一种基于遗传因素的肺癌预后分期检测试剂、系统及应用技术方案

本发明专利技术公开了一种基于遗传因素的肺癌预后分期检测试剂、系统及应用。本发明专利技术提供的肺癌预后分期检测试剂，包括SPP1、SLC20A1、CENPH、MAGEE1、C16ORF54、KCNS3、TRIM68、以及CYB5D2基因表达水平检测试剂一种或多种的组合。本发明专利技术提供的检测系统，包括基因表达水平获取模块、判断模块，所述基因表达水平获取模块用于获取SPP1、SLC20A1、CENPH、MAGEE1、C16ORF54、KCNS3、TRIM68、以及CYB5D2基因中一个或多个基因表达水平，并提交给判断模块；所述判断模块，以SPP1、SLC20A1、CENPH、MAGEE1、C16ORF54、KCNS3、TRIM68、以及CYB5D2基因一个或多个基因表达水平为分类器的输入，判断样本是否来自肺癌预后高风险患者。本发明专利技术可作为独立候选诊断生物标志物发挥作用，对于肺癌具有明显的特异性，对肺癌准确预后有重大意义。对肺癌准确预后有重大意义。对肺癌准确预后有重大意义。

【技术实现步骤摘要】
一种基于遗传因素的肺癌预后分期检测试剂、系统及应用


[0001]本专利技术属于癌症预后领域，更具体地，涉及一种基于遗传因素的肺癌预后分类系统。

技术介绍

[0002]为改善肺癌预后是目前的一个主要研究焦点，因为肺癌患者晚期生存的比例明显降低。作为世界上发病率和死亡率最高的癌症，其5年生存率仅为19％。虽然在治疗策略上取得了进展，但由于晚期诊断，肺癌患者的高死亡率并没有急剧下降。非小细胞肺癌(NSCLC)患者的治疗在过去几年中随着靶向治疗和免疫治疗的引入而不断发展，这些变化增加了预后和预测性生物标志物的重要性，使临床医生能够为NSCLC患者做出最合适的治疗决定。然而，在具有相似临床和病理特征的患者中发现了不同的疾病结局，提示目前使用的临床预后因素可能不足以一致预测个体临床结局。因此，寻找新的、敏感、可靠的治疗和预后生物学标志物，使肿瘤患者受益一直是肿瘤学家关注的焦点。
[0003]传统的预后指标目前无法准确预测。目前癌症进展预测主要基于疾病表现和美国癌症联合委员会(AJCC)的肿瘤
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淋巴结
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转移分期系统。然而，这两种方法对临床病理因素的静态表征都不能解释癌症的遗传异质性，限制了它们的预测价值。最近的研究表明，基因突变和表达紊乱与肺癌的疾病进展和治疗反应有关。然而，这些目前的生物标志物，如表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor，EGFR)和Kirsten rat sarcoma virus(Kirsten rat sarcoma virus，KRAS)癌基因同源物，并不能完全代表肺癌进展的复杂机制。
[0004]肺癌的早期诊断和预后判断，对于肺癌的治疗方案的制定、治疗效果有着决定性影响。而遗传因素的肺癌预后指标，相比生化指标对肺癌的早期诊断意义更大。然而现有的基于遗传因素的肺癌预后指标，特异性不高，难以开发出准确肺癌预后分期系统，无法为早期诊断和治疗方案制定提供更准确的决策参考。

技术实现思路

[0005]针对现有技术的以上缺陷或改进需求，本专利技术提供了一种肺癌预后分期检测试剂、系统及应用，其目的在于通过检测特定肺癌预后相关的基因在血液中的表达量，作为肺癌预后高风险可量化的特异性指标，由此解决现有技术肺癌预后指标特异性不高、难以准确预测肺癌预后分期的技术问题。
[0006]为实现上述目的，按照本专利技术的一个方面，提供了一种肺癌预后分期检测试剂，其包括SPP1、SLC20A1、CENPH、MAGEE1、C16ORF54、KCNS3、TRIM68、以及CYB5D2基因表达水平检测试剂一种或多种的组合。
[0007]优选地，所述肺癌预后分期检测试剂，其包括SPP1、SLC20A1、CENPH、MAGEE1、C16ORF54、KCNS3、TRIM68、以及CYB5D2基因表达水平检测试剂。
[0008]优选地，所述肺癌预后分期检测试剂，其所述基因表达检测试剂为基因mRNA表达
水平检测试剂。
[0009]优选地，所述肺癌预后分期检测试剂，其所述基因mRNA表达水平检测试剂包括GSE30219、GSE37745和GSE50081芯片。
[0010]按照本专利技术的另一方面，提供了一种肺癌预后分期检测系统，其包括基因表达水平获取模块和判断模块。
[0011]所述基因表达水平获取模块用于获取SPP1、SLC20A1、CENPH、MAGEE1、C16ORF54、KCNS3、TRIM68、以及CYB5D2基因中一个或多个基因的表达水平，并提供给判断模块。
[0012]所述判断模块以SPP1、SLC20A1、CENPH、MAGEE1、C16ORF54、KCNS3、TRIM68、以及CYB5D2基因中一个或多个基因的表达水平为分类器的输入，判断样本是否来自于肺癌预后高风险患者。
[0013]优选地，所述肺癌预后分期检测系统，所述基因表达水平获取模块用于获取SPP1、SLC20A1、CENPH、MAGEE1、C16ORF54、KCNS3、TRIM68、以及CYB5D2基因的表达水平。
[0014]按照本专利技术的另一方面，提供了一种应用：SPP1、SLC20A1、CENPH、MAGEE1、C16ORF54、KCNS3、TRIM68、以及CYB5D2基因表达水平检测试剂一种及多种组合应用于制备肺癌早期预测定量检测试剂。
[0015]总体而言，通过本专利技术所构思的以上技术方案与现有技术相比，能够取得下列有益效果：
[0016]本专利技术提供了一种肺癌预后分期检测试剂，包括肺癌预后相关基因的表达量检测试剂：SPP1、SLC20A1、CENPH、MAGEE1、C16ORF54、KCNS3、TRIM68、以及CYB5D2基因表达量的检测试剂具有较高的诊断效率和特异性，可作为独立候选诊断生物标志物发挥作用，可通过血液样本中使用GSE30219、GSE37745和GSE50081芯片无创、高通量的检测其表达量。其各自作为筛查指标准确性达到0.5至0.8，达到中等强度筛查指标的标准，其联合表达量指标作为筛查指标的AUC达到0.7以上。尤其值得注意的是，本专利技术提供肺癌预后分期检测试剂及系统，对于肺癌具有明显的特异性，对肺癌准确预后有重大意义。
附图说明
[0017]图1是实施例1对GSE30219、GSE37745和GSE50081全血检测结果数据集进行分析，不同基因在肺癌预后高风险患者和肺癌预后低风险患者之间的表达差异；
[0018]图2是实施例1的GSE30219、GSE37745和GSE50081全血检测结果对SPP1、SLC20A1、CENPH、MAGEE1、C16ORF54、KCNS3、TRIM68、以及CYB5D2基因表达差异小提琴图；
[0019]图3是实施例2对SPP1、SLC20A1、CENPH、MAGEE1、C16ORF54、KCNS3、TRIM68、以及CYB5D2基因通过多变量Cox回归估计的8个基因的回归系数结果；
[0020]图4是实施例3对SPP1、SLC20A1、CENPH、MAGEE1、C16ORF54、KCNS3、TRIM68、以及CYB5D2基因联合指标对肺癌患者1年、3年、5年生存预测的感受性曲线；
[0021]图5时实施例3对SPP1、SLC20A1、CENPH、MAGEE1、C16ORF54、KCNS3、TRIM68、以及CYB5D2基因高风险人群和低风险人群分类结果；
[0022]图6是实施例4肺癌预后分期检测系统特异性测试结果。
具体实施方式
[0023]为了使本专利技术的目的、技术方案及优点更加清楚明白，以下结合实施例，对本专利技术进行进一步详细说明。应当理解，此处所描述的具体实施例仅仅用以解释本专利技术，并不用于限定本专利技术。此外，下面所描述的本专利技术各个实施方式中所涉及到的技术特征只要彼此之间未构成冲突就可以相互组合。
[0024]最近的研究表明，基因突变和表达紊乱与肺癌的疾病进展和治疗反应本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种肺癌预后分期检测试剂，其特征在于，包括SPP1、SLC20A1、CENPH、MAGEE1、C16ORF54、KCNS3、TRIM68、以及CYB5D2基因表达水平检测试剂一种或多种的组合。2.如权利要求1所述的肺癌预后分期检测试剂，其特征在于，包括SPP1、SLC20A1、CENPH、MAGEE1、C16ORF54、KCNS3、TRIM68、以及CYB5D2基因表达水平检测试剂。3.如权利要求1和2任意一项所述的肺癌预后分期检测试剂，其特征在于，所述基因标量检测试剂为基因mRNA表达水平检测试剂。4.如权利要求3所述的肺癌预后分期检测试剂，其特征在于，所述基因mRNA表达水平检测试剂包括GSE30219、GSE37745和GSE50081芯片。5.一种肺癌预后分期检测系统，其特征在于，包括基因表达水平获取模块、判断模块；所述基因表达水平获取模块用于获取SPP1、SLC20A1、CENPH、MAGEE1、C16ORF54、KCNS3、TRIM68、以及CYB5D2基因中一个或多个基因表达水平，并提交给判断模块；所述判断模块，以SPP1、SLC20A1、CENPH、MAGEE1、C16ORF54、KCNS3、TRIM68、以及CYB5D2基因一个或多个基...

【专利技术属性】
技术研发人员：欧阳锦，黄邵鑫，杨勇，杜博贾，陈希，韩强强，
申请(专利权)人：谱度众合武汉生命科技有限公司，
类型：发明
国别省市：