引起番茄抗坏血酸合成差异的SNP位点、筛选方法及鉴别方法技术

本发明专利技术涉及4个引起番茄抗坏血酸合成差异的SNP位点、筛选方法及鉴定方法。4个SNP位点分别位于异柠檬酸裂解酶编码基因的起始密码子上游286bp、847bp、1193bp和1981bp处，所述基因位于番茄7号染色体SL2.50ch07:60973492.60970926，该基因序列NCBI序列号为NM_001246949.2，SGN基因索列号为Solyc07g052480.2。该SNP位点能够为鉴定或辅助鉴定高含量抗坏血酸番茄种植资源提供了技术支持。术支持。术支持。

【技术实现步骤摘要】
引起番茄抗坏血酸合成差异的SNP位点、筛选方法及鉴别方法
[0001]本申请为申请日为2021年07月15日的中国专利技术专利申请：ICL 基因在调控番茄抗坏血酸积累中的应用(申请号CN202110802319.6) 的分案申请。


[0002]本专利技术涉及番茄抗坏血酸合成SNP检测
，尤其涉及引起番茄抗坏血酸合成差异的SNP位点、筛选方法及鉴别方法。

技术介绍

[0003]在植物体内，抗坏血酸可以作为一些酶的辅酶，调控植物体内的酶促反应，提高细胞应对逆境抗性；保护植物光合作用；延缓衰老；抗坏血酸还可以作为植物生长调节因子。抗坏血酸通过调控氧化还原水平协调茉莉酸和乙烯途径诱导系统抗病性；抗坏血酸通过调节氧化 /抗氧化平衡影响番茄果实的成熟。目前，已报道的抗坏血酸生物合成途径主要有甘露糖/半乳糖合成途径，AsA合成途径、AsA合成的半乳糖醛酸途径，AsA生物合成的古洛糖途径、AsA生物合成的肌醇途径。抗坏血酸合成后由APX和AO催化酶等氧化降解，通过 DHAR还原再生系统再生。
[0004]异柠檬酸裂解酶又称异柠檬酸裂合酶(本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.4个引起番茄抗坏血酸合成差异的SNP位点，分别位于异柠檬酸裂解酶编码基因的起始密码子上游286bp、847bp、1193bp和1981bp处，所述基因位于番茄7号染色体SL2.50ch07:60973492..60970926，该基因序列NCBI序列号为NM_001246949.2，SGN基因索列号为Solyc07g052480.2。2.如权利要求2所述的SNP位点，其特征在于，根据所述的4个SNP位点，可将番茄分为四种单倍基因型，分别为HapⅠ、HapⅡ、HapⅢ和HapⅣ；其中HapⅠ单倍型抗坏血酸含量高于其他基因型；HapⅠ单倍型的对应的基因型在286bp、847bp、1193bp和1981bp处的4个SNP位点核苷酸碱基依次为A、T、G、C；HapⅡ单倍型的对应的基因型在286bp、847bp、1193bp和1981bp处的4个SNP位点核苷酸碱基依次为A、C、G、C；HapⅢ单倍型的对应的基因型在286bp、847bp、1193bp和1981bp处的4个SNP位点核苷酸碱基依次为G、C、A、T；HapⅣ单倍型的对应的基因型在286bp、847bp、1193bp和1981bp处的4个SNP位点核苷酸碱基依次为G、C、A、T。3.引起番茄抗坏血酸合成差异的SNP位点的筛选方法，包括以下步骤：选取MAF>0.05及最小等位基因品种≧6的5.5M高质量的SNP进行全基因组关联分析；通过TASSEL 4.0中压缩混合线性模型对抗...

【专利技术属性】
技术研发人员：张余洋，陈卫芳，叶志彪，
申请(专利权)人：华中农业大学，
类型：发明
国别省市：