基因突变在结肠癌、肺癌易感基因变异检测中的应用制造技术

本发明专利技术涉及一种基因突变在结肠癌、肺癌易感基因变异检测中的应用。提供了一种基因突变或核酸在制备试剂盒或设备中的应用，所述试剂盒或者设备用于检测结肠癌或肺癌；所述基因突变为位于BRD2基因上的突变位点rs778675391；所述核酸为与野生型BRD2基因相比，具有c.2455A>T突变。该基因突变是结肠癌或者肺癌相关性强，通过检测该突变在生物样品中是否存在，可以有效地检测生物样品是否患结肠癌或者肺癌或者易患结肠癌或者肺癌。该基因突变进一步扩展和完善了结肠癌或肺癌疾病的检测和研究，为该疾病的诊断和治疗提供了新的检测位点，以及新的检测方法和途径。以及新的检测方法和途径。

【技术实现步骤摘要】
基因突变在结肠癌、肺癌易感基因变异检测中的应用


[0001]本专利技术涉及生物领域，具体涉及一种基因突变在结肠癌、肺癌易感基因变异检测中的应用。

技术介绍

[0002]恶性肿瘤具有转移性强、复发率高、死亡率高等特点，是危害我国人民身体健康的重大疾病。研究表明，恶性肿瘤是由环境因素和遗传因素等共同作用引起的。肿瘤发生的家族聚集现象，是提示肿瘤可能具有遗传性的最早线索之一。近年来，随着基于常见变异的遗传关联研究的广泛开展，越来越多的肿瘤遗传易感基因和变异得以发现。最近，高通量基因组测序技术的测序通量和准确性迅速提升，而测序成本大幅下降。因此，高通量基因组测序技术得以在肿瘤易感基因的鉴定中大量应用，发现TP53(J Clin Oncol.2018Feb20；36(6):591-599.)、GPR161(J Clin Oncol.2020Jan 1；38(1):43-50.)CHD1(Nat Genet.2019Jan；51(1):76-87.)、ELP1(Nature.2020Apr；580(7803):396-401.)等一批基因上的罕见变异与多种肿瘤的发病风险增加有关。肿瘤易感基因及变异的发现，有助于深入阐明肿瘤发生发展的分子机理，针对性设计分子靶向干预方法，以及肿瘤的发病风险预测，从而为推动肿瘤的精准防治提供重要依据。
[0003]但是，肿瘤的遗传易感性仍然没有得到全部揭示，发现新的肿瘤遗传易感基因和变异是今后需要持续开展的研究方向。

技术实现思路

[0004]本专利技术旨在至少在一定程度上解决相关技术中的技术问题之一。为此，本专利技术的一个目的在于提出一种基因突变在结肠癌、肺癌易感基因变异检测中的应用。
[0005]我们采用高通量测序等基因组学技术，对来自中国的约2400名结肠癌、肺癌、乳腺癌、胃癌等肿瘤患者和1960名非肿瘤对照个体进行目标基因区域的遗传变异研究，发现了一个与结肠癌、肺癌发病风险增加显著相关的易感基因变异(其中，结肠癌fisher
’
s exact test p＝0.003537；肺癌fisher
’
s exact test p＝0.008257)，并专利技术了用于该变异位点检测的有效方法。所发现的该基因突变位点，补充了现有用于结肠癌、肺癌等肿瘤易感风险预测的基因变异检测位点，利用BRD2基因变异rs778675391(ENST00000395287.5:c.2455A>T；ENSP00000378702.1:p.Glu726Asp)提供一种迅速检测结肠癌、肺癌等肿瘤易感风险的方法。其应用该基因变异位点能够快速、准确、高效、简便、早期诊断率高，检测结果可以为结肠癌、肺癌的早期诊断、鉴别诊断及开发治疗结肠癌、肺癌的治疗药物提供科学依据。
[0006]具体而言，本专利技术提供了如下技术方案：
[0007]在本专利技术的第一方面，本专利技术提供了一种基因突变或核酸在制备试剂盒或设备中的应用，所述试剂盒或者设备用于检测结肠癌或肺癌；所述基因突变为位于BRD2基因上的突变位点rs778675391；所述核酸为与野生型BRD2基因相比，具有c.2455A>T突变。专利技术人首次发现BRD2基因上的突变位点rs778675391或者用核酸表示即也野生型BRD2基因相比，具
有c.2455A>T突变的核酸，与结肠癌和肺癌的发病发病密切相关，从而可以通过检测上述基因突变或者上述核酸在生物样品中是否发生，可以有效地检测生物样品是否患有结肠癌或者肺癌。
[0008]根据本专利技术的实施例，所述基因突变或者所述核酸表达的蛋白与野生型BRD2基因表达的蛋白相比，具有p.Glu726Asp突变。通过研究发现，BRD2基因上所发生的c.2455A>T突变，使得合成的蛋白质与野生型BRD2基因所表达的蛋白质或者多肽不同，具体表现为在726位由谷氨酸(Glu)突变为天冬氨酸(Asp)。该多肽与结肠癌或者肺癌的发病密切相关，从而可以通过检测该多肽在生物样品中是否存在，可以有效地检测生物样品是否易感结肠癌或者肺癌。
[0009]在本专利技术的第二方面，本专利技术提供了一种生物模型在筛选药物中的用途，所述药物用于预防或治疗结肠癌或肺癌，所述生物模型携带下列至少之一：(1)基因突变位点rs778675391；(2)与野生型BRD2基因相比，具有c.2455A>T突变；(3)与野生型BRD2基因所表达的蛋白相比，具有p.Glu726Asp突变的多肽。由此所提供的生物模型能有效地用作结肠癌或者肺癌的相关研究的模型。
[0010]在本专利技术的第三方面，本专利技术提供了特异性改变基因突变或者核酸的试剂在制备药物中的用途，所述药物用于治疗结肠癌或肺癌，所述基因突变为位于BRD2基因上的突变位点rs778675391；所述核酸为与野生型BRD2基因相比，具有c.2455A>T突变。需要说明的是，这里的特异性改变是指能使得突变的核酸或者基因突变的位点恢复到原来的野生状态或者其他不具有致病性的状态，而对于个体基因组的其他序列不产生实质影响。如前所述，所述核酸或者所述基因突变与结肠癌或者肺癌的发病密切相关，由此，特异性改变前面所述的核酸或者前面所述的基因突变的试剂制备的药物能有效用于治疗结肠癌或者肺癌。
[0011]在本专利技术的第四方面，本专利技术提供了一种基因突变或核酸在制备构建体中的用途，所述构建体用于制备治疗结肠癌或肺癌的药物，所述构建体包含所述基因突变或者所述核酸；所述基因突变为位于BRD2基因上的突变位点rs778675391；所述核酸为与野生型BRD2基因相比，具有c.2455A>T突变。需要说明的是，“构建体包含所述基因突变”表示，本专利技术的构建体与野生型BRD2基因相比具有rs778675391突变；“构建体包含所述的核酸”表示，本专利技术的构建体与野生型BRD2基因相比，其所包含的核酸具有c.2455A>T突变。由此，根据本专利技术实施例的构建体转化受体细胞获得的重组细胞，能够有效地用作结肠癌、肺癌相关研究的模型，或者用作制备治疗结肠癌或者肺癌的药物中。
[0012]在本专利技术的第五方面，本专利技术提供了一种基因突变或核酸在制备重组细胞中的用途，所述重组细胞用于制备治疗结肠癌或肺癌的药物；所述重组细胞中包含所述基因突变或者所述核酸；所述基因突变为位于BRD2基因上的突变位点rs778675391；所述核酸为与野生型BRD2基因相比，具有c.2455A>T突变。本专利技术的重组细胞，能够有效地用作结肠癌、肺癌相关研究的模型。
[0013]在本专利技术的第六方面，本专利技术提供了一种检测结肠癌或肺癌的试剂盒，所述试剂盒中包括检测基因突变或核酸的试剂；所述基因突变为位于BRD2基因上的突变位点rs778675391；所述核酸为与野生型BRD2基因相比，具有c.2455A>T突变。所提到的基因突变或者核酸与结肠癌和肺癌的发病密切相关，进而能用于包含能有效地检测所述核酸或者所述基因突变的本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
NO:2；任选地，所述试剂进一步包括dNTPs、PCR缓...

【专利技术属性】
技术研发人员：张红星，郑莉，肖飞，李君辉，刘夫锋，
申请(专利权)人：天津科技大学，
类型：发明
国别省市：