本发明专利技术涉及动物分子标记辅助育种技术领域，具体涉及一种用于鉴定鸡高产性能的分子标记及其应用。本发明专利技术提供的与鸡高产性能相关的SNP分子标记的多态性位点位于基因组版本galGal5的5号染色体的第48607009位，多态性为C/T。该SNP分子标记能够将具有高产性能的鸡只或群体与其他鸡群进行有效区分，利用该分子标记进行高产性能鸡的鉴定具有速度快、成本低、准确度高的优点，既可以为快速鉴定产蛋量较高的鸡只乃至群体提供有效的方法，同时也可以用于鸡产蛋性状的育种，改善产蛋量低的问题，在蛋鸡产业中具有较好的应用前景。蛋鸡产业中具有较好的应用前景。
【技术实现步骤摘要】
一种用于鉴定鸡高产性能的分子标记及其应用
[0001]本专利技术涉及动物分子标记辅助育种
，具体涉及一种用于鉴定鸡高产性能的分子标记及其应用。
技术介绍
[0002]自鸡驯化以来，大量鸡种已通过自然选择或人工选择的方式，用于食品生产、观赏等。繁殖性状，特别是产蛋性状，是家禽生产中最重要的经济指标。作为动物蛋白的重要来源，在过去的几十年里，世界范围内的禽蛋消费量显著增加。据统计，每人每年大约消费12.5公斤鸡蛋，并且消费量可能随着城市人口的增加而继续增加。中国的蛋鸡产业近年来实现了快速发展，目前已经达到了总量世界第一，在全球的占比接近三分之一。
[0003]中国地方鸡种在中国的家禽业中扮演着非常重要的角色，代表了优质且丰富的自然及物质资源，但是受地域管理、人员技术限制等多种因素影响，中国地方鸡种年产蛋不足200枚，而与产蛋性能较弱的地方鸡种相比，商业品种或品系已被大量选择用于专门化蛋鸡或肉鸡生产，经过长时间的改良及严格管理，年平均产蛋量已达到300枚左右。
[0004]因此探索高产蛋鸡与地方鸡产蛋量差异，寻找与高产蛋鸡高产性状相关的特异性SNP位点，并作为地方鸡种高产性状选育的重要指标，将从根本意义上保障家禽产业发展的基础动力，为蛋鸡选种培育提供宝贵的育种经验，具有非常重大的经济意义和现实意义。
[0005]然而，产蛋是一个低至中等遗传力的多基因遗传性状，受遗传组分和环境因素的双重影响，可通过初次产蛋年龄、产蛋量、产蛋率等指标来评价。其中，产蛋量是能够有效评价鸡只某一阶段产蛋量和繁殖能力的重要指标。开发与产蛋量等高产性状相关的分子标记对于高产性能蛋鸡的育种具有重要意义。
技术实现思路
[0006]本专利技术的目的是提供一种与鸡高产性能相关的SNP分子标记以及该SNP分子标记的应用。
[0007]本专利技术利用600K高密度SNP芯片技术对产蛋性能明显不同的大量鸡种进行基因分型，通过全基因组关联分析，发现了与产蛋量性状相关的SNP位点，通过对不同鸡种的关联SNP位点进行基因频率计算及对比，发现了与高产蛋鸡高产性状相关的特异性SNP位点，该SNP位点在高产蛋鸡与地方鸡种(低产蛋量鸡种)间的基因频率分布存在非常显著的差异，可作为分子标记迅速准确地将具有高产性能的鸡只或群体鉴别出来。
[0008]具体地，本专利技术提供以下技术方案：
[0009]本专利技术提供与鸡高产性能相关的SNP分子标记，所述SNP分子标记的多态性位点位于基因组版本galGal5的5号染色体的第48607009位，多态性为C/T。
[0010]以上所述的SNP位点的具体信息如表1所示。
[0011]表1 SNP位点信息
[0012]SNP位置ReferenceMutation
AX
‑
7685526648607009CT
[0013]具体地，所述SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，多态性位点位于SEQ ID NO.1所示序列的第251位，多态性为C/T。
[0014]以上所述的SNP分子标记的多态性位点为T，对应于高产蛋量，多态性位点为C，对应于低产蛋量。
[0015]本专利技术提供用于检测所述SNP分子标记的引物，其包含序列如SEQ ID NO.2
‑
3所示的引物。
[0016]上述引物的序列具体如下：
[0017]SEQ ID NO.2：F：TGGAGAGCTCGAAACTAAAGCG；
[0018]SEQ ID NO.3：R：AAAGAGCCCTGAGAGTCAGTTG。
[0019]本专利技术还提供含有以上所述的引物的试剂盒。
[0020]除包含上述引物外，所述试剂盒还可包含选自如下试剂中的一种或多种：dNTP、Mg
2+
、DNA聚合酶、ddH2O、PCR反应缓冲液；上述试剂可单独包装，也可以预混液的形式混合包装。
[0021]基于本专利技术提供的SNP分子标记的功能，本专利技术提供所述SNP分子标记或用于检测所述SNP分子标记的试剂或所述引物或所述试剂盒在鉴定具有高产性能的鸡只或鸡群中的应用。
[0022]本专利技术还提供所述SNP分子标记或用于检测所述SNP分子标记的试剂或所述引物或所述试剂盒在鉴定高产蛋量的鸡只或鸡群中的应用。
[0023]本专利技术还提供所述SNP分子标记或用于检测所述SNP分子标记的试剂或所述引物或所述试剂盒在中国地方鸡中鉴定高产蛋量的鸡只或鸡群中的应用。
[0024]本专利技术还提供所述SNP分子标记或用于检测所述SNP分子标记的试剂或所述引物或所述试剂盒在高产性能鸡的分子标记辅助育种中的应用。
[0025]以上所述的高产性能鸡优选为具有高产蛋量性状的鸡。
[0026]本专利技术还提供所述SNP分子标记或用于检测所述SNP分子标记的试剂或所述引物或所述试剂盒在鸡的产蛋性能改良中的应用。
[0027]以上所述的产蛋性能优选为产蛋量性能。
[0028]以上所述的用于检测所述SNP分子标记的试剂包括用于检测所述SNP分子标记的引物、探针或其他试剂。
[0029]根据本专利技术的SNP分子标记及其上下游序列，本领域技术人员可以获得用于扩增、检测所述SNP分子标记的特异性引物或探针。
[0030]以上所述的应用具体包括：
[0031](1)提取待测鸡的基因组DNA，以所述基因组DNA为模板，利用用于检测所述SNP分子标记的引物进行PCR，得到扩增产物；
[0032](2)对所述扩增产物进行测序，检测所述SNP分子标记的基因型，若所述SNP分子标记的多态性位点为C，则判断为低产蛋量，若所述SNP分子标记的多态性位点为T，则判断为高产蛋量。
[0033]本专利技术的有益效果在于：本专利技术提供的用于鉴定鸡高产性能的SNP分子标记能够将具有高产性能的鸡只或群体与其他鸡群进行有效区分，利用该SNP分子标记进行高产性
能鸡的鉴定具有速度快、成本低、准确度高的优点，既可以为快速鉴定产蛋量较高、具有高产性能的鸡只乃至群体提供有效的方法，同时也可以用于产蛋性状的育种，改善地方鸡等存在的产蛋量低的问题，有利于选育具有高产性能的品系，从根本上提高鸡群的产蛋性能，在蛋鸡产业中具有较好的应用前景。
具体实施方式
[0034]以下实施例用于说明本专利技术，但不用来限制本专利技术的范围。
[0035]实施例1与鸡高产性能相关的SNP分子标记及其鉴定方法的开发
[0036]1、材料与方法
[0037]选择年平均产蛋量较高，产蛋性能具有突出优势的遗传背景各不相同的商业高产蛋鸡3个品种共220只鸡(洛岛红60只，矮小鸡60只，白来航100只)，以及产蛋性能较差的中国地方鸡种222只(北京油鸡42只，河南斗鸡13只，西双版纳斗鸡10只，吐鲁番斗鸡11只，漳州斗鸡10只，鲁西斗鸡10只，藏鸡42只，洪山鸡42只，泰和丝羽乌骨鸡42只)。
[0038]2、基因分型及数据质量过滤<本文档来自技高网...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.与鸡高产性能相关的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记的多态性位点位于基因组版本galGal5的5号染色体的第48607009位，多态性为C/T。2.根据权利要求1所述的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，多态性位点位于SEQID NO.1所示序列的第251位，多态性为C/T。3.根据权利要求1或2所述的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记的多态性位点为T，对应于高产蛋量，多态性位点为C，对应于低产蛋量。4.用于检测权利要求1～3任一项所述的SNP分子标记的引物，其特征在于，其包含序列如SEQ ID NO.2
‑
3所示的引物。5.一种试剂盒，其特征在于，其含有权利要求4所述的引物。6.权利要求1～3任一项所述的SNP分子标记或用于检测权利要求1～3任一项所述的SNP分子标记的试剂或权利要求4所述的引物或权利要求5所述的试剂盒在鉴定具有高产性能的鸡只或鸡群中的应用。7.权利要求1～3任一项所...
【专利技术属性】
技术研发人员：曲鲁江，赵秀蓉，张金鑫，宁中华，陈余，贾亚雄，吕学泽，王梁，李凯扬，
申请(专利权)人：中国农业大学，
类型：发明
国别省市：
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