一种中华鳖遗传性别相关的SNPs标记及其引物和应用制造技术

本发明专利技术公开了一种中华鳖遗传性别相关的SNPs标记及其引物和应用，中华鳖遗传性别相关的SNPs标记为SEQ ID NO:1所示序列自5

【技术实现步骤摘要】
一种中华鳖遗传性别相关的SNPs标记及其引物和应用


[0001]本专利技术涉及SNP
，尤其涉及一种中华鳖遗传性别相关的SNPs 标记及其引物和应用。

技术介绍

[0002]中华鳖(Pelodiscus sinensis)俗称甲鱼、团鱼、脚鱼等，隶属脊椎动物门(Vertebrata)，爬行纲(Reptilia)，龟鳖目(Testudines)，鳖科 (Trionychidae)，鳖属(Pelodiscus)，是水陆两栖、用肺呼吸的爬行动物，主要分布于中国、日本、朝鲜、俄罗斯和越南等地。中华鳖蛋白质含量高，能够提供人体所需多种氨基酸，具有极高的营养价值，因此广受消费者的喜爱。
[0003]中华鳖雌雄存在明显的生长差异，中华鳖的性别决定机制尚未阐明，进行性别控制技术探讨，实现雄性单性化生产，是中华鳖育种的重要发展方向。在中华鳖的养殖过程中，中华鳖雄性普遍快于雌性，在成熟期表现差异尤为明显，雄鳖比雌鳖生长快25
‑
30％，且雄鳖裙边宽厚、脂肪少，具有更高的营养价值，市场价值高于雌性，实行中华鳖单性苗种培育对中华鳖产业发展有重要的经济意义。但在性腺发育成熟之前，其性别通过肉眼更难判别，胚胎和幼体阶段雌雄鱼形态上几乎没有区别。这给其单性育种技术的开发带来了很大困难，也阻碍了需要在性腺发育分化之前进行遗传性别识别的性别决定分子机制研究的开展。
[0004]因此，开发一种可以准确鉴别其遗传性别的分子标记用于中华鳖性别控制育种具有极大的生产应用价值，对于中华鳖基因组选择育种和性别决定分子机制的研究也将起到促进作用。

技术实现思路

[0005]1.要解决的技术问题
[0006]本专利技术的目的是为了解决现有技术中在性腺发育成熟之前，其性别通过肉眼更难判别，胚胎和幼体阶段雌雄鱼形态上几乎没有区别的问题，而提出的一种中华鳖遗传性别相关的SNPs标记及其引物和应用。
[0007]2.技术方案
[0008]为了实现上述目的，本专利技术采用了如下技术方案：
[0009]一种中华鳖遗传性别相关的SNPs标记，所述SNPs标记为SEQ ID NO:1 所示序列自5
’
端起第164、167、172、173、174、177位碱基为A/G、C/T、 T/C、T/C、G/A、C/T。
[0010]优选地，所述SNPs标记为AG、CT、TC、TC、GA、CT基因型的个体为雌性中华鳖，SNPs标记为AA、CC、TT、TT、GG、CC基因型的个体为雄性中华鳖。
[0011]优选地，所述引物组的核苷酸序列如SEQ ID NO:2
‑
4所示。
[0012]本专利技术还提出了一种中华鳖遗传性别相关的SNPs标记的引物组，包含核苷酸序列如SEQ ID NO:2
‑
4所示的引物组。
[0013]本专利技术还提出了一种中华鳖遗传性别相关的SNPs标记的试剂盒，包含核苷酸序列如SEQ ID NO:2
‑
4所示的引物组。
[0014]优选地，在鉴别中华鳖遗传性别中的用途。
[0015]本专利技术还提出了一种鉴别中华鳖遗传性别的方法，通过对待测中华鳖进行SNPs标记的检测，确定所述待测中华鳖的遗传性别，其中SNPs标记为 AG、CT、TC、TC、GA、CT基因型的个体为雌性中华鳖，SNPs标记为 AA、CC、TT、TT、GG、CC基因型的个体为雄性中华鳖。
[0016]优选地，一种鉴别中华鳖遗传性别的方法，包括以下步骤：
[0017]步骤1：提取待测中华鳖的基因组DNA；
[0018]步骤2：利用引物组，将所述待测中华鳖的基因组DNA进行PCR扩增，获得PCR扩增产物；
[0019]步骤3：对所述PCR扩增产物进行电泳检测，根据PCR扩增条带的数目及大小来确定中华鳖的遗传性别。
[0020]优选地，其中所述PCR扩增条带为大小分别为265bp和401bp的两条条带，则所述SNPs标记为AG、CT、TC、TC、GA、CT基因型，该个体为遗传雌性中华鳖；所述PCR扩增条带为大小401bp的一条条带时，SNPs标记为AA、CC、TT、TT、GG、CC基因型，该个体为遗传雄性中华鳖。
[0021]3.有益效果
[0022]相比于现有技术，本专利技术的优点在于：
[0023](1)本专利技术中，设计了3条特异性标记引物，经不同群体验证后，发现该特异性标记引物组可快速、简便、准确鉴别不同品系中华鳖遗传性别，为顺利开展中华鳖的性别控制育种工作、发展单性养殖，以及开展中华鳖基因组选择育种和性别决定机制研究建立基础。
[0024](2)本专利技术中，所涉及的6个SNPs位点，在雌性个体中均为杂合型，在雄性个体中均为纯合型，能够保证引物的特异性结合，确保分型的准确性。
附图说明
[0025]图1为本专利技术提出的一处中华鳖雌雄个体基因组SNPs差异的序列比较与引物设计图；
[0026]图2a为实施例2所示10尾雌性中华鳖所示SNPs位点的测序峰图(图中箭头处为SNPs位点)；
[0027]图2b为实施例2所示10尾雄性中华鳖所示SNPs位点的测序峰图(图中箭头处为SNPs位点)；
[0028]图3为实施例3的中华鳖洞庭品系遗传性别鉴定电泳结果图；
[0029]图4为实施例3的中华鳖中国台湾品系、黄沙品系、日本品系的遗传性别鉴别图。
具体实施方式
[0030]下面将结合本专利技术实施例中的附图，对本专利技术实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述，显然，所描述的实施例仅仅是本专利技术一部分实施例，而不是全部的实施例。
[0031]实施例1：
[0032]一种中华鳖遗传性别相关的SNPs标记，SNPs标记为SEQ ID NO:1所示序列自5
’
端起第164、167、172、173、174、177位碱基为A/G、C/T、T/C、 T/C、G/A、C/T。
[0033]本实施例中，SNPs标记为AG、CT、TC、TC、GA、CT基因型的个体为雌性中华鳖，SNPs标记为AA、CC、TT、TT、GG、CC基因型的个体为雄性中华鳖。
[0034]本实施例中，引物组的核苷酸序列如SEQ ID NO:2
‑
4所示。
[0035]本实施例中，一种中华鳖遗传性别相关的SNPs标记的引物组，包含核苷酸序列如SEQ ID NO:2
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4所示的引物组。
[0036]本实施例中，还提出了一种中华鳖遗传性别相关的SNPs标记的试剂盒，包含核苷酸序列如SEQ ID NO:2
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4所示的引物组。
[0037]本实施例中，一种鉴别中华鳖遗传性别的方法，通过对待测中华鳖进行 SNPs标记的检测，确定待测中华鳖的遗传性别，其中SNPs标记为AG、 CT、TC、TC、GA、CT基因型的个体为雌性中华鳖，SNPs标记为AA、 CC、TT、TT、GG、CC基因型的个体本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种中华鳖遗传性别相关的SNPs标记，其特征在于，所述SNPs标记为SEQ ID NO:1所示序列自5
’
端起第164、167、172、173、174、177位碱基为A/G、C/T、T/C、T/C、G/A、C/T。2.根据权利要求1所述的一种中华鳖遗传性别相关的SNPs标记，其特征在于，所述SNPs标记为AG、CT、TC、TC、GA、CT基因型的个体为雌性中华鳖，SNPs标记为AA、CC、TT、TT、GG、CC基因型的个体为雄性中华鳖。3.一种用于检测权利要求1
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2任一所述的一种中华鳖遗传性别相关的SNPs标记的引物组，其特征在于，所述引物组的核苷酸序列如SEQ ID NO:2
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4所示。4.一种用于中华鳖遗传性别鉴定的试剂盒，其特征在于，所述的试剂盒中包括用于鉴定权利要求1
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2任一项所述的SNPs标记的试剂。5.根据权利要求4所述的试剂盒，其特征在于，所述的试剂盒中包括权利要求3所述的引物。6.一种鉴别中华鳖遗传性别的方法，其特征在于，通过检测权利要求1
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【专利技术属性】
技术研发人员：曾丹，王晓清，曾嘉伟，胡亚洲，秦溱，王佩，梁艺馨，
申请(专利权)人：湖南农业大学，
类型：发明
国别省市：