用于分类监测的分子交互的方法和系统技术方案

技术编号:36737737 阅读:34 留言:0更新日期:2023-03-04 10:10
所公开的是一种用于通过下列来分类来自分析传感器系统(20)的监测结果的方法:允许(100)分析物样本溶液的第一集合与配体(3)进行交互,并且获取(101)响应数据集合;从所述响应数据中提取(102)至少一个交互参数;以及对于每个分析物样本溶液,为训练的机器学习算法提供(103)(一个或多个)交互参数。所述训练的机器学习算法基于(一个或多个)交互参数将每个分析物样本溶液分类为指示分析物样本溶液与配体(3)的交互的至少一个质量分类组。使用下列来训练(200)机器学习算法:从响应数据所提取的交互参数集合,所述响应数据从分析物样本溶液的第二集合与至少一个配体(3)之间的交互获得;以及指示分析物样本溶液与配体(3)的交互的至少一个质量分类组。交互的至少一个质量分类组。交互的至少一个质量分类组。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于分类监测的分子交互的方法和系统


[0001]本专利技术一般涉及用于分类监测的分子交互的方法和系统。

技术介绍

[0002]被布置成实时监测分子(诸如生物分子)之间的交互的分析传感器系统通常基于非标记生物传感器(诸如光学生物传感器)。代表这样的生物传感器系统是仪表,所述仪表将表面等离子体共振(SPR)用于检测样本中的分子与感测表面上所固定的分子结构之间的交互。样本经过传感器表面,并且结合的进展直接反映交互发生的速率。样本的注入之后接着缓冲液流,在所述缓冲液流期间,检测器响应反映复合物在表面上解离的速率。
[0003]来自系统和类似生物传感器系统的典型输出是描述分子交互随时间的进展的响应图或检测曲线,包括关联相部分和解离相部分。通常在计算机屏幕上显示的这个响应图或检测曲线通常称作结合曲线或“传感器图”。
[0004]利用系统(和类似传感器系统),有可能确定用作配体和分析物的分子的多个交互参数。这些参数包括分子交互的结合(关联)和解离的动力速率常数以及交互亲和力。
[0005]在例如基于片段的药物发现中的早期阶段,单独从单本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种用于分类来自分析传感器系统(20)的监测结果的方法,所述分析传感器系统(20)布置成监测分析物(4)与配体(3)之间的分子交互,其中获取表示所述分子交互随时间的进展的响应数据集合,依次允许(100)分析物样本溶液的第一集合与配体(3)进行交互,并且获取(101)用于每个监测的分子交互的响应数据的对应集合,从获取的响应数据的每个集合的至少一部分中提取(102)至少一个交互参数,对于每个分析物样本溶液,为训练的机器学习算法提供(103)所述至少一个提取的交互参数,并且允许所述训练的学习算法基于所述至少一个提取的交互参数将每个分析物样本溶液分类(104)到指示所述分析物样本溶液与所述配体(3)的交互的至少一个质量分类组中,其中使用下列来训练(200)所述机器学习算法:从响应数据的获取集合的至少一部分中所提取的交互参数集合,所述响应数据从分析物样本溶液的第二集合与至少一个配体(3)之间的交互获得,以及对于分析物样本溶液的所述第二集合的每个分析物样本溶液,指示所述分析物样本溶液与所述配体(3)的所述交互的至少一个相应质量分类组。2.如权利要求1所述的方法,其中,从用于分析物样本溶液的所述第一集合的分析物样本溶液的获取的响应数据集合所提取(102)的所述至少一个交互参数包括获取的响应数据的80

100%。3.如权利要求1或2所述的方法,其中,从用于分析物样本溶液的所述第二集合的分析物样本溶液的获取的响应数据集合所提取并且用于训练所述机器学习算法的所述至少一个交互参数包括获取的响应数据的80

100%。4.如权利要求1

3中的任一项所述的方法,其中,从用于分析物样本溶液的所述第一集合的分析物样本溶液的获取的响应数据集合所提取的所述至少一个交互参数包括在所述响应数据中的所定义时间点处所提取的任何一个或多个下列交互参数,a)早期结合响应,b)晚期结合响应,c)稳定性早期响应,d)稳定性晚期响应,e)早期结合响应除以所述分析物的分子量,f)晚期结合响应除以所述分析物的分子量,g)结合晚期响应和结合早期响应的差与所述结合早期响应相除,h)交互参数的a)

g)中的任何交互参数的测量变化,i)所述交互参数的a)

g)中的任何交互参数的测量斜率,和/或当所述分析物样本溶液由相同分析物的不同分析物浓度的多个分析物样本溶液来组成时,所述交互参数包括:j)使用来自所述多个分析物样本溶液的最大结合容量所计算的平衡解离常数。5.如权利要求1

4中的任一项所述的方法,其中,从用于分析物样本溶液的所述第二集合的分析物样本溶液的获取的响应数据的所述第二集合所提取并且用于训练所述机器学习算法的所述至少一个交互参数包括在所述响应数据中的所定义时间点处所提取的任何一个或多个下列交互参数,
a)早期结合响应,b)晚期结合响应,c)稳定性早期响应,d)稳定性晚期响应,e)早期结合响应除以所述分析物的分子量,f)晚期结合响应除以所述分析物的分子量,g)结合晚期响应和结合早期响应的差与所述结合早期响应相除,h)交互参数的a)

g)中的任何交互参数的测量变化,i)所述交互参数的a)

g)中的任何交互参数的测量斜率,和/或当所述分析物样本溶液由相同分析物的不同分析物浓度的多个分析物样本溶液来组成时,所述交互参数包括:j)使用来自所述多个分析物样本溶液的最大结合容量所计算的平衡解离常数。6.如前面权利要求中的任何权利要求所述的方法,还包括:对于分析物样本溶液的所述第一集合的所述分析物样本溶液中的每个分析物样本溶液,提取至少一个参考扣除交互参数,并且将这个参数提供给所述训练的机器学习算法。7.如前面权利要求中的任何权利要求所述的方...

【专利技术属性】
技术研发人员:T
申请(专利权)人:思拓凡瑞典有限公司
类型:发明
国别省市:

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