【技术实现步骤摘要】
微滴式数字PCR检测禽圆环病毒2型的引物组、探针及应用
[0001]本专利技术涉及禽圆环病毒2型检测
,尤其涉及微滴式数字PCR检测禽圆环病毒2型的引物组、探针及应用。
技术介绍
[0002]禽圆环病毒2型AGV2是2011年Rijsewijk等人首次在巴西的病鸡中发现的一种新发传染病。AGV2是鸡传染性贫血病毒(CAV)相关的环形病毒。同年,与AGV2序列同源性较高的一种人类病毒(HGyV)在法国人群的皮肤中被检出。2015年,新型环形病毒AGV2首次在中国内地的鸡群和健康的人群中发现。Bullenkamp等研究表明AGV2的VP3蛋白与CAV的VP3蛋白结构类似,能诱导癌细胞凋亡。AGV2已经在不同的地区(如意大利、南非、美国、巴西和荷兰)被检测到,这表明该病毒分布范围比较广。此外,一项检测市场销售的家禽疫苗是否被AGV2污染的研究中发现,巴西、加拿大和荷兰产的32株活性疫苗中发现有9株疫苗含有AGV2,这可能是造成AGV2分布范围比较广的原因。越来越多的证据表明AGV2对鸡和人均具有感染性,这不仅对家禽业而且对人 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.微滴式数字PCR检测禽圆环病毒2型的引物组和探针,其特征在于:所述引物组和探针的核苷酸序列如下所示:上游引物AGV2
‑
F:5
’
GACGATGGAGGAGTCACTGGTT 3
’
(SEQ ID NO:1);下游引物AGV2
‑
R:5
’
GTCCGTCTGGGTYTCCTGTGT 3
’
(SEQ ID NO:2);探针AGV2
‑
P:5
’
FAM
‑
CAGGAGGCTAGTGGACT
‑
BHQ1 3
’
(SEQ ID NO:3)。2.根据权利要求1所述的微滴式数字PCR检测禽圆环病毒2型的引物组和探针,其特征在于:所述上游引物AGV2
‑
F、下游引物AGV2
‑
R和探针AGV2
‑
P的摩尔比为9:9:5。3.根据权利要求1所述的微滴式数字PCR检测禽圆环病毒2型的引物组和探针在PCR扩增中的应用,其特征在于:退火温度为54.0℃。4.微滴式数字PCR检测禽圆环病毒2型的引物组和探针在PCR扩增中的应用,其特征在于:总的扩增体系为20μL:dd PCRTMSupermix for Probe 10μL,设置6个不同引物探针组合,浓度为600、600、900、900、1200、1200nmol/L上下游引物各1μL,对应浓度梯度为150、300、250、500、350、600nmol/L的探针1μL,模板2μL,最后用ddH2O补足20μL反应体系。5.根据权利要求4所述的微滴式数字PCR检测禽圆环病毒2型的引物组和探针在PCR扩增中的应用,其特征在于:dd PCR反应程序为:95℃预变性10min;94℃30s,退火温度60.0~50.0℃,40个循环,98℃固化10min,4℃结束反应,升降温度设置2.0℃/s。6.根据权利要求5所述的微滴式数字PCR检测禽圆环病毒2型的引物组和探针在PCR扩增中的应用,其特征在于:Real
‑
time PCR反应体系为20μL:Probe qPCR Mix,with UNG 10μL,上下游引物各0.4μL,浓度为900nmol/L,探针0.8μL,浓度为900nmol/L,ROX Reference Dye 0.4μL,模板2μL,ddH2O 6μL。7.根据权利要求6所述的微滴式数字PCR检测禽圆环病毒2型的引物组和探针在PCR扩增中的应用,其特征在于:反应程序:95℃预变性30s;95℃5s,退火温度60℃34s,40个循环;4℃结束反应。8.微滴式数字PCR检测禽圆环病毒2型的方法,其特征在于:所...
【专利技术属性】
技术研发人员:谢芝勋,张艳芳,曾婷婷,张民秀,谢丽基,罗思思,黄娇玲,王盛,邓显文,谢志勤,刘加波,
申请(专利权)人:广西壮族自治区兽医研究所,
类型:发明
国别省市:
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