用于测定生物样品的装置制造方法及图纸

本文公开了在蛋白质和NP官能化水平上鉴定与蛋白冠形成相关的物理化学性质的方法，以及包含被配置用于低丰度蛋白质收集和深度蛋白质组学分析的颗粒组合的组合物。本文进一步公开了一种用于测定生物样品的装置。公开了一种用于测定生物样品的装置。公开了一种用于测定生物样品的装置。

【技术实现步骤摘要】
用于测定生物样品的装置
[0001]交叉引用
[0002]本申请要求2021年2月26日提交的美国临时申请第63/154,660 号和2022年2月4日提交的美国临时申请第63/306,951号的权益，其各自的全部内容通过引用并入本文。


[0003]本申请涉及低丰度生物分子的分析技术，特别是一种用于测定生物样品的装置。

技术介绍

[0004]低丰度生物分子的分析是蛋白质组学的重大挑战。虽然最近的一些进展改善了从样品中捕捉单个生物分子，但诊断方法通常需要检测大量生物分子才能准确鉴定生物状态、组学和有机体。因此，需要用于从样品中富集大部分低丰度生物分子的组合物和方法。

技术实现思路

[0005]在一些方面，本公开描述了一种用于测定生物样品的装置，包括：(a)一个或多个传输单元；(b)样品储存单元，其被配置为接收和保留生物样品，其中样品储存单元可操作地联接到一个或多个传输单元；(c)其中容纳颗粒的分区，其中分区可操作地联接到一个或多个传输单元；(d)多个柱，包括捕获柱、耗尽柱和分析柱，其中多个柱彼此流体连通并可操作地联接到一个或多个传输单元；和 (e)控制单元，包括一个或多个处理器，其中控制单元与一个或多个传输单元电通信。
[0006]在一些实施方案中，一个或多个传输单元被配置为将生物样品从样品储存单元传输到耗尽柱以产生耗尽样品。
[0007]在一些实施方案中，一个或多个传输单元被配置为将耗尽样品传输到分区，以将来自生物样品的多个生物分子吸附到颗粒上。
[0008]在一些实施方案中，一个或多个传输单元被配置为将多个生物分子传输到捕获柱以产生纯化样品。
[0009]在一些实施方案中，一个或多个传输单元被配置为将纯化样品传输到分析柱以产生分离样品。
[0010]在一些实施方案中，一个或多个传输单元被配置为将分离样品传输到质谱仪，以便对多个生物分子进行质谱分析以产生多个信号。
[0011]在一些实施方案中，该装置还包括多个试剂储存单元，该多个试剂储存单元包括其中容纳水性溶剂的第一试剂储存单元和其中容纳洗脱溶剂的第二试剂储存单元，其中一个或多个传输单元可操作地联接到多个试剂储存单元。
[0012]在一些实施方案中，一个或多个传输单元包括移液管。
[0013]在一些实施方案中，一个或多个传输单元包括流体连接。
[0014]在一些实施方案中，样品储存单元被配置为接收和保留多个生物样品。
[0015]在一些实施方案中，装置还包括样品制备单元，该样品制备单元包括HPLC柱、过滤
器和离心机中的至少一个，其中一个或多个传输单元可操作地联接到样品制备单元。
[0016]在一些实施方案中，装置还包括其中容纳第二颗粒的第二分区。
[0017]在一些实施方案中，颗粒为顺磁性颗粒。
[0018]在一些实施方案中，分区在其中容纳至少两种不同的颗粒类型。
[0019]在一些实施方案中，一个或多个传输单元被配置为从样品储存单元传输生物样品，以将多个生物分子从生物样品吸附到颗粒上。
[0020]在一些实施方案中，一个或多个传输单元被配置为将多个生物分子传输到捕获柱以产生纯化样品。
[0021]在一些实施方案中，一个或多个传输单元被配置为将纯化样品传输到耗尽柱以产生耗尽样品。
[0022]在一些实施方案中，一个或多个传输单元被配置为将耗尽样品传输到分析柱以产生分离样品。
[0023]在一些实施方案中，一个或多个传输单元被配置为将分离样品传输到质谱仪，以便对多个生物分子进行质谱分析以产生多个信号。
[0024]在一些实施方案中，分析柱包括设置在其中的多个微柱。
[0025]本公开的各个方面提供了用于确定颗粒特性并进一步用于鉴定颗粒特性的组合的方法，该方法使得能够对生物样品进行深度组学分析。本公开还提供了容纳颗粒的组合物，该颗粒具有针对从生物样品中限定地捕捉蛋白质而优化(例如，针对蛋白质子集、蛋白质分类或跨多个分类广泛捕捉蛋白质而定制)的物理化学性质组合。
[0026]通过下面的详细描述，本公开的其他方面和优点对于本领域技术人员将变得显而易见，其中仅示出和描述本公开的说明性实施方案。将会认识到，本公开能够具有其他和不同的实施方案，并且其若干细节能够在各种明显的方面进行修改，所有这些都不脱离本公开。因此，附图和描述本质上应被认为是说明性的，而不是限制性的。
[0027]援引并入
[0028]本说明书中提到的所有出版物、专利和专利申请都以相同的程度通过引用并入本文，就如同每个单独的出版物、专利或专利申请被明确地并单独地指出通过引用的方式并入一样。在通过援引并入的出版物和专利或专利申请与说明书中包含的公开内容相抵触的程度上，本说明书旨在取代和/或优先于任何此类相抵触的材料。
附图说明
[0029]本公开的新颖特征在所附权利要求书中特别地阐述。通过参考以下详细描述和附图，将获得对本公开的特征和优点的更好理解，所述详细描述阐述了其中利用本公开的原理的说明性实施方案，并且在附图(在本文也称为“图”)中：
[0030]专利或申请文件包含至少一幅彩色附图。在请求并且支付必要的费用后，具有一个或多个彩色附图的本专利或专利申请公开的副本将由专利局提供。
[0031]图1示出了从生物样品中进行基于颗粒的蛋白质收集以用于质谱分析的工作流程示意图。
[0032]图2描绘了根据一些实施方案的颗粒的表面官能化的示例类型。
[0033]图3A示出了根据一些实施方案的在37种不同颗粒上的从血浆收集的不同蛋白质
的质谱强度图。
[0034]图3B示出了根据一些实施方案，基于与每个颗粒形成的功能上和 /或结构上相关的蛋白质的蛋白冠组合物对37种颗粒执行的分级聚类。
[0035]图4A示出了根据一些实施方案，对图3A
‑
图3B中所示的蛋白冠数据执行的方差分解的图，说明了不同因素对观察到的蛋白质强度的贡献程度。
[0036]图4B示出了根据一些实施方案，蛋白质强度与图3A
‑
图B和图 4A中所示的37种颗粒的不同颗粒特性的关系的方差程度图。
[0037]图5A示出了根据一些实施方案，血浆蛋白质纯化和分析的四种不同工作流程的示意图。一些工作流程可利用颗粒、血浆耗尽方法、纯血浆、变性、还原/烷基化、蛋白质消化、磁分离、肽分级分离、高pH 值分级分离或其任何组合。
[0038]图5B示出了根据一些实施方案，通过图5A所示的工作流程鉴定的蛋白质分组(protein group)的数量。
[0039]图5C示出了根据一些实施方案，肽强度在多个LC
‑
MS/MS参数 (包括LC梯度长度和MS仪器)上的变化。
[0040]图5D示出了根据一些实施方案，通过图5A所示的每个工作流程鉴定的人血浆蛋白质丰度。
[0041]图5E示出了根据一些实施方案，来自图5A本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种用于测定生物样品的装置，包括：(a)一个或多个传输单元；(b)样品储存单元，其被配置为接收和保留所述生物样品，其中所述样品储存单元可操作地联接到所述一个或多个传输单元；(c)分区，所述分区在其中容纳颗粒，其中所述分区可操作地联接到所述一个或多个传输单元；(d)多个柱，包括捕获柱、耗尽柱和分析柱，其中所述多个柱彼此流体连通并可操作地联接到所述一个或多个传输单元；和(e)控制单元，包括一个或多个处理器，其中所述控制单元与所述一个或多个传输单元电通信。2.根据权利要求1所述的装置，其中所述一个或多个传输单元被配置为将所述生物样品从所述样品储存单元传输到所述耗尽柱以产生耗尽样品。3.根据权利要求2所述的装置，其中所述一个或多个传输单元被配置为将所述耗尽样品传输到所述分区，以将多个生物分子从所述生物样品吸附到所述颗粒上。4.根据权利要求3所述的装置，其中所述一个或多个传输单元被配置为将所述多个生物分子传输到所述捕获柱以产生纯化样品。5.根据权利要求4所述的装置，其中所述一个或多个传输单元被配置为将所述纯化样品传输到所述分析柱以产生分离样品。6.根据权利要求5所述的装置，其中所述一个或多个传输单元被配置为将所述分离样品传输到质谱仪，以便对所述多个生物分子进行质谱分析以产生多个信号。7.根据权利要求1所述的装置，还包括多个试剂储存单元，所述多个试剂储存单元包括其中容纳水性溶剂的第一试剂储存单元和其中容纳洗脱溶剂的第二试剂储存单元，其中所述一个或多个传输单元可操作地联接到所述多个试剂储存单元。8.根据权利要...

【专利技术属性】
技术研发人员：丹尼尔，
申请(专利权)人：禧尔公司，
类型：新型
国别省市：