一种判定鸡羽色的分子标记组合及其在育种中的应用方法技术

本发明专利技术属于生物育种技术领域，涉及一种鸡羽色相关分子标记组合、引物及判定羽色、培育和/或生产特定羽色鸡的方法和应用。本发明专利技术提供了一种鸡羽色相关分子标记组合，所述鸡羽色相关分子标记包括MC1R基因、PMEL17基因、SLC45A2基因、TYR基因和SOX10基因。本发明专利技术解决了现有的仅用单一标记进行分子育种不具有广泛适用性的问题，依据本发明专利技术所列各种基因的组合模式，可以快速有效的培育目标羽色的鸡配套系。系。系。

【技术实现步骤摘要】
一种判定鸡羽色的分子标记组合及其在育种中的应用方法


[0001]本专利技术属于生物育种
，具体涉及一种鸡羽色相关分子标记组合、引物及判定羽色、培育和/或生产特定羽色鸡的方法和应用。

技术介绍

[0002]鸡的生产性能不受羽色性状影响，但是人们更偏好于有色羽的鸡。同时鸡的羽色便于识别，可以作为育种的遗传标记。羽色伴性基因可用于羽色自别雌雄的家禽配套系培育，因此对于国内优质鸡的育种，家鸡羽色性状是一个重要选择指标，具有重要的经济价值。
[0003]由于鸡的羽色性状受众多基因的控制，因此在家禽育种工作中需要解决的难题之一就是羽色选择。但是随着现代生物技术的进步以及在分子生物学和细胞生物学等层面对羽毛色素沉着性状的广泛研究，已经发现许多羽色相关的基因和致因突变位点。包括黑素扩散位点(E)编码基因——黑素皮质激素受体1基因(MelanocortinReceptor 1，MC1R)、显性白基因座(I)编码基因——前黑素小体蛋白17基因(Premelanosome protein 17，PMEL17)、隐性白基因座(c)编码基因——酪氨酸酶基因(TYRosinase，TYR)、深褐色基因座(DB)编码基因——性别决定区Y框蛋白10基因(SRY(sex determiningregionY)
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box 10，SOX10)等。迄今为止，已发现的羽色相关基因变异包括氨基酸序列的插入缺失突变；氨基酸序列的错义突变；碱基插入或缺失导致的移码突变；基因非编码区变异；外源序列插入导致的可变剪接变异。总之，羽色形成是一个复杂且精细的过程，受到众多基因和多条信号通路的精确调控。应用上述遗传变异的分子育种方法，经常用于鸡特定羽色的配套系培育。但以往技术往往只关注单个遗传变异在配套系培育中的作用。

技术实现思路

[0004]本专利技术的目的在于提供一种鸡羽色相关分子标记组合、引物及判定羽色、培育和/或生产特定羽色鸡的方法和应用。本专利技术解决了现有的仅用单一标记进行分子育种不具有广泛适用性的问题，依据本专利技术所列各种基因的组合模式，可以快速有效的培育目标羽色的鸡配套系。
[0005]本专利技术提供了一种鸡羽色相关分子标记组合，所述鸡羽色相关分子标记包括MC1R基因、PMEL17基因、SLC45A2基因、TYR基因和SOX10基因。
[0006]本专利技术还提供了检测鸡羽色相关分子标记的试剂在培育和/或生产特定羽色的鸡及鸡配套系或判断鸡羽色中的应用，所述鸡羽色相关分子标记包括MC1R基因、PMEL17基因、SLC45A2基因、TYR基因和SOX10基因。
[0007]优选的是，所述培育和/或生产的过程中，鸡的亲本包括白来航鸡。
[0008]优选的是，所述试剂包括引物；所述引物包括检测MC1R基因的引物MC1R
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F和MC1R
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R、检测PMEL17基因的引物PMEL17
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F2和PMEL17
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R2、检测SLC45A2基因的引物SLC45A2
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ex4F和SLC45A2
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ex4R、检测TYR基因的引物TYR
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F1、TYR
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R和TYR
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F2、以及检测SOX10基因的引物
SOX10
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1F、SOX10
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1R和SOX10
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6R；
[0009]所述MC1R
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F的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，所述MC1R
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R的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示；所述PMEL17
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F2的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示，所述PMEL17
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R2的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示；所述SLC45A2
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ex4F的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示，所述SLC45A2
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ex4R的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示；所述TYR
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F1的核苷酸序列如SEQ ID NO.7所示，所述TYR
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R的核苷酸序列如SEQ ID NO.8所示，所述TYR
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F2的核苷酸序列如SEQ ID NO.9所示；所述SOX10
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1F的核苷酸序列如SEQ ID NO.10所示，所述SOX10
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1R的核苷酸序列如SEQ ID NO.11所示，所述SOX10
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6R的核苷酸序列如SEQ ID NO.12所示。
[0010]本专利技术还提供了一组检测鸡羽色相关分子标记的引物，所述引物包括检测MC1R基因的引物MC1R
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F和MC1R
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R、检测PMEL17基因的引物PMEL17
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F2和PMEL17
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R2、检测SLC45A2基因的引物SLC45A2
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ex4F和SLC45A2
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ex4R、检测TYR基因的引物TYR
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F1、TYR
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R和TYR
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F2、以及检测SOX10基因的引物SOX10
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1F、SOX10
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1R和SOX10
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6R；
[0011]所述MC1R
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F的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，所述MC1R
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R的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示；所述PMEL17
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F2的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示，所述PMEL17
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R2的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示；所述SLC45A2
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ex4F的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示，所述SLC45A2
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ex4R的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示；所述TYR
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F1的核苷酸序列如SEQ ID NO.7所示，所述TYR
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R的核苷酸序列如SEQ ID NO.8所示，所述TYR
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F2的核苷酸序列如SEQ ID NO.9所示；所述SOX10
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1F的核苷酸序列如SEQ ID NO.10所示，所述SOX10
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1R的核苷酸序列如SEQ ID NO.11所示，所述SOX10
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6R的核苷酸序列如SEQ ID NO.12所示。
[0012]本专利技术还提供了一种判断鸡羽色的方法，包括以下步骤：
[0013]利用上述技术方案所述引物分别PCR扩增MC1R基因、PMEL17基因、SLC45A2基因、TYR基因和SOX10基因，根据PCR扩增产物的大小和各基因的基因型，按照下表的判断方法，对鸡羽色进行判断：
[0014]。
[0015]优选的是，PC本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种鸡羽色相关分子标记组合，其特征在于，所述鸡羽色相关分子标记包括MC1R基因、PMEL17基因、SLC45A2基因、TYR基因和SOX10基因。2.检测鸡羽色相关分子标记的试剂在培育和/或生产特定羽色的鸡及鸡配套系或判断鸡羽色中的应用，其特征在于，所述鸡羽色相关分子标记包括MC1R基因、PMEL17基因、SLC45A2基因、TYR基因和SOX10基因。3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述培育和/或生产的过程中，鸡的亲本包括白来航鸡。4.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述试剂包括引物；所述引物包括检测MC1R基因的引物MC1R
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F和MC1R
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R、检测PMEL17基因的引物PMEL17
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F2和PMEL17
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R2、检测SLC45A2基因的引物SLC45A2
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ex4F和SLC45A2
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ex4R、检测TYR基因的引物TYR
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F1、TYR
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R和TYR
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F2、以及检测SOX10基因的引物SOX10
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1F、SOX10
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1R和SOX10
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6R；所述MC1R
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F的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，所述MC1R
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R的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示；所述PMEL17
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F2的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示，所述PMEL17
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R2的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示；所述SLC45A2
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ex4F的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示，所述SLC45A2
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ex4R的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示；所述TYR
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F1的核苷酸序列如SEQ ID NO.7所示，所述TYR
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R的核苷酸序列如SEQ ID NO.8所示，所述TYR
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F2的核苷酸序列如SEQ ID NO.9所示；所述SOX10
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1F的核苷酸序列如SEQ ID NO.10所示，所述SOX10
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1R的核苷酸序列如SEQ ID NO.11所示，所述SOX10
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6R的核苷酸序列如SEQ ID NO.12所示。5.一组检测鸡羽色相关分子标记的引物，其特征在于，所述引物包括检测MC1R基因的引物MC1R
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F和MC1R
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R、检测PMEL17基因的引物PMEL17
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F2和PMEL17
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R2、检测SLC45A2基因的引物SLC45A2
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ex4F和SLC45A2
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ex4R、检测TYR基因的引物TYR
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F1、TYR
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R和TYR
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F2、以及检测SOX10基因的引物SOX10
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1F、SOX10
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1R和SOX10
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6R；所述MC1R
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F的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，所述MC1R
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R的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示；所述PMEL17
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F2的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示，所述PMEL17
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R2的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示；所述SLC45A2
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ex4F的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示，所述SLC45A2
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ex4R的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示；所述TYR
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F1的核苷酸序列如SEQ ID NO.7所示，所述TYR
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R的核苷酸序列如SEQ ID NO.8所示，所述TYR<...

【专利技术属性】
技术研发人员：孙从佼，杨宁，张文忻，
申请(专利权)人：中国农业大学，
类型：发明
国别省市：