T细胞受体及其使用方法技术

本公开涉及能够结合MUC5AC表位的重组T细胞受体和编码所述重组T细胞受体的核酸分子。在一些方面中，所述核酸分子还包含第二核苷酸序列，其中所述第二核苷酸序列或由所述第二核苷酸序列编码的多肽抑制内源性TCR的表达。本公开的其它方面涉及包含所述核酸分子的载体和包含所述重组TCR、所述核酸分子或所述载体的细胞。本公开的其它方面涉及使用所述重组TCR、所述核酸分子、所述载体和所述细胞的方法。在一些方面中，所述方法包括治疗有需要的受试者的癌症。受试者的癌症。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】II类分子为HLA
‑
DP等位基因。在一些方面中，所述HLA II类分子为HLA
‑
DP4等位基因。
[0012]在一些方面中，所述抗MUC5AC TCR包含α链和β链，其中所述α链包含含有α链CDR1、α链CDR2和α链CDR3的可变区；并且其中所述β链包含含有β链CDR1、β链CDR2和β链CDR3的可变结构域；其中所述α链CDR3包含如SEQ ID NO:7中所列的氨基酸序列。
[0013]在一些方面中，所述抗MUC5AC TCR的β链CDR3包含如SEQ ID NO:10中所列的氨基酸序列。
[0014]在一些方面中，所述抗MUC5AC TCR包含α链和β链，其中所述α链包含含有α链CDR1、α链CDR2和α链CDR3的可变区；并且其中所述β链包含含有β链CDR1、β链CDR2和β链CDR3的可变结构域；其中所述抗MUC5AC TCR的β链CDR3包含如SEQ ID NO:10中所列的氨基酸序列。
[0015]在一些方面中，所述抗MUC5AC TCR的α链CDR3包含如SEQ ID NO:7中所列的氨基酸序列。在一些方面中，所述抗MUC5AC TCR的α链CDR1包含如SEQ ID NO:5中所列的氨基酸序列。在一些方面中，所述抗MUC5AC TCR的β链CDR1包含如SEQ ID NO:8中所列的氨基酸序列。在一些方面中，所述抗MUC5AC TCR的α链CDR2包含如SEQ ID NO:6中所列的氨基酸序列。在一些方面中，所述抗MUC5AC TCR的β链CDR2包含如SEQ ID NO:9中所列的氨基酸序列。
[0016]在一些方面中，所述抗MUC5AC TCR的α链可变结构域包含SEQ ID NO:1所列的氨基酸序列中存在的可变结构域的氨基酸序列。在一些方面中，所述抗MUC5AC TCR的β链可变结构域包含SEQ ID NO:2所列的氨基酸序列中存在的可变结构域的氨基酸序列。
[0017]在一些方面中，所述抗MUC5AC TCR的α链还包含恒定区，其中所述恒定区不同于所述α链的内源性恒定区。
[0018]在一些方面中，所述抗MUC5AC TCR的α链还包含恒定区，其中所述α链恒定区包含与SEQ ID NO:1所列的氨基酸序列中存在的恒定区具有至少约85％、至少约90％、至少约95％、至少约96％、至少约97％、至少约98％或至少约99％序列同一性的氨基酸序列。
[0019]在一些方面中，所述α链恒定区包含相对于SEQ ID NO:1所列的氨基酸序列中存在的恒定区包含至少1个、至少2个、至少3个、至少4个或至少5个氨基酸取代的氨基酸序列。
[0020]在一些方面中，所述抗MUC5AC TCR的β链还包含恒定区，其中所述恒定区不同于所述β链的内源性恒定区。
[0021]在一些方面中，所述抗MUC5AC TCR的β链还包含恒定区，其中所述β链恒定区包含与SEQ ID NO:2所列的氨基酸序列中存在的恒定区具有至少约85％、至少约90％、至少约95％、至少约96％、至少约97％、至少约98％或至少约99％序列同一性的氨基酸序列。
[0022]在一些方面中，所述β链恒定区包含相对于SEQ ID NO:2所列的氨基酸序列中存在的恒定区包含至少2个、至少2个、至少3个、至少4个或至少5个氨基酸取代的氨基酸序列。
[0023]在一些方面中，所述抗MUC5AC TCR的α链包含如SEQ ID NO:1中所列的氨基酸序列。在一些方面中，所述抗MUC5AC TCR的β链包含如SEQ ID NO:2中所列的氨基酸序列。
[0024]在一些方面中，所述第二核苷酸序列为降低内源性TCR的表达的一种或多种siRNA。在一些方面中，所述一种或多种siRNA与编码内源性TCR的恒定区的核苷酸序列内的靶序列互补。在一些方面中，所述一种或多种siRNA包含选自由SEQ ID NO:25
‑
28组成的组的一个或多个核苷酸序列。
[0025]在一些方面中，所述抗MUC5AC TCR包含α链恒定区、β链恒定区或两者；并且其中所述α链恒定区、所述β链恒定区或两者包含相对于内源性TCR的对应氨基酸序列在靶序列内
具有至少1个、至少2个、至少3个、至少4个或至少5个取代的氨基酸序列。
[0026]在一些方面中，所述α链包含信号肽，所述β链包含信号肽，或者所述α链和所述β链两者均包含信号肽。在一些方面中，所述信号肽包含选自SEQ ID NO:20
‑
22中所列的氨基酸序列及其任何组合的氨基酸序列。
[0027]本公开的某些方面涉及一种包含本文所公开的核酸分子的载体。在一些方面中，所述载体为病毒载体、哺乳动物载体或细菌载体。在一些方面中，所述载体为逆转录病毒载体。在一些方面中，所述载体选自由以下组成的组：腺病毒载体、慢病毒、仙台病毒(Sendai virus)载体、杆状病毒载体、爱泼斯坦巴尔病毒载体(Epstein Barr viral vector)、乳多空病毒载体、痘苗病毒载体、单纯疱疹病毒载体、杂合载体和腺相关病毒(AAV)载体。在一些方面中，所述载体为慢病毒。
[0028]本公开的某些方面涉及一种T细胞受体(TCR)或其抗原结合部分，其包含本文所公开的抗MUC5AC TCR的α链可变结构域和本文所公开的抗MUC5AC TCR的β链可变结构域。
[0029]本公开的某些方面涉及一种特异性地结合人MUC5AC的重组T细胞受体(TCR)或其抗原结合部分(“抗MUC5AC TCR”)，其与参考TCR交叉竞争结合于人MUC5AC；其中所述参考TCR包含α链和β链，并且其中所述α链包含如SEQ ID NO:1中所列的氨基酸序列且所述β链包含如SEQ ID NO:2中所列的氨基酸序列；并且其中所述抗MUC5AC TCR包含α链和β链，其中所述α链包含恒定区，并且其中所述β链包含恒定区；其中所述α链恒定区包含相对于SEQ ID NO:1中所列的氨基酸序列中存在的恒定区具有至少1个、至少2个、至少3个、至少4个或至少5个氨基酸取代的氨基酸序列，或者所述β链恒定区包含相对于SEQ ID NO:2的氨基酸序列中存在的恒定区具有至少1个、至少2个、至少3个、至少4个或至少5个氨基酸取代的氨基酸序列。
[0030]本公开的某些方面涉及一种特异性地结合人MUC5AC的重组T细胞受体(TCR)或其抗原结合部分(“抗MUC5AC TCR”)，其与参考TCR结合人MUC5AC的相同表位或重叠表位；其中所述参考TCR包含α链和β链，并且其中所述α链包含如SEQ ID NO:1中所列的氨基酸序列且所述β链包含如SEQ ID NO:2中所列的氨基酸序列；并且其中所述抗MUC5AC TCR包含α链和β链，其中所述α链包含恒定区，并且其中所述β链包含恒定区；其中所述α链恒定区包含相对于SEQ ID NO:1中所列的氨基酸序列中存在的恒定区具有至少1个、至少2个、至少3个、至少4个或至少5个氨基酸取代的氨基酸序列，或者所述β链恒定区包含本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】1.一种核酸分子，所述核酸分子包含(i)第一核苷酸序列，所述第一核苷酸序列编码特异性地结合人粘蛋白5AC(MUC5AC)的重组T细胞受体(TCR)或其抗原结合部分(“抗MUC5AC TCR”)；和(ii)第二核苷酸序列，其中所述第二核苷酸序列或由所述第二核苷酸序列编码的多肽抑制内源性TCR的表达，其中所述抗MUC5AC TCR与参考TCR交叉竞争结合于人MUC5AC，所述参考TCR包含α链和β链，并且其中所述α链包含如SEQ ID NO:1中所列的氨基酸序列且所述β链包含如SEQ ID NO:2中所列的氨基酸序列。2.一种核酸分子，所述核酸分子包含(i)第一核苷酸序列，所述第一核苷酸序列编码特异性地结合人MUC5AC的重组T细胞受体(TCR)或其抗原结合部分(“抗MUC5AC TCR”)；和(ii)第二核苷酸序列，其中所述第二核苷酸序列或由所述第二核苷酸序列编码的多肽抑制内源性TCR的表达，其中所述抗MUC5AC TCR与参考TCR结合人MUC5AC的相同表位或重叠表位，所述参考TCR包含α链和β链，其中所述α链包含如SEQ ID NO:1中所列的氨基酸序列且所述β链包含如SEQ ID NO:2中所列的氨基酸序列。3.如权利要求1或2所述的核酸分子，其中所述抗MUC5AC TCR结合于MUC5AC的由如SEQ ID NO:13中所列的氨基酸序列组成的表位。4.如权利要求2或3所述的核酸分子，其中所述表位与HLA II类分子复合。5.如权利要求4所述的核酸分子，其中所述HLA II类分子为HLA
‑
DP、HLA
‑
DQ或HLA
‑
DR等位基因或其任何组合。6.如权利要求4所述的核酸分子，其中所述HLA II类分子为HLA
‑
DP等位基因。7.如权利要求4至6中任一项所述的核酸分子，其中所述HLA II类分子为HLA
‑
DP4等位基因。8.如权利要求1至7中任一项所述的核酸分子，其中所述抗MUC5AC TCR包含α链和β链，其中所述α链包含含有α链CDR1、α链CDR2和α链CDR3的可变区；并且其中所述β链包含含有β链CDR1、β链CDR2和β链CDR3的可变结构域；其中所述α链CDR3包含如SEQ ID NO:7中所列的氨基酸序列。9.如权利要求8所述的核酸分子，其中所述抗MUC5AC TCR的所述β链CDR3包含如SEQ ID NO:10中所列的氨基酸序列。10.如权利要求1至7中任一项所述的核酸分子，其中所述抗MUC5AC TCR包含α链和β链，其中所述α链包含含有α链CDR1、α链CDR2和α链CDR3的可变区；并且其中所述β链包含含有β链CDR1、β链CDR2和β链CDR3的可变结构域；其中所述抗MUC5AC TCR的所述β链CDR3包含如SEQ ID NO:10中所列的氨基酸序列。11.如权利要求10所述的核酸分子，其中所述抗MUC5AC TCR的所述α链CDR3包含如SEQ ID NO:7中所列的氨基酸序列。12.如权利要求8至11中任一项所述的核酸分子，其中所述抗MUC5AC TCR的所述α链CDR1包含如SEQ ID NO:5中所列的氨基酸序列。13.如权利要求8至12中任一项所述的核酸分子，其中所述抗MUC5AC TCR的所述β链CDR1包含如SEQ ID NO:8中所列的氨基酸序列。14.如权利要求8至13中任一项所述的核酸分子，其中所述抗MUC5AC TCR的所述α链
CDR2包含如SEQ ID NO:6中所列的氨基酸序列。15.如权利要求8至14中任一项所述的核酸分子，其中所述抗MUC5AC TCR的所述β链CDR2包含如SEQ ID NO:9中所列的氨基酸序列。16.如权利要求8至15中任一项所述的核酸分子，其中所述抗MUC5AC TCR的所述α链可变结构域包含SEQ ID NO:1所列的氨基酸序列中存在的可变结构域的氨基酸序列。17.如权利要求8至16中任一项所述的核酸分子，其中所述抗MUC5AC TCR的所述β链可变结构域包含SEQ ID NO:2所列的氨基酸序列中存在的可变结构域的氨基酸序列。18.如权利要求8至17中任一项所述的核酸分子，其中所述抗MUC5AC TCR的所述α链还包含恒定区，其中所述恒定区不同于所述α链的内源性恒定区。19.如权利要求8至18中任一项所述的核酸分子，其中所述抗MUC5AC TCR的所述α链还包含恒定区，其中所述α链恒定区包含与SEQ ID NO:1所列的氨基酸序列中存在的恒定区具有至少约85％、至少约90％、至少约95％、至少约96％、至少约97％、至少约98％或至少约99％序列同一性的氨基酸序列。20.如权利要求18或19所述的核酸分子，其中所述α链恒定区包含相对于SEQ ID NO:1所列的氨基酸序列中存在的恒定区包含至少1个、至少2个、至少3个、至少4个或至少5个氨基酸取代的氨基酸序列。21.如权利要求8至20中任一项所述的核酸分子，其中所述抗MUC5AC TCR的所述β链还包含恒定区，其中所述恒定区不同于所述β链的内源性恒定区。22.如权利要求8至21中任一项所述的核酸分子，其中所述抗MUC5AC TCR的所述β链还包含恒定区，其中所述β链恒定区包含与SEQ ID NO:2所列的氨基酸序列中存在的恒定区具有至少约85％、至少约90％、至少约95％、至少约96％、至少约97％、至少约98％或至少约99％序列同一性的氨基酸序列。23.如权利要求21或22所述的核酸分子，其中所述β链恒定区包含相对于SEQ ID NO:2所列的氨基酸序列中存在的恒定区包含至少1个、至少2个、至少3个、至少4个或至少5个氨基酸取代的氨基酸序列。24.如权利要求8至23中任一项所述的核酸分子，其中所述抗MUC5AC TCR的所述α链包含如SEQ ID NO:1中所列的氨基酸序列。25.如权利要求8至24中任一项所述的核酸分子，其中所述抗MUC5AC TCR的所述β链包含如SEQ ID NO:2中所列的氨基酸序列。26.如权利要求1至25中任一项所述的核酸分子，其中所述第二核苷酸序列为降低内源性TCR的表达的一种或多种siRNA。27.如权利要求26所述的核酸分子，其中所述一种或多种siRNA与编码所述内源性TCR的恒定区的核苷酸序列内的靶序列互补。28.如权利要求26或27所述的核酸分子，其中所述一种或多种siRNA包含选自由SEQ ID NO:25
‑
28组成的组的一个或多个核苷酸序列。29.如权利要求1至28中任一项所述的核酸分子，其中所述抗MUC5AC TCR包含α链恒定区、β链恒定区或两者；并且其中所述α链恒定区、所述β链恒定区或两者包含相对于内源性TCR的对应氨基酸序列在所述靶序列内具有至少1个、至少2个、至少3个、至少4个或至少5个取代的氨基酸序列。
30.如权利要求1至29中任一项所述的核酸分子，其中所述α链包含信号肽，所述β链包含信号肽，或者所述α链和所述β链两者均包含信号肽。31.如权利要求30所述的核酸分子，其中所述信号肽包含选自SEQ ID NO:20
‑
22中所列的氨基酸序列及其任何组合的氨基酸序列。32.一种载体，所述载体包含权利要求1至31中任一项所述的核酸分子。33.如权利要求32所述的载体，所述载体为病毒载体、哺乳动物载体或细菌载体。34.如权利要求32或33所述的载体，所述载体为逆转录病毒载体。35.如权利要求31至33中任一项所述的载体，所述载体选自由以下组成的组：腺病毒载体、慢病毒、仙台病毒载体、杆状病毒载体、爱泼斯坦巴尔病毒载体、乳多空病毒载体、痘苗病毒载体、单纯疱疹病毒载体、杂合载体和腺相关病毒(AAV)载体。36.如权利要求32至35中任一项所述的载体，所述载体为慢病毒。37.一种T细胞受体(TCR)或其抗原结合部分，其包含权利要求8至31中任一项所述的抗MUC5AC TCR的所述α链可变结构域和权利要求8至31中任一项所述的抗MUC5AC TCR的所述β链可变结构域。38.一种特异性地结合人MUC5AC的重组T细胞受体(TCR)或其抗原结合部分(“抗MUC5AC TCR”)，其与参考TCR交叉竞争结合于人MUC5AC；其中所述参考TCR包含α链和β链，并且其中所述α链包含如SEQ ID NO:1中所列的氨基酸序列且所述β链包含如SEQ ID NO:2中所列的氨基酸序列；并且其中所述抗MUC5AC TCR包含α链和β链，其中所述α链包含恒定区，并且其中所述β链包含恒定区；其中(i)所述α链恒定区包含相对于SEQ ID NO:1中所列的氨基酸序列中存在的恒定区具有至少1个、至少2个、至少3个、至少4个或至少5个氨基酸取代的氨基酸序列，或(ii)所述β链恒定区包含相对于SEQ ID NO:2的氨基酸序列中存在的恒定区具有至少1个、至少2个、至少3个、至少4个或至少5个氨基酸取代的氨基酸序列。39.一种特异性地结合人MUC5AC的重组T细胞受体(TCR)或其抗原结合部分(“抗MUC5AC TCR”)，其与参考TCR结合人MUC5AC的相同表位或重叠表位；其中所述参考TCR包含α链和β链，并且其中所述α链包含如SEQ ID NO:1中所列的氨基酸序列且所述β链包含如SEQ ID NO:2中所列的氨基酸序列；并且其中所述抗MUC5AC TCR包含α链和β链，其中所述α链包含恒定区，并且其中所述β链包含恒定区；其中(i)所述α链恒定区包含相对于SEQ ID NO:1中所列的氨基酸序列中存在的恒定区具有至少1个、至少2个、至少3个、至少4个或至少5个氨基酸取代的氨基酸序列，或(ii)所述β链恒定区包含相对于SEQ ID NO:2中所列的氨基酸序列中存在的恒定区具有至少1个、至少2个、至少3个、至少4个或至少个5氨基酸取代的氨基酸序列。40.如权利要求38或39所述的抗MUC5AC TCR，所述抗MUC5AC TCR结合于MUC5AC的由如SEQ ID NO:13中所列的氨基酸序列组成的表位。41.如权利要求39或40所述的抗MUC5AC TCR，其中所述表位与HLA II类分子复合。42.如权利要求42所述的抗MUC5AC TCR，其中所述HLA II类分子为HLA
‑
DP、HLA
‑
DQ或HLA
‑
DR等位基因或其任何组合。
43.如权利要求42或43所述的抗MUC5AC TCR，其中所述HLA II类分子为HLA
‑
DP等位基因。44.如权利要求42至44中任一项所述的抗MUC5AC TCR，其中所述HLA II类分子选自HLA
‑
DP4等位基因。45.如权利要求38至44中任一项所述的抗MUC5AC TCR，其中所述抗MUC5AC TCR的所述α链包含含有α链CDR1、α链CDR2和α链CDR3的可变结构域；并且其中所述抗MUC5AC TCR的所述β链包含含有β链CDR1、β链CDR2和β链CDR3的可变结构域；其中所述抗MUC5AC的所述α链CDR3包含如SEQ ID NO:7中所列的氨基酸序列。46.如权利要求45所述的抗MUC5AC TCR，其中所述抗MUC5AC TCR的所述β链CD...

【专利技术属性】
技术研发人员：平野直人，菅田健二，佐生嘉代子，
申请(专利权)人：大学健康网络，
类型：发明
国别省市：