包含细菌物种的组合物及其相关方法技术

本公开总体上涉及Anaerostipes的细菌菌株(例如Anaerostipes rhamnosivorans细菌菌株)以及包含此类细菌菌株的组合物(例如药物组合物)。本公开还涉及使用此类细菌菌株和组合物在施用于有需要的受试者时预防或治疗病症(例如炎性病症、胃肠道病症、代谢病症和/或生态失调)的方法。生态失调)的方法。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】包含细菌物种的组合物及其相关方法
相关申请的交叉引用
[0001]本申请要求于2019年11月22日提交的美国临时专利申请序列号62/939,120 的权益和优先权，其全部内容通过引用并入本文。序列表
[0002]本申请包含已经以ASCII格式电子提交的序列表，其全部内容通过引用并入本文。所述ASCII拷贝创建于2020年11月20日，文件名为ASP
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060WO_SL.txt并且大小为4,684,004字节。

技术介绍

[0003]胃肠道(GI)以及其他器官系统是一种包含许多不同生物体的群落的复杂的生物系统，生物体包括各种细菌菌株。数百种不同的物种可以在健康人的胃肠道和其他器官中形成共生群落。此外，肠道中存在的微生物不仅在消化健康中起关键作用，而且还影响免疫系统。生物系统(例如胃肠道)中的紊乱或失衡可能包括肠道中细菌的类型和数量的变化，其可导致不健康状态和/或疾病的发展或可能是不健康状态和/或疾病的指示。

技术实现思路

[0004]本公开一般涉及细菌菌株、细菌菌株混合物和组合物，例如包含Anaerostipes 的菌株。所公开的细菌菌株、细菌菌株混合物或组合物可用于治疗胃肠道病症和/或炎性病症，包括例如生态失调和/或免疫介导的炎性病症(例如炎性皮肤病症)。示例性炎性皮肤病症包括但不限于与细胞增殖相关的病症，例如银屑病、湿疹、皮炎(例如，湿疹性皮炎、局部和脂溢性皮炎、过敏性或刺激性接触性皮炎、裂纹样湿疹、光过敏性皮炎、光毒性皮炎、植物日光性皮炎、放射性皮炎和淤滞性皮炎)和痤疮。
>[0005]在一个方面，本文提供了一种组合物，例如药物组合物，其包含Anaerostipes 的细菌菌株。在一些实施方案中，该细菌菌株包含与SEQ ID NO:1的多核苷酸序列具有至少约97％序列同一性的16s rRNA基因序列。在一个具体实施方案中，该 Anaerostipes细菌菌株是物种Anaerostipes rhamnosivorans的菌株。在一些实施方案中，所述组合物还包含赋形剂、稀释剂和/或载体(vehicle)。在一些实施方式中，所述组合物中的细菌菌株是冻干的、升华干燥的或喷雾干燥的。
[0006]在一些实施方案中，所述组合物能够增加人细胞例如巨噬细胞(例如THP
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1 巨噬细胞)、单核细胞、外周血单核细胞(PBMC)或单核细胞衍生的树突细胞中至少一种抗炎基因产物(例如IL
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10和/或CCL
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18)的产生。例如，在一些实施方案中，当人细胞与所述组合物接触时，所述组合物增加人细胞(例如巨噬细胞(例如THP
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1巨噬细胞)、单核细胞、外周血单核细胞(PBMC)或单核细胞衍生的树突细胞)中至少一种抗炎基因产物(例如IL
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10和/或CCL
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18)的产生。在一些实施方案中，所述组合物能够减少或防止破坏或能够增加用TNF
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α处理的人细胞(例如上皮细胞)单层(例如HT29MTX
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E12细胞单层)的屏障完整性。例如，在一些实施方案中，当人细胞单层与所述组合物接触时，所述组合物减少或防止破坏或增加用TNF
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α
处理的人细胞(例如上皮细胞)单层(例如HT29MTX
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E12细胞单层)的屏障完整性。
[0007]在一些实施方案中，所述组合物包含Anaerostipes的细菌菌株，所述细菌菌株包含与SEQ ID NO:1的多核苷酸序列具有至少约98％序列同一性的16s rRNA基因序列。在一些实施方案中，所述Anaerostipes细菌菌株包含与SEQ ID NO:1的多核苷酸序列具有至少约98.5％、至少约99％或至少约99.5％序列同一性的16s rRNA基因序列。在一些实施方案中，所述Anaerostipes细菌菌株包含SEQ ID NO:1的16s rRNA基因序列。在一些实施方案中，所述Anaerostipes细菌菌株与以保藏号DSM 33275保藏的菌株Anaerostipes sp.P127
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B2a共有至少70％的DNA
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DNA杂交。在一些实施方案中，所述Anaerostipes细菌菌株包含与SEQ ID NO:2至SEQ ID NO:52中的任一个具有至少约70％同一性的核苷酸序列。在一些实施方案中，所述Anaerostipes细菌菌株包含与以保藏号DSM 33275保藏的菌株Anaerostipes sp.P127
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B2a的基因组具有至少 95％平均核苷酸同一性(ANI)的基因组。在一些实施方案中，所述Anaerostipes细菌菌株包含与以保藏号DSM 33275保藏的菌株Anaerostipes sp.P127
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B2a的基因组具有至少96.5％平均核苷酸同一性(ANI)和至少60％比对分数(AF)的基因组。在一些实施方案中，所述Anaerostipes细菌菌株是以保藏号DSM 33275保藏的Anaerostipessp.P127
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B2a。
[0008]在一些实施方案中，所述组合物的Anaerostipes细菌菌株是有活力的。在一些实施方案中，所述细菌菌株能够至少部分地定植于人类受试者的肠道。
[0009]在一些实施方案中，所述组合物适合于口服递送至受试者。在一些实施方案中，将所述组合物配制成肠溶制剂。在一些实施方案中，所述肠溶制剂被配制为胶囊、片剂、囊片、丸剂、含片、锭剂、粉末或颗粒。在一些实施方案中，将所述组合物配制成栓剂、混悬剂、乳剂或凝胶。在一些实施方式中，所述组合物包含至少1x10
3 CFU的细菌菌株。
[0010]在一些实施方案中，所述组合物包含治疗有效量的细菌菌株，所述治疗有效量的细菌菌株在给予有需要的受试者时足以预防或治疗病症。在一些实施方案中，所述病症选自炎性病症、胃肠道病症、炎性肠病、癌症、非酒精性脂肪肝病(NAFLD)、非酒精性脂肪性肝炎(NASH)、代谢综合征、胰岛素缺乏、胰岛素抵抗相关病症、胰岛素敏感性、葡萄糖耐受不良、前驱糖尿病、糖尿病、高体重指数(BMI)、过度肥胖、肥胖、超重、心血管疾病、动脉粥样硬化、高脂血症、高血糖症、脂质代谢异常和高血压。在一些实施方案中，所述胃肠道病症选自溃疡性结肠炎、克罗恩病(Crohn
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s disease) 和肠易激综合征。在一些实施方案中，所述炎性病症是炎性皮肤病症，例如选自由以下组成的组中的炎性皮肤病症：银屑病、湿疹、皮炎(例如，湿疹性皮炎、局部和脂溢性皮炎、过敏性或刺激性接触性皮炎、裂纹样湿疹、光过敏性皮炎、光毒性皮炎、植物日光性皮炎、放射性皮炎和淤滞性皮炎)和痤疮。
[0011]在一些实施方案中，所述组合物包含选自由填充剂、粘合剂、崩解剂及其任意组合组成的组的赋形剂。在一些实施方案中，赋形剂选自由纤维素、聚乙烯吡咯烷酮、二氧化硅、硬脂富马酸或其药学上可接受的盐及其任意组合组成的组本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种组合物，包含：Anaerostipes的细菌菌株，其包含与SEQ ID NO:1的多核苷酸序列具有至少约98％序列同一性的16s rRNA基因序列；和赋形剂、稀释剂和/或载体，其中，所述细菌菌株是冻干的、升华干燥的或喷雾干燥的。2.根据权利要求1所述的组合物，其中，所述细菌菌株能够在体外增加人巨噬细胞、单核细胞、外周血单核细胞或单核细胞衍生的树突细胞的IL
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10产生。3.根据权利要求1或2所述的组合物，其中，所述细菌菌株包含与SEQ ID NO:1的多核苷酸序列具有至少约98.5％、至少约99％或至少约99.5％序列同一性的16s rRNA基因序列。4.根据权利要求1至3中任一项所述的组合物，其中，所述细菌菌株包含SEQ ID NO:1的16s rRNA基因序列。5.根据权利要求1至4中任一项所述的组合物，其中，所述细菌菌株与以保藏号DSM 33275保藏的菌株Anaerostipes sp.P127
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B2a共有至少70％的DNA
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DNA杂交。6.根据权利要求1至5中任一项所述的组合物，其中，所述细菌菌株包含与SEQ ID NO:2至SEQ ID NO:52中的任一个具有至少约70％同一性的核苷酸序列。7.根据权利要求1至6中任一项所述的组合物，其中，所述细菌菌株包含与以保藏号DSM 33275保藏的菌株Anaerostipes sp.P127
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B2a的基因组具有至少95％平均核苷酸同一性(ANI)的基因组。8.根据权利要求1至7中任一项所述的组合物，其中，所述细菌菌株包含与以保藏号DSM 33275保藏的菌株Anaerostipes sp.P127
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B2a的基因组具有至少96.5％平均核苷酸同一性(ANI)和至少60％比对分数(AF)的基因组。9.根据权利要求1至8中任一项所述的组合物，其中，所述细菌菌株是以保藏号DSM 33275保藏的Anaerostipes sp.P127
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B2a。10.根据权利要求1至9中任一项所述的组合物，其中，所述组合物被配制作为肠溶制剂。11.根据权利要求10所述的组合物，其中，所述肠溶制剂被配制成胶囊、片剂、囊片、丸剂、含片、锭剂、粉末或颗粒。12.根据权利要求1至11中任一项所述的组合物，其中，所述组合物被配制成栓剂、混悬剂、乳剂或凝胶。13.根据权利要求1至12中任一项所述的组合物，其中，所述组合物包含至少1x10
3 CFU的所述细菌菌株。14.根据权利要求1至13中任一项所述的组合物，其中，所述组合物包含治疗有效量的所述细菌菌株，所述治疗有效量的所述细菌菌株在施用于有需要的受试者时足以预防或治疗病症。15.根据权利要求14所述的组合物，其中，所述病症选自由以下组成的组：炎性病症、胃肠道病症、炎性肠病、非酒精性脂肪肝病(NAFLD)、非酒精性脂肪性肝炎(NASH)、代谢综合征、胰岛素缺乏、胰岛素抵抗相关病症、胰岛素敏感性、葡萄糖耐受不良、前驱糖尿病、糖尿病、高体重指数(BMI)、过度肥胖、肥胖、超重、心血管疾病、动脉粥样硬化、高脂血症、高血糖症、脂质代谢异常和高血压。
16.根据权利要求15所述的组合物，其中，所述胃肠道病症...

【专利技术属性】
技术研发人员：杰森，
申请(专利权)人：未知君有限责任公司，
类型：发明
国别省市：