用于蛋白质组质控的FFPE参考品、其制备方法及应用技术

本发明专利技术公开了一种用于蛋白质组质控的FFPE参考品、其制备方法及应用，所述制备方法包括以下步骤：S1，对来自不同物种的细胞系进行细胞培养，不同细胞系包括人源细胞，收集细胞沉淀；S2，在保证2~5x106细胞量质量总和一致情况下，对所述不同物种的细胞沉淀进行不同比例的混合，之后进行福尔马林固定，并用琼脂糖凝胶包裹形成均匀细胞团块，最终制成为细胞蜡块；S3，提取所述混合细胞蜡块中的蛋白，该参考品可用于临床蛋白样本提取流程的质控；S4,对所述提取的蛋白质进行酶解然后质谱检测，以此作为FFPE样本的蛋白质组质谱检测的质控及实验室间质量评价的标准品。本发明专利技术所得FFPE参考品，能够通过不同的质谱检测方法来验证整个临床蛋白质组系统的稳定性。床蛋白质组系统的稳定性。床蛋白质组系统的稳定性。

【技术实现步骤摘要】
用于蛋白质组质控的FFPE参考品、其制备方法及应用


[0001]本专利技术属于生物
，具体地，涉及一种用于蛋白质组质控的FFPE参考品、其制备方法及应用。

技术介绍

[0002]近年来，随着质谱硬件以及软件相关技术的提升，蛋白质组检测领域发展极为迅速，越来越多的应用到了临床肿瘤标志物的发现以及蛋白质组的分子分型，以及潜在药物靶点的发现，推动了精准医疗的发展。以往临床蛋白质组应用更多的样本检测除了体液样本，更多的是手术切除的新鲜样本，或者保存一定期限的冻存组织或体液，然而临床样本更多是以福尔马林固定石蜡包埋的样本（Formalin fixed and paraffin embedded，FFPE样本）。目前蛋白质组提取的参考品多为单一或混合的细胞，其不能很好的模拟临床样本的情况，而组织FFPE样本缺乏均一性不能成为临床蛋白质组提取的标品进行大规模、多次的重复验证。市场上虽然有福尔马林固定石蜡包埋的基因检测标品，但其不能满足蛋白质组定性和定量评估的要求，不能作为临床蛋白质组质控的参考品。

技术实现思路

[0003]专利技术目的本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种用于蛋白质组质控的FFPE参考品的制备方法，其特征在于，包括以下步骤：S1，对来自不同物种的细胞系进行细胞培养，不同细胞系包括人源细胞，收集细胞沉淀；S2，在保证2~5x106细胞量质量总和一致情况下，对所述不同物种的细胞沉淀进行不同比例的混合，之后进行福尔马林固定，并用琼脂糖凝胶包裹形成均匀细胞团块，最终制成为细胞蜡块；S3，提取所述混合细胞蜡块中的蛋白，该参考品可用于临床蛋白样本提取流程的质控；S4，对所述提取的蛋白质进行酶解然后质谱检测，以此作为蛋白质组质谱检测的质控。2.根据权利要求1所述的用于蛋白质组质控的FFPE参考品的制备方法，其特征在于，步骤S1中，所述人源细胞系选自肿瘤细胞系或非肿瘤细胞系；所述不同物种的细胞系，除了有人源物种的细胞系外，还至少包括其他一种物种来源的细胞。3.根据权利要求1所述的用于蛋白质组质控的FFPE参考品的制备方法，其特征在于，步骤S2中，不同配对样本间人源细胞系的蛋白比例为1：1~10。4.根据权利要求1所述的用于蛋白质组质控的FFPE参考品的制备方法，其特征在于，步骤S3中，提取所述混合细胞蜡块中的蛋白，其方法包括以下步骤：S31，有机溶剂进行脱蜡，结束后采用不同比例乙醇进行脱蜡后的复水；S32，加入裂解液超声；S33，水浴去交联后离心取上清；S34，上清液加入有机溶剂，沉淀，然后复溶；S35，BCA法进行蛋白浓度测定；S36，蛋白跑胶质控。5.根据权利要求1所述的用于蛋白质组质控的FFPE参考品的制备方法，其特征在于，步骤S3中，提取所述混合细胞蜡块...

【专利技术属性】
技术研发人员：宋雷，李捷，
申请(专利权)人：谱天天津生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：