一种用于检测新型冠状病毒及其变异株的引物、探针组合物及试剂盒制造技术

本发明专利技术公开了一种用于检测新型冠状病毒及其变异株的引物、探针组合物及试剂盒，包括针对SARS

【技术实现步骤摘要】
ID NO.13所示，探针如SEQ ID NO.14所示；所述E基因P71L突变位点的正向引物如SEQ ID NO.15所示，反向引物如SEQ ID NO.16 所示，探针如SEQ ID NO.17所示；所述ORF7A基因V82A突变位点的正向引物如SEQ IDNO.18所示，反向引物如SEQ ID NO.19所示，探针如SEQ ID NO.20所示；所述ORF3A 基因S253P突变位点的正向引物如SEQ ID NO.21所示，反向引物如SEQ ID NO.22所示，探针如SEQ ID NO.23所示。
[0008]本专利技术针对上述选取到的基因及突变位点进行引物及探针设计，在设计过程中考虑了多种常规设计因素及设计经验积累，最终通过临床样本验证，确定了针对上述基因及突变位点的特异性探针及引物。经与商业试剂盒对比及临床验证，证明上述引物及探针检测突变位点的结果正确率为100％。
[0009]进一步地，作为优选的方案，所述ORF1ab基因的正向引物如SEQ ID NO.24所示，反向引物如SEQ ID NO.25所示，探针如SEQ ID NO.26所示；和/或，所述N基因本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种用于检测新型冠状病毒及其变异株的引物、探针组合物，包括针对SARS
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CoV
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2的ORF1ab基因、N基因以及内参基因的特异性的引物及探针，其特征在于，还包括：针对SARS
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CoV
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2的S基因69
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70Del、L452R、E484K、E484Q和N501Y突变位点、NSP6基因106/107/108del突变位点、E基因P71L突变位点、ORF7A基因V82A突变位点、ORF3A基因S253P突变位点中的一个或多个突变位点的特异性的引物及探针；所述引物及探针组合物用于在检测新型冠状病毒时又检测突变位点，可区分出新型冠状病毒B.1.351变异株、B.1.1.7变异株、B.1.617变异株或P.1变异株中的一种或多种。2.根据权利要求1所述的用于检测新型冠状病毒及其变异株的引物、探针组合物，其特征在于：所述S基因69
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70Del突变位点的正向引物如SEQ ID NO.1所示，反向引物如SEQ ID NO.2所示，探针如SEQ ID NO.3所示；所述S基因L452R突变位点的正向引物如SEQ ID NO.4所示，反向引物如SEQ ID NO.5所示，探针如SEQ ID NO.6所示；所述S基因E484K突变位点的正向引物如SEQ ID NO.7所示，反向引物如SEQ ID NO.10所示，探针如SEQ ID NO.11所示；所述S基因E484Q突变位点的正向引物如SEQ ID NO.8所示，反向引物如SEQ ID NO.10所示，探针如SEQ ID NO.11所示；所述S基因N501Y突变位点的正向引物如SEQ ID NO.9所示，反向引物如SEQ ID NO.10所示，探针如SEQ ID NO.11所示；所述NSP6基因106/107/108del突变位点的正向引物如SEQ ID NO.12所示，反向引物如SEQ ID NO.13所示，探针如SEQ ID NO.14所示；所述E基因P71L突变位点的正向引物如SEQ ID NO.15所示，反向引物如SEQ ID NO.16所示，探针如SEQ ID NO.17所示；所述ORF7A基因V82A突变位点的正向引物如SEQ ID NO.18所示，反向引物如SEQ ID NO.19所示，探针如SEQ ID NO.20所示；所述ORF3A基因S253P突变位点的正向引物如SEQ ID NO.21所示，反向引物如SEQ ID NO.22所示，探针如SEQ ID NO.23所示。3.根据权利要求1或2所述的用于检测新型冠状病毒及其变异株的引物、探针组合物，其特征在于：所述ORF1ab基因的正向引物如SEQ ID NO.24所示，反向引物如SEQ ID NO.25所示，探针如SEQ ID NO.26所示；和/或，所述N基因的正向引物如SEQ ID NO.27所示，反向引物如SEQ ID NO.28所示，探针如SEQ ID NO.29所示；和/或，所述内参基因为ACTIN基因，所述ACTIN基因的正向引物如SEQ ID NO.30所示，反向引物如SEQ ID NO.31所示，探针如SEQ ID NO.32所示。4.根据权利要求1
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3任一项所述的用于检测新型冠状病毒及其变异株的引物、探针组合物，其特征在于：所述S基因69
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70Del突变位点、ORF1ab基因及N基因的探针的5
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端采用相同的第一荧光基团；
所述S基因L452R、E484K、E484Q、N501Y突变位点的探针的5
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端采用相同的第二荧光基团；所述NSP6基因106/107/108del突变位点、E基因P71L突变位点、ORF7A基因V82A突变位点、ORF3A基因S253P突变位点的探针的5
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端采用相同的第三荧光基团；所述内参基因的探针的5
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端采用第四荧光基团。5.根据权利要求4所述的用于检测新型冠状病毒及其变异株的引物、探针组合物，其特征在于：所述S基因69
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70Del突变位点、ORF1ab基因及N基因的探针的5
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端均采用FAM荧光...

【专利技术属性】
技术研发人员：刘亚宝，韩英，赵燕，
申请(专利权)人：成都峰际生物技术有限公司，
类型：发明
国别省市：