基于食管癌前病变或食管癌miRNAs液体活检预测模型、诊断试剂盒与应用制造技术

本发明专利技术公开了基于食管癌前病变或食管癌miRNAs液体活检预测模型、诊断试剂盒与应用，涉及生物医疗领域，本发明专利技术提供了具有极高诊断价值的食管癌miRNAs液体活检标志物组合，包括has

【技术实现步骤摘要】
基于食管癌前病变或食管癌miRNAs液体活检预测模型、诊断试剂盒与应用


[0001]本专利技术涉及生物医疗领域，具体而言，涉及基于食管癌前病变或食管癌miRNAs液体活检预测模型、诊断试剂盒与应用。

技术介绍

[0002]食管由于解剖位置深，发病隐匿，且缺乏早期预警特异性的标志物，五年总体生存率低于30％。临床诊断与筛查主要依赖内镜检查，人群的依从性差，费用相对比较高，无法满足食管癌高发区的早期筛查的需求。
[0003]因此，亟待筛选特异性的液体活检的靶点，自主研发一种无创或微创的，实时快速的评估方法，用于食管癌前病变与食管癌的诊断，提高检出率，节约治疗的成本。
[0004]鉴于此，特提出本专利技术。

技术实现思路

[0005]本专利技术的目的在于提供基于食管癌前病变或食管癌miRNAs液体活检预测模型、诊断试剂盒与应用。
[0006]本专利技术是这样实现的：
[0007]第一方面，本专利技术实施例提供了检测目标miRNAs表达水平的试剂在制备用于预测食管癌前病变或食管癌的产品中的应用，所述目标miRNAs包括：has
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421。
[0008]第二方面，本专利技术实施例提供了一种用于预测食管癌前病变或食管癌的试剂或试剂盒，其包括：前述实施例所述的检测目标miRNAs表达水平的试剂。
[0009]第三方面，本专利技术实施例提供了一种食管癌前病变或食管癌的预测模型的训练方法，其包括：获取训练样本中的目标miRNAs的表达水平的检测结果及其对应的标注结果；其中，所述标注结果为代表样本食管癌或食管癌前病变是否发生或发生的程度的标签，所述目标miRNAs为前述实施例所述的目标miRNAs；将所述检测结果输入预先构建的预测模型中，获得预测结果；其中，所述预测模型为能根据所述目标miRNAs的表达水平预测样本是否为食管癌前病变或食管癌的机器学习模型，或预测样本是否为食管癌或食管癌前病变程度；基于所述标注结果和所述预测结果对所述预测模型进行参数更新。
[0010]第四方面，本专利技术实施例提供了一种食管癌或食管癌前病变的预测装置，其包括获取模块和预测模块。获取模块，用于获取待测样本的目标miRNAs的表达水平的检测结果；其中，所述目标miRNAs为前述实施例所述的目标miRNAs；预测模块，用于将目标miRNAs的表达水平的检测结果输入如前述实施例所述的训练方法训练获得的预测模型中，获得待测样本的预测结果。
[0011]第五方面，本专利技术实施例提供了一种电子设备，其包括：处理器和存储器；所述电子设备包括处理器和存储器；所述存储器用于存储程序，当所述程序被所述处理器执行时，
使得所述处理器实现如前述实施例所述的食管癌前病变或食管癌的预测模型的训练方法或食管癌前病变或食管癌的预测；所述食管癌或食管癌前病变的预测包括：获取待测样本的目标miRNAs的表达水平的检测结果；其中，所述目标miRNAs为前述实施例所述的目标miRNAs；将目标miRNAs的表达水平的检测结果输入如前述实施例所述的训练方法训练获得的预测模型中，获得待测样本的预测结果。
[0012]第六方面，本专利技术实施例提供了一种计算机可读介质，所述计算机可读介质上存储有计算机程序，所述计算机程序被处理器执行时实现如前述实施例所述的食管癌前病变或食管癌的预测模型的训练方法或如前述实施例所述的食管癌前病变或食管癌的预测。
[0013]本专利技术具有以下有益效果：
[0014]本专利技术提供了具有极高诊断价值的miRNAs液体活检的标志物组合，能够用于构建食管癌的早筛模型，以作为食管癌高发区筛查和临床食管癌的辅助诊断手段，提高食管癌患者的预后，具有检测便捷，检测成本低，检测准确性高等优势。
附图说明
[0015]为了更清楚地说明本专利技术实施例的技术方案，下面将对实施例中所需要使用的附图作简单地介绍，应当理解，以下附图仅示出了本专利技术的某些实施例，因此不应被看作是对范围的限定，对于本领域普通技术人员来讲，在不付出创造性劳动的前提下，还可以根据这些附图获得其他相关的附图。
[0016]图1为食管癌组织/血液中差异表达miRNAs的筛选；
[0017]图2为28个miRNAs在血液中的表达改变；
[0018]图3为训练集建立食管癌7个miRNAs液体活检预测模型；
[0019]图4为7个miRNAs标志物组合可以区分健康人群与食管癌前病变及食管癌；
[0020]图5为验证集确定食管癌不同miRNAs标志物组合诊断性能。
具体实施方式
[0021]为使本专利技术实施例的目的、技术方案和优点更加清楚，下面将对本专利技术实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述。实施例中未注明具体条件者，按照常规条件或制造商建议的条件进行。所用试剂或仪器未注明生产厂商者，均为可以通过市售购买获得的常规产品。
[0022]本专利技术实施例提供了检测目标miRNAs表达水平的试剂在制备用于预测食管癌前病变或食管癌的产品中的应用，所述目标miRNAs包括：has
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421中的至少两种。
[0023]本文所述的“预测食管癌前病变或食管癌”可以理解为诊断或辅助诊断食管癌或食管癌前病变是否发生或发生的程度。
[0024]专利技术人经一系列创造性劳动，基于构建的155配对食管鳞状细胞癌于邻近癌旁组织转录组数据与公共两个数据集(GSE43732、GSE55856)并结合大样本食管癌血清miRNAs表达谱的数据，较好的避免或减少肿瘤异质性，弥补了以前研究队列规模小、重现性差的问题；筛选出具有极高诊断价值的目标miRNAs组合，其涵盖面较广，优于其他单个或多个的
miRNAs组合。MiRNAs稳定性好，在血液不易被降解，定量P本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.检测目标miRNAs标志物组合表达水平的试剂在制备食管癌前病变或食管癌诊断试剂或试剂盒中的应用，其特征在于，所述目标miRNAs包括：has
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421中的至少两种。2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述目标miRNAs包括：has
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421中的至少三种；优选地，所述目标miRNAs包括：has
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421中的至少四种；优选地，所述目标miRNAs包括：has
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421中的至少五种；优选地，所述目标miRNAs包括：has
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421中的至少六种；优选地，所述目标miRNAs还包括：has
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5p中的至少一种。3.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述目标miRNAs包括组合1～9中的任意一种；组合1由has
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3p组成；组合2由has
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3p组成；组合3由has
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3p组成；组合4由has
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3p组成；组合5由has
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3p、has

【专利技术属性】
技术研发人员：刘芝华，骆爱萍，
申请(专利权)人：中国医学科学院肿瘤医院，
类型：发明
国别省市：