【技术实现步骤摘要】
寡核苷酸编码的化学文库
[0001]本申请是分案申请，原申请的申请日为2018年9月24日、申请号为2018800720827、专利技术名称为“寡核苷酸编码的化学文库”。
[0002]本公开涉及使用化合物文库的高通量筛选，其中化合物与珠粒结合或包含在珠粒中，每个珠粒含有一种化合物的多个拷贝，其中进一步地珠粒还含有编码包含在珠粒内或上的化合物的身份或合成历史的DNA标签。本公开还涉及在皮可孔中进行的高通量测定，其中皮可孔含有负载化合物的珠粒和测定材料。本公开进一步涉及释放珠粒结合的化合物并对其生物学活性进行筛选。广义地说，本公开设想了将珠粒用作化合物的递送媒剂的测定，以及用于产生这种负载化合物的珠粒的方法。
[0003]本公开涉及珠粒结合的化合物，其中每种化合物由一个或多个属于化学文库的单体制成。本公开还涉及珠粒结合的DNA条形码，即涉及核酸，其中每个核酸的序列是密码(与遗传密码无关)，所述密码是指一种特定的化学文库单体。本公开进一步涉及释放珠粒结合的化合物，然后筛选释放的化合物的生物活性。
[0004]本公开总体上还...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种用于鉴定化合物诱导的细胞中的转录组变化的方法，其中所述化合物包括在组合化学文库的测定，所述方法包括：a)生成测定阵列，其中所述阵列包括：i)多个有限体积，其中每个有限体积与其他有限体积分开，并且其中每个有限体积包括感兴趣的细胞；ii)多个珠粒，其中每个珠粒包括多个基本上相同的化合物，使得每个珠粒包括来自所述组合文库的唯一化合物，并且选择所述文库中的每种化合物作为潜在候选药物；和多个功能化寡核苷酸，其中所述功能化寡核苷酸包括编码所述唯一化合物的结构或用于制造所述唯一化合物的合成步骤的寡核苷酸部分和RNA捕获元件，其中在每个有限体积中分散单个珠粒；b)将每个有限体积中的细胞与从所述珠粒释放到所述有限体积的化合物接触并维持所述接触持续足以响应于所述接触生成所述细胞表达的RNA中的转录组变化的时段；c)通过裂解所述细胞并且将RNA与所述珠粒上的RNA捕获元件接触，捕获在每个有限体积中来自所述细胞的RNA；d)鉴定来自所述多个珠粒的至少一部分的捕获的RNA，并评估所述捕获的RNA中的任何转录组变化；和e)鉴定生成所述转录组变化的任何化合物的结构。2.根据权利要求1所述的方法，其进一步包括f)基于与对照相比所述捕获的RNA的水平，评估所述化合物是否证明作为候选药物...
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