检测融合基因的方法技术

本发明专利技术利用对线性核酸片段的末端进行修复使其形成平末端，同时进行加A尾反应加高通量测序接头引物序列，对添加了一种接头的线性核酸片段采用5端带有高通量测序另一接头的针对病毒序列的引物组合进行多循环单向引物延伸，和随后采用接头一与接头二的成对引物的双向核酸扩增制备高通量测序文库，达到富集病毒基因与宿主基因所形成的融合基因片段的效果。因此，新的策略对序列未知的融合基因可以进行富集，富集后的核酸片段可以达到高通量测序的可靠性范围。可靠性范围。可靠性范围。

【技术实现步骤摘要】
检测融合基因的方法


[0001]本专利技术涉及生物医药领域，更具体地说，它涉及检测融合基因的方法。

技术介绍

[0002]同一物种的不同基因间，和不同物种的基因间，在一定条件下可以发生相 互融合。融合基因一方面时新基因产生的来源，但同时也可能导致物种生理功 能的异常。在生物医学方面，多种白血病的发生就与自身不同基因形成的融合 基因有关。在病原体感染尤其是病毒感染是，病毒既可以加速自身基因捡的融 合，也可形成病毒基因与宿主基因在宿主体内的基因融合。生物医学中的另一 种基因融合是病原微生物之间以及病原微生物与宿主基因之间形成的加速病原 微生物变异的基因融合。一个典型的例子是新冠病毒，以及历史上由融合基因 突变导致大流行的流行性感冒
[0003]当融合基因与非融合基因混合存在是，对于序列已经确定的融合基因，采 用聚合酶链式反应扩增和一代测序，或者直接采用荧光PCR技术，即可对该类 融合基因进行定性和定量分析。
[0004]当融合基因与非融合基因混合存在是，对于序列不确定的可能的新的融合 基因，当新的融合基因的丰度达到千分之一左右时，可本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.检测融合基因的方法，其特征是：包括如下步骤。1)修复待测样本中的核酸分子的末端，使其形成平末端；2)对步骤1)获得的核酸分子进行加A尾反应，使其两端连接A碱基，记为核酸片段α；3)在核酸片段α的两端连接第一接头；4)在步骤3)获得的核酸片段上连接第二接头，并进行单向核酸扩增，获得核酸片段β；5)对核酸片段β进行双向核酸扩增，进而得到富集产物；6)对步骤5)中获得的富集产物进行生物分析。2.根据权利要求1所述的检测融合基因的方法，其特征是：所述单向核酸扩增采用大于或等于5个循环；或者，所述单向核酸扩增采用大于45个循环。3.根据权利要求2所述的检测融合基因的方法，其特征是：所述双向核酸扩增采用5～50个循环；或者，所述双向核酸扩增采用35～50个循环。4.根据权利要求1所述的检测融合基因的方法，其特征是：双向引物扩增时的第二接头序列采用生物素标...

【专利技术属性】
技术研发人员：肖莉，廖端芳，李凯，
申请(专利权)人：廖端芳，
类型：发明
国别省市：