一种杧果品种特异性SSR分子标记引物及其应用制造技术

本发明专利技术涉及一种杧果品种特异性SSR分子标记引物，至少包含以下12对SSR引物之一：Mgi026、Mgi037、Mgi060、Mgi061、Mgi070、Mgi073、Mgi081、Mgi084、Mgi135、Mgi145、Mgi154、Mgi187；该引物可以应用于杧果种质资源遗传多样性分析和分子身份证构建，先收集待测植株健康叶片提取DNA，提取的DNA作为模板进行SSR分子标记PCR扩增，PCR扩增产物经过纯化后进行荧光检测，收集原始数据计算遗传多样性指标和多态性信息含量，将每对引物获得的等位基因数按从小到大顺序排列，获得每份种质特有的字符串，得到分子身份证。本发明专利技术利用接头引物M13与12对SSR引物合成TP

【技术实现步骤摘要】
一种杧果品种特异性SSR分子标记引物及其应用


[0001]本专利技术涉及分子生物学DNA标记技术与应用领域，特别涉及一种杧果品种特异性SSR分子标记引物及其应用。

技术介绍

[0002]我国是世界第二大杧果(Mangifera indica L.)生产国，近年来，我国杧果产业快速发展，截至2020年，全国杧果种植面积达485万亩，产量约266万吨，产值达205.2亿元(农业农村部农垦局2021年统计数据)，杧果产业已成为我国热区主要农业支柱产业之一。丰富的种质资源是杧果新品种选育和产业发展的基础，据统计，目前我国保存有大约1000份杧果种质材料，保存量位居世界第二。面对如此庞大的种质数量，如何有效进行鉴定区分及合理利用是我们目前亟待解决的问题。
[0003]SSR标记作为一种有效的分子标记手段，具有操作简便、准确可靠，重复性好等优点，被国际植物新品种权保护联盟(UPOV)推选为DNA指纹图谱构建的首选标记之一。目前，SSR标记在国内已应用于苹果、梨、桃、荔枝等多种果树遗传育种研究的各个领域。国内较早地应用ISSR和SRAP分子标记分别绘制红麻与蓖麻DNA指纹图谱，并建立其分子身份证；在果树种质资源的分子身份证研究上，利用10对SSR引物构建了38份甜樱桃种质的指纹图谱，将分子指纹赋值后建立品种的分子身份证，而后在桃、葡萄和梨等果树上也进行过此类研究。
[0004]研究发现，基于SSR荧光标记的杧果种质遗传多样性分析和分子身份证构建研究较少，如能开发出杧果品种特异性SSR分子标记引物，对杧果品种及其近缘野生种扁桃进行遗传多样性分析，构建个体独特的分子身份证，有利于实现杧果种质资源的快速、准确区分，为杧果种质合理利用提供指导。

技术实现思路

[0005]为解决上述问题，本专利技术提供一种杧果品种特异性SSR分子标记引物及其应用。
[0006]本专利技术所采用的技术方案:一种杧果品种特异性SSR分子标记引物，至少包含以下12对SSR引物之一：Mgi026、Mgi037、Mgi060、Mgi061、Mgi070、Mgi073、Mgi081、Mgi084、Mgi135、Mgi145、Mgi154、Mgi187；12对SSR引物序列信息如下：
[0007](1)Mgi026引物序列：重复单元：(AT)4；
[0008]正向引物序列(5'
‑
3')：GGTAAGTAATGTGAAGGGGAGGG；
[0009]反向引物序列(3'
‑
5')：ATTAGAGAAATGTCAATGACCAATTCA；
[0010](2)Mgi037引物序列：重复单元：(AC)7；
[0011]正向引物序列(5'
‑
3')：CGTGAAAGCAAGAAGTTGTTATCT；
[0012]反向引物序列(3'
‑
5')：GAGGAAAGGAGAAGAAACCAATTAA；
[0013](3)Mgi060引物序列：重复单元：(TCT)10；
[0014]正向引物序列(5'
‑
3')：GTCCCCCTCACCCATAAAGC；
[0015]反向引物序列(3'
‑
5')：TCTCCTCAATAATGCTGCCCA；
[0016](4)Mgi061引物序列：重复单元：(TA)11；
[0017]正向引物序列(5'
‑
3')：GCTTGGCTCGGTTTGAATCC；
[0018]反向引物序列(3'
‑
5')：TGAACTTGCCCTTTAACCGT；
[0019](5)Mgi070引物序列：重复单元：(TTC)10；
[0020]正向引物序列(5'
‑
3')：GCCGAAATAGCAGAGTCAGA；
[0021]反向引物序列(3'
‑
5')：AGCTGCAGGATTCTGACAAGA；
[0022](6)Mgi073引物序列：重复单元：(AAG)6；
[0023]正向引物序列(5'
‑
3')：GGGGGCACTGCTTTACTCAA；
[0024]反向引物序列(3'
‑
5')：ACACGATAACAGATCAGGCGT；
[0025](7)Mgi081引物序列：重复单元：(CTT)7；
[0026]正向引物序列(5'
‑
3')：CTGAGCCCATAACCAGAGGC；
[0027]反向引物序列(3'
‑
5')：CCCTAGGTGGTCACATGAGG；
[0028](8)Mgi084引物序列：重复单元：(TCT)5；
[0029]正向引物序列(5'
‑
3')：CGTCCTTGCGTACTCGATCA；
[0030]反向引物序列(3'
‑
5')：TTTGAAAACCACGCGCCAAT；
[0031](9)Mgi135引物序列：重复单元：(TA)8；
[0032]正向引物序列(5'
‑
3')：TCATGGGTCATTGGAGGAAAAGA；
[0033]反向引物序列(3'
‑
5')：ACTGTCATTCATCGCATAACGT；
[0034](10)Mgi145引物序列：重复单元：(AAT)7；
[0035]正向引物序列(5'
‑
3')：GCACACACTTTCTGTTCTCCA；
[0036]反向引物序列(3'
‑
5')：ACAATGGAAGTGCACCATGT；
[0037](11)Mgi154引物序列：重复单元：(ATT)9；
[0038]正向引物序列(5'
‑
3')：GCGGAAAATAGTCTTTTGGCCA；
[0039]反向引物序列(3'
‑
5')：TGACTTTTTGTGCACGGATTT；
[0040](12)Mgi187引物序列：重复单元：(AAT)6；
[0041]正向引物序列(5'
‑
3')：CCGCCATGACCATGAAAACG；
[0042]反向引物序列(3'
‑
5')：GCACTAATGTTCCCGCCAAC。
[0043]优选地，所述SSR引物与接头引物M13合成带荧光标记的TP
‑
M13
‑
SSR荧光引物。
[0044]优选地，所述的杧果品种特异性SSR分子标记引物在杧果种质资源遗传多样性分析和分子身份证构建的应用。
[0045]优选地，所述的杧果品种特异性SSR分子标记引物在杧果种质资源遗传多样性分析和分子身份证构建的应用，包括以下步骤：
[0046]步骤1本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种杧果品种特异性SSR分子标记引物，其特征在于：至少包含以下12对SSR引物之一：Mgi026、Mgi037、Mgi060、Mgi061、Mgi070、Mgi073、Mgi081、Mgi084、Mgi135、Mgi145、Mgi154、Mgi187；12对SSR引物序列信息如下：(1)Mgi026引物序列：重复单元：(AT)4；正向引物序列(5'
‑
3')：GGTAAGTAATGTGAAGGGGAGGG；反向引物序列(3'
‑
5')：ATTAGAGAAATGTCAATGACCAATTCA；(2)Mgi037引物序列：重复单元：(AC)7；正向引物序列(5'
‑
3')：CGTGAAAGCAAGAAGTTGTTATCT；反向引物序列(3'
‑
5')：GAGGAAAGGAGAAGAAACCAATTAA；(3)Mgi060引物序列：重复单元：(TCT)10；正向引物序列(5'
‑
3')：GTCCCCCTCACCCATAAAGC；反向引物序列(3'
‑
5')：TCTCCTCAATAATGCTGCCCA；(4)Mgi061引物序列：重复单元：(TA)11；正向引物序列(5'
‑
3')：GCTTGGCTCGGTTTGAATCC；反向引物序列(3'
‑
5')：TGAACTTGCCCTTTAACCGT；(5)Mgi070引物序列：重复单元：(TTC)10；正向引物序列(5'
‑
3')：GCCGAAATAGCAGAGTCAGA；反向引物序列(3'
‑
5')：AGCTGCAGGATTCTGACAAGA；(6)Mgi073引物序列：重复单元：(AAG)6；正向引物序列(5'
‑
3')：GGGGGCACTGCTTTACTCAA；反向引物序列(3'
‑
5')：ACACGATAACAGATCAGGCGT；(7)Mgi081引物序列：重复单元：(CTT)7；正向引物序列(5'
‑
3')：CTGAGCCCATAACCAGAGGC；反向引物序列(3'
‑
5')：CCCTAGGTGGTCACATGAGG；(8)Mgi084引物序列：重复单元：(TCT)5；正向引物序列(5'
‑
3')：CGTCCTTGCGTACTCGATCA；反向引物序列(3'
‑
5')：TTTGAAAACCACGCGCCAAT；(9)Mgi135引物序列：重复单元：(TA)8；正向引物序列(5'
‑
3')：TCATGGGTCATTGGAGGAAAAGA；反向引物序列(3'
‑
5')：ACTGTCATTCATCGCATAACGT；(10)Mgi145引物序列：重复单元：(AAT)7；正向引物序列(5'
‑
3')：GCACACACTTTCTGTTCTCCA；反向引物序列(3'
...

【专利技术属性】
技术研发人员：唐玉娟，罗世杏，黄国弟，宋恩亮，李日旺，张宇，赵英，唐莹莹，郭丽梅，莫永龙，覃昱茗，彭鹏，
申请(专利权)人：广西壮族自治区亚热带作物研究所广西亚热带农产品加工研究所，
类型：发明
国别省市：