HSD17B13基因多态性在中重度MAFLD诊断中的应用制造技术

本发明专利技术公开了HSD17B13基因多态性在中重度MAFLD诊断中的应用，所述SNP为rs72613567；通过对MAFLD的样本进行SNP检测，首次发现了rs72613567与中重度MAFLD相关，相比非MAFLD和轻度MAFLD受试者，中重度MAFLD受试者中rs72613567发生插入缺失突变的频率增加；相比非肥胖型轻度MAFLD受试者，非肥胖型中重度MAFLD受试者中rs72613567发生插入缺失突变的频率增加；可以通过检测rs72613567的基因型判断受试者是否患有中重度MAFLD。断受试者是否患有中重度MAFLD。

【技术实现步骤摘要】
HSD17B13基因多态性在中重度MAFLD诊断中的应用


[0001]本专利技术属于生物医药领域，涉及HSD17B13基因多态性在中重度MAFLD诊断中的应用，具体的涉及SNP为rs72613567。

技术介绍

[0002]非酒精性脂肪性肝病(nonalcoholic fatty liver disease,NAFLD)是一组高度异质性疾病，与多种机体代谢功能障碍密切相关，在2020年3月，国际专家共识建议将NAFLD改为代谢相关脂肪性肝病(metabolic dysfunction
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associated fatty liver disease，MAFLD)(薛苗，范建高.代谢相关脂肪性肝病新定义的国际专家共识简介[J].临床肝胆病杂志，2020,36(06):1224
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1227.)。NAFLD/MAFLD的全球患病率估计为24
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30％。超重/肥胖及代谢综合症(metabolic syndrome,MetS)这些与NAFLD/MAFLD密切相关疾病的流行，使得其患病率更高，预计在接下来的10年，其严重状态的非酒精性脂肪性肝炎(nonalcoholic steatohepatitis,NASH)的发病率将激增至56％(Huang Daniel Q,El
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Serag Hashem B,Loomba Rohit,Global epidemiology of NAFLD
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related HCC:trends,predictions,risk factors and prevention[J].Nat Rev Gastroenterol Hepatol,2020,undefined:undefined.)。随着NAFLD/MAFLD及NASH的患病率的迅速增长，该病及其所致的终末期肝脏病所带来的公共卫生负担也在飞速增加，然而目前临床上尚无针对NAFLD/MAFLD安全有效的治疗方案，由此可见，提高早期诊断率尤为重要。目前肝活检仍是NAFLD/MAFLD患者诊断、分级和分期的金标准，然而肝脏活检也有自身的局限性，比如采样误差风险、观察者间和观察者内差异率高、并发症风险高等。故而，努力寻找安全、有效、可推广的非侵入性诊断的方法显得尤为重要。
[0003]HSD17B13主要表达于肝细胞脂滴(lipiddroplet，LD)表面，是一种新型的小鼠和人类肝脏特异性LD表面相关蛋白(SUW，MAOZ，LIUY，et al.Role of HSD17B13 in the liver physiology and pathophysiology[J].Mol Cell Endocrinol，2019，489:119
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125.)HSD17B13最初被命名为短链脱氢酶/还原酶9，于2007年首次在人类肝脏cDNA文库中克隆发现。现HSD17B13被列入17
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HSD家族，该家族在类固醇代谢中发挥重要作用，HSD17B13同17
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HSD家族其他成员一样，具有NAD(P)+/NAD(P)H结合位点(TGxxGxG)和一个在N
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端的酶促活性位点(YxxxK)。HSD17B13亚细胞定位于肝细胞LD表面，蛋白质组学研究显示HSD17B13在肝细胞中大量表达，组织分布研究显示HSD17B13在肾脏肺脑骨骼肌卵巢和睾丸中仅有非常低的表达水平，表明其在肝脏中发挥重要作用(SUW，WANGY，JIAX，et al.Comparative proteomic study reveals17
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HSD13 as apathogenic protein in nonalcoholic fattyliver disease[J].ProcNatl AcadSci USA，2014，111(31):11437
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11442.)。
[0004]HSD17B13作为一种新型肝脏特异性LD表面蛋白，在脂肪性肝病进展中具有重要意义。目前关于HSD17B13在肝脏疾病的作用机制仍需进一步探究。本申请拟通过检测受试者的基因型，筛选与MAFLD相关的基因型，从而为不同亚型的MAFLD的诊断提供分子基础。

技术实现思路

[0005]为了弥补现有技术的不足，本专利技术的目的在于提供一种用于判断中重度MAFLD的SNP标志物，通过检测SNP基因型来判断中重度MAFLD患者的预后。
[0006]为了实现上述目的，本专利技术采用了如下技术方案：
[0007]本专利技术提供了检测样本中SNP标志物的试剂在制备判断中重度MAFLD的产品中的应用，所述SNP为rs72613567。
[0008]进一步，当rs72613567发生插入缺失突变时，患者存在患中重度MAFLD的风险或患中重度MAFLD。
[0009]进一步，相比非MAFLD和轻度MAFLD受试者，中重度MAFLD受试者中rs72613567发生插入缺失突变的频率增加。
[0010]进一步，相比非肥胖型轻度MAFLD受试者，非肥胖型中重度MAFLD受试者中rs72613567发生插入缺失突变的频率增加。
[0011]进一步，检测样本中SNP标志物的试剂包括通过直接测序、单碱基延伸、等位基因特异性探针杂交、等位基因特异性引物延伸、等位基因特异性扩增(allele
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specific PCR，AS
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PCR))、等位基因特异性核苷酸掺入、5'核酸酶消化、分子信标测定、寡核苷酸连接测定、大小分析和单链构象多态性(SSCP)方法检测rs72613567基因型的试剂。
[0012]进一步，所述样本选自血液、组织。
[0013]进一步，所述样本为血液。
[0014]本专利技术提供了用于判断中重度MAFLD的产品，所述产品包括检测受试者样本中SNP位点rs72613567基因型的试剂。
[0015]进一步，所述试剂包括引物或探针。
[0016]进一步，所述探针包括与rs72613567突变进行特异性杂交的突变型探针。
[0017]进一步，所述探针还包括与HSD17B13中rs72613567突变以外区域杂交的通用型探针。
[0018]进一步，所述产品还包括处理样本的试剂。
[0019]进一步，所述产品还包括检测MAFLD的常规指标的试剂。
[0020]进一步，所述产品包括试剂盒、芯片。
[0021]本专利技术提供了rs72613567在构建预测中重度MAFLD的计算模型中的应用。
[0022]本专利技术的优点和有益效果：
[0023]本专利技术首次发现了SNP位点rs72613567的基因型与中重度MAFLD相关，通过检测rs72613567的基因型，可以判断受试者是否患有中重度MAFLD或存在患中重度MAFLD的风险。
具体实施方式
[0024]术语“样本”或“样品”是指含有或假定本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.检测样本中SNP标志物的试剂在制备判断中重度MAFLD的产品中的应用，其特征在于，所述SNP为rs72613567。2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，当rs72613567发生插入缺失突变时，患者存在患中重度MAFLD的风险或患中重度MAFLD；优选的，相比非MAFLD和轻度MAFLD受试者，中重度MAFLD受试者中rs72613567发生插入缺失突变的频率增加；优选的，相比非肥胖型轻度MAFLD受试者，非肥胖型中重度MAFLD受试者中rs72613567发生插入缺失突变的频率增加。3.根据权利要求1或2所述的应用，其特征在于，所述试剂包括通过直接测序、单碱基延伸、等位基因特异性探针杂交、等位基因特异性引物延伸、等位基因特异性扩增、等位基因特异性核苷酸掺入、5'核酸酶消化、分子信标测定、寡核苷酸连接测定、大小分析和单链构象多态性方法检测rs7261...

【专利技术属性】
技术研发人员：丁艳华，阿儒汗，朱晓雪，陈红，张洪，李晓娇，胡月，
申请(专利权)人：吉林大学第一医院，
类型：发明
国别省市：