一种评估、检测和/预测耗牛的牛肉品质性状的方法技术

本发明专利技术公开了一种评估、检测和/预测耗牛的牛肉品质性状的方法，该方法基于与牦牛的肉质性状相关的3个分子标记SNP位点的组合，分别位于ARS

【技术实现步骤摘要】
一种评估、检测和/预测耗牛的牛肉品质性状的方法


[0001]本专利技术涉及牦牛育种
，具体地，涉及一种评估、检测和/预测耗牛的牛肉品质性状的方法。

技术介绍

[0002]牦牛属于大型反刍动物，体格高大、被毛厚密，心肺功能发达，抗逆性强，是唯一起源于青藏高原且在高海拔地区繁衍至今的珍稀牛种。具有高海拔地区适应能力强、耐粗饲、抗寒耐劳等优良特性。与普通黄牛肉相比，牦牛肉的蛋白质含量高达22.52％，脂肪含量约为3.15％，且矿物质元素含量丰富，氨基酸结构比例更与人体相近，有着较高的营养价值与经济价值。截至2019年全世界牦牛总数量约为1700万头，其中中国牦牛存栏数为1600多万头，占90％以上，主要分布于青海，四川，西藏等地区。牦牛肉的高经济价值，改善了人们的生活环境与膳食结构，因此推动牦牛产业的发展，对加强经济建设有着重要意义。单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism，SNP)是基因组水平上单个核苷酸变异所导致的DNA碱基序列的多态性，可用于快速基因型分型，是研究遗传育种相关的分子标记常用的技术之一。
[0003]动物屠宰后由于机体组织细胞中糖酵解速度加快，造成乳酸含量迅速积累，导致肌肉组织的pH值改变。肌肉组织的pH值可直接影响肉质性状，例如牛肉的嫩度、肉色、系水力等相关指标，因此，宰后的PH值是衡量肉质性状的重要指标。宰前牛肉多为中性pH值，随着宰后时间的增加，pH值下降，从而导致肉色变差，系水力下降，肉品质降低。宰后肌肉若能较长时间维持较高的pH值，则说明肌肉嫩度高，肉用品质好。对于相关的肉品质性状，例如背膘厚，其直接与动物机体脂肪的蓄积能力有关，脂肪积累多，背膘脂肪含量高，脂肪累积量低，瘦肉率高，即背膘脂肪含量低。所以一般来说，背膘厚不低于3mm较为理想。
[0004]酰基辅酶A硫脂酶(acyl
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CoA thioeaterase，ACOT)是一种水解酶，可催化酯酰辅酶A水解成自由脂肪酸和辅酶A，广泛存在于哺乳动物组织中。目前已知的ACOT家族成员有15个家族成员，根据酶的相对分子质量大致被分为Ⅰ型和Ⅱ型，两种类型的ACOT无结构相似性和序列同源性，因此被称为类似物而非同系物。Ⅰ型和Ⅱ型ACOT均含有保守的催化三联体氨基酸序列，该序列在催化反应和调节酶活性中发挥重要作用。酰基辅酶A硫脂酶12(acyl
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CoAthioeaterase 12，ACOT12)是ACOT家族Ⅱ型酶成员之一，主要在肝、肾和小肠中表达。ACOT12基因相关的研究主要集中在小鼠、大鼠和人上，有研究表明(T M,F I,Y N,et al.Physiological changes in the activities of extramitochondrial acetyl
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CoA hydrolase in the liver of rats under various metabolic conditions[J].European journal of biochemistry/FEBS,1985,152(2):331
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336.)，在大鼠中饥饿和过氧化物酶体增值无在内的代谢刺激可诱导ACOT12的表达，再次喂食和施加胰岛素可降低ACOT12的表达。而ACOT12基因与牦牛相关的研究未见报道。

技术实现思路

[0005]本专利技术的目的是为了克服现有技术的上述不足，提供一种评估、检测和/预测耗牛的牛肉品质性状的方法。
[0006]本专利技术的第一个目的是提供一种评估、检测和/预测耗牛的牛肉品质性状的试剂。
[0007]本专利技术的第二个目的是提供另一种评估、检测和/预测耗牛的牛肉品质性状的试剂。
[0008]本专利技术的第三个目的是提供所述的试剂在评估、检测和/预测耗牛的牛肉品质性状中的应用。
[0009]本专利技术的第四个目的是提供一种评估、检测和/预测耗牛的牛肉品质性状的方法。
[0010]本专利技术的第五个目的是提供另一种评估、检测和/预测耗牛的牛肉品质性状的方法。
[0011]本专利技术的第六个目的是提供所述的试剂在制备评估、检测和/预测耗牛的牛肉品质性状的试剂盒中的应用。
[0012]本专利技术的第七个目的是提供一种评估、检测和/预测耗牛的牛肉品质性状的试剂盒。
[0013]本专利技术的第八个目的是提供所述试剂、所述另一试剂、所述方法、所述另一方法、和所述的试剂盒的任意一个或几个在耗牛的牛肉品质性状育种中的应用。
[0014]为了实现上述目的，本专利技术是通过以下方案予以实现的：
[0015]本专利技术对102头四川牦牛ACOT12基因的多态性进行研究，使用Haploview4.2软件对ACOT12基因的多态性位点进行连锁不平衡分析，并通过SPSS 23.0软件分析ACOT12基因的SNPs位点及其单倍型与肉品质性状的相关性。发现了四川牦牛ACOT12基因的外显子1上共存在3个SNPs位点，分别为E1
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285 T>C、E1
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603T>A、E1
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675 C>G，其中E1
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603T>A、E1
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675 C>G位点分别与pH
45min
值、背膘厚性状显著相关(P<0.05)，说明以上2个SNPs可作为四川牦牛宰后pH
45min
和背膘厚性状的相关分子标记；H2H2单倍型组合的宰后pH
45min
值显著高于其余H1H4单倍型组合，因此可作为四川牦牛宰后pH
45min
值性状的最优单倍型组合，为未来优质肉牛早期选育提供分子理论依据。
[0016]因此本专利技术要求保护以下内容：
[0017]一种评估、检测和/预测耗牛的牛肉品质性状的试剂，所述试剂检测SNP位点1、SNP位点2和SNP位点3的基因型：
[0018]SNP位点1位于NC_037334.1：81354300，即ARS
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UCD1.2版牛基因组的第7染色体的第81354300位，SNP位点2位于NC_037334.1：81353982，即ARS
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UCD1.2版牛基因组的第7染色体的第81353982位，SNP位点3位于NC_037334.1：81353910，即ARS
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UCD1.2版牛基因组的第7染色体的第81353910位；
[0019]SNP位点1的基因型为TT、SNP位点2的基因型为AA、且SNP位点3的基因型为CC的个体的pH
45min
值显著高于SNP位点1的基因型为TC、SNP位点2的基因型为TT且SNP位点3的基因型为CC的个体。
[0020]以及，一种评估、检测和/预测耗牛的牛肉品质性状的试剂，所述试剂检测SNP位点2和/或SNP位点3的基因型：
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【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种评估、检测和/预测耗牛的牛肉品质性状的试剂，其特征在于，所述试剂检测SNP位点1、SNP位点2和SNP位点3的基因型：SNP位点1位于NC_037334.1：81354300，即ARS
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UCD1.2版牛基因组的第7染色体的第81354300位，SNP位点2位于NC_037334.1：81353982，即ARS
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UCD1.2版牛基因组的第7染色体的第81353982位，SNP位点3位于NC_037334.1：81353910，即ARS
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UCD1.2版牛基因组的第7染色体的第81353910位；SNP位点1的基因型为TT、SNP位点2的基因型为AA、且SNP位点3的基因型为CC的个体的pH
45min
值显著高于SNP位点1的基因型为TC、SNP位点2的基因型为TT且SNP位点3的基因型为CC的个体。2.一种评估、检测和/预测耗牛的牛肉品质性状的试剂，其特征在于，所述试剂检测SNP位点2和/或SNP位点3的基因型：SNP位点2位于NC_037334.1：81353982，即ARS
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UCD1.2版牛基因组的第7染色体的第81353982位，TT基因型个体的pH 45min
值显著低于TA、AA基因型个体；SNP位点3位于NC_037334.1：81353910，即ARS
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UCD1.2版牛基因组的第7染色体的第81353910位，CG基因型个体的背膘厚显著高于CC基因型个体。3.根据权利要求1所述的试剂，其特征在于，所述试剂为核苷酸序列如SEQ ID NO:1～2所示的引物。4.权利要求1或2所述的试剂在评估、检测和/预测耗牛的牛肉品质性状中的应用。5.一种评估、检测和/预测耗牛的牛肉品质性状的方法，其特征在于，检测SNP位点1、SNP位点2和SNP位点3的基因的基因...

【专利技术属性】
技术研发人员：姜平，赵志辉，于海滨，阮梦茹，王浩铸，隋亚民，
申请(专利权)人：广东海洋大学，
类型：发明
国别省市：