一种预测肝细胞癌恶性风险以及预测预后的生物标志物制造技术

本发明专利技术公开了一种基于TP53基因多态性预测初诊肝细胞癌恶性风险以及预测肝细胞癌患者预后风险的生物标志物。所述生物标志物为TP53rs28934571C>A。通过聚合酶链式反应

【技术实现步骤摘要】
一种预测肝细胞癌恶性风险以及预测预后的生物标志物


[0001]本专利技术属于肝细胞癌临床诊断预后领域，具体而言，涉及一种基于TP53 rs28934571多态性的，能够预测初诊肝细胞癌临床T分期≥T2的风险，能够预测初诊肝细胞癌门静脉癌栓累及的风险，以及能够预测肝细胞癌患者的预后不良风险的生物标志物。

技术介绍

[0002]肝细胞癌(Hepatocellular Carcinoma，HCC)是全球第5大常见的恶性肿瘤，也是癌症死亡的第3大主要原因。肝细胞癌的致癌因素包括肥胖、饮酒、吸烟、乙肝和丙肝。目前肝细胞癌的治疗手段或策略包括外科手术切除、肝移植、射频消融、经动脉化疗栓塞术和全身化疗。近年来这些治疗手段或策略虽然得到了长足的发展和进步，然而HCC患者的5年生存率仍然处于较低水平，不足5％。在治疗前准确评估HCC的恶性程度有利于指导后续的治疗方案，对于提高患者的5年生存率，改善患者的预后而言意义重大。
[0003]单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism，SNP)指在基因组水平上由可遗传的单个核苷酸变异所促成的DNA序列多态性。SNP可以表现为单个碱基的转换(C
←→
T；G
←→
A)或颠换(C
←→
A；G
←→
T；C
←→
G；A
←→
T)，也可以表现为单个碱基的插入或缺失。目前，已有大量研究表明一些SNP和癌症的发生发展相关，属于致病SNP。例如，SIRT1rs3758391T>C和rs369274325G>A能够增加伊朗人群的膀胱癌发病风险。因此，研究与HCC发生发展相关的基因的多态性，对于准确评估HCC的恶性程度以及精准预测HCC患者的预后而言具有指导意义。
[0004]TP53是近年来癌症发生发展相关研究的热点之一，位于人类染色体17p13.1。编码TP53的DNA序列包含了11个外显子和10个内含子。先行研究已经表明，野生型TP53发挥抑癌作用，抑制癌症的发生发展；然而发生SNP的TP53则可能促进癌症的发生发展。例如在乳腺癌中，TP53 rs1625895G>A可能使患者的早期死亡风险增加3倍；TP53 72Arg>Pro则可能参与了卵巢癌的发生发展。然而关于TP53基因多态性在HCC中如何影响其恶性程度的研究尚不充分。

技术实现思路

[0005]本专利技术的第一目的在于提供一种基于TP53 rs28934571多态性预测初诊HCC临床T分期≥T2的风险的生物标志物。本专利技术的第二目的在于提供一种基于TP53 rs28934571多态性预测初诊HCC门静脉癌栓累及的风险的生物标志物。本专利技术的第三目的在于提供一种基于TP53rs28934571多态性预测HCC患者预后不良风险的生物标志物。
[0006]为了实现本专利技术的目的，本专利技术采用的技术方案如下所述：
[0007]步骤1：收集HCC患者的肝细胞癌组织样本和临床信息数据(包括性别、临床T分期、原发灶数目、门静脉癌栓累及状态、血清AFP表达水平、总生存时间、总生存状态)。
[0008]步骤2：利用聚合酶链式反应
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限制性片段长度多态性技术检测HCC患者肝细胞癌组织样本的TP53 rs28934571基因型(包括CC、CA、AA)。
[0009]步骤3：分析HCC患者TP53基因型和患者临床信息(包括性别、临床T分期、原发灶数目、门静脉癌栓累及状态、血清AFP表达水平、总生存时间、总生存状态)之间的相关关系。
[0010]进一步地，步骤2中所述的TP53基因型为TP53 rs28934571CC基因型、CA基因型和AA基因型。
[0011]进一步地，步骤2中所述的TP53 rs28934571CC基因型、CA基因型、AA基因型以预测初诊HCC临床T分期≥T2的风险、门静脉癌栓累及的风险为目的，以及以预测HCC患者预后不良风险为目的时，无论以任何检测手段明确上述基因型的，均应视为在本专利技术的保护范围内。
[0012]进一步地，步骤2中所述的TP53 rs28934571CC基因型、CA基因型和AA基因型在其他数据库中的名称即便与本专利技术所使用名称不同，应视作指示相同的生物标志物；并且以预测初诊HCC临床T分期≥T2的风险、门静脉癌栓累及的风险为目的，以及以预测HCC患者预后不良风险为目的时，亦应视为在本专利技术的保护范围内。
[0013]两者择一地，当TP53 rs28934571基因型为CC时，指示初诊HCC临床T分期≥T2的风险相对较低；当TP53 rs28934571基因型为CA或AA时，指示初诊HCC临床T分期≥T2的风险相对较高。
[0014]两者择一地，当TP53 rs28934571基因型为CC时，指示初诊HCC的门静脉癌栓累及风险相对较低，当TP53 rs28934571基因型为CA或AA时，指示初诊HCC的门静脉癌栓累及风险相对较高。
[0015]两者择一地，当TP53 rs28934571基因型为CC时，指示HCC患者的预后不良风险相对较低；当TP53 rs28934571基因型为CA或AA时，指示HCC患者的预后不良风险相对较高。
[0016]与现有技术相比，本专利技术实现的积极有益作用为：
[0017](1)在目前常见、常用的影像学手段评估初诊HCC临床分期的系统(例如美国癌症协会肝癌分期系统、肝癌米兰分期系统、巴塞罗那肝癌分期系统、香港中文大学肝癌预后指数和日本综合肝癌分期)下，本专利技术本着精准医学理念，开发了基于TP53 rs28934571基因型预测初诊HCC临床T分期≥T2的风险以及门静脉癌栓累及的风险的生物标志物。以往的HCC临床分期或恶性程度评价系统多从原发灶大小、淋巴结累及、远端转移三个方面进行评估，然而由于HCC的异质性，仅靠上述三个方面已经无法满足对HCC的恶性程度以及病程发展进行全面准确评价的要求。本专利技术则在一定程度上弥补了上述局限性。(2)基于本专利技术，可以做到对HCC患者的预后不良风险的精准预测，在治疗初期甚至治疗前即可预测HCC患者的预后不良风险，做到早预测，早指导，早治疗，以此改善HCC患者的预后。(3)本专利技术所使用的HCC组织标本在常规微创HCC活检中即可取得，操作方便，易于推广。
附图说明
[0018]图1为TP53 rs28934571不同基因型的HCC患者的生存分析图。
[0019]图2为基于初诊HCC患者的临床样本分析得到的TP53 rs28934571不同基因型的生存分析图。
具体实施方式
[0020]以下结合说明书附图和具体实施例，对本专利技术作更详细准确地阐述和解释。以下
所述实施例仅作为解释本专利技术使用，不限制本专利技术的范围。以下所述的实施例中所使用的实验方法若无特殊说明，均为常规方法；所使用的材料、试剂等，若无特殊说明，均为常规途径或商业途径获得。
[0021]本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种基于TP53 rs28934571多态性的，能够预测初诊肝细胞癌临床T分期≥T2的风险的生物标志物。2.一种基于TP53 rs28934571多态性的，能够预测初诊肝细胞癌门静脉癌栓累及的风险的生物标志物。3.一种基于TP53 rs28934571多态性的，能够预测肝细胞癌患者预后不良的风险的生物标志物。4.根据权利要求1、2和3所述的生物标志物，其特征在于，所述的TP53 rs28934571多态性指通过聚合酶链式反应
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限制性片段长度多态性技术检测，得到TP53 rs28934571位点的不同的突变基因型：CC、CA、AA。5.权利要求1所述的生物标志物在预测初诊肝细胞癌临床T分期≥T2的风险中的应用。6.根据权利要求5所述的应用，其特征在于，所述的临床T分期≥T2的风险指基于T...

【专利技术属性】
技术研发人员：吴柏旭，请求不公布姓名，请求不公布姓名，
申请(专利权)人：浙江洛兮医疗科技有限公司，
类型：发明
国别省市：