电泳分析数据处理装置以及记录介质制造方法及图纸

本发明专利技术提供一种电泳分析数据处理装置以及记录介质，以实现改善进行拖尾解析时的操作性和减少作业错误。本发明专利技术所涉及的电泳分析数据处理装置的一个方式是对利用电泳分析获取到的数据进行处理的数据处理装置，具备：显示处理部(31、33)，其基于获取到的数据创建电泳图，并将该电泳图显示在显示部(5)的画面上；解析范围指定部(4、34)，其受理用户在显示于所述显示部的电泳图上对提取为解析对象的拖尾范围的指定，并且将所述电泳图上的与所指定的拖尾范围对应的背景区域以能够与其它背景区域区别的方式进行显示；以及解析处理部(35)，其使用所述指定的拖尾范围中包括的数据来实施规定的拖尾解析。规定的拖尾解析。规定的拖尾解析。

【技术实现步骤摘要】
电泳分析数据处理装置以及记录介质


[0001]本专利技术涉及一种对利用电泳装置获取到的数据进行处理的数据处理装置、以及记录有用于该数据处理的计算机程序的非暂时性记录介质。

技术介绍

[0002]近年来，在药物研发领域、医疗领域、农业/畜牧业领域、生物化学领域等各种领域中，能够高速地解析DNA片段的全基因信息的下一代测序仪(Next Generation Sequencer)发挥着威力。在一般的使用了下一代测序仪的解析中，从生物体组织提取DNA，将该DNA片段化为具有适当的窄尺寸分布的片段来制备文库(以下称为“NGS文库”)。然后，通过将该NGS文库提供给下一代测序仪，来执行对原始的DNA的碱基序列的测序。
[0003]在该解析中，如果NGS文库的尺寸分布不适当，则无法得到良好的测序结果，从而解析作业本身就变为了徒劳。为了避免这种情况，以往在测序之前实施用于确认所制备的NGS文库的尺寸分布和浓度的作业，即称为QC(Quality Control：质量控制)的作业。
[0004]在非专利文献1中公开有：为了确认NGS文库的尺寸分布和浓度而使用非专利文献2、3中记载的微芯片电泳装置。在该微芯片电泳装置中，如非专利文献2、3等所公开的那样，能够针对预先准备的多个样品自动地实施微芯片电泳分析。另外，还能够利用系统中包含的数据处理软件对通过电泳分析获取到的数据进行解析。
[0005]在对NGS文库进行电泳分析的情况下，在泳动波形中观测到反映有DNA片段的尺寸分布的宽形状的峰(例如参照非专利文献1的图3)。泳动波形上的该宽形状的峰通常被称为拖尾(smear)或拖尾峰。上述数据处理软件包括用于解析拖尾的软件，该软件计算所指定的范围的拖尾的平均尺寸和浓度等。
[0006]现有技术文献
[0007]非专利文献
[0008]非专利文献1：“次世代
シーケンサー
(NGS)
ライブラリー
Quality Control(QC)
への
応用”，Application News No.B52，株式会社岛津制作所，[online]，[2020年8月18日检索]，因特网<URL:https://solutions.shimadzu.co.jp/cgi/ac？cmd＝1&url＝/solnavi/s/apl/a
‑
news/1/b/pdf/b052.pdf>
[0009]非专利文献2：“MultiNA(
マルチナ
)DNA/RNA分析用
マイクロチップ
電気泳動装置”，株式会社岛津制作所，[online]，[2020年8月18日检索]，因特网<URL:https://www.an.shimadzu.co.jp/bio/mce/multina/spec.htm>
[0010]非专利文献3：铃木功一等12名，“DNA/RNA分析用
マイクロチップ
電気泳動装置MCE
‑
202"MultiNA"－開発
と
応用－”，岛津评论编辑部发行，2008年4月24日，岛津评论，第64卷，第3
·
4号，p.117
‑
122

技术实现思路

[0011]专利技术要解决的问题
[0012]在使用如上所述的软件来对利用电泳分析获取到的数据执行拖尾解析中，首先，为了指定作为解析对象的拖尾的范围，而需要操作员指定峰开始尺寸、峰结束尺寸等参数。在现有的拖尾解析用软件中，利用数据网格和文本框等能够受理数值输入的用户接口(UI)控制，以由操作员指定这样的参数。
[0013]因此，操作员需要一边通过电泳图确认泳动波形的形状，一边确定想要设为解析对象的拖尾的开始位置和结束位置，并在电泳图上读取各个位置的尺寸来向数据网格等进行数值输入。然而，这样的作业繁杂且效率差，特别是在想要修正已输入的数值的情况下很麻烦。另外，容易产生因数值的读取错误、输入错误等作业错误引起的解析结果的错误。并且，还有时需要根据峰的形状来指定互不相同的多个拖尾范围，并针对每个该拖尾范围计算平均尺寸等，但在指定多个拖尾范围时，还存在难以判断所指定的多个拖尾范围是否重叠、在重叠的情况下重叠到了什么程度等的问题。
[0014]本专利技术是为了解决上述问题而完成的，其主要目的在于，提供一种能够改善进行拖尾解析时的操作性、提高解析的作业效率并减少作业错误的电泳分析数据处理装置以及记录有电泳分析数据处理程序的记录介质。
[0015]用于解决问题的方案
[0016]为了解决上述问题而完成的本专利技术所涉及的电泳分析数据处理装置的一个方式是对利用电泳分析获取到的数据进行处理的数据处理装置，所述数据处理装置具备：
[0017]显示处理部，其基于获取到的数据创建电泳图，并将该电泳图显示在显示部的画面上；
[0018]解析范围指定部，其受理用户在显示于所述显示部的电泳图上对提取为解析对象的拖尾范围的指定，并且将所述电泳图上的与所指定的拖尾范围对应的背景区域以能够与其它背景区域区别的方式进行显示；以及
[0019]解析处理部，其使用所述指定的拖尾范围中包括的数据来实施规定的拖尾解析。
[0020]另外，为了解决上述问题而完成的本专利技术所涉及的记录有电泳分析数据处理程序的记录介质的一个方式是记录有用于对利用电泳分析获取到的数据进行处理的数据处理程序的非暂时性记录介质，该程序使计算机执行以下步骤：
[0021]显示处理步骤，基于获取到的数据创建电泳图，并将该电泳图显示在显示部的画面上；
[0022]解析范围指定步骤，受理用户在显示于所述显示部的电泳图上对提取为解析对象的拖尾范围的指定，并且将所述电泳图上的与所指定的拖尾范围对应的背景区域以能够与其它背景区域区别的方式进行显示；以及
[0023]解析处理步骤，使用所述指定的拖尾范围中包括的数据来实施规定的拖尾解析。
[0024]专利技术的效果
[0025]本专利技术所涉及的电泳分析数据处理装置以及记录有数据处理程序的记录介质特别是在对为了DNA或RNA的序列解析而准备的文库进行分析时是有用的。在该情况下，规定的拖尾解析例如是指能够计算文库中的平均尺寸、尺寸分布、整体比、浓度、摩尔浓度、面积等中的至少一方的解析。
[0026]根据本专利技术所涉及的电泳分析数据处理装置以及记录有电泳分析数据处理程序的记录介质的上述方式，用户能够一边通过显示的电泳图来确认峰波形的形状等，一边在
该曲线图上直观地对设为解析对象的拖尾范围进行指定。例如能够通过对表示该范围的开始位置的线和表示结束位置的线各自的移动操作、以及对范围整体的移动操作等图形形式的操作来进行对该拖尾范围的指定。由此，能够简便且准确地进行对设为解析对象的拖尾范围的指定。另外，用户能够在电泳图上直观地确认指定的拖尾范围，能够容易地掌握拖尾范围中包括的泳动波形的样子本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种电泳分析数据处理装置，对利用电泳分析获取到的数据进行处理，所述电泳分析数据处理装置具备：显示处理部，其基于获取到的数据创建电泳图，并将该电泳图显示在显示部的画面上；解析范围指定部，其受理用户在显示于所述显示部的电泳图上对提取为解析对象的拖尾范围的指定，并且将所述电泳图上的与所指定的拖尾范围对应的背景区域以能够与其它背景区域区别的方式进行显示；以及解析处理部，其使用所述指定的拖尾范围中包括的数据来实施规定的拖尾解析。2.根据权利要求1所述的电泳分析数据处理装置，其特征在于，所述显示处理部创建将一个以上的泳动波形以至少使横轴一致的方式配置而得到的电泳图，并且将该电泳图进行显示，所述解析范围指定部在显示有所述一个以上的泳动波形的电泳图上受理拖尾范围的指定。3.根据权利要求1所述的电泳分析数据处理装置，其特征在于，所述解析范围指定部根据使显示在电泳图上的拖尾范围的两端部分别移动的拖动操作，来变更该拖尾范围的位置和宽度。4.根据权利要求1所述的电泳分析数据处理装置，其特征在于，所述解析范围指定部根据使显示在电泳图上的分别被分配给拖尾范围的标签移动的拖动操作，来在保持着该拖尾范围的宽度不变的状态下变更位置。5.根据权利要求1所述的电泳分析数据处理装置，其特征在于，所述解析范围指定部将用于以数值的方式来分别输入作为解析对象的拖尾范围的开始位置和结束位置的输入区域显示在与电泳图相同的画面上，使该电泳图上的同拖尾范围有关的指示操作与所述输入区域中的以数值的方式进行的输入操作互相联动。6.根据权利要求1所述的电泳分析数据处理装置，其特征在于，每当所述解析范围指定部指定的拖尾范围被变更时所述解析处理部执行拖尾解析，所述显示处理部将所述解析处理部的拖尾解析结果显示在与电泳图相同的画面上。7.一种记录有电泳分析数据处理程序的记录介质，所述记录介质是记录有用于对利用电泳分析获取到的数据进行处理的数据处理程序的非暂时...

【专利技术属性】
技术研发人员：荻野康太，
申请(专利权)人：株式会社岛津制作所，
类型：发明
国别省市：