技术的第五方面提供一种用于早期诊断肥厚型心肌病的试剂盒，其包括检测所述生物标志物表达量的试剂，且以所述试剂作为唯一活性成分。
[0016]作为优选，检测样本为外周血。
[0017]与现有技术相比，本专利技术的有益效果在于：
[0018]①
本专利技术提出一种检测肥厚型心肌病致病基因突变的基因标志物，通过对家族性肥厚型心肌病患者的致病基因进行全外显子组测序，涵盖所有已知的肥厚型心肌病致病基因，结合超声心动图对左心室肥大的程度进行分段量化，使心肌肥大的特征更加精确，对肥厚型心肌病心超表型和基因型之间的关系进行精确评估得到，确定敏感的预测参数，提高临床基因测试的效率。此外，这种方法改善对新的突变或意义不确定的变体的解释。
[0019]②
本专利技术通过检测基因标志物的表达水平用于早期诊断肥厚型心肌病，在诊断过程中基因结合超声心动图可以为临床医生和家属提供更多的信息，有助于基因测试和咨询，基因测试阳性的概率更高。
[0020]③
本专利技术结合基因型及心超表型之间的关系，充分发挥超声心动图无创价廉的优点，增加基因检测的阳性率。
附图说明
[0021]通过阅读参照以下附图对非限制性实施例所作的详细描述，本专利技术的其它特征、目的和优点将会变得更显著：
[0022]图1是实施例中肥厚型心肌病致病基因筛查结果；其中，a1、a2：阳性；b1、b2：阴性。
[0023]图2是实施例中肥厚型心肌病患者的室壁厚度积分及最大室壁厚度(MLVWT)的分布情况；其中，浅灰色：基因阴性；深灰色：基因阳性。
[0024]图3是实施例中不同基因的16节段肥厚热图，代表基因型与肥厚型心肌病肥厚节段表型之间的关系；其中，a：突变；b：复合突变；c：截短突变。
[0025]图4是实施例中不同类型的基因突变对患者左室射血分数(LVEF)的测试结果。
[0026]图5是实施例中两种基因突变MYH7、MYBPC3对患者是否梗阻及心室收缩功能测试结果。
[0027]图6是实施例中基因型与心超表型预测肥厚型心肌病致病基因突变的受试者工作特征曲线(ROC)；其中：
[0028]Model 1：年龄，主动脉根部内径，室间隔与后壁的比率，中间隔前壁；
[0029]Model 2：年龄，室间隔与后壁的比率，S8，S1，S7，S9，MLVWT；
[0030]Model 3：年龄，主动脉根部内径，室间隔与后壁的比率，S8，S1，S7，S9，MLVWT。
具体实施方式
[0031]为使本专利技术实施例的目的、技术方案和优点更加清楚，下面将结合本专利技术实施例的附图，对本专利技术实施例的技术方案进行清楚、完整地描述。显然，所描述的实施例是本专利技术的一部分实施例，而不是全部的实施例。基于所描述的本专利技术的实施例，本领域普通技术
人员在无需创造性劳动的前提下所获得的所有其它实施例，都属于本专利技术保护的范围。
[0032]实施例1
[0033]以下临床研究纳入400名在复旦大学附属中山医院就医的确诊为HCM的汉族患者，有经验的心脏病专家根据临床检查、心电图和超声心动图发现的左心室肥大≥15毫米以及没有其他导致肥大的因素来确定诊断。在HCM的家族性病例中，或结合基因检测结果呈阳性的情况下，较少程度的肥厚也可满足诊断标准。研究方案需要收集家庭成员的大量临床数据，包括发病年龄、初始症状、心电图和超声心动图，并经复旦大学附属中山医院伦理委员会批准(编号：B2016
‑
016(2)R)，所有参与者都提供书面知情同意书，并捐献5毫升外周血用于DNA提取和基因测序。
[0034]超声心动图研究使用Vivid E9(GE医疗)或iE33飞利浦医疗系统)超声系统进行。所有研究都是在左侧卧位下进行的，通过二维、M型、频谱多普勒和组织多普勒图像，进行标准化的临床功能评估。二维动态图像从左心室心尖四腔视图、两腔视图、三腔视图、左心室短轴瓣环、乳头肌以及心尖区的水平切面获得。在二维短轴图像中，左心室壁被分为1本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种用于检测肥厚型心肌病致病基因突变的基因标志物，其选自以下基因形成的组：MYBPC3、MYH7、TNNI3、TNNT2、ALPK3、TPM1、OBSCN和TTN。2.检测权利要求1所述用于检测肥厚型心肌病致病基因突变的基因标志物的试剂在制备检测肥厚型心肌病致病基因突变的药物中的应用。3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述基因标志物为MYBPC3和/或MYH7。4.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述药物包含检测所述用于检测肥厚型心肌病致病基因突变的基因标志物表达量的试剂，且以其作为唯一活性成分。5.一种检测肥厚型心肌病致病基因突变的试剂盒，其特征在于，包括检测权利要求1所述用于检...

【专利技术属性】
技术研发人员：周年伟，舒先红，潘翠珍，赵维鹏，
申请(专利权)人：复旦大学附属中山医院，
类型：发明
国别省市：