咪唑并三嗪通过抑制CDK12作用于癌症制造技术

技术编号:35983732 阅读:13 留言:0更新日期:2022-12-17 22:56
本发明专利技术提供了通式(I)的化合物,其中X、R1、R2和R3如本文所述和定义,还提供了制备所述化合物的方法、用于制备所述化合物的有用的中间体化合物、包含所述化合物的药物组合物和组合,以及所述化合物用于制备用于治疗和/或预防疾病,特别是过度增殖性疾病如癌症疾病的药物组合物,作为单一药剂或与其他活性成分组合的用途。的用途。的用途。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】咪唑并三嗪通过抑制CDK12作用于癌症


[0001]本专利技术提供了削弱CDK12活性的通式(I)的化合物。具体而言,本专利技术提供了用于治疗癌症和其他CDK12依赖性疾病的组合物和方法。更具体地,本专利技术提供了诱导细胞中和/或Cyclin K蛋白水解降解的化合物。因此,本专利技术提供了能够降解CDK12和/或Cyclin K的化合物,所述化合物用于治疗乳腺癌、肝癌、肺癌、卵巢癌、子宫内膜癌、宫颈癌、结直肠癌、胃癌、食道癌、膀胱癌、前列腺癌、尤文(Ewing)肉瘤、胶质母细胞瘤和急性髓性白血病。更具体地,本专利技术提供了能够降解CDK12和/或Cyclin K的化合物,所述化合物用于治疗肺癌、乳腺癌、肝癌、结直肠癌、胃癌、前列腺癌和白血病。

技术介绍

[0002]细胞周期蛋白依赖性激酶(CDK)12(CDK12,基因id 51755)是磷酸化RNA聚合酶II的C末端结构域(CTD)的CDK丝氨酸/苏氨酸激酶家族子集的成员。与Cyclin K(CCNK,基因id 8812)复合的CDK12通过RNA聚合酶II复合物CTD的Ser2和Ser5的磷酸化来调节转录、共转录和转录后过程,这在前mRNA合成的延伸阶段很重要。据报道,CDK12/Cyclin K可调节转录延伸和mRNA加工,特别是共转录和转录后的前mRNA剪接、可变剪接、3

端加工和内含子多聚腺苷酸化的抑制。CDK13(CDK13,基因id 8621)——一种与CDK12密切相关的激酶——也与Cyclin K形成复合物并调节一组不同基因的转录(Bartkowiak等人Genes Dev.2010;24:2303

16。Dubbury等人Nature.2018;564:141

5。Greenleaf,Transcription.2018;10:91

110。Greifenberg等人Cell Rep.2016;14:320

31。Liang等人Mol.Cell.Biol.2015;35:928

38。Lui等人J.Clin.Pathol.2018;71:957

62。Tien等人Nuc.Acids Res.2017;45:6698

716)。据报道,编码DNA损伤信号通路和修复通路组分的基因(例如同源重组和复制应激反应基因BRCA1、FANCD2、FANCI和ATR)的转录以及编码其他应激反应通路(例如NF

κB和氧化应激反应)组分受CDK12/Cyclin K的特异性调节,如基因敲除法和由化学蛋白质组学研究所证明的(Blazek等人Genes Dev.2011;25:2158

72。Henry等人Sci.Signal.2018;11:eaam8216。Li等人Sci.Rep.2016;6:21455。)。此外,据报道,CDK12/Cyclin K通过直接磷酸化mRNA5



结合翻译抑制因子4E

BP1导致其从mRNA帽中释放来控制mRNA子集(包括CHK1 mRNA)的翻译(Choi等人Genes Dev.2019;33:418

35)。最近在高级别浆液性卵巢癌以及原发性和去势抵抗性前列腺癌中发现了罕见的双等位基因CDK12失活突变,导致一种特殊类型的基因组不稳定性,其特征是出现大量串联重复,表明DNA修复存在严重缺陷,强调了CDK12在DNA损伤反应和基因组维护中的作用(Ekumi等人Nucl.Acids Res.2015;43:2575

89。Grasso等人Nature.2012;487:239

43。Joshi等人J.Biol.Chem.2014;289:9247

53。Menghi等人Cancer Cell.2018;34:197

210.e5。Popova等人Cancer Res.2016;76:1882

91。Quigley等人Cell.2018;174:758

69.e9。Robinson等人2015;162:454。Viswanathan等人Cell.2018;174:433

47.e19。Wu等人Cell.2018;173:1770

82.e14)。CDK12基因位于17号染色体上,距ERBB2基因约200kb,且其通常在乳腺癌中同时扩增。此外,在胃癌、食道癌、胰腺癌、子宫癌、子宫内膜癌、前列腺癌和膀胱癌等其他癌症类型中也观察到CDK12基因扩增
(Lui等人J Clin Pathol.2018;71:957

62。Gupta等人Clin.Cancer Res.2017;23:1346

57)。CDK12扩增和高表达水平表明CDK12的肿瘤促进作用至少部分地是基于可变剪接的mRNA、增加的DNA修复能力和增加的应激耐受性(Lui等人J Clin Pathol.2018;71:957

62。Tien等人Nucl.Acids Res.2017;45:6698

716)。综合这些数据,证实CDK12是开发治疗癌症和其他疾病(如1型强直性营养不良)药物的潜在靶点。
[0003]一些CDK12激酶活性抑制剂是已知的:
[0004]夫拉平度(Flavopiridol)(一种微摩尔非选择性CDK12抑制剂)可抑制CDK9、CDK1、CDK4等其他激酶(等人Nat.Comm.2014;5:3505)。地那西利(Dinaciclib),一种泛CDK抑制剂(Johnson等人Cell Rep.2016;17:2367

81)。THZ531,一种CDK12和CDK13的双重抑制剂(Zhang等人Nat.Chem.Biol.2016;12:876

84)。SR

3029和相关的嘌呤化合物(Johannes等人Chem.Med.Chem.2018;13:231

5)。SR

4835,一种CDK12和CDK13的双重抑制剂(Quereda等人,Cancer Cell 2019;36:1

14)。化合物919278,一种微摩尔CDK12抑制剂(Henry等人Science Signal.2018;11:eaam8216)。芳基脲衍生物(Ito等人J.Med.Chem.2018;61:7710

28)。
[0005]需要开发选择性削弱CDK12/Cyclin K功能的用于治疗癌症和其他疾病的化合物,例如通过诱导细胞中CDK12和/或Cyclin K蛋白的蛋白水解降解。靶向ATP口袋的抑制剂的选择性受限是一个问题,它可能导致不希望的副作用和有本文档来自技高网
...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.式(I)的化合物,或互变异构体,或N

氧化物,或其盐,或互变异构体的盐,或N

氧化物的盐,或它们的混合物其中R1选自卤素原子、C1‑
C6‑
烷基、C1‑
C6‑
卤代烷基、C3‑
C8‑
环烷基、(C3‑
C8‑
环烷基)

(C1‑
C6‑
烷基)

基团、氰基、苯基、杂环烷基和杂芳基,其中所述C1‑
C6‑
烷基、C3‑
C8‑
环烷基、苯基、杂环烷基或杂芳基各自任选地被一个或多个独立地选自以下的取代基取代:卤素原子、氰基、C1‑
C6‑
烷基、C1‑
C6‑
烷氧基、C1‑
C6‑
卤代烷基、C1‑
C6‑
卤代烷氧基、C3‑
C8‑
环烷基、C3‑
C8‑
环烷氧基和R5R6N

基团;R2选自C1‑
C6‑
烷基、C1‑
C6‑
烷氧基、C1‑
C6‑
卤代烷基、C1‑
C6‑
卤代烷氧基、C3‑
C8‑
环烷基、C3‑
C8‑
环烷氧基、杂环烷基和

NR
a
R
b
基团,其中所述杂环烷基通过所述杂环烷基的碳原子连接到分子的其余部分,其中R
a
和R
b
各自独立地选自氢原子、C1‑
C6‑
烷基、C3‑
C8‑
环烷基、C1‑
C6‑
卤代烷基、(C3‑
C8‑
环烷基)

(C1‑
C6‑
烷基)

基团、C1‑
C6‑
羟烷基、(C1‑
C6‑
烷氧基)

(C1‑
C6‑
烷基)

基团、杂环烷基、杂芳基和苯基,其中所述C3‑
C8‑
环烷基、苯基、杂芳基或杂环烷基各自任选地被一个或多个独立地选自以下的取代基取代:卤素原子、氰基、羟基、C1‑
C6‑
烷基、C1‑
C6‑
羟烷基、C1‑
C6‑
卤代烷基、C1‑
C6‑
烷氧基、C1‑
C6‑
卤代烷氧基和R5R6N

基团,其中R
a
或R
b
中的至少一个不是氢原子;或者,R
a
和R
b
与它们所连接的氮原子一起形成4至9元含氮单环杂环烷基或5至11元含氮双环杂环烷基、7至9元含氮桥接化合物或7至12元含氮螺环化合物,所述4至9元含氮单环杂环烷基或5至11元含氮双环杂环烷基、7至9元含氮桥接化合物或7至12元含氮螺环化合物各自任选地含有一个、两个或三个独立地选自氮、氧和硫的其他杂原子或一个选自以下的基团:

NR8‑


S(=O)



S(=O)2‑


S(=O)(=NH)

,和/或任选地被取代一次、两次或三次,每个取代基独立地选自卤素原子或选自以下的基团:氰基、羟基、C1‑
C2‑
烷基、C1‑
羟烷基、C1‑
C2‑
卤代烷基、C1‑
C2‑
烷氧基、C3‑
C4‑
环烷基、(C1‑
C2‑
烷基)OOC

基团、R5R6N

基团和氧代;X选自氮原子和CR4基团;R3选自C3‑
C8‑
环烷基、杂环烷基、苯基和杂芳基,其中所述杂环烷基、苯基或杂芳基各自任选地被一个或多个独立地选自以下的取代基取代:卤素原子、氰基、羟基、C1‑
C6‑
烷基、C1‑
C6‑
羟烷基、C1‑
C6‑
卤代烷基、C1‑
C6‑
烷氧基、C1‑
C6‑
卤代烷氧基、C3‑
C8‑
环烷基、R5R6N

基团和R7OOC

基团;
R4选自氢原子、C1‑
C3‑
烷基和C1‑
C3‑
卤代烷基;或者,其中当X是CR4基团时,R3和R4与它们所连接的碳原子一起形成5至7元环烯基、杂环烯基、苯基或杂芳基,其中所述杂环烯基或杂芳基含有一个或两个独立地选自氮、氧和硫的杂原子,并且其中所述环烯基、杂环烯基、苯基或杂芳基各自任选地被取代一次、二次或三次,每个取代基独立地选自卤素原子、氰基、C1‑
C6‑
烷基、C1‑
C6‑
羟烷基、C1‑
C6‑
卤代烷基、C1‑
C6‑
烷氧基、C1‑
C6‑
卤代烷氧基、C3‑
C5‑
环烷基、C3‑
C5‑
环烷氧基、R5R6N

基团、(R5R6N)

(C1‑
C6‑
烷基)

基团和R7OOC

基团;R5和R6各自独立地选自氢原子、C1‑
C6‑
烷基、C3‑
C8‑
环烷基、C1‑
C6‑
卤代烷基、(C3‑
C8‑
环烷基)

(C1‑
C6‑
烷基)

基团、C1‑
C6‑
羟烷基、(C1‑
C6‑
烷氧基)

(C1‑
C6‑
烷基)

基团、甲酰基(HCO

)基团、乙酰基(H3CCO

)基团、杂环烷基、杂芳基和苯基;R7选自氢原子和C1‑
C3‑
烷基;R8选自氢原子、C1‑
C6‑
烷基、C3‑
C6‑
环烷基和C1‑
C6‑
卤代烷基。2.根据权利要求1所述的化合物,或互变异构体,或N

氧化物,或其盐,或互变异构体的盐,或N

氧化物的盐,或它们的混合物,其中R1选自卤素原子、C1‑
C6‑
卤代烷基、氰基和苯基,其中所述苯基任选地被一个或多个独立地选自以下的取代基取代:卤素原子、氰基、C1‑
C6‑
烷基、C1‑
C6‑
烷氧基、C1‑
C6‑
卤代烷基、C1‑
C6‑
卤代烷氧基、C3‑
C8‑
环烷基、C3‑
C8‑
环烷氧基和R5R6N

基团;R2选自C1‑
C6‑
烷基、C1‑
C6‑
烷氧基、C1‑
C6‑
卤代烷基、C1‑
C6‑
卤代烷氧基、C3‑
C8‑
环烷基、C3‑
C8‑
环烷氧基、杂环烷基和

NR
a
R
b
基团,其中所述杂环烷基通过所述杂环烷基的碳原子连接到分子的其余部分,其中R
a
和R
b
各自独立地选自氢原子、C1‑
C6‑
烷基、C3‑
C8‑
环烷基、C1‑
C6‑
卤代烷基、(C3‑
C8‑
环烷基)

(C1‑
C6‑
烷基)

基团、C1‑
C6‑
羟烷基、(C1‑
C6‑
烷氧基)

(C1‑
C6‑
烷基)

基团、杂环烷基、杂芳基和苯基,其中所述C3‑
C8‑
环烷基、苯基、杂芳基或杂环烷基各自任选地被一个或多个独立地选自以下的取代基取代:卤素原子、羟基、氰基、C1‑
C3‑
烷基、C1‑
C3‑
羟烷基、C1‑
C3‑
卤代烷基、C1‑
C3‑
烷氧基、C1‑
C3‑
卤代烷氧基和R5R6N

基团,其中R
a
或R
b
中的至少一个不是氢原子;或者,R
a
和R
b
与它们所连接的氮原子一起形成4至9元含氮单环杂环烷基或5至11元含氮双环杂环烷基、7至9元含氮桥接化合物或7至12元含氮螺环化合物,所述4至9元含氮单环杂环烷基或5至11元含氮双环杂环烷基、7至9元含氮桥接化合物或7至12元含氮螺环化合物各自任选地含有一个、两个或三个独立地选自氮、氧和硫的其他杂原子或一个选自以下的基团:

NR8‑


S(=O)



S(=O)2‑


S(=O)(=NH)

,和/或任选地被取代一次、两次或三次,每个取代基独立地选自卤素原子或选自以下的基团:氰基、羟基、C1‑
C2‑
烷基、C1‑
羟烷基、C1‑
C2‑
卤代烷基、C1‑
C2‑
烷氧基、C3‑
C4‑
环烷基、(C1‑
C2‑
烷基)OOC

基团、R5R6N

基团和氧代;X选自氮原子和CR4基团;R3选自C3‑
C8‑
环烷基、杂环烷基、苯基和杂芳基,
其中所述杂环烷基、苯基或杂芳基各自任选地被一个或多个独立地选自以下的取代基取代:卤素原子、氰基、羟基、C1‑
C6‑
烷基、C1‑
C6‑
羟烷基、C1‑
C6‑
卤代烷基、C1‑
C6‑
烷氧基、C1‑
C6‑
卤代烷氧基、C3‑
C8‑
环烷基、R5R6N

基团和R7OOC

基团;R4选自氢原子、C1‑
C3‑
烷基和C1‑
C3‑
卤代烷基;或者,其中当X是CR4基团时,R3和R4与它们所连接的碳原子一起形成5至7元环烯基、杂环烯基、苯基或杂芳基,其中所述杂环烯基或杂芳基含有一个或两个独立地选自氮、氧和硫的杂原子,并且其中所述环烯基、杂环烯基、苯基或杂芳基各自任选地被取代一次、二次或三次,每个取代基独立地选自卤素原子、氰基、C1‑
C6‑
烷基、C1‑
C6‑
羟烷基、C1‑
C6‑
卤代烷基、C1‑
C6‑
烷氧基、C1‑
C6‑
卤代烷氧基、C3‑
C5‑
环烷基、C3‑
C5‑
环烷氧基、R5R6N

基团、(R5R6N)

(C1‑
C6‑
烷基)

基团和R7OOC

基团;R5和R6各自独立地选自氢原子、C1‑
C6‑
烷基、C3‑
C8‑
环烷基、C1‑
C6‑
卤代烷基、(C3‑
C8‑
环烷基)

(C1‑
C6‑
烷基)

基团、C1‑
C6‑
羟烷基、(C1‑
C6‑
烷氧基)

(C1‑
C6‑
烷基)

基团、甲酰基(HCO

)基团、乙酰基(H3CCO

)基团、杂环烷基、杂芳基和苯基;R7选自氢原子和C1‑
C3‑
烷基;R8选自氢原子、C1‑
C6‑
烷基、C3‑
C6‑
环烷基和C1‑
C6‑
卤代烷基。3.根据权利要求1或2中任一项所述的化合物,或互变异构体,或N

氧化物,或其盐,或互变异构体的盐,或N

氧化物的盐,或它们的混合物,其中R1选自卤素原子、C1‑
C6‑
卤代烷基、氰基和苯基,其中所述苯基任选地被一个或多个独立地选自以下的取代基取代:卤素原子、氰基、C1‑
C6‑
烷基、C1‑
C6‑
烷氧基、C1‑
C6‑
卤代烷基、C1‑
C6‑
卤代烷氧基、C3‑
C8‑
环烷基、C3‑
C8‑
环烷氧基和R5R6N

基团;R2为

NR
a
R
b
基团,其中R
a
和R
b
各自独立地选自氢原子、C1‑
C6‑
烷基、C1‑
C6‑
羟烷基、杂芳基和苯基,其中所述苯基、杂芳基或杂环烷基各自任选地被一个或多个独立地选自以下的取代基取代:卤素原子、氰基、C1‑
烷基、C1‑
羟烷基、C1‑
卤代烷基、C1‑
烷氧基、C1‑
卤代烷氧基和R5R6N

基团,其中R
a
或R
b
中的至少一个不是氢原子;或者,R
a
和R
b
与它们所连接的氮原子一起形成4至9元含氮单环杂环烷基或5至11元含氮双环杂环烷基、7至9元含氮桥接化合物或7至12元含氮螺环化合物,所述4至9元含氮单环杂环烷基或5至11元含氮双环杂环烷基、7至9元含氮桥接化合物或7至12元含氮螺环化合物各自任选地含有一个、两个或三个独立地选自氮、氧和硫的其他杂原子或一个选自以下的基团:

NR8‑


S(=O)



S(=O)2‑


S(=O)(=NH)

,和/或任选地被取代一次、两次或三次,每个取代基独立地选自卤素原子或选自以下的基团:羟基、C1‑
C2‑
烷基、C1‑
羟烷基、C1‑
C2‑
卤代烷基、C1‑
C2‑
烷氧基、C3‑
C4‑
环烷基、R5R6N

基团和氧代;X选自氮原子和CR4基团;R3选自C3‑
C8‑
环烷基、杂环烷基、苯基和杂芳基,其中所述杂环烷基、苯基或杂芳基各自任选地被一个或多个独立地选自以下的取代基
取代:卤素原子、氰基、羟基、C1‑
C6‑
烷基、C1‑
C6‑
羟烷基、C1‑
C6‑
卤代烷基、C1‑
C6‑
烷氧基、C1‑
C6‑
卤代烷氧基、C3‑
C8‑
环烷基、R5R6N

基团和R7OOC

基团;R4选自氢原子、C1‑
C3‑
烷基和C1‑
C3‑
卤代烷基;或者,其中当X是CR4基团时,R3和R4与它们所连接的碳原子一起形成5至7元环烯基、杂环烯基、苯基或杂芳基,其中所述杂环烯基或杂芳基含有一个或两个独立地选自氮、氧和硫的杂原子,并且其中所述环烯基、杂环烯基、苯基或杂芳基各自任选地被取代一次、二次或三次,每个取代基独立地选自卤素原子、氰基、C1‑
C6‑
烷基、C1‑
C6‑
羟烷基、C1‑
C6‑
卤代烷基、C1‑
C6‑
烷氧基、C1‑
C6‑
卤代烷氧基、C3‑
C5‑
环烷基、C3‑
C5‑
环烷氧基、R5R6N

基团、(R5R6N)

(C1‑
C6‑
烷基)

基团和R7OOC

基团;R5和R6各自独立地选自氢原子、C1‑
C6‑
烷基、C3‑
C8‑
环烷基、C1‑
C6‑
卤代烷基、(C3‑
C8‑
环烷基)

(C1‑
C6‑
烷基)

基团、C1‑
C6‑
羟烷基、(C1‑
C6‑
烷氧基)

(C1‑
C6‑
烷基)

基团、甲酰基(HCO

)基团、乙酰基(H3CCO

)基团、杂环烷基、杂芳基和苯基;R7选自氢原子和C1‑
C3‑
烷基;R8选自氢原子、C1‑
C6‑
烷基、C3‑
C6‑
环烷基和C1‑
C6‑
卤代烷基。4.根据权利要求1至3中任一项所述的化合物,或互变异构体,或N

氧化物,或其盐,或互变异构体的盐,或N

氧化物的盐,或它们的混合物,其中R1选自卤素原子、C1‑
C6‑
卤代烷基、氰基和苯基,其中所述苯基任选地被一个或多个独立地选自以下的取代基取代:卤素原子、氰基、C1‑
C6‑
烷基、C1‑
C6‑
烷氧基、C1‑
C6‑
卤代烷基、C1‑
C6‑
卤代烷氧基、C3‑
C8‑
环烷基、C3‑
C8‑
环烷氧基和R5R6N

基团;R2为

NR
a
R
b
基团,其中R
a
和R
b
与它们所连接的氮原子一起形成4至9元含氮单环杂环烷基,所述4至9元含氮单环杂环烷基任选地含有一个、两个或三个独立地选自氮、氧和硫的其他杂原子或一个选自以下的基团:

NR8‑


S(=O)



S(=O)2‑


S(=O)(=NH)

,和/或任选地被取代一次、两次或三次,每个取代基独立地选自卤素原子或选自以下的基团:羟基、C1‑
C2‑
烷基、C1‑
羟烷基、C1‑
C2‑
卤代烷基、C1‑
C2‑
烷氧基、C3‑
C4‑
环烷基、R5R6N

基团和氧代;X选自氮原子和CR4基团;R3选自C3‑
C8‑
环烷基、杂环烷基、苯基和杂芳基,其中所述杂环烷基、苯基或杂芳基各自任选地被一个或多个独立地选自以下的取代基取代:卤素原子、氰基、羟基、C1‑
C6‑
烷基、C1‑
C6‑
羟烷基、C1‑
C6‑
卤代烷基、C1‑
C6‑
烷氧基、C1‑
C6‑
卤代烷氧基、C3‑
C8‑
环烷基、R5R6N

基团和R7OOC

基团;R4选自氢原子、C1‑
C3‑
烷基和C1‑
C3‑
卤代烷基;或者,其中当X是CR4基团时,R3和R4与它们所连接的碳原子一起形成5至7元环烯基、杂环烯基、苯基或杂芳基,其中所述杂环烯基或杂芳基含有一个或两个独立地选自氮、氧和硫的杂原子,并且其中所述环烯基、杂环烯基、苯基或杂芳基各自任选地被取代一次、二次或三次,每个取代基独立地选自卤素原子、氰基、C1‑
C6‑
烷基、C1‑
C6‑
羟烷基、C1‑
C6‑
卤代烷基、C1‑
C6‑
烷氧基、C1‑
C6‑
卤代烷氧基、C3‑
C5‑
环烷基、C3‑
C5‑
环烷氧基、R5R6N

基团、(R5R6N)

(C1‑
C6‑
烷基)

基团和R7OOC

基团;R5和R6各自独立地选自氢原子、C1‑
C6‑
烷基、C3‑
C8‑
环烷基、C1‑
C6‑
卤代烷基、(C3‑
C8‑
环烷基)

(C1‑
C6‑
烷基)

基团、C1‑
C6‑
羟烷基、(C1‑
C6‑
烷氧基)

(C1‑
C6‑
烷基)

基团、甲酰基(HCO

)基团、乙酰基(H3CCO

)基团、杂环烷基、杂芳基和苯基;R7选自氢原子和C1‑
C3‑
烷基;R8选自氢原子、C1‑
C6‑
烷基、C3‑
C6‑
环烷基和C1‑
C6‑
卤代烷基。5.根据权利要求1至4中任一项所述的化合物,或互变异构体...

【专利技术属性】
技术研发人员:K
申请(专利权)人:德国癌症研究中心
类型:发明
国别省市:

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