一种结直肠癌辅助免疫治疗靶基因C16orf54检测试剂盒及应用制造技术

本发明专利技术属于生物技术领域，涉及一种结直肠癌辅助免疫治疗靶基因C16orf54检测试剂盒及应用。本发明专利技术研究证实结直肠癌中C16orf54表达显著下降。C16orf54表达水平与免疫微环境指标StromalScore，ImmuneScore和ESTIMATEScore均呈正相关，与多种免疫细胞浸润正相关，且与免疫检查点等免疫相关基因表达正相关，并且设计了C16orf54检测试剂盒。了C16orf54检测试剂盒。了C16orf54检测试剂盒。

【技术实现步骤摘要】
一种结直肠癌辅助免疫治疗靶基因C16orf54检测试剂盒及应用


[0001]本专利技术属于生物
，具体地，涉及一种检测C16orf54表达水平的试剂在制备用于结直肠癌检测和/或辅助免疫治疗的制剂中的应用，以及一种结直肠癌辅助免疫治疗靶基因C16orf54检测试剂盒及应用。

技术介绍

[0002]结直肠癌(Colorectal Carcinoma，CRC)是指发生于结肠或者是直肠的癌变，可以发生于结直肠的任何部位，但尤以直肠、乙状结肠最为常见。结直肠癌是第三大最常见的癌症，也是死亡率第二高的癌症，据估计2018年全球共有180多万例新发CRC病例和88万例CRC相关死亡病例。在我国，CRC是最常见的消化道恶性肿瘤之一，发病率和死亡率在所有癌症中分别位居第三位和第五位，且发病率仍在继续增长，尤其是城区男性发病率增长速度最快。免疫治疗是一种具有前景的结直肠癌治疗新方式，但目前仍然存在治疗响应率不高、副作用等问题，因此，开发新型辅助免疫治疗新靶点对于临床肿瘤免疫治疗具有重要意义。

技术实现思路

[0003]本专利技术的目的是提供一种结直肠癌免疫治疗新靶点C16orf54，并由此提供一种检测C16orf54表达水平的试剂在制备用于结直肠癌检测和/或辅助免疫治疗的制剂中的应用，以及一种结直肠癌辅助免疫治疗靶基因C16orf54检测试剂盒及应用。
[0004]本专利技术的第一方面提供一种检测C16orf54表达水平的试剂在制备用于结直肠癌检测和/或辅助免疫治疗的制剂中的应用。
[0005]进一步地，所述检测C16orf54表达水平包括检测C16orf54的mRNA表达水平和/或检测C16orf54的蛋白表达水平。
[0006]进一步地，所述检测C16orf54表达水平的方法包括：通过RT
‑
qPCR方法检测结直肠癌和癌旁组织中C16orf54 mRNA的表达量；通过分子探针技术检测结直肠癌和癌旁组织中C16orf54 mRNA表达量；通过免疫组化或Western
‑
Blot检测结直肠癌和癌旁组织中C16orf54蛋白表达量。
[0007]更具体地，所述检测C16orf54表达水平的试剂为C16orf54基因DNA序列或mRNA序列的寡核酸探针、PCR引物，或者为靶向C16orf54的抗体。
[0008]根据本专利技术，优选地，所述检测C16orf54表达水平的试剂为SEQ ID NO：1和SEQ ID NO：2所示核苷酸序列的实时荧光定量PCR特异性引物。
[0009]5’‑
GAGGACTGGTATGGCTCTGC
‑3’
(SEQ ID NO：1)
[0010]5’‑
GGAGCAGAATTTGGGGCTGA
‑3’
(SEQ ID NO：2)
[0011]本专利技术的第二方面提供一种结直肠癌辅助免疫治疗靶基因C16orf54检测试剂盒，该试剂盒包括：检测C16orf54表达水平的试剂。
[0012]进一步地，所述检测C16orf54表达水平的试剂为靶向C16orf54基因DNA序列或
mRNA序列的寡核酸探针、PCR引物，或者为靶向C16orf54的抗体。
[0013]具体地，所述检测C16orf54表达水平的试剂为具有SEQ ID NO：1和SEQ ID NO：2所示核苷酸序列的实时荧光定量PCR特异性引物。
[0014]根据本专利技术，所述试剂盒还可以含有其他常规的用于实时荧光定量的试剂，优选地，所述试剂盒还包括以下组分中的至少一种：Trizol、异丙醇、氯仿、无水乙醇、无RNA酶水、随机引物、5
×
M
‑
MLV缓冲液、dNTPs、RNA酶抑制剂、M
‑
MLV逆转录酶、具有SEQ ID NO：3和SEQ ID NO：4所示核苷酸序列的ACTB实时荧光定量PCR特异性引物。
[0015]5’‑
GGCACCCAGCACAATGAAGA
‑3’
(SEQ ID NO：3)
[0016]5’‑
ACTCCTGCTTGCTGATCCAC
‑3’
(SEQ ID NO：4)
[0017]本专利技术第三方面提供上述试剂盒在制备用于结直肠癌检测和/或辅助免疫治疗的制剂中的应用。
[0018]C16orf54是一种蛋白编码基因，本专利技术研究证实结直肠癌中C16orf54表达显著下降。C16orf54表达水平与免疫微环境指标StromalScore，ImmuneScore和ESTIMATEScore均呈正相关，与多种免疫细胞浸润正相关，且与免疫检查点等免疫相关基因表达正相关，由此说明，C16orf54可以作为结直肠癌免疫治疗新靶点。并且基于此设计了C16orf54检测试剂盒。
[0019]本专利技术的其它特征和优点将在随后具体实施方式部分予以详细说明。
附图说明
[0020]通过结合附图对本专利技术示例性实施方式进行更详细的描述，本专利技术的上述以及其它目的、特征和优势将变得更加明显。
[0021]图1示出了结直肠癌中靶基因C16orf54的表达变化。(A)非配对样本结果显示结直肠癌组织中C16orf54表达显著下调；(B)配对样本结果显示结直肠癌组织中C16orf54表达显著下调。
[0022]图2示出了结直肠癌中C16orf54表达与肿瘤免疫微环境的相关性。(A)C16orf54表达与ESTIMATEScore显著正相关；(B)C16orf54表达与ImmuneScore显著正相关；(C)C16orf54表达与StromalScore显著正相关。
[0023]图3示出了结直肠癌中C16orf54表达与免疫细胞浸润的相关性。(A)xCELL法分析显示C16orf54表达与免疫细胞浸润显著正相关；(B)CIBERSORT法分析显示C16orf54表达与免疫细胞浸润显著正相关；(C)MCPcounter法分析显示C16orf54表达与免疫细胞浸润显著正相关；(D)EPIC法分析显示C16orf54表达与免疫细胞浸润显著正相关；(E)QUANTISEQ法分析显示C16orf54表达与免疫细胞浸润显著正相关；(F)Timer法分析显示C16orf54表达与免疫细胞浸润显著正相关；(G)IPS法分析显示C16orf54表达与免疫细胞浸润显著正相关。
[0024]图4示出了结直肠癌中C16orf54表达与免疫检查点等免疫相关基因的相关性。(A)C16orf54表达与细胞因子、受体和MHC表达显著正相关；(B)C16orf54表达与免疫检查点基因显著正相关。
[0025]图5示出了结直肠癌中C16orf54的表达变化。
具体实施方式
[0026]下面将更详细地描述本专利技术的优选实施方式。虽然以下描述了本专利技术的优选实施方式，然而应该理解，可以以各种形式实现本专利技术而不应被这里阐述的实施方式所限制。
[0027]实本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.检测C16orf54表达水平的试剂在制备用于结直肠癌检测和/或辅助免疫治疗的制剂中的应用。2.根据权利要求1所述的应用，其中，所述检测C16orf54表达水平包括检测C16orf54的mRNA表达水平和/或检测C16orf54的蛋白表达水平。3.根据权利要求1所述的应用，其中，所述检测C16orf54表达水平的方法包括：通过RT
‑
qPCR方法检测结直肠癌和癌旁组织中C16orf54 mRNA的表达量；通过分子探针技术检测结直肠癌和癌旁组织中C16orf54 mRNA表达量；通过免疫组化或Western
‑
Blot检测结直肠癌和癌旁组织中C16orf54蛋白表达量。4.根据权利要求1所述的应用，其中，所述检测C16orf54表达水平的试剂为靶向C16orf54基因DNA序列或mRNA序列的寡核酸探针、PCR引物，或者为靶向C16orf54的抗体。5.根据权利要求4所述的应用，其中，所述检测C16orf54表达水平的试剂为SEQ ID NO：1和SEQ ID NO：2所示核苷酸序列的实时荧光定量PCR特异性引物。6.一种结直肠...

【专利技术属性】
技术研发人员：李梦琳，梅峰，李春明，杜欣娜，
申请(专利权)人：江苏医药职业学院，
类型：发明
国别省市：