复合物信息生成方法、装置、计算机设备和存储介质制造方法及图纸

技术编号:37710550 阅读:12 留言:0更新日期:2023-06-02 00:02
本申请涉及一种复合物信息生成方法、装置、计算机设备、存储介质和计算机程序产品。该方法包括:获取蛋白质结构信息、对应的突变信息和对应的药物结构信息;按照突变信息对蛋白质结构信息进行调整,得到突变型蛋白质结构信息;将蛋白质结构信息和突变型蛋白质结构信息分别与药物结构信息进行分子对接,得到各个野生型复合物结构信息和各个突变型复合物结构信息;从各个野生型复合物结构信息中确定对应的目标野生型复合物结构信息,并从各个突变型复合物结构信息中确定对应的目标突变型复合物结构信息;基于目标野生型复合物结构信息和目标突变型复合物结构信息得到目标复合物信息。采用本方法能够提高得到目标复合物信息的效率。效率。效率。

【技术实现步骤摘要】
复合物信息生成方法、装置、计算机设备和存储介质


[0001]本申请涉及计算机
,特别是涉及一种复合物信息生成方法、装置、计算机设备、存储介质和计算机程序产品。

技术介绍

[0002]随着人工智能技术的发展,出现了通过人工智能进行药物耐药性预测的技术,在进行耐药性预测的时候,通常需要获取到蛋白质突变前后的复合物信息,使用复合物信息提取特征从而进行耐药性预测模型的训练。目前,获取复合物信息通常是通过实验的方式来测得蛋白质突变前后的复合物信息,比如,通过采用结构生物学方法(如,X射线衍射技术、单分子冷冻电镜技术等)来解析蛋白质或蛋白致突变体与药物的复合物信息。然而,这些方法获取复合物信息的效率低下,导致复合物的样本量小,使得训练的耐药性预测模型的准确性降低。

技术实现思路

[0003]基于此,有必要针对上述技术问题,提供一种能够提高复合物信息生成效率的复合物信息生成方法、装置、计算机设备、存储介质和计算机程序产品。
[0004]第一方面,本申请提供了一种复合物信息生成方法。所述方法包括:
[0005]获取蛋白质结构信息和所述蛋白质结构信息对应的突变信息,并获取蛋白质结构信息对应的药物结构信息;
[0006]按照突变信息对蛋白质结构信息进行调整,得到突变型蛋白质结构信息;
[0007]将蛋白质结构信息与药物结构信息进行分子对接,得到蛋白质结构信息对应的各个野生型复合物结构信息,并将突变型蛋白质结构信息与药物结构信息进行分子对接,得到突变型蛋白质结构信息对应的各个突变型复合物结构信息;
[0008]计算各个野生型复合物结构信息对应的野生型能量信息,基于野生型能量信息从各个野生型复合物结构信息中确定蛋白质结构信息对应的目标野生型复合物结构信息;
[0009]计算各个突变型复合物结构信息对应的突变型能量信息,基于突变型能量信息从各个突变型复合物结构信息中确定突变型蛋白质结构信息对应的目标突变型复合物结构信息;
[0010]基于目标野生型复合物结构信息和目标突变型复合物结构信息得到目标复合物信息。
[0011]第二方面,本申请还提供了一种复合物信息生成装置。所述装置包括:
[0012]信息获取模块,用于获取蛋白质结构信息和所述蛋白质结构信息对应的突变信息,并获取蛋白质结构信息对应的药物结构信息;
[0013]突变模块,用于按照突变信息对蛋白质结构信息进行调整,得到突变型蛋白质结构信息;
[0014]分子对接模块,用于将蛋白质结构信息与药物结构信息进行分子对接,得到蛋白
质结构信息对应的各个野生型复合物结构信息,并将突变型蛋白质结构信息与药物结构信息进行分子对接,得到突变型蛋白质结构信息对应的各个突变型复合物结构信息;
[0015]野生复合物确定模块,用于计算各个野生型复合物结构信息对应的野生型能量信息,基于野生型能量信息从各个野生型复合物结构信息中确定蛋白质结构信息对应的目标野生型复合物结构信息;
[0016]突变复合物确定模块,用于计算各个突变型复合物结构信息对应的突变型能量信息,基于突变型能量信息从各个突变型复合物结构信息中确定突变型蛋白质结构信息对应的目标突变型复合物结构信息;
[0017]目标复合物信息得到模块,用于基于目标野生型复合物结构信息和目标突变型复合物结构信息得到目标复合物信息。
[0018]第三方面,本申请还提供了一种计算机设备。所述计算机设备包括存储器和处理器,所述存储器存储有计算机程序,所述处理器执行所述计算机程序时实现以下步骤:
[0019]获取蛋白质结构信息和所述蛋白质结构信息对应的突变信息,并获取蛋白质结构信息对应的药物结构信息;
[0020]按照突变信息对蛋白质结构信息进行调整,得到突变型蛋白质结构信息;
[0021]将蛋白质结构信息与药物结构信息进行分子对接,得到蛋白质结构信息对应的各个野生型复合物结构信息,并将突变型蛋白质结构信息与药物结构信息进行分子对接,得到突变型蛋白质结构信息对应的各个突变型复合物结构信息;
[0022]计算各个野生型复合物结构信息对应的野生型能量信息,基于野生型能量信息从各个野生型复合物结构信息中确定蛋白质结构信息对应的目标野生型复合物结构信息;
[0023]计算各个突变型复合物结构信息对应的突变型能量信息,基于突变型能量信息从各个突变型复合物结构信息中确定突变型蛋白质结构信息对应的目标突变型复合物结构信息;
[0024]基于目标野生型复合物结构信息和目标突变型复合物结构信息得到目标复合物信息。
[0025]第四方面,本申请还提供了一种计算机可读存储介质。所述计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序,所述计算机程序被处理器执行时实现以下步骤:
[0026]获取蛋白质结构信息和所述蛋白质结构信息对应的突变信息,并获取蛋白质结构信息对应的药物结构信息;
[0027]按照突变信息对蛋白质结构信息进行调整,得到突变型蛋白质结构信息;
[0028]将蛋白质结构信息与药物结构信息进行分子对接,得到蛋白质结构信息对应的各个野生型复合物结构信息,并将突变型蛋白质结构信息与药物结构信息进行分子对接,得到突变型蛋白质结构信息对应的各个突变型复合物结构信息;
[0029]计算各个野生型复合物结构信息对应的野生型能量信息,基于野生型能量信息从各个野生型复合物结构信息中确定蛋白质结构信息对应的目标野生型复合物结构信息;
[0030]计算各个突变型复合物结构信息对应的突变型能量信息,基于突变型能量信息从各个突变型复合物结构信息中确定突变型蛋白质结构信息对应的目标突变型复合物结构信息;
[0031]基于目标野生型复合物结构信息和目标突变型复合物结构信息得到目标复合物
信息。
[0032]第五方面,本申请还提供了一种计算机程序产品。所述计算机程序产品,包括计算机程序,该计算机程序被处理器执行时实现以下步骤:
[0033]获取蛋白质结构信息和所述蛋白质结构信息对应的突变信息,并获取蛋白质结构信息对应的药物结构信息;
[0034]按照突变信息对蛋白质结构信息进行调整,得到突变型蛋白质结构信息;
[0035]将蛋白质结构信息与药物结构信息进行分子对接,得到蛋白质结构信息对应的各个野生型复合物结构信息,并将突变型蛋白质结构信息与药物结构信息进行分子对接,得到突变型蛋白质结构信息对应的各个突变型复合物结构信息;
[0036]计算各个野生型复合物结构信息对应的野生型能量信息,基于野生型能量信息从各个野生型复合物结构信息中确定蛋白质结构信息对应的目标野生型复合物结构信息;
[0037]计算各个突变型复合物结构信息对应的突变型能量信息,基于突变型能量信息从各个突变型复合物结构信息中确定突变型蛋白质结构信息对应的目标突变型复合物结构信息;
[0038]基于目标野生型复合物结构信息和目标突变型复合物结构信息得到目标复合物信息。
[003本文档来自技高网
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种复合物信息生成方法,其特征在于,所述方法包括:获取蛋白质结构信息和所述蛋白质结构信息对应的突变信息,并获取所述蛋白质结构信息对应的药物结构信息;按照所述突变信息对所述蛋白质结构信息进行调整,得到突变型蛋白质结构信息;将所述蛋白质结构信息与所述药物结构信息进行分子对接,得到所述蛋白质结构信息对应的各个野生型复合物结构信息,并将所述突变型蛋白质结构信息与所述药物结构信息进行分子对接,得到所述突变型蛋白质结构信息对应的各个突变型复合物结构信息;计算所述各个野生型复合物结构信息对应的野生型能量信息,基于所述野生型能量信息从所述各个野生型复合物结构信息中确定所述蛋白质结构信息对应的目标野生型复合物结构信息;计算所述各个突变型复合物结构信息对应的突变型能量信息,基于所述突变型能量信息从所述各个突变型复合物结构信息中确定所述突变型蛋白质结构信息对应的目标突变型复合物结构信息;基于所述目标野生型复合物结构信息和所述目标突变型复合物结构信息得到目标复合物信息。2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,在所述基于所述目标野生型复合物结构信息和所述目标突变型复合物结构信息得到目标复合物信息之后,还包括:获取所述目标复合物信息对应的耐药性标签;基于所述目标复合物信息、所述药物结构信息、所述蛋白质结构信息和所述突变型蛋白质结构信息进行耐药性特征提取,得到目标耐药性特征;将所述目标耐药性特征输入到初始耐药性预测模型中进行耐药性预测,得到初始耐药性预测结果;基于所述初始耐药性预测结果和所述耐药性标签进行损失计算,得到损失信息,并基于所述损失信息反向更新所述初始耐药性预测模型,直到达到训练完成条件时,得到目标耐药性预测模型。3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,在所述基于所述初始耐药性预测结果和所述耐药性标签进行损失计算,得到损失信息,并基于所述损失信息反向更新所述初始耐药性预测模型,直到达到训练完成条件时,得到目标耐药性预测模型之后,还包括:获取待预测数据,所述待预测数据包括待预测蛋白质结构信息、待预测突变型蛋白质结构信息、待预测药物结构信息和待预测复合物信息;基于所述待预测复合物信息、所述待预测蛋白质结构信息、所述待预测药物结构信息和所述待预测突变型蛋白质结构信息进行耐药性特征提取,得到待预测耐药性特征;将所述待预测耐药性特征输入到所述目标耐药性预测模型进行耐药性预测,得到耐药性预测结果。4.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述基于所述目标复合物信息、所述药物结构信息、所述蛋白质结构信息和所述突变型蛋白质结构信息进行耐药性特征提取,得到目标耐药性特征,包括:基于所述目标复合物信息、所述药物结构信息、所述蛋白质结构信息和所述突变型蛋白质结构信息进行理化性质特征提取,得到目标理化性质特征;
基于所述目标复合物信息、所述药物结构信息、所述蛋白质结构信息和所述突变型蛋白质结构信息进行相互作用能量特征提取,得到目标能量特征;基于所述目标理化性质特征和目标能量特征得到所述目标耐药性特征。5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述获取蛋白质结构信息和所述蛋白质结构信息对应的突变信息,并获取所述蛋白质结构信息对应的药物结构信息,包括:获取耐药性基本信息,所述耐药性基本信息中包括蛋白质结构信息存储地址、所述突变信息和药物初始结构信息存储地址;从所述蛋白质结构信息存储地址获取所述蛋白质结构信息,并从所述药物初始结构信息存储地址获取药物初始结构信息;基于所述药物初始结构信息进行结构优化,得到所述药物结构信息。6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述从所述蛋白质结构信息存储地址获取所述蛋白质结构信息,包括:从所述蛋白质结构信息存储地址下载目标文件,所述目标文件中包括蛋白质结构信息和所述蛋白质结构信息关联的参考药物结构信息;按照所述目标文件中的标注信息将所述蛋白质结构信息和所述参考药物结构信息进行拆分,得到所述蛋白质结构信息。7.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,基于所述药物...

【专利技术属性】
技术研发人员:杨子翊叶兆丰张胜誉
申请(专利权)人:腾讯科技深圳有限公司
类型:发明
国别省市:

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