信息处理装置、信息处理系统、信息处理方法和程序制造方法及图纸

技术编号:37702294 阅读:21 留言:0更新日期:2023-06-01 23:48
本技术的主要目的是提供一种自动提出荧光染料标记的抗体的良好组合的技术。本技术提供了一种信息处理装置,包括处理单元,该处理单元基于根据样本中的相应表达水平对用于分析样本的多个生物分子进行分类的表达水平类别、根据亮度对用于分析样本的多个荧光体进行分类的亮度类别、以及多个荧光体之间的相关信息,产生关于生物分子的荧光体的组合列表。该处理单元从属于与该生物分子所属的表达水平类别相关联的亮度类别的荧光体中选择在该组合列表中要分配给生物分子的荧光体。合列表中要分配给生物分子的荧光体。合列表中要分配给生物分子的荧光体。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】信息处理装置、信息处理系统、信息处理方法和程序


[0001]本技术涉及信息处理装置、信息处理系统、信息处理方法和程序。更具体地,本技术涉及提出如何将荧光体分配给生物分子的信息处理装置、信息处理系统、信息处理方法和程序。

技术介绍

[0002]例如,用荧光染料标记诸如细胞、微生物和脂质体的粒子群体,并测量通过用激光照射粒子群体的每个粒子所激发的荧光染料生成的荧光的强度和/或模式,从而测量粒子的特性。执行测量的粒子分析仪的典型示例包括流式细胞仪。
[0003]流式细胞仪是用特定波长的激光(激发光)照射在流路中的一条线中流动的粒子并且检测从每个粒子发射的荧光和/或散射光以逐个分析多个粒子的设备。流式细胞仪可以将由光电探测器检测的光转换为电信号,量化电信号,并且执行统计分析以确定每个粒子的特性,诸如类型、尺寸、和结构。
[0004]迄今为止已经提出了关于用于选择要用于标记要通过流式细胞仪分析的粒子群体的荧光染料的技术的若干技术。例如,下面的专利文献1描述了用于设计流式细胞仪的探针面板的方法,该方法包括:确定应变因子,该应变因子量化由意图在第一通道中测量的第一标记的发光引起的到第二通道的泄漏的影响;
[0005]输入包括第一标记和第一探针的第一探针

标记组合的预测的最大信号;
[0006]基于应变因子和第一探针

标记组合的预测的最大信号来计算第二通道中的检测限的增加;并且
[0007]基于所计算的检测限的增加来选择包括在探针面板中的探针

标记组合。
[0008]引用列表
[0009]专利文献
[0010]专利文献1:日本未审查专利申请公开(PCT申请的译文)第2016

517000号。

技术实现思路

[0011]本专利技术要解决的问题
[0012]为了标记要通过流式细胞仪分析的粒子群体,经常使用多种荧光染料标记的抗体。用于分析的荧光染料标记的抗体的组合的确定过程也称为面板设计。分析中使用的荧光染料标记的抗体的数量倾向于增加,并且随着数量增加,面板设计变得更困难。
[0013]因此,本技术的主要目的是提供一种自动提出荧光染料标记的抗体的更好组合的技术。
[0014]问题的解决方案
[0015]本技术提供了一种信息处理装置,包括:处理单元,基于样本中的表达水平对要用于分析样本的多个生物分子进行分类的表达水平类别、基于亮度对能用于分析样本的多个荧光体进行分类的亮度类别、以及多个荧光体之间的相关信息,生成关于生物分子的荧光
体的组合列表,其中,处理单元从属于与生物分子所属的表达水平类别相关联的亮度类别的荧光体中选择在组合列表中要分配给生物分子的荧光体。
[0016]表达水平类别与亮度类别相关联,使得通过对表现出较低表达水平的生物分子进行分类而获得的表达水平类别对应于对较亮荧光体进行分类的亮度类别。
[0017]处理单元可以通过使用相关信息来选择荧光体中的每一个。
[0018]相关信息可以是多个荧光体的荧光光谱之间的相关系数。
[0019]相关信息可以是通过使多个荧光体的荧光光谱之间的相关系数进行平方而获得的值。
[0020]处理单元可以通过使用在荧光体被两个或更多个不同波长的激发光束照射的情况下分别获得的两个或更多个荧光光谱来计算相关系数。
[0021]相关信息可以是多个荧光体之间的染色指数。
[0022]相关信息可以是多个荧光体之间的溢出扩散矩阵。
[0023]可以基于关于荧光体和生物分子的复合物是否能用的数据来识别多个荧光体。
[0024]处理单元可以根据属于表达水平类别中的每一个的生物分子的数量来调整属于亮度类别中的每一个的荧光体的数量。
[0025]可以基于关于与荧光体相关联的优先级的信息来识别多个荧光体。
[0026]处理单元可以执行与组合列表相关的分离能力的评估。
[0027]处理单元可以根据分离能力的评估的结果进一步生成修改的组合列表,并且进一步执行与修改的组合列表相关的分离能力评估,在该修改的组合列表中,包括在组合列表中的一组荧光体中的至少一个荧光体被改变为另一荧光体。
[0028]处理单元可以进一步基于关于生物分子和荧光体的复合物的成本信息生成组合列表。
[0029]在识别要分配给多个生物分子中的至少一个生物分子的荧光体的情况下,处理单元可以进一步基于多个荧光体和预先识别的荧光体之间的相关信息生成组合列表。
[0030]在识别要用于分析样本的光产生物质的情况下,处理单元可以进一步基于多个荧光体与光产生物质之间的相关信息生成组合列表。
[0031]多个生物分子中的每一个可以是抗原或抗体。
[0032]在多个生物分子中的每一个是抗原的情况下,表达水平可以是抗原的表达水平,并且在多个生物分子中的每一个是抗体的情况下,表达水平可以是由抗体捕获的抗原的表达水平。
[0033]此外,本技术还提供了一种信息处理系统,包括:输入单元,接受关于要用于分析样本的多个生物分子的表达水平的数据的输入;以及处理单元,其根据基于样本中的表达水平对多个生物分子进行分类的表达水平类别、基于亮度对能用于分析样本的多个荧光体进行分类的亮度类别、以及多个荧光体之间的相关信息,生成关于生物分子的荧光体的组合列表,其中,处理单元从属于与生物分子所属的表达水平类别相关联的亮度类别的荧光体中选择在组合列表中要分配给生物分子的荧光体。
[0034]此外,本技术还提供了一种信息处理方法,包括:列表生成步骤,根据基于样本中的表达水平对要用于分析样本的多个生物分子进行分类的表达水平类别、基于亮度对能用于分析样本的多个荧光体进行分类的亮度类别、以及多个荧光体之间的相关信息,生成关
于生物分子的荧光体的组合列表,其中,在列表生成步骤中,从属于与生物分子所属的表达水平类别相关联的亮度类别的荧光体中选择在组合列表中要分配给生物分子的荧光体。
[0035]此外,本技术还提供了一种程序,使信息处理装置执行:列表生成步骤,根据基于样本中的表达水平对要用于分析样本的多个生物分子进行分类的表达水平类别、基于亮度对能用于分析样本的多个荧光体进行分类的亮度类别、以及多个荧光体之间的相关信息,生成关于生物分子的荧光体的组合列表,其中,在列表生成步骤中,从属于与生物分子所属的表达水平类别相关联的亮度类别的荧光体中选择在组合列表中要分配给生物分子的荧光体。
附图说明
[0036]图1是流式细胞仪的配置的示意图。
[0037]图2是示出在本技术应用于流式细胞术的情况下的实验流程示例的示图。
[0038]图3是示出根据本技术的信息处理装置的配置示例的示图。
[0039]图4是由根据本技术的信息处理装置执行的处理的流程图。
[0040]图5A是用于说明根据本技术的信息处理的示图。
[0041]图5B是用于说明根据本技术的信本文档来自技高网
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种信息处理装置,包括:处理单元,根据基于样本中的表达水平对要用于分析所述样本的多个生物分子进行分类的表达水平类别、基于亮度对能用于分析所述样本的多个荧光体进行分类的亮度类别、以及所述多个荧光体之间的相关信息,生成关于生物分子的荧光体的组合列表,其中,所述处理单元从属于与所述生物分子所属的表达水平类别相关联的亮度类别的荧光体中选择在所述组合列表中要分配给所述生物分子的荧光体。2.根据权利要求1所述的信息处理装置,其中,所述表达水平类别与所述亮度类别相关联,使得通过对表现出较低表达水平的生物分子进行分类而获得的表达水平类别对应于对较亮荧光体进行分类的亮度类别。3.根据权利要求1所述的信息处理装置,其中,所述处理单元通过使用所述相关信息来选择所述荧光体中的每一个。4.根据权利要求1所述的信息处理装置,其中,所述相关信息是所述多个荧光体的荧光光谱之间的相关系数。5.根据权利要求1所述的信息处理装置,其中,所述相关信息是通过将所述多个荧光体的荧光光谱之间的相关系数进行平方而获得的值。6.根据权利要求4所述的信息处理装置,其中,所述处理单元通过使用在荧光体被两个或更多个不同波长的激发光束的射线照射的情况下分别获得的两个或更多个荧光光谱来计算所述相关系数。7.根据权利要求1所述的信息处理装置,其中,所述相关信息是所述多个荧光体之间的染色指数。8.根据权利要求1所述的信息处理装置,其中,所述相关信息是所述多个荧光体之间的溢出扩散矩阵。9.根据权利要求1所述的信息处理装置,其中,基于关于荧光体和生物分子的复合物是否能用的数据来识别所述多个荧光体。10.根据权利要求1所述的信息处理装置,其中,所述处理单元根据属于所述表达水平类别中的每一个的生物分子的数量来调整属于所述亮度类别中的每一个的荧光体的数量。11.根据权利要求1所述的信息处理装置,其中,基于与荧光体相关联的关于优先级的信息来识别所述多个荧光体。12.根据权利要求1所述的信息处理装置,其中,所述处理单元执行与所述组合列表相关的分离能力的评估。13.根据权利要求12所述的信息处理装置,其中,所述处理单元根据所述分离能力的评估的结果进一步生成修改的组合列表,并且进一步执行与所述修改的组合列表相关的分离能力评估,在所述修改的组合列表中,包括在所述组合列表中的一组荧光体中的至少一个荧光体被改变为另一荧光体。14.根据权利要求1所述的信息处理装置,其中,所述处...

【专利技术属性】
技术研发人员:梅津友行山根健治
申请(专利权)人:索尼集团公司
类型:发明
国别省市:

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