一种类风湿性关节炎诊断分类器的构建方法及其应用技术

本发明专利技术属于医药和生物医学检测领域技术，具体涉及一种类风湿性关节炎诊断分类器的构建方法及其应用。该方法包括：基于类风湿性关节炎的基因表达谱，获取类风湿性关节炎数据集；基于类风湿性关节炎数据集对类风湿性关节炎免疫微环境RIME进行分类，获得两种亚型(基质亚型C1和免疫亚型C2)；基于两种亚型，提取特征基因并构建类风湿关节炎滑膜免疫微环境人类指数RSIMI分类器。本发明专利技术提供的类风湿性关节炎分型和构建的RSIMI分类器将为个体化治疗和精准医疗的临床指导提供理论支持。和精准医疗的临床指导提供理论支持。和精准医疗的临床指导提供理论支持。

【技术实现步骤摘要】
一种类风湿性关节炎诊断分类器的构建方法及其应用


[0001]本专利技术属于医药和生物医学检测领域技术，具体涉及一种类风湿性关节炎诊断分类器的构建方法及其应用。

技术介绍

[0002]类风湿关节炎(rheumatoid arthritis，RA)是一种以多关节炎、全身性炎症和自身抗体产生为特征的慢性全身炎症性自身免疫性疾病。它具有高度异质性的临床表现和可变的病程。在过去几十年中，为了更好地了解RA的发病机制和指导RA的治疗，RA患者可根据性别、年龄、血清阳性/阴性、初发/复治、一般和难治性的分类。然而，RA的疾病异质性尚无法清晰表征。这也是目前常规治疗虽取得了一定的疗效，但据中国风湿病数据库2万多例RA患者的统计，仅有17％患者可达到疾病低活动度指标，而且长期免疫抑制治疗会破坏免疫防御和免疫监视功能，增加感染和肿瘤的风险。基于RA治疗的现状及矛盾，我们有必要据其疾病的异质性特征给予分类探索，以便于更好地了解疾病和指导治疗。
[0003]由于RA患者中的滑膜组织中免疫性细胞(如T细胞、B细胞、自然杀伤(NK)细胞等)和基质性细胞(如巨噬细胞本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种类风湿性关节炎诊断分类器的构建方法，其特征在于：包括以下步骤：步骤1：基于类风湿性关节炎RA的基因表达谱，获取类风湿性关节炎数据集；步骤2：基于步骤1得到的类风湿性关节炎数据集对类风湿性关节炎免疫微环境RIME进行分类，获得两种亚型；步骤3：基于步骤2得到的两种亚型，提取特征基因并构建类风湿关节炎滑膜免疫微环境人类指数RSIMI分类器。2.根据权利要求1所述的构建方法，其特征在于：所述步骤2中获得两种亚型的方法为无监督聚类分析法。3.根据权利要求1所述的构建方法，其特征在于：所述步骤2中两种亚型为基质亚型C1和免疫亚型C2。4.根据权利要求1所述的构建方法，其特征在于：所述步骤3的具体过程包括：步骤3.1：利用“limma”包来识别基质亚型C1和免疫亚型C2的差异基因；步骤3.2：基于识别得到的差异基因，使用R包“Boruta”提取出79个特征基因；...

【专利技术属性】
技术研发人员：张升校，赵蓉，贺培风，于琦，张译文，范建鑫，姚佳媛，郭锦程，张荷艺，程婷，李小峰，王彩虹，
申请(专利权)人：山西医科大学，
类型：发明
国别省市：