一种检测AML1/ETO基因的荧光原位杂交探针组及其应用制造技术

本发明专利技术涉及基因检测技术领域，具体涉及一种检测AML1/ETO基因的荧光原位杂交探针组及其应用。该探针组由说明书表1中所示的2440个核苷酸序列制备得到。本发明专利技术直接在AML1和ETO基因的目标区域，构建与目标区域完全互补的长度为45bp的单链片段作为候选探针，然后将每一条序列进行批量BLAST比对，保证杂交的每一条探针序列的高特异性；同时精确控制目标区域的靶向，突破探针尺寸限制，提高探针的分辨率；在制备的过程中，采用PCR掺入法，保证产物中含有更多的荧光基团。采用上述探针组用于检测AML1/ETO基因重排状态，成本较低且在30分钟左右即可完成骨髓样本的FISH杂交，敏感性高，特异性强且杂交背景干净、信噪比低。信噪比低。信噪比低。

【技术实现步骤摘要】
一种检测AML1/ETO基因的荧光原位杂交探针组及其应用


[0001]本专利技术涉及基因检测
，具体涉及一种检测AML1/ETO基因的荧光原位杂交探针组及其应用。

技术介绍

[0002]白血病是起源于造血干细胞的恶性克隆性疾病，克隆性白血病细胞因为增殖失控、分化障碍、凋亡受阻等机制在骨髓和其他造血组织中大量蓄积，从而抑制骨髓正常造血功能并浸润其他组织和器官。AML1/ETO融合基因是急性髓细胞白血病(AML)患者中常见的细胞遗传学异常，在AML患者中的发生率约为10％，在M2型中发生率可达40％，主要见于M2b亚型，阳性率高达90％、M2b亚型具有治疗反应好、完全缓解率高、缓解期长等特点，AML1/ETO基因被定义为AML预后良好类型。
[0003]荧光原位杂交实验可以用于评估AML1/ETO基因状态。传统的商业化FISH探针主要使用BAC克隆作为探针经过荧光分子标记后进行杂交检测，然后，BAC克隆制备的探针存在一些非重复序列，探针特异性不高，需要使用Cot1
‑
DNA进行非封闭性封闭，且探针片段普遍偏大，长度在本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种检测AML1/ETO基因的荧光原位杂交探针组，其特征在于，该探针组由说明书表1中所示的2440个核苷酸序列制备得到。2.根据权利要求1所述的检测AML1/ETO基因的荧光原位杂交探针组，其特征在于，该探针组由权利要求1所述的核苷酸序列通过添加标签序列后扩增得到。3.根据权利要求2所述的检测AML1/ETO基因的荧光原位杂交探针组，其特征在于，所述核苷酸序列的5
’
端标签序列为：TAATACGACTCACTATAGGG；3
’
端标签序列为：CCGCTGAGCAATAACTAGCA。4.根据权利要求2或3所述的检测AML1/ETO基因的荧光原位杂交探针组，其特征在于，PCR扩增体系中含有Alexa fluor555
‑
dUTP。5.根据权利要求1～4任一项所述的探针组的制备方法，其特征在于，包括以下步骤：S1，以AML1和ETO基因序列为依据，在不含重复序列的区域分别设计含45个碱基核苷酸序列，设定探针Tm为50℃，GC含量范围为40～60％，舍弃包含AAAA/TTTT/CCCC/GGGG的序列后，得到2860条候选探针，再经过全基因hg38 ...

【专利技术属性】
技术研发人员：祝丹平，魏亮，董祥，马云飞，吴文雅，
申请(专利权)人：武汉友芝友医疗科技股份有限公司，
类型：发明
国别省市：