一种与鸡屠体性状相关的分子标记及其应用制造技术

本发明专利技术公开了一种与鸡屠体性状相关的分子标记及其应用，属于基因技术领域。该分子标记核苷酸序列如SEQ ID No.1所示，SEQ ID No.1所示序列的SNP位点g.762处有一个C/A的碱基突变，出现AA、AC和CC不同的基因分型。本发明专利技术还公开了检测该分子标记的引物对，包含该分子标记的试剂盒以及检测该分子标记的方法，通过该分子标记可以实现早期对地方品种种鸡进行选育，利于大大缩短育种时间，节约饲养成本，这为分子标记辅助选育工作提供理论基础和参考数据。子标记辅助选育工作提供理论基础和参考数据。子标记辅助选育工作提供理论基础和参考数据。

【技术实现步骤摘要】
一种与鸡屠体性状相关的分子标记及其应用


[0001]本专利技术涉及基因
，特别是涉及一种与鸡屠体性状相关的分子标记及其应用。

技术介绍

[0002]屠宰性能是生产性能的重要指标之一，包括屠体重、半净膛重、全净膛重、背宽、单侧腿重等指标，除了饲养方式对肉鸡屠宰性能有不同程度的影响外，遗传因素也起着至关重要的作用。研究证明，生长激素(GH)基因可能调控鸡屠体性状的主效基因或与控制屠体性状的主基因连锁。筛选GH基因序列中与屠宰性状相关的多态位点作为分子育种的辅助选择标记，能够直接应用于鸡育种和生产实践中。
[0003]宁都黄鸡是江西省小型地方肉鸡品种，具有早熟脚矮、三黄、五红、体型小肉质好等特点，同时由于缺乏系统育种，目前还面临着个体生产性能层次不一，饲养效率低的问题。如果能够从宁都黄公鸡的生长发育规律及其相关基因入手，筛选屠体相关的遗传标记，可为宁都黄鸡的分子辅助选育积累理论基础，为宁都黄种公鸡的饲养管理提供数据，使得地方鸡种的选种更高效。

技术实现思路

[0004]本专利技术的目的是提供一种与鸡屠体性状相关的分子标记及其应用，以解决上述现有技术存在的问题，本专利技术以宁都黄鸡为材料，研究GH基因突变与生长、屠体性状的相关性，以期为宁都黄鸡的标记辅助选择提供依据。
[0005]为实现上述目的，本专利技术提供了如下方案：
[0006]本专利技术提供一种与鸡屠体性状相关的分子标记，其核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。
[0007]进一步地，SEQ ID No.1所示核苷酸序列的SNP位点g.762处有一个C/A的碱基突变，出现AA、AC和CC不同的基因分型。
[0008]进一步地，所述屠体性状包括屠体重、半净膛重、全净膛重、背宽和/或单侧腿重。
[0009]本专利技术还提供一种检测上述的与鸡屠体性状相关的分子标记的引物对，包括：
[0010]上游引物F：TGTTAACCGTGGGGCAGAAA；
[0011]下游引物R：TTTATGCAGGGTGGGAAGCC。
[0012]本专利技术还提供一种试剂盒，包括上述的引物对。
[0013]本专利技术还提供一种检测上述的与鸡屠体性状相关的分子标记的方法，包括以下步骤：
[0014]步骤1：提取待测鸡的基因组DNA；
[0015]步骤2：利用上述的引物对进行PCR扩增，获取扩增产物；
[0016]步骤3：将步骤2所得的扩增产物经测序后，获取分子标记的基因型；
[0017]步骤4：根据基因型分析与鸡屠体性状的相关性。
[0018]进一步地，在步骤2中，PCR扩增反应体系包括：DNA 1
‑
2μL，2
×
PCR mix 7.5μL，混合引物2μL，H2O补至15μL。
[0019]进一步地，在步骤2中，PCR扩增反应程序为：95℃3min；94℃15s，55℃15s，72℃30s，20cycles；72℃3min。
[0020]本专利技术还提供一种上述的分子标记、上述的引物对或上述的试剂盒在检测鸡屠体性状相关性状中的应用。
[0021]本专利技术还提供一种上述的分子标记、上述的引物对或上述的试剂盒在早期选育地方品种种鸡中的应用。
[0022]本专利技术公开了以下技术效果：
[0023]本专利技术公开一种与鸡屠体性状相关的分子标记，以GH基因g.762位点为分子标记，检测该位点在宁都黄公鸡中的多态性，并分析其与屠体性状的关系，通过实验发现，GH基因g.762位点等位基因A有利于鸡屠体性状发育，通过GH基因g.762基因型可实现早期选择不同屠体性状的种鸡，这为地方鸡种选育及标记辅助选择提供依据。这种选育方法相较于现在的表型数据选育，不仅成本低、操作简便，而且结果准确，并且该方法简单易行，可重复性强，在普通实验室即可进行。
附图说明
[0024]为了更清楚地说明本专利技术实施例或现有技术中的技术方案，下面将对实施例中所需要使用的附图作简单地介绍，显而易见地，下面描述中的附图仅仅是本专利技术的一些实施例，对于本领域普通技术人员来讲，在不付出创造性劳动的前提下，还可以根据这些附图获得其他的附图。
[0025]图1为实施例2目的位点的分型结果。
具体实施方式
[0026]现详细说明本专利技术的多种示例性实施方式，该详细说明不应认为是对本专利技术的限制，而应理解为是对本专利技术的某些方面、特性和实施方案的更详细的描述。
[0027]应理解本专利技术中所述的术语仅仅是为描述特别的实施方式，并非用于限制本专利技术。另外，对于本专利技术中的数值范围，应理解为还具体公开了该范围的上限和下限之间的每个中间值。在任何陈述值或陈述范围内的中间值以及任何其他陈述值或在所述范围内的中间值之间的每个较小的范围也包括在本专利技术内。这些较小范围的上限和下限可独立地包括或排除在范围内。
[0028]除非另有说明，否则本文使用的所有技术和科学术语具有本专利技术所述领域的常规技术人员通常理解的相同含义。虽然本专利技术仅描述了优选的方法和材料，但是在本专利技术的实施或测试中也可以使用与本文所述相似或等同的任何方法和材料。本说明书中提到的所有文献通过引用并入，用以公开和描述与所述文献相关的方法和/或材料。在与任何并入的文献冲突时，以本说明书的内容为准。
[0029]在不背离本专利技术的范围或精神的情况下，可对本专利技术说明书的具体实施方式做多种改进和变化，这对本领域技术人员而言是显而易见的。由本专利技术的说明书得到的其他实施方式对技术人员而言是显而易见得的。本专利技术说明书和实施例仅是示例性的。
[0030]关于本文中所使用的“包含”、“包括”、“具有”、“含有”等等，均为开放性的用语，即意指包含但不限于。
[0031]实施例1检测与鸡屠体性状相关的分子标记的方法
[0032]采用PCR方法对相应的变异位点进行分型，根据被检鸡目的位点的基因型来选择不同屠体性状的种鸡。具体步骤如下：
[0033]1.样本采集与准备
[0034]采集391只16周龄公鸡血液。
[0035]2.DNA提取
[0036]基因组DNA的抽提采用苯酚
‑
氯仿抽提法(奥斯泊F等，1998)，具体步骤如下：
[0037](1)取全血30μL置于1.5mL离心管，分别加入470μL 1
×
SET缓冲液、12.5μL20％SDS和6μL 10mg/mL蛋白酶K，混合均匀后放于55℃水浴过夜；
[0038](2)取出样本于1.5mL离心管，加入500μL饱和苯酚，轻摇20min，10000rpm离心10min；
[0039](3)取上清，再次加入500μL饱和苯酚，轻摇20min，10000rpm离心10min；
[0040](4)取上清，加入500μL氯仿
‑
异戊醇(体积比23：1)轻摇20min，10000rpm离心10min；
[0041](5)取上清，加入1mL冰无水乙醇(本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种与鸡屠体性状相关的分子标记，其特征在于，其核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。2.根据权利要求1所述的分子标记，其特征在于，SEQ ID No.1所示核苷酸序列的SNP位点g.762处有一个C/A的碱基突变，出现AA、AC和CC不同的基因分型。3.根据权利要求1所述的分子标记，其特征在于，所述屠体性状包括屠体重、半净膛重、全净膛重、背宽和/或单侧腿重。4.一种检测权利要求1
‑
3任一项所述的与鸡屠体性状相关的分子标记的引物对，其特征在于，包括：上游引物F：TGTTAACCGTGGGGCAGAAA；下游引物R：TTTATGCAGGGTGGGAAGCC。5.一种试剂盒，其特征在于，包括权利要求4所述的引物对。6.一种检测权利要求1
‑
3任一项所述的与鸡屠体性状相关的分子标记的方法，其特征在于，包括以下步骤：步骤1：提取待测鸡的基因组DNA；步骤2：利用权利要求4所述的引物对...

【专利技术属性】
技术研发人员：姚利君，马荆鄂，周敏，朱学农，谭玉文，许继国，杨艳北，李金，饶友生，文正亚，王樟凤，徐淘，孙铭，
申请(专利权)人：南昌师范学院，
类型：发明
国别省市：