一种含组织位置信息的单细胞文库构建方法及测序方法技术

本发明专利技术公开了一种含组织位置信息的单细胞文库构建方法及测序方法，包括以下步骤：S10、提供芯片，所述芯片具有多个位点，每一位点上具有已知碱基序列的核酸分子，所述核酸分子含有位置信息；S20、将待测组织的切片与所述芯片接触，以使所述芯片中的具有已知碱基序列的核酸分子与所述待测的组织切片的细胞结合，得到结合组织切片；S30、将结合组织切片解离制备成单细胞悬液；S40、通过高通量单细胞建库测序平台对单细胞悬液构建文库，得转录组文库与空间标签文库；S50、对转录组文库与空间标签文库进行测序，得到含组织位置信息的单细胞文库。本发明专利技术可以在单细胞水平上分析遗传信息的同时还可以测到该单细胞的空间位置信息。同时还可以测到该单细胞的空间位置信息。同时还可以测到该单细胞的空间位置信息。

【技术实现步骤摘要】
一种含组织位置信息的单细胞文库构建方法及测序方法


[0001]本专利技术涉及基因测序和组织细胞样本分析
，特别涉及一种含组织位置信息的单细胞文库构建方法及测序方法。

技术介绍

[0002]众所周知复杂的生命机体由许多性质特异的细胞组成，在特定的状态下每个细胞表达的核酸和蛋白的种类与数量都有所不同，所以在单细胞水平上检测核酸和蛋白指标以及所处的细胞微环境对生物医学研究有重要意义。
[0003]目前包括高通量单细胞转录组在内的单细胞研究技术只能在单细胞水平上分析其核酸信息及部分蛋白信息，但对于单个细胞在组织中所处的空间位置所知甚少。为了在组织水平上深入了解核酸信息，科学家开发了各种空间组学技术，包括FISSEQ、Slide
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seq、10
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Visium、HDST、SeqFish、MerFish、STARmap等。这些技术根据实现方式不同大致可分为原位杂交、原位捕获和原位测序三种类型，其中原位杂交（SeqFish和MerFish）与原位测序（FISSEQ和STARMAP）技术都依赖于感兴趣的基因设本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种含组织位置信息的单细胞文库构建方法，其特征在于，包括以下步骤：S10、提供芯片，所述芯片具有多个位点，每一位点上具有已知碱基序列的核酸分子，所述核酸分子含有位置信息；S20、将待测组织的切片与所述芯片接触，以使所述芯片中的具有已知碱基序列的核酸分子与所述待测的组织切片的细胞结合，得到结合组织切片；S30、将结合组织切片解离制备成单细胞悬液；S40、通过高通量单细胞建库测序平台对单细胞悬液构建文库，得转录组文库与空间标签文库；S50、对转录组文库与空间标签文库进行测序，得到含组织位置信息的单细胞文库。2.如权利要求1所述的含组织位置信息的单细胞文库构建方法，其特征在于，步骤S10中：不同位点上具有不同已知碱基序列核酸分子，同一位点上具有相同已知碱基序列的核酸分子；和/或，位点之间的间距为100nm~1mm。3.如权利要求1所述的含组织位置信息的单细胞文库构建方法，其特征在于，步骤S10中：所述芯片为平面，具有位置信息的核酸分子以相对独立的成簇方式固定在芯片表面；和/或，所述芯片具有微孔，所述微孔中具有介质，具有位置信息的核酸分子分布在芯片微孔中的介质上或偶联在芯片表面；和/或，所述芯片具有微孔，所述微孔中具有介质，所述芯片微孔中的介质包括：聚合物微珠、磁性微珠及水凝胶微珠的任意一种；和/或，芯片的材质包括玻璃、ITO玻璃、聚合物、ITO聚合物以及硅片中的任意一种。4.如权利要求1所述的含组织位置信息的单细胞文库构建方法，其特征在于，步骤S10中：具有位置信息的核酸分子偶联有与细胞中特定物质结合的分子。5.如权利要求4所述的含组织位置信息的单细胞文库构建方法，其特征在于，所述与细胞中特定物质结合的分子包括凝集素，所述细胞中特定物质为糖蛋白；或，所述与细胞中特定物质结合的分子包括抗体，所述细胞中特定物质为β2
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微球蛋白；或，所述与细胞中特定物质结合的分子包括脂类分子，所述细胞中特定物质为脂质双分子层；或，所述与细胞中特定物质结合的分子包括核酸，所述细胞中特定物质为mRNA。6.如权利要求1所述的含组织位置信息的单细胞文库构建方法，其特征在于，在步骤S10和S20之间，还包括：使用醛类固定液、酸类固定液、醇类固定液及DSP交联剂中的任意一种固定剂对待测组织的切片的细胞进行浸泡处理；和/或，使用醇类或表面活性剂对待测组织的切片的细胞进行浸泡处理。7.如...

【专利技术属性】
技术研发人员：韩金桓，关荧，职小玲，智敏，桑国芹，石焕焕，焦少灼，李宗文，
申请(专利权)人：北京寻因生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：